Depois de instalar o Napari e o Napari Animation, crie um novo arquivo de notebook Jupyter. Para visualizar imagens e criar filmes do cérebro do peixe-zebra renderizado, carregue a imagem 3D e abra a janela Napari. Em seguida, conecte o plugin de animação Napari.
Em seguida, defina os parâmetros, como tamanho do voxel, mapa de cores e limites de contraste nos controles de camada. Ajuste as configurações do visualizador na tela. Em seguida, para capturar a imagem renderizada, pressione o botão de captura no assistente de animação.
Para gerar filmes do volume renderizado, modifique as configurações do visualizador e adicione quadros-chave. Depois de adicionar quadros-chave, defina o número de quadros entre quadros-chave no assistente de animação. Finalmente, salve a animação renderizada.
O campo de visão volumétrico de um cérebro de peixe-zebra que expressa GCaMP 7A pan-neuronal cobriu as regiões cerebrais do prosencéfalo, mesencéfalo e rombencéfalo. Corpos celulares neuronais do bulbo, placa cerebelar, tecto óptico, hebenula e telencéfalo dorsal eram claramente visíveis em todo o cérebro de uma larva de peixe-zebra. Em imagens funcionais 2D, os corpos celulares neuronais eram claramente visíveis tanto no fundo quanto na atividade neuronal sobreposta.
