Exploramos o papel funcional das vesículas extracelulares na imunidade inata. Desenvolvemos um protocolo para isolar pequenas vesículas extracelulares, ou sEVs, via ultracentrifugação diferencial e identificar o peptidoma por LC-MS/MS, revelando as principais funções biológicas dos peptídeos em sEVs. Foi demonstrado que as vesículas extracelulares mediam a comunicação intercelular transportando carga para as células receptoras, como proteínas, lipídios e ácidos nucléicos.
Ao liberar componentes antimicrobianos, eles atuam como a primeira linha de defesa contra micróbios invasores na imunidade inata. Embora a ultracentrifugação diferencial produza pequenos sEVs extracelulares altamente puros, ela pode ser demorada e muitas vezes resulta em baixos rendimentos. Em nosso estudo, estes são os principais desafios para a identificação estável de peptídeos de baixa abundância nos sEVs.