Medição do comprimento da cauda de Poly A do cérebro da larva de Drosophila e da linha celular

A poliadenilação é uma modificação pós-transcrição. Isso adiciona caudas poli-A à extremidade de três primos das moléculas de mRNA. A desregulação da poliadenilação tem sido associada à expressão anormal de genes e a várias doenças, incluindo distúrbios neurológicos.

Nosso método fornece uma análise econômica e de alta resolução para medir comprimentos poli-A. Métodos de alta taxa de transferência para análise de cauda poli-A, como sequenciamento de próxima geração, e um sequenciamento de alta taxa de transferência fornecem informações de alto conteúdo. No entanto, a análise de transcrições raras pode ser extremamente desafiadora com esses métodos.

Os métodos baseados em PCR são geralmente de baixo rendimento. No entanto, eles podem ser facilmente usados para analisar um pequeno número de transcrições. O método GI-tailing é um deles.

Com este método, descobrimos que os mRNAs Dscam contêm caudas poli-A curtas. Dscam é uma molécula de adesão celular neuronal. Está envolvida em muitos processos importantes do neurodesenvolvimento.

Como o mRNA do Dscam contém caudas poli-A curtas, ao contrário da maioria dos mRNAs, a tradução do mRNA do Dscam está sob regulação genética única, que é uma das perguntas que estamos tentando responder.