Misurazione della lunghezza della coda di Poly A dal cervello e dalla linea cellulare della larva di Drosophila

La poliadenilazione è una modificazione post-trascrizione. Questo aggiunge code di poli-A all'estremità a tre numeri primi delle molecole di mRNA. La disregolazione della poliadenilazione è stata associata a un'espressione genica anomala e a varie malattie, compresi i disturbi neurologici.

Il nostro metodo fornisce un'analisi economica e ad alta risoluzione per la misurazione delle lunghezze poly-A. I metodi ad alto rendimento per l'analisi della coda poli-A, come il sequenziamento di nuova generazione, e un sequenziamento ad alto rendimento fornisce informazioni ad alto contenuto. Tuttavia, l'analisi di trascrizioni rare può essere estremamente impegnativa con questi metodi.

I metodi basati sulla PCR sono generalmente a bassa produttività. Tuttavia, possono essere facilmente utilizzati per analizzare un piccolo numero di trascrizioni. Il metodo GI-tailing è uno di questi.

Con questo metodo, abbiamo scoperto che gli mRNA di Dscam contengono code corte di poli-A. Dscam è una molecola di adesione delle cellule neuronali. È coinvolto in molti importanti processi di sviluppo neurologico.

Poiché l'mRNA di Dscam contiene brevi code di poli-A a differenza della maggior parte degli mRNA, la traduzione dell'mRNA di Dscam è soggetta a una regolazione genica unica, che è una delle domande a cui stiamo cercando di rispondere.