Диссоциация образцов опухолевой ткани человека и мыши для секвенирования РНК одиночных клеток

Сферой наших исследований является изучение механизмов ответа или резистентности при стандартной иммунотерапии. Наша лаборатория пытается понять, что движет успешным иммунным ответом против опухолей, и сможем ли мы идентифицировать эти предикторы терапии, чтобы найти мишени, которые могут преодолеть резистентность. Самым большим достижением последних лет стала разработка и интеграция методов секвенирования РНК одиночных клеток.

Они позволяют нам в режиме реального времени систематически изучать молекулярные особенности в отдельных клетках непредвзятым образом, что полезно при анализе этих сложных и развивающихся опухолевых экосистем. В то время как многие доклинические модели используются для изучения механизмов ответа на иммунотерапию, мы до сих пор не знаем иммунологические детерминанты, которые важны для иммунитета человека. Обработка и анализ образцов пациентов в режиме реального времени имеет решающее значение для нашей способности исследовать все клеточные компартменты в данной опухоли.

Используя объективные геномные и транскриптомные методы, наша лаборатория обнаружила, что дефекты в механизме презентации антигена связаны с резистентностью к иммунотерапии при меланоме. Совсем недавно, используя одноклеточные подходы, мы обнаружили уникальные состояния Т-клеток и полярности миелоидных клеток, связанные с исходами лечения меланомы и рака головы и шеи соответственно. Самое большое преимущество нашего протокола заключается в его простоте.

Это универсальный протокол, предназначенный для диссоциации малых и больших образцов опухолей из нескольких типов рака за короткий период времени, что заканчивается получением высокожизнеспособных одноклеточных суспензий.