Yazarlar bu analiz için kavun meyve sağlamak için Bill Copes (Harris Moran Tohum Şirketi, Davis) teşekkür ederim. Bu proje, Özel Tarla Bitkileri Merkez Araştırma Girişimi Rekabetçi Hibeler Programı tarafından desteklenen hiçbir vermek. Gıda ve Tarım USDA Ulusal Enstitüsü&#39;nden 2009-51181-05783.

1. Numune Hazırlama <ol><li> Istenilen olgunluk aşamasında Hasat meyveler. Kir ve tozu temizlemek için musluk suyuyla durulayın. </li><li> Harici ve dahili arızaların ve boyutu homojenlik yokluğunda göre analiz için meyve seçmek. </li><li> Uçucu numune için kullanılmak üzere kamalar içine uzunlamasına meyve kesilir. Varsa, cilt, tohumlar, tohum boşluğu doku veya çukur kaldırın. Meyve doku seçimi deney boyunca tutarlı olması ve tek bir meyve (yani, eşit ekvator, çiçek ve kök ucu parçalardan örnek almak) içinde hesap değişkenliği dikkate almak zorundadır. </li><li> Seçilen meyve doku birleştirin, o rastgele amacıyla karıştırın ve daha sonra bir blender içine 200 gr tarttın. </li><li> Doymuş CaCI2 çözeltisi (20 g 372,5 ° C, deiyonize su ve 500 mL) ve 2-metilbutil bir 100 mM metanol içindeki bir çözeltisi isovalerate 50 uL, 200 ml ilave edilir. CaCI2 enzimsel ac bir inhibitörü olarak hareket etmeye yöneliktirkesme ve meyve eti homojenizasyon sonrası oluşabilecek sensitivite,. 2-metilbutil isovalerate homojenleştirme işlemi sırasında uçucu bileşiklerin olası herhangi bir zarar izlemek için bir iç standart olarak ilave edilir. </li><li> 18,000 rpm&#39;de 30 saniye için bir laboratuvar blender (Waring, ABD), karışım homojenize, sonra hemen teflon kapaklı cam şişe ve mühür dökün. Tüm örneklerde hazırlanıncaya kadar oda sıcaklığında şişede Homojenat tutun. </li><li> Şişeye Homojenat doldurduktan sonra, 20 ml cam şişe içine kehribar, köpük olmadan, sıvıdan köpük ayırma, sıvı daha sonra pipetle 5 ml izin vermek için 10 dakika bekleyin ve Teflon ile donatılmış çelik vidalı kapakları şişeleri mühür / silikon septa. Bu prosedür, kavun ve armut Homojenat hazırlanması için uygundur. Diğer meyveler analiz için kullanılması halinde, santrifüj basamağı gerekli olabilir. Bu nedenle, köpük kaldırmak ve daha sonra pelet parçacıklara sıvı santrifüj olduğu olabilirpipet engel. Teknik çoğaltır olarak hizmet vermeye örnek başına en az üç şişe hazırlayın. </li><li> Bu noktada, numuneler hemen analiz edilebilir veya sıvı azot içerisinde flash-dondurulmuş ve daha sonra analiz için ultra düşük sıcaklıkta (-80 ° C) saklanır. </li><li> Donmuş numuneler için, günde analizi dondurucudan örnekleri çıkarın ve oda sıcaklığında bir saat boyunca çözülmeyi izin verir. Çözülme ve analizden önce, temiz, kuru bir septuma sahip yenisi ile flakon kapağı değiştirdikten sonra. Septum yerini değilse, eritme sırasında septum üzerine yoğunlaşmış su aracı içine çekilir ve hasar olabilir. </li></ol> 2. Gaz Kromatografisi-yüzey Akustik Dalga (GC-SAW) Set-up ve Veri Toplama <ol><li> ZNose uygun analiz yöntemi yükleyin. Kavun ester zengini uçucu profili analizi için, yazılım MicroSense versiyonu 5.44.22 (Newbury Park, CA, USA) bizim parametreleri şöyledir: içine tepe boşluğu emişpompası ile 30 mL dak -1 20 saniye boyunca giriş; giriş sıcaklığı 200 ° C; 225 Tenax tuzak ° C; 2.9 mL dk-1 taşıyıcı gaz (helyum saflık% 99.999) akış hızı; kolon (DB-5 45 sütun, 1 m × 0.25mm ID 0.25 mikron film kalınlığında) sıcaklık programı ° C ile 180 ° C 10 oranında ° C sn -1; 40 sensör sıcaklığı ° C, 165 ° C de kapak Toplam analiz süresi örnek başına 1 dakikadır. </li><li> ZNose girişine olmayan karot ucu ile bir paslanmaz çelik iğne bağlayın ve temel istikrarlı ve 200 Sayımlar daha büyük bir pik (Ct) tespit edilinceye kadar ortam havası ile sistemi birkaç kez temizleme. </li><li> Düz zincirli alkanlar (C6-C14) solüsyonu kullanılarak aleti ayarlamak. Tune sonucu Kovats Endeksi (KI) birimler halinde zaman birimlerinden Yıkanan tepe retansiyon süresi dönüştürmek için cihaz yazılım tarafından kullanılır. Sistem ayarlanmış sonra Sonuç olarak, tutma süreleri KI biriminde raporlanır. </li&gt; <li> Analizinden önce, Örnek 30 dakika boyunca dengelemek için olanak sağlar. Numune şişeleri biri analiz etmek için, basıncı rahatlatmak için flakon septum içine bir iğne takın. Sonra flakon septum içine enstrüman girişine bağlı iğne takın ve headspace örnekleme başlatabilir. Teknik analiz en az üç örnek başına çoğaltır. </li><li> Elle &quot;Play&quot; butonuna tıklayarak aracı başlatmak; pompanın çalıştığını ve kaçıyor buharlar örnek yukarıda sunuyoruz. Analiz sonunda, bir kromatogram ekranda görüntülenir ve sensör otomatik olarak temizlemek için 10 saniye için 150 ° C&#39;ye kadar ısıtılır. Sistem durumu kutusunda düğmesine tekrar yeşil yandığı zaman, cihaz başka bir numune analiz etmek için hazırdır. </li><li> Istikrarlı bir temel ve uygun sistem temizliği sağlamak için, her örnek arasında en az bir hava boş çalıştırın. Şişe ve kapak olası uçucu kirlenme izlemek için, günün başında ve sonunda, iki şişe-boşlukları (kapaklı boş tüp) analiz. &lt;/ Li&gt; </ol> 3. Veri Aktarma ve Analiz <ol><li> MicroSense yazılım &quot;Tepe günlüğünü&quot; işlevini kullanarak kazanılmasından sonra bir Microsoft excel dosyasına veri verir. Veri ihraç edildikten sonra, değişkenler ve çoğaltır için etiket içeren sütunlar ekleyin. </li><li> Komut biz &quot;reform_data.py&quot; (önce ve script &quot;reform_data kullandıktan sonra veri formatının bir örnek için bakınız Şekil 1 adlı geliştirdi; Python kullanarak daha kolay manipülasyon (serbestçe kullanılabilir on-line versiyonu 2.6) için veri formatını değiştirin. py &quot;). Veri girişi, hem de çıkış için istediğiniz dosya adını (xls formatında) için kaynak dosyası (xls formatında) ve sayfa adını adı, doğrudan komut dosyası düzenlenir. </li><li> &quot;Kim_interface.py&quot; (de Python 2.6 ile yazılmış; bkz. Şekil 2) başlatın ve önceki adımda oluşturulan dosyadan veri almak. Spesifik olarak, analiz, her Ki değeri tespit edildi kez görüntüleme ve sayısı analiz dayanmaktadır(&quot;KI hit&quot;). Böylece program her KI değeri için KI hits bir çubuk grafik görüntüler. </li><li> Teknik her grup bir araya çoğaltır analiz örneklerinin belirli altkümelerini KI hit değerlendirin. Bunu yapmak için, kontrol / ilgili kutulara unchecking tarafından ayrı ayrı her tedavi veya değişken analiz. Grafik kullanıcı arayüzü (GUI) özellikleri detaylı açıklaması için Şekil 2 başlığa bakın. </li><li> GUI kullanarak her KI pencerenin genişliğini belirledikten sonra, rastgele Microsense yazılım ilgili kromatogramlar bazı seçin ve teknik arasında doruklarına örtüşen çoğaltır değerlendirmek. Çoğaltır iki teknik overlaid kromatogramlar bir örnek için Şekil 3&#39;e bakın. </li><li> KI pencere bireyleşirler sonra, en kalabalık KI içine penceresinde düşmek KIS birleştirmek için GUI mevcut &#39;Birleştirme&#39; özelliğini kullanın. Bu özelliği kullanarak, KI bir değer aralığı ile etiketlenmiş zirveleri tek KI etiket, allowi altında konsolide edilirng tek bir değişken gibi zirveleri tedavi. Bunu yapmak için ilk özelliği etkinleştirmek için &#39;Birleştirme&#39; butonuna tıklayın ve ilgili çubuk sol-tıklayarak pencereyi merkezi olarak en kalabalık KI seçin. Çubuk seçildikten sonra, bu renk değiştirir ve yeşile döner. Seçilen KI içine penceresinde giren KIS birleştirmek için, ilgili çubukları üzerinde sağ tıklayın; ilgili uzunlukta bir mavi çubuk merkezi KI üstüne ilave edilirken, bu (Bkz: Şekil 4, bar kırmızı dönmesine neden olur ). Bir kez tüm seçilen KIS uygun merkezi KI içine birleştirilmiş, değişiklikleri kabul etmek için tekrar &#39;Birleştirme&#39; düğmesini tıklatın; bu sararmaya &#39;Birleştirme&#39; düğmesine neden olur. Hata durumunda, &#39;Ayırma&#39; düğmesini de mevcuttur. Çözebilirsiniz için, çözebilirsiniz istediğiniz kırmızı çubuğunda sağ tıklatın, GUI &#39;Ayırma&#39; düğmesini tıklatın. Kırmızı itibaren, çubuk mavi olur. Değişiklikleri kabul etmek için tekrar &#39;Ayırma&#39; düğmesini tıklayın. </li><li> Eğer ben bir denemencorrectly tek KI değer olarak tek bir örnek, iki tepe birleştirme, bir hata mesajı yazdırılır. Bu gibi durumlarda, yakından kromatogram kontrol edin ve bu bölgede KI penceresini yeniden tanımlıyor. </li><li> Sonra birleştirme işlemleri tüm yapılmıştır, dosyayı kaydedin. </li><li> Istatistiksel analiz geçmeden önce, hava ve flakon boşlukları kromatogramlar olası kontaminasyonların izlemek için analiz edilir. Boşlukları tepe KI tespit edildiğinde, örnek pikin alanında gelen hava ve / veya şişe-boş tespit pik alanı çıkarılır. Daha sonra istatistiksel analizler ile devam edin. </li></ol> 4. Temsilcisi Sonuçlar Elektronik burun, farklı olgunluk aşamalarında (Şekil 5) hasat kavun meyve arasında uçucu profilleri farklılıkları tespit etmeyi başardı. Yirmi KI pencereler tüm örnekler arasında belirlendi. Varyans analizi 14 zirveleri Dete olduğunu gösterdiolgunluk aşamaları arasında anlamlı farklılık elektronik burun tarafından cted. Şekil 6, bu 14 bileşenlerin ortalama pik alanlarının günlük erken olgun ve tam olgun meyve iki olgunluk aşamaları arasında pik bollukları farklılıkları göstermek için çizilir. <img alt="Şekil 1" src="/files/ftp_upload/3821/3821fig1.jpg" /> Şekil 1. Cihaz yazılımı (A) arasında ve dönüşümden sonra, &quot;reform_data.py&quot; komut dosyası (B) kullanılarak yapıldı. Ihraç veri formatı örnekleri Veri manipülasyonu ve analiz kolaylaştırmak için, bütün eşsiz KIS tüm örnekleri arasında tespit edilir, daha sonra veri satır ve eşsiz KIS tekabül kolonları, pik alanı örnek bilgiler ile birlikte tekrar sıralanır. Bir tepe bir numune bir Ki değeri için tespit değilse, karşılık gelen hücre boş kalır. <img alt="Şekil 2" src="/files/ftp_upload/3821/3821fig2.jpg" /> Kese Şekil 2&#39;de. Ekran yakalamat dosyası &quot;kim_interface.py&quot;. Merkezinde arsa KI karşı KI başına isabet sayısını gösterir. &#39;KI başına vur&#39; belirli KI ile pik tespit edildiği örneklerinin sayısıdır. Sol tarafta, seçilen veriler kontrol üç sarı kutu vardır. Bu veri seti (tedaviler, çoğaltır, nitel değişkenler, vb) bölmek için parametreleri görüntülemek. Bu şekilde, onlar (yukarıdan aşağıya) şunlardır: Hasatta Variety, Dikim tarih ve Olgunluk aşaması. Altta: 3 bar tıklayarak ve sola veya sağa doğru mavi çubuğunu taşıyarak, bir minimum ve KI aralığı ve minimum pik alanı (&#39;Eşik&#39;) maksimum değeri seçebilirsiniz. Sağda: &#39;Birleştirme&#39; düğmesine elle çizim çubukları tıklayarak seçilen KIS birleştirme sağlar. &#39;Ayırma&#39; düğmesini biri seçilmiş olgularda, süreci tersine sağlar. <img alt="Şekil 3" src="/files/ftp_upload/3821/3821fig3.jpg" /> Şekil 3. Overlaid kromatogramları (in<html> İki teknik siyah ve kırmızı) tutma süresi bir kayma göstermek için kavun uçucu tepe boşluğundan çoğaltır. <img alt="Şekil 4" src="/files/ftp_upload/3821/3821fig4.jpg" /> Şekil 4. Prosedürü birleştirme KI örneği. Merkezi arsa, yeşil bar (Merkez KI) KI pencerenin merkezi olarak seçilmiştir en kalabalık KI, temsil eder. KI KI X ve Y ilgi penceresinde düşen KIS ve bunlar merkezi KI birleştirilecek gerekir. KI X çubuğuna sağ tıklayarak, kırmızı olur ve, aynı zamanda, KI X çubuğu aynı uzunlukta, bir mavi çubuk yeşil birinin üzerinde görüntülenir. KI Y, mavi çubuğun uzunluğunun (birleştirilmiştir KIS) için aynı prosedür tekrar edilerek karşılık gelen uzunluğunun artacaktır. Bir kez tüm KIS yeşil &#39;Birleştirme&#39; düğmesine, birleştirme işlemi sona erer tıklayarak, eklenmiş, değişiklikler kaydedilir ve tuş rengi sarıya döner edilir. / Files/ftp_upload/3821/3821fig5.jpg &quot;/&gt; Şekil 5. Farklı olgunluk aşamalarında hasat edilen kavun örneklerin ikisi kromatogramları, erken olgun (üst) ve tam olgun (altta), uçucu bollukları farklılıkları tespit etmek için elektronik burun yeteneğini göstermek için. <img alt="Şekil 6" src="/files/ftp_upload/3821/3821fig6.jpg" /> Şekil 6. Erken olgun ve tam olgun iki farklı olgunluk aşamalarında, iki kavun numuneleri içinde bulunan 14 bileşenlerin pik alanı gösteren Radar arsa. Pik alanları karşılaştırma görselleştirmek yardımcı olmak için günlük ölçekli bildirilmektedir. Her bir ray sonunda numaraları karşılık gelen Kovats indisleri temsil eder.

<ol>
	<li>Kader, A. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Flavor+quality+of+fruits+and+vegetables.">Flavor quality of fruits and vegetables.</a> Journal of the Science of Food and Agriculture. 88, 1863-1868 (2008).</li><li>Persaud, K., Dodd, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analysis+of+discriminant+mechanisms+in+the+mammalian+olfactory+system+using+a+model+nose.">Analysis of discriminant mechanisms in the mammalian olfactory system using a model nose.</a> Nature. 299, 352-355 (1982).</li><li>Gardner, J. W., Bartlett, P. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+brief-history+of+electronic+noses.">A brief-history of electronic noses.</a> Sensors and Actuators. 18, 211-220 (1994).</li><li>Rock, F., Barsan, N., Weimar, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Electronic+nose:+Current+status+and+future+trends.">Electronic nose: Current status and future trends.</a> Chem. Rev. 108, 705-725 (2008).</li><li>Li, C., Heinemann, P. H., Irudayaraj, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+of+apple+deterioration+using+an+electronic+nose+and+zNose.">Detection of apple deterioration using an electronic nose and zNose.</a> Transactions of the Asabe. 50, 1417-1425 (2007).</li><li>Li, Z. F., Wang, N., Raghavan, G. S. V., Vigneault, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ripeness+and+rot+evaluation+of+'Tommy+Atkins'+mango+fruit+through+volatiles+detection.">Ripeness and rot evaluation of 'Tommy Atkins' mango fruit through volatiles detection.</a> J. Food Eng. 91, 319-324 (2009).</li><li>Oh, S. Y., Ko, J. W., Jeong, S. Y., Hong, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Application+and+exploration+of+fast+gas+chromatography-surface+acoustic+wave+sensor+to+the+analysis+of+thymus+species.">Application and exploration of fast gas chromatography-surface acoustic wave sensor to the analysis of thymus species.</a> J. Chromatogr. A. 1205, 117-127 (2008).</li><li>Watkins, P., Wijesundera, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Application+of+zNose+for+the+analysis+of+selected+grape+aroma+compounds.">Application of zNose for the analysis of selected grape aroma compounds.</a> Talanta. 70, 595-601 (2006).</li><li>Gan, H. L., Man, Y. B. C., Tan, C. P., NorAini, I., Nazimah, S. A. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterisation+of+vegetable+oils+by+surface+acoustic+wave+sensing+electronic+nose.">Characterisation of vegetable oils by surface acoustic wave sensing electronic nose.</a> Food Chem. 89, 507-518 (2005).</li><li>Marina, A. M., Man, Y. B. C., Amin, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Use+of+the+SAW+Sensor+Electronic+Nose+for+Detecting+the+Adulteration+of+Virgin+Coconut+Oil+with+RBD+Palm+Kernel+Olein.">Use of the SAW Sensor Electronic Nose for Detecting the Adulteration of Virgin Coconut Oil with RBD Palm Kernel Olein.</a> Journal of the American Oil Chemists Society. 87, 263-270 (2010).</li><li>Evans, M. B., Haken, J. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Recent+developments+in+the+gas-chromatographic+index+scheme.">Recent developments in the gas-chromatographic index scheme.</a> Journal of Chromatography. 472, 93-127 (1989).</li></ol>

Biz ifşa hiçbir şey yok.

Elektronik burunlar meyve veya uçucu zengin örneklerinden aroma profillerinin hızlı, objektif değerlendirme için umut verici bir yöntem temsil eder. Ancak, pik tanımlama için bir meydan okuma temsil eden ve iki kromatogramları mükemmel uyumlu olmadığı zaman verilerin yorumlanmasına yol olabilir tutma süresi içinde kaydırır. Kromatogramlar Görsel inceleme örnekleri arasında tutma sürelerinin değişkenliği sık biraz farklı KI değerleri (yaklaşık ± 10) ile etiketlenmesine aynı tepe neden olduğunu göstermiştir. Bu tespit benzersiz KIS abartılı bir numara çevrilir. (A) farklı bileşikler farklı olgunluk aşamalarında mevcut ve (b) teknik çoğaltır, iki bilgisayar tabanlı programlarda (veri işleme için rutinlerini içerir &quot;kim_merge.py&quot;, yaklaşık olarak aynı olduğu gerçekleri yararlanmak için seti ve bir grafik kullanıcı arayüzü (GUI) sağlar &quot;kim_interface.py&quot;) sistematik olarak geliştirilmiştirbüyük ölçüde, büyük veri kümeleri kromatogramı analiz için gerekli zamanı azaltarak, bir yarı-otomatik moda örnekleri karşılaştırın. Uygun olan yerlerde Bu programlar tek bir KI etiketi altında KI bir değer aralığı ile etiketlenmiş piklerin, konsolidasyon sağlar. Bu iki önemli amaca hizmet eder: (a) tek bir değişken gibi zirveleri tedavi etmek için bir istatistiksel analiz sağlar, ve (b) pik kimlik ve diğer sistemler ve yayınlanan değerleri ile karşılaştırıldığında kolaylaştırır. Burada sunulan Sonuçlar kavun örnekleri yeterli KI tanımlanması ile kombinasyon halinde zNose sistemi kullanılarak olgunluğa ve aroma profil dayalı ayırt kalabileceğini göstermiştir. Bu kalite kontrol programları için de kullanılıyor olabilir Uçucu maddelerin analizi için gelecek vaat eden yeni bir teknoloji temsil ediyor.

<table border="1"><tbody><tr><td> Reaktif Adı </td><td> Şirket </td><td> Katalog numarası </td><td> Yorumlar </td></tr><tr><td> Kalsiyum klorür </td><td> MP Biyomedikal </td><td> 195088 </td><td></td></tr><tr><td> 2-metilbutil isovalerate </td><td> SAFC Küresel </td><td> W350613 </td><td> ≥% 98, doğal, FCC </td></tr><tr><td> Metanol </td><td> Fisher Scientific </td><td> A411-4 </td><td></td></tr><tr><td> Flakon </td><td> Sigma / Supelco </td><td> SU860098 </td><td></td></tr><tr><td> Kapak </td><td> Sigma / Supelco </td><td> SU860101 </td><td></td></tr><tr><td> Laboratuvar blender </td><td> Waring Laboratuar Bilimi </td><td> 7009G </td><td> 2-hızlı blender; 1 - Litre cam kap </td></tr><tr><td> Şişe </td><td> Fisher Scientific </td><td> 06-414-1C </td><td> Pyrex, 500 mL; polipropilen plug-mühür </td></tr><tr><td> Iğne </td><td> Elektronik Sensör Teknolojisi </td><td> TLC101046 </td><td> Yan delik luer </td></tr><tr><td> Alkanlar çözüm </td><td> Elektronik Sensör Teknolojisi </td><td></td><td> Metanol içinde C6-C14 alkanlar solüsyonu </td></tr><tr><td> zNose </td><td> Elektronik Sensör Teknolojisi </td><td> Model 4500 </td><td></td></tr><tr><td> DB-5 GC </td><td> Elektronik Sensör Teknolojisi </td><td> SYS4500C5 </td><td></td></tr><tr><td> MicroSense </td><td> Elektronik Sensör Teknolojisi </td><td> Sürüm 5.44.22 </td><td></td></tr><tr><td> Python 2.6 </td><td></td><td></td><td> Serbestçe kullanılabilir on-line </td></tr><tr><td> &quot;Reform_data.py&quot; ve &quot;kim_interface.py&quot; komut</td><td></td><td></td><td> Vallahi üzerine ek malzeme olarak kullanılabilir Scripts </td></tr></tbody></table>

fruit volatile analysis using an electronic nose

Çok sayıda ve çeşitli fizyolojik değişiklikler meyve aromalı karakterize, belirli bir uçucu karışımı geliştirilmesi dahil olmak üzere meyve olgunlaşması sırasında meydana gelir. Hasatta Vade meyve ve sebzeler 1 lezzet kalitesini etkileyen önemli faktörlerden biridir. Hızla meyve olgunluğunu değerlendirmek ve aroma kalitesini ileri yetiştirme programları, üretim uygulamaları ve hasat sonrası işleme geliştirilmiş yönetim sağlayacak sağlam yöntemlerden doğrulama. Son üç yılda, çok araştırma hızla tat ve kokudan 2-4 tespit edebiliyoruz cihazlardır sözde elektronik burun, geliştirmek için yapılmıştır. Şu anda, farklı teknolojiler dayanan uçucu analizi, yapabilen bir çok piyasada mevcut elektronik burun vardır. (ZNose, EST, Newbury Park, CA, USA) işimizde kullanılan elektronik burun, (bir yüzey akustik dalga sensörü ile birlikte ultra-hızlı gaz kromatografisi oluşur UFGC-) SAW. Mango 6 olgunluk ve çürüme değerlendirilmesi;; Bu teknoloji zaten elma 5 bozulma tespiti gibi çeşitli ürünlerin, kalite kontrol kabiliyetini test edilmiştir timus türlerin aroması profilleme 7; üzüm meyveleri 8 C 6 uçucu bileşikler; karakterizasyonu bitkisel yağ 9 ve virgin hindistan cevizi yağı 10 tağşiş tespiti. Headspace örnekleme, uçucu bileşiklerin ayrılması ve algılama: Bu sistem, aroma analizi üç temel adımları gerçekleştirebilirsiniz. Yaklaşık bir dakika sonra, çıkış, bir kromatogramıdır, bir temizleme döngüsünden sonra, cihazın daha fazla analiz için hazırdır, üretilen ve edilir. ZNose ile elde edilen sonuçlar Kovats Endeksleri (KI) hesaplanması ile diğer gaz-kromatografik sistemlerin kıyasla edilebilir. Cihaz, bir alkan standart çözelti ile ayarlanmış edildikten sonra, tutma süreleri otomatik olarak dönüştürülürKIS. Ancak, sıcaklık ve debisi küçük değişiklikler saklama süreleri sürüklenmeye neden, zaman içinde ortaya çıkması bekleniyor. Ayrıca, sabit faz sütunu polaritesi bağlı olarak, KI hesaplamalar tekrarlanabilirliği birkaç birim 11 tarafından indeksi olarak değişebilir. Programlar ve grafik arayüzleri bir dizi nedenle yarı-otomatik moda örnekleri arasında hesaplanan KIS karşılaştırmak için geliştirilmiştir. Bu programlar, büyük veri kümeleri kromatogramı analiz için gerekli zamanı azaltmak ve kromatogramlar mükemmel hizada olmayan verilerin yanlış yorumlanmasından potansiyelini en aza indirmek. Biz meyve hızlı uçucu bileşik analizi için bir yöntem sunuyoruz. Örnek hazırlama, veri toplama ve işleme işlemleri de tartışılmıştır.

Watch this Scientific Journal Video about Fruit Volatile Analysis Using an Electronic Nose at JoVE.com

Fruit Volatile Analysis Using an Electronic Nose

Meyve uçucu bileşik analizi için hızlı bir yöntem tarif edilmiştir. Numunenin bir Homojenizasyondan tepe boşluğu içinde mevcut uçucu bileşikler hızla ayrılmış ve bir yüzey akustik dalga (SAW) sensörü ile birlikte son derece hızlı gaz kromatografisi (GC) ile tespit edilir. Veri işleme ve analiz için bir prosedür de tartışılmıştır.

Elektronik Burun kullanarak Meyve Uçucu Analizi

Numerous and diverse physiological changes occur during fruit ripening, including the development of a specific volatile blend that characterizes fruit ...

fruit-volatile-analysis-using-an-electronic-nose

Research

JoVE Journal

Biology

21.2K Görüntüleme.  University of California, Davis. Meyve uçucu bileşik analizi için hızlı bir yöntem tarif edilmiştir. Numunenin bir Homojenizasyondan tepe boşluğu içinde mevcut uçucu bileşikler hızla ayrılmış ve bir yüzey akustik dalga (SAW) sensörü ile birlikte son derece hızlı gaz kromatografisi (GC) ile tespit edilir. Veri işleme ve analiz için bir prosedür de tartışılmıştır.

Video: Fruit Volatile Analysis Using an Electronic Nose

Studying Aggression in Drosophila (fruit flies)

Aggression is an innate behavior that evolved in the framework of defending or obtaining resources. This complex social behavior is influenced by genetic, hormonal and environmental factors. In many organisms, aggression is critical to survival but controlling and suppressing aggression in distinct contexts also has become increasingly important. In recent years, invertebrates have become increasingly useful as model systems for investigating the genetic and systems biological basis of complex social behavior. This is in part due to the diverse repertoire of behaviors exhibited by these organisms. In the accompanying video, we outline a method for analyzing aggression in Drosophila whose design encompasses important eco-ethological constraints. Details include steps for: making a fighting chamber; isolating and painting flies; adding flies to the fight chamber; and video taping fights. This approach is currently being used to identify candidate genes important in aggression and in elaborating the neuronal circuitry that underlies the output of aggression and other social behaviors.

Studying Aggression in Drosophila fruit flies

Drosophila (meyve sineği) Saldırganlık incelenmesi

Aggression is an innate behavior that evolved in the framework of defending or obtaining resources.  This complex social behavior is influenced by ...

Biyoloji

Homemade Site Directed Mutagenesis of Whole Plasmids

Site directed mutagenesis of whole plasmids is a simple way to create slightly different variations of an original plasmid. With this method the cloned target gene can be altered by substitution, deletion or insertion of a few bases directly into a plasmid. It works by simply amplifying the whole plasmid, in a non PCR-based thermocycling reaction. During the reaction mutagenic primers, carrying the desired mutation, are integrated into the newly synthesized plasmid. In this video tutorial we demonstrate an easy and cost effective way to introduce base substitutions into a plasmid. The protocol works with standard reagents and is independent from commercial kits, which often are very expensive. Applying this protocol can reduce the total cost of a reaction to an eighth of what it costs using some of the commercial kits. In this video we also comment on critical steps during the process and give detailed instructions on how to design the mutagenic primers.

Site directed mutagenesis of whole plasmids is a simple way to create slightly different variations of an original plasmid. Here we demonstrate an easy and cost effective way to introduce base substitutions into a plasmid using standard reagents.

Tüm Plazmidler Homemade Sitesi Yönetmen Mutagenez

Site directed mutagenesis of whole plasmids is a simple way to create slightly different variations of an original plasmid. With this method the cloned ...

A Neuronal and Astrocyte Co-Culture Assay for High Content Analysis of Neurotoxicity

High Content Analysis (HCA) assays combine cells and detection reagents with automated imaging and powerful image analysis algorithms, allowing measurement of multiple cellular phenotypes within a single assay. In this study, we utilized HCA to develop a novel assay for neurotoxicity. Neurotoxicity assessment represents an important part of drug safety evaluation, as well as being a significant focus of environmental protection efforts. Additionally, neurotoxicity is also a well-accepted in vitro marker of the development of neurodegenerative diseases such as Alzheimer's and Parkinson's diseases. Recently, the application of HCA to neuronal screening has been reported. By labeling neuronal cells with &beta;III-tubulin, HCA assays can provide high-throughput, non-subjective, quantitative measurements of parameters such as neuronal number, neurite count and neurite length, all of which can indicate neurotoxic effects. However, the role of astrocytes remains unexplored in these models. Astrocytes have an integral role in the maintenance of central nervous system (CNS) homeostasis, and are associated with both neuroprotection and neurodegradation when they are activated in response to toxic substances or disease states. GFAP is an intermediate filament protein expressed predominantly in the astrocytes of the CNS. Astrocytic activation (gliosis) leads to the upregulation of GFAP, commonly accompanied by astrocyte proliferation and hypertrophy. This process of reactive gliosis has been proposed as an early marker of damage to the nervous system. The traditional method for GFAP quantitation is by immunoassay. This approach is limited by an inability to provide information on cellular localization, morphology and cell number. We determined that HCA could be used to overcome these limitations and to simultaneously measure multiple features associated with gliosis - changes in GFAP expression, astrocyte hypertrophy, and astrocyte proliferation - within a single assay. In co-culture studies, astrocytes have been shown to protect neurons against several types of toxic insult and to critically influence neuronal survival. Recent studies have suggested that the use of astrocytes in an in vitro neurotoxicity test system may prove more relevant to human CNS structure and function than neuronal cells alone. Accordingly, we have developed an HCA assay for co-culture of neurons and astrocytes, comprised of protocols and validated, target-specific detection reagents for profiling &beta;III-tubulin and glial fibrillary acidic protein (GFAP). This assay enables simultaneous analysis of neurotoxicity, neurite outgrowth, gliosis, neuronal and astrocytic morphology and neuronal and astrocytic development in a wide variety of cellular models, representing a novel, non-subjective, high-throughput assay for neurotoxicity assessment. The assay holds great potential for enhanced detection of neurotoxicity and improved productivity in neuroscience research and drug discovery.

This article describes a novel protocol and reagent set designed for sensitive measurement of neurotoxic effects of compounds and treatments on co-cultures of neurons and astrocytes using high content analysis. Results demonstrate that high content analysis represents an exciting novel technology for neurotoxicity assessment.

Nörotoksisite Yüksek İçerik Analizi Nöronal ve Astrosit Hücre Co-Kültür Testi

High Content Analysis (HCA) assays combine cells and detection reagents with automated imaging and powerful image analysis algorithms, allowing ...

An Optimized Protocol for Rearing Fopius arisanus, a Parasitoid of Tephritid Fruit Flies

Fopius arisanus (Sonan) is an important parasitoid of Tephritid fruit flies for at least two reasons. First, it is the one of only three opiine parasitoids known to infect the host during the egg stage1. Second, it has a wide range of potential fruit fly hosts. Perhaps due to its life history, F. arisanus has been a successfully used for biological control of fruit flies in multiple tropical regions2-4. One impediment to the wide use of F. arisanus for fruit fly control is that it is difficult to establish a stable laboratory colony5-9. Despite this difficulty, in the 1990s USDA researchers developed a reliable method to maintain laboratory populations of F. arisanus10-12. There is significant interest in F. arisanus biology13,14, especially regarding its ability to colonize a wide variety of Tephritid hosts14-17; interest is especially driven by the alarming spread of Bactrocera fruit fly pests to new continents in the last decade18. Further research on F. arisanus and additional deployments of this species as a biological control agent will benefit from optimizations and improvements of rearing methods. In this protocol and associated video article we describe an optimized method for rearing F. arisanus based on a previously described approach12. The method we describe here allows rearing of F. arisanus in a small scale without the use of fruit, using materials available in tropical regions around the world and with relatively low manual labor requirements.

An Optimized Protocol for Rearing Fopius arisanus, a Parasitoid of Tephritid Fruit Flies

Fopius arisanus is an egg-larval parasitoid of Tephritid fruit flies that is successfully used in biological control of these important tropical pests. We describe here an optimized protocol for rearing F. arisanus on a small scale using readily available materials.

Yetiştirilmesi için Optimum Protokol Fopius arisanus Tephritid Meyve bir parazitoit Sinekler

Fopius arisanus (Sonan) is an important parasitoid of Tephritid fruit flies for at least two reasons. First, it is the one of only three opiine ...

Isolation and Biophysical Study of Fruit Cuticles

The cuticle, a hydrophobic protective layer on the aerial parts of terrestrial plants, functions as a versatile defensive barrier to various biotic and abiotic stresses and also regulates water flow from the external environment.1 A biopolyester (cutin) and long-chain fatty acids (waxes) form the principal structural framework of the cuticle; the functional integrity of the cuticular layer depends on the outer 'epicuticular' layer as well as the blend consisting of the cutin biopolymer and 'intracuticular' waxes.2 Herein, we describe a comprehensive protocol to extract waxes exhaustively from commercial tomato (Solanum lycopersicum) fruit cuticles or to remove epicuticular and intracuticular waxes sequentially and selectively from the cuticle composite. The method of Jetter and Sch&auml;ffer (2001) was adapted for the stepwise extraction of epicuticular and intracuticular waxes from the fruit cuticle.3,4 To monitor the process of sequential wax removal, solid-state cross-polarization magic-angle-spinning (CPMAS) 13C NMR spectroscopy was used in parallel with atomic force microscopy (AFM), providing molecular-level structural profiles of the bulk materials complemented by information on the microscale topography and roughness of the cuticular surfaces. To evaluate the cross-linking capabilities of dewaxed cuticles from cultivated wild-type and single-gene mutant tomato fruits, MAS 13C NMR was used to compare the relative proportions of oxygenated aliphatic (CHO and CH2O) chemical moieties.
Exhaustive dewaxing by stepwise Soxhlet extraction with a panel of solvents of varying polarity provides an effective means to isolate wax moieties based on the hydrophobic characteristics of their aliphatic and aromatic constituents, while preserving the chemical structure of the cutin biopolyester. The mechanical extraction of epicuticular waxes and selective removal of intracuticular waxes, when monitored by complementary physical methodologies, provides an unprecedented means to investigate the cuticle assembly: this approach reveals the supramolecular organization and structural integration of various types of waxes, the architecture of the cutin-wax matrix, and the chemical composition of each constituent. In addition, solid-state 13C NMR reveals differences in the relative numbers of CHO and CH2O chemical moieties for wild-type and mutant red ripe tomato fruits. The NMR techniques offer exceptional tools to fingerprint the molecular structure of cuticular materials that are insoluble, amorphous, and chemically heterogeneous. As a noninvasive surface-selective imaging technique, AFM furnishes an effective and direct means to probe the structural organization of the cuticular assembly on the nm-&mu;m length scale.

Aerial plant organs are protected by the cuticle, a supramolecular biopolyester-wax assembly. We present protocols to monitor selective removal of epi- and intracuticular waxes from tomato fruit cuticles on molecular and micro scales by solid-state NMR and atomic force microscopy, respectively, and to assess the cross-linking capacity of engineered cuticular biopolyesters.

İzolasyon ve Meyve cuticles biyofiziksel Çalışması

The cuticle, a hydrophobic protective layer on the aerial parts of terrestrial plants, functions as a versatile defensive barrier to various biotic and ...

Analysis of SNARE-mediated Membrane Fusion Using an Enzymatic Cell Fusion Assay

The interactions of SNARE (soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptor) proteins on vesicles (v-SNAREs) and on target membranes (t-SNAREs) catalyze intracellular vesicle fusion1-4. Reconstitution assays are essential for dissecting the mechanism and regulation of SNARE-mediated membrane fusion5. In a cell fusion assay6,7, SNARE proteins are expressed ectopically at the cell surface. These "flipped" SNARE proteins drive cell-cell fusion, demonstrating that SNAREs are sufficient to fuse cellular membranes. Because the cell fusion assay is based on microscopic analysis, it is less efficient when used to analyze multiple v- and t-SNARE interactions quantitatively.
Here we describe a new assay8 that quantifies SNARE-mediated cell fusion events by activated expression of &beta;-galactosidase. Two components of the Tet-Off gene expression system9 are used as a readout system: the tetracycline-controlled transactivator (tTA) and a reporter plasmid that encodes the LacZ gene under control of the tetracycline-response element (TRE-LacZ). We transfect tTA into COS-7 cells that express flipped v-SNARE proteins at the cell surface (v-cells) and transfect TRE-LacZ into COS-7 cells that express flipped t-SNARE proteins at the cell surface (t-cells). SNARE-dependent fusion of the v- and t-cells results in the binding of tTA to TRE, the transcriptional activation of LacZ and expression of &beta;-galactosidase. The activity of &beta;-galactosidase is quantified using a colorimetric method by absorbance at 420 nm.
The vesicle-associated membrane proteins (VAMPs) are v-SNAREs that reside in various post-Golgi vesicular compartments10-15. By expressing VAMPs 1, 3, 4, 5, 7 and 8 at the same level, we compare their membrane fusion activities using the enzymatic cell fusion assay. Based on spectrometric measurement, this assay offers a quantitative approach for analyzing SNARE-mediated membrane fusion and for high-throughput studies.

We have developed a cell fusion assay that quantifies SNARE-mediated membrane fusion events by activated expression of &beta;-galactosidase.

Enzimatik bir hücre füzyon deneyi kullanılarak SNARE-aracılı membran füzyon analizi

The interactions of SNARE (soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptor)  proteins on vesicles (v-SNAREs) and on target membranes ...

Laboratory Protocol for Genetic Gut Content Analyses of Aquatic Macroinvertebrates Using Group-specific rDNA Primers

Analyzing food webs is essential for a better understanding of ecosystems. For example, food web interactions can undergo severe changes caused by the invasion of non-indigenous species. However, an exact identification of field predator-prey interactions is difficult in many cases. These analyses are often based on a visual evaluation of gut content or the analysis of stable isotope ratios (&#948;15N and &#948;13C). Such methods require comprehensive knowledge about, respectively, morphologic diversity or isotopic signature from individual prey organisms, leading to obstacles in the exact identification of prey organisms. Visual gut content analyses especially underestimate soft bodied prey organisms, because maceration, ingestion and digestion of prey organisms make identification of specific species difficult. Hence, polymerase chain reaction (PCR) based strategies, for example the use of group-specific primer sets, provide a powerful tool for the investigation of food web interactions. Here, we describe detailed protocols to investigate the gut contents of macroinvertebrate consumers from the field using group-specific primer sets for nuclear ribosomal deoxyribonucleic acid (rDNA). DNA can be extracted either from whole specimens (in the case of small taxa) or out of gut contents of specimens collected in the field. Presence and functional efficiency of the DNA templates need to be confirmed directly from the tested individual using universal primer sets targeting the respective subunit of DNA. We also demonstrate that consumed prey can be determined further down to species level via PCR with unmodified group-specific primers combined with subsequent single strand conformation polymorphism (SSCP) analyses using polyacrylamide gels. Furthermore, we show that the use of different fluorescent dyes as labels enables parallel screening for DNA fragments of different prey groups from multiple gut content samples via automated fragment analysis.

Most common gut content analyses of macroinvertebrates are visual. Requiring intense knowledge about morphological diversity of prey organisms, they miss soft bodied prey and, due to strong comminution of prey, are nearly impossible for some organisms, including amphipods. We provide detailed, novel genetic approaches for macroinvertebrate prey identification in the diet of amphipods.

Su Macroinvertebrates kullanma gruba özel rDNA astar genetik Gut içerik analizleri için laboratuvar iletişim kuralı

Analyzing food webs is essential for a better understanding of ecosystems. For example, food web interactions can undergo severe changes caused by the ...

Simple Homemade Tools to Handle Fruit Flies&#8212;Drosophila melanogaster

The fruit fly, Drosophila melanogaster, is widely used both in biological research and biology education. Handling adult flies is common but difficult in practice, as adult flies fly. Demonstrated here is how to make some simple and cost-effective tools to address difficult issues in the handling of Drosophila. Holes in foam stoppers are made and pipette tips or funnels are inserted into the holes. Flies then move only in one direction into the pipette tip/funnel assemblage, allowing efficient control of the transfer of adult Drosophila into or out of a vial. Existing protocols have been modified for cool-anesthetizing flies by chilling in crushed ice and transferring them onto a cold, hard icepack surface. The icepack is covered with a piece of medical gauze that keeps immobilized flies from the condensed water when examined under a stereomicroscope. The flies are finally euthanized for counting and sorting or discarded by microwaving. A bottle-shaped cage has also been developed for collecting eggs, as well as a labor-saving device and accompanying protocol for cleaning glass culture vials.

Described here is the use of several homemade tools to transfer, chill, and kill adult Drosophila, as well as to clean glass culture vials and collect eggs. These tools are easy to make and are rather efficient in handling Drosophila.

Meyve sinekleri Işlemek için basit ev yapımı Araçlar-Drosophila melanogaster

The fruit fly, Drosophila melanogaster, is widely used both in biological research and biology education. Handling adult flies is common but difficult in ...

Topical Application Bioassay to Quantify Insecticide Toxicity for Mosquitoes and Fruit Flies

The continued use of insecticides for public health and agriculture has led to widespread insecticide resistance and hampering of control methods. Insecticide resistance surveillance of mosquito populations is typically done through Centers for Disease Control and Prevention (CDC) bottle bioassays or World Health Organization (WHO) tube tests. However, these methods can result in a high degree of variability in mortality data due to variable insecticide contact with&#160;the insect, the relatively small numbers of organisms tested, extensive variation in mass between populations, and constantly changing environmental conditions, leading to variable outcomes. This paper presents the topical application bioassay, adapted as a high-throughput phenotypic bioassay for both mosquitoes and fruit flies, to test large numbers of insects along&#160;a range of insecticide concentrations.
This assay 1) ensures consistent treatment and insecticide contact with every organism, 2) produces highly specific dose-response curves that account for differences in average mass between strains and sexes (which is particularly important for field-collected organisms), and 3) allows for the calculation of statistically rigorous median lethal doses (LD50), which are necessary for resistance ratio comparisons-an alternative surveillance approach from diagnostic dose mortality, which is also used for larvicide resistance surveillance. This assay will be a complementary tool for accurately phenotyping mosquito populations and, as illustrated using fruit flies, is easily adaptable for use with other insects. We argue that this assay will help fill the gap between genotypic and phenotypic insecticide resistance in multiple insect species.

We describe the methodology and importance of the topical application bioassay to measure insecticide susceptibility in mosquitoes and fruit flies. The presented assay is high-throughput, utilizes insect mass-thus allowing for calculating a mass-relativized lethal dose instead of concentration-and likely has lower variability than other similar methods.

Sivrisinekler ve Meyve Sinekleri için İnsektisit Toksisitesini Ölçmek için Topikal Uygulama Biyotahlili

The continued use of insecticides for public health and agriculture has led to widespread insecticide resistance and hampering of control methods. ...

Protocols for CRISPR/Cas9 Mutagenesis of the Oriental Fruit Fly Bactrocera dorsalis

The Oriental fruit fly, Bactrocera dorsalis, is a highly invasive and adaptive pest species that causes damage to citrus and over 150 other fruit crops worldwide. Since adult fruit flies have great flight capacity and females lay their eggs under the skins of fruit, insecticides requiring direct contact with the pest usually perform poorly in the field. With the development of molecular biological tools and high-throughput sequencing technology, many scientists are attempting to develop environmentally friendly pest management strategies. These include RNAi or gene editing-based pesticides that downregulate or silence genes (molecular targets), such as olfactory genes involved in searching behavior, in various insect pests. To adapt these strategies for Oriental fruit fly control, effective methods for functional gene research are needed. Genes with critical functions in the survival and reproduction of B. dorsalis serve as good molecular targets for gene knockdown and/or silencing. The CRISPR/Cas9 system is a reliable technique used for gene editing, especially in insects. This paper presents a systematic method for CRISPR/Cas9 mutagenesis of B. dorsalis, including the design and synthesis of guide RNAs, collecting embryos, embryo injection, insect rearing, and mutant screening. These protocols will serve as a useful guide for generating mutant flies for researchers interested in functional gene studies in B. dorsalis.

Protocols for CRISPR/Cas9 Mutagenesis of the Oriental Fruit Fly Bactrocera dorsalis

This paper presents the step-by-step protocols for CRISPR/Cas9 mutagenesis of the Oriental fruit fly Bactrocera dorsalis. Detailed steps provided by this standardized protocol will serve as a useful guide for generating mutant flies for functional gene studies in B. dorsalis.

CRISPR / Cas9 Oryantal Meyve Sineği Bactrocera dorsalis'in mutagenezi için protokoller

The Oriental fruit fly, Bactrocera dorsalis, is a highly invasive and adaptive pest species that causes damage to citrus and over 150 other fruit crops ...