Bu protokol, kimerik kodlamayan RNA-hedef RNA etkileşimlerinden elde edilen yüksek verimli dizileme verilerini analiz etmek için tasarlanmış bir hesaplama ardışık düzeninin kullanımı için kurulum ve pratik adımları kapsar. Kimerik RNA'ları oluşturmak için moleküler strateji, genom çapında kodlamayan RNA-hedef RNA-etkileşim ortamını açık bir şekilde anlamada önceki biyokromatik tahmin araçlarına kıyasla avantajlara sahip nispeten yeni bir gelişmedir. Kimerik RNA'ların yüksek verimli diziliminden elde edilen verilerin dizilenmesi, bu stratejinin yeni uygulayıcıları için bir analiz zorluğu sunabilir.
Giriş seviyesindeki kullanıcıların kimerik kodlamayan RNA hedef RNA dizileme deneylerinden elde edilen verileri analiz etmelerine olanak sağlamak için yüksek açıklamalı açık kaynaklı bir çapraz platform hesaplama hattı oluşturduk. Gelecekteki deneylerde, Mefford laboratuvarı, memeli sinir sistemindeki transkripsiyon sonrası düzenlemeye yönelik devam eden araştırmalarımızdan elde edilen veri kümesi üzerinde hurda ile hesaplama analizini kullanmayı ve GitHub'ımızda bir güncelleme hurdası tutmayı planlıyor.
