Laboratuvar araştırmamızın kapsamı, bağırsak mikrobiyomu ile akciğer dokuları arasındaki iletişimi ve bağırsak mikrobiyomunun bileşenlerinin akciğer bağışıklık ve inflamatuar yanıtlarını doğrudan nasıl etkileyebileceğini anlamaktır. Spesifik metabolitlerin, yani kısa zincirli yağ asitlerinin etkilerine odaklanıyoruz. Asetat, propiyonat ve bütirat gibi kısa zincirli yağ asitlerinin, deneysel farelerde çeşitli hastalık süreçlerini etkilemede rolleri olduğu gösterilmiştir.
Bunlar arasında tip 2 diyabette lipid metabolizması, polikondrit, patolojik kemik kaybı, alerjik astım ve kan-beyin bariyeri geçirgenliği bulunur. Kısa zincirli yağ asidi konsantrasyonlarının ölçümü, farelerden atılan dışkı peletlerinde en uygun olanıdır. Bununla birlikte, bu dışkı kısa zincirli yağ asidi seviyeleri, in vivo, kolonda mevcut olanlara ve daha da önemlisi konak dolaşımına iletilenlere güvenilir bir şekilde karşılık gelmez.
Portal kanda ölçülen kısa zincirli yağ asitleri ve diğer metabolitlerin seviyelerinin, dışkı örneklerinden ölçülenlere kıyasla in vivo konsantrasyonlardaki kararlı durumu daha doğru bir şekilde yansıtacağına inanıyoruz. Portal venin hepatik hilus yakınında bağlanması, portal venin boyutlarını genişletebilir ve böylece başarı oranını önemli ölçüde artırabilir ve toplanabilecek maksimum kan hacmini artırabilir.