Lo scopo della nostra ricerca di laboratorio è comprendere la comunicazione tra il microbioma intestinale e i tessuti polmonari e come i componenti del microbioma intestinale possono influenzare direttamente le risposte immunitarie e infiammatorie polmonari. Ci concentriamo sugli effetti di metaboliti specifici, vale a dire gli acidi grassi a catena corta. Gli acidi grassi a catena corta come l'acetato, il propionato e il butirrato sono stati implicati nell'influenzare diversi processi patologici nei topi sperimentali.
Questi includono il metabolismo dei lipidi nel diabete di tipo 2, la policondrite, la perdita ossea patologica, l'asma allergico e la permeabilità della barriera emato-encefalica. La misurazione delle concentrazioni di acidi grassi a catena corta è più conveniente nei pellet fecali espulsi dai topi. Tuttavia, questi livelli di acidi grassi a catena corta fecale non corrispondono in modo affidabile a ciò che è presente in vivo, nel colon e, soprattutto, a ciò che viene trasmesso nella circolazione dell'ospite.
Riteniamo che i livelli di acidi grassi a catena corta e di altri metaboliti misurati all'interno del sangue portale riflettano in modo più accurato le concentrazioni allo stato stazionario in vivo rispetto a quelle misurate da campioni fecali. Legare la vena porta vicino all'ilo epatico può espandere le dimensioni della vena porta e quindi migliorare significativamente il tasso di successo, oltre ad aumentare il volume massimo di sangue che può essere raccolto.