Method Article
الزمانية والمكانية تحليل التعبير الجيني لها دور حاسم في علم الجينوم وظيفي. كل جبل تهجين في الموقع هو مفيد لتحديد توطين النصوص داخل أنسجة ومقصورات التحت خلوية. نحن هنا الخطوط العريضة لتهجين في الموقع بروتوكول مع بعض التعديلات لالأنسجة المستهدفة المحددة في البعوض.
البعوض الناقل لمجموعة متنوعة من مسببات الأمراض بما في ذلك arboviruses، طفيليات الأوالي والديدان الخيطية. تحقيق النصوص والمنظمين الجينات التي يتم التعبير عنها في الأنسجة التي المضيف البعوض وتتفاعل العوامل المسببة للأمراض، والأجهزة المعنية في استنساخ ذات أهمية كبيرة لوضع استراتيجيات للحد من ينقله البعوض وانتقال المرض وعرقلة التنمية البيض. وقد تم استخدام عدد من الأدوات اللازمة لدراسة والتحقق من صحة تنظيم الزمنية وأنسجة محددة في التعبير الجيني. هنا، نحن تصف البروتوكولات التي وضعت للحصول على المعلومات المكانية، والتي تعزز فهمنا لل، حيث يتم التعبير عن جينات معينة وتتراكم منتجاتها. وقد تم استخدام بروتوكول للتحقق من صحة وصف التعبير وتحديد أنماط تراكم من النصوص في الأنسجة المتصلة الذي ينقله البعوض ناقل للمرض، مثل الغدد اللعابية للإناث، وكذلك المقصورات التحت خلوية من المبيض والأجنة، والتي أعيدفي وقت متأخر لتكاثر البعوض والتنمية.
الإجراءات التالية تمثل المنهجية الأمثل أن يحسن كفاءة مختلف الخطوات في هذا البروتوكول من دون خسارة للإشارات تهجين هدف محدد. المبادئ التوجيهية لإعداد مسبار الحمض النووي الريبي، وصفت تشريح الأنسجة الرخوة وإجراءات عامة لتثبيت والتهجين في الجزء ألف، في حين ترد تفاصيل الخطوات المحددة لجمع وتثبيت، قبل التهجين والتهجين للأجنة البعوض في الجزء باء.
A. التهجين في الموقع لالأنسجة الرخوة: الغدد اللعابية والمبايض البعوضة
وترد وصفات لحلول والمخازن اللازمة لأغراض الاجراءات التالية في الجدول رقم 1.
1. الحمض النووي الريبي التحقيق إعداد وتحليل نوعية
2. تشريح الغدد اللعابية والمبايض البعوضة
3. تثبيت
4. تهجين
5. ريبونوكلياز والعلاج
6. الأجسام المضادة الحضانة
7. فسفاتاز قلوية تلطيخ
8. الجلسرين تركيب
B. التهجين في الموقع لأجنة البعوضة
يتم وصف الحلول والمخازن اللازمة لتهجين في الموضع الطبيعي للأجنة البعوض (جدول 1). تم تعديل وتثبيت تهجين الإجراءات المعروضة هنا من thosه أول تقرير عن أنوفيليس غامبياي، 5،6 الزاعجة المصرية (7) والخماسية الكيولكس. 8
1. جنين مجموعة
2. Dechorionation، التثبيت، وEndochoriعلى التعطيل
3. تقشير
4. توضيح من المح
5. تثبيت والتهجين في الموقع
تثبيت والتهجين في الموضع إجراءات مماثلة لتلك التي وصفها في بروتوكول القسم A.
الممثل جيم النتائج
وصف التهجين في بروتوكول الموقع هنا، والنتائج في أنماط تلطيخ الملونة التي تشير إلى وجود وتوطين مرنا المستهدفة. من المهم التأكيد على أنه لا يمكن المستويات النسبية من وفرة نص تحددها التهجين في الموقع. نتائج تهجين تعتمد على لجنة التحقيق مرنا المحددة المستخدمة لإجراء التهجين، وفرة من الهدف مرنا في النسيج المهجنة، فضلا عن تركيز التحقيق ودرجة الحرارة التهجين. مقارنة بين الأنسجة تهجين مع العقاقير وما يقابلها من تحقيقات مرنا بمعنى تجعل من الممكن تفسير دقيق لأنماط تلطيخ.
التهجين في الموقع من كل جبل الغدد اللعابية للبعوض الزاعجة الإناث مع تحقيقات مرنا أن amylase1 الهدف (AAEL006719)، D7s2 (AAEL006423)، وD7L2 (AAEL006424) إلى تراكم هذه النصوص في القريب الاطراف، الاطراف البعيدة، والبعيدة، الفص الجانبي / وسطي، على التوالي (الشكل 8). تم تهجين الجامعة 1 جبل المبيض من أنواع البعوض الثلاثة مع تحقيقات مرنا التي تستهدف على وجه التحديد للنصوص المعنية orthologous من أوسكار (الشكل 9). 7،8 التهجين في الموقع من كل جبل الأجنة من AE. بعوض، وهي. الغامبية و Cx. تم تنفيذ الخماسية باستخدام العقاقير تحقيقات الحمض النووي الريبي استهداف أوسكار البعوض النصوص orthologous منهما (الشكل 10). 7،8
igure 1 "SRC =" / files/ftp_upload/3709/3709fig1.jpg "/>
الشكل 1. رسم تخطيطي للتهجين ما بعد تصاعد مجموعة المتابعة.
الشكل 2. إعداد ممسحة Kimwipe التي استخدمت خلال عينة في تصاعد مستمر. والملتوية والأنسجة Kimwipe بإحكام لإنتاج ممسحة غرامة ذات الرؤوس لامتصاص فائض متوسطة متزايدة من العينات والشرائح.
الشكل 3. التخطيطي من dechorionation Saatilene شبكة أنبوب الصيد. A) هو قطع الجزء السفلي من أنبوب مل البوليسترين 50 مخروطي من أن تسفر عن أنبوب مجوف 4.5 سم في الطول، ومفتوحة في كلا الجانبين. يحدث قطع لفتح دائري من غطاء أنبوب مخروطي الشكل للسماح لسائل لغسلها من خلال قطعة 6.5 2 سم مربع من شبكة Saatilene. من مواضيع 330 في البوصة، 34 الموضوع قطرها ميكرون شاشة شبكة يحتفظ الأجنة البعوض. ب) الحمارembled قبض على أنبوب.
الشكل 4. الزاعجة المصرية والأنوفيلة الغامبية البيض، قبل وبعد dechorionation. A) الزاعجة بيض بعوض قبل dechorionation. ومشيماء أديمية ظاهرة معشقة مثل الشبكة تقع فوق باطنة المشيماء السوداء ويعطي مظهر البيض بمادة (تكبير الشكل). بعد إزالة مشيماء أديمية ظاهرة، إلا أن باطنة المشيماء على نحو سلس ومصقول يبقى (توسيع باء والشكل). C) من البيض أنوفيليس غامبياي قبل dechorionation. هياكل مشيماء أديمية ظاهرة مثل العوامات مرئية (سهام). D) وسطح أملس ومصقول من باطنة المشيماء مرئيا بعد dechorionation. بار = 100 ميكرون.
الشكل 5. وكانت سلسلة من خطوات متعاقبة لتثبيت وتعطيل باطنة المشيماء من AE. بيض بعوض. A) مميل أمامي رأيوباء) الاطراف نظرا لقارورة تحتوي على عزت التلألؤ. بيض بعوض خلال خطوات متتابعة من تثبيت وتعطيل باطنة المشيماء. 1) الأجنة في الماء المقطر. 2) الأجنة تعوم في الطور البيني بين المرحلة هيبتان العلوي والسفلي المرحلة المائية. 3) تثبيت ما يلي الأجنة حزمة معا في كتلة مستديرة. الاجنة لا تزال في الطور البيني بين مراحل حل هيبتان ومثبت. 4) بعد العلاج مع الماء المغلي وحضانة في الجليد، ومرحلة هيبتان عتامة قليلا. 5) تظهر الأجنة مع endochorions تعطلت في الطور البيني بين مرحلة 1 هيبتان غير واضحة وشفافة مرحلة الميثانول.
الشكل 6. تعطل باطنة المشيماء من AE ثابت. بيض بعوض. A) وفور نشيط دوامات من هيبتان ومراحل الميثانول، ويمكن تشكيل فقاعات، وتعطيل للباطنة المشيماء تصور. B) Followiنانوغرام خمس دقائق من الحضانة، في درجة حرارة الغرفة.
الشكل 7. البعوض البيض بعد انقطاع وإزالة باطنة المشيماء. البيض من AE. بعوض (A)، و. الغامبية (B) و Cx. الخماسية (ج) عقب تثبيت وتعطيل للباطنة المشيماء. ويمكن رؤية بيضاء، شفافة الأجنة داخل باطنة المشيماء متصدع. بعد إزالة باطنة المشيماء، الأجنة شفافة من AE. بعوض (D)، و. الغامبية (E) و Cx. الخماسية (F) هي واضحة للعيان. بار = 100 ميكرون.
الرقم 8. التهجين في الموقع لمدة ثلاثة جينات التي أعرب عنها في فصوص مختلفة من جبل لكامل، عزت الإناث. الغدد اللعابية بعوض. تلطيخ يدل على توطين وتراكم amylase1 (AAE L006719) (A)، D7s2 (AAEL006423) (B) وD7L2 (AAEL006424) (B). بار = 100 ميكرون.
الشكل 9. التهجين في الموقع لأوسكار تحقيقات البعوض RNA العقاقير إلى البويضات البعوض كل جبل وخلايا الممرضة. مرحلة البويضات الرابع (شركة النفط العمانية) تشريح من المبيض ل. الغامبية (A)، AE. بعوض (B) و Cx. الخماسية (C)، وتهجين مع تحقيقات الحمض النووي الريبي التي تستهدف كل منها mRNAs أوسكار البعوض. الحويصلات الأولية موجهة مع الأمامي على اليسار. تلطيخ في القطب الخلفي (الأزرق رأس السهم) إلى تراكم mRNAs أوسكار. وتظهر الثانوية (F2) والثالثة (F3) بصيلات وتلطيخ (أسود رأس السهم) إلى تراكم مرنا أوسكار في ممرضة السيتوبلازم الخلية (NCC). وتستثنى من تلطيخ الممرضة نوى الخلايا (روز). شريط = 50 ميكرون.
ad/3709/3709fig10.jpg "/>
الرقم 10. التهجين في الموقع لأوسكار تحقيقات البعوض RNA العقاقير على الأجنة البعوض كامل جبل. الأجنة موجهة مع الأمامي على اليسار. الخلوية الأجنة مرحلة الأريمة ل. الغامبية (A) و Cx. الخماسية (C) وتهجين مع كل منها البعوض أنواع محددة تحقيقات الجيش الملكي النيبالي أوسكار. ب) مرحلة الأريمة المخلوي عزت. بعوض الأجنة المهجنة مع تحقيقات الحمض النووي الريبي استهداف عزت. بعوض أوسكار النص. تلطيخ هو واضح في خلايا القطب الخلفي للجميع الأجنة، مشيرا إلى توطين وتراكم مرنا أوسكار البعوض في هذه الخلايا. شريط = 50 ميكرون.
الجدول رقم 1. حلول ومخازن لتثبيت الفورمالديهايد هلام، والكهربائي والتهجين في الموقع.
ftp_upload/3709/3709table2.jpg "/>
الجدول 2. أحداث التنموي والملاحظات الشكلية المقابلة لمراحل متتالية خلال مرحلة التطور الجنيني البعوض.
الجدول 3. ملخص الاختلافات الرئيسية في مرحلة ما قبل تهجين خطوات لأنواع الأنسجة المختلفة.
التهجين في بروتوكول تلطيخ الموقع واللونية المقدمة هنا لأنسجة البعوض كله جبل والأجنة هو تقنية مفيدة لتوطين النصوص داخل أجهزة معينة وأنواع الخلايا. هذه الإجراءات هي تحسنا طرقنا ذكرت سابقا، على حد سواء في تبسيط خطوات غسيل واسعة النطاق وتقديم التفاصيل التقنية ومصادر إضافية الكاشف.
في تجربتنا، والكشف عن الإشارات اللونية تهجين متفوقة في الحساسية وضوح إشارة تهجين مقارنة مع مخططات كشف مضان مقرها. وعلاوة على ذلك كشف اللونية تلتف حول القضايا المرتبطة تمييز إشارة في الأجنة، والتي هي بطبيعتها لصناعة السيارات في فلوري. القيود في الكشف عن إشارات التهجين يحدث، وعندما يتم استهداف منخفضة وفرة النصوص وتلوين الخلفية هو واضح. زيادة درجة الحرارة إلى 65 درجة تهجين تم العثور على C للحد من الخلفإشارات تهجين الأرض، ولكن ليست بديلا المقترحة لتصميم فريد هدف محدد تحقيقات الحمض النووي الريبي.
وقد استخدم هذا البروتوكول لأداء التهجين في الموقع من كل جبل الغدد اللعابية للبعوض الزاعجة، والمبايض والأجنة من أنوفيليس غامبياي، الأنوفيلة stephensi، AE. بعوض الكيولكس والخماسية. هذا الأسلوب ينطبق أيضا على أنسجة أخرى من البعوض، ويفترض من تلك الحشرات الأخرى. بالإضافة إلى ذلك، نحن لتجميع المبادئ التوجيهية للمرة الأولى مقارنة للانطلاق من التطور الجنيني في البعوض الحامل للمرض 3، AE. بعوض، وهي. الغامبية و Cx. fatigans. تم الإبلاغ عن الملاحظات لسلالات معينة من هذه الأنواع الثلاثة، في ظل ظروف تربية حصيف. من المهم أن نلاحظ أن دوام التنموية يمكن أن تختلف عن سلالات مختلفة من أنواع البعوض وتحت ظروف تربية مختلفة. التهجين في الملحق الموقع في الجهود الجارية لاناlyze في transcriptomes من البعوض والمفصليات الأخرى، ويجوز أن يقدم صورة أفضل للتنظيم التعبير الجيني في هذه الكائنات.
الكتاب ليس لديهم الكشف.
فإن الكتاب أود أن أشكر ماريكا والترز للحصول على المشورة في تهجين النامية في طرق الموقع للأنسجة لينة وGoltsev يوري لمناقشة بروتوكولات لتهجين في الموضع الطبيعي للأجنة أنوفيليس غامبياي، والتي تم تكييفها وتعديلها في وقت لاحق لوضع البروتوكول وصفها هنا لتهجين في الموقع من الزاعجة والأجنة الكيولكس. نعترف أيضا توصيات مفيدة قدمها باري آدم وKosman ديفيد. نشكر أوزفالدو Marinotti للنقاش العلمي وتحرير نص البروتوكول.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
اسم كاشف | شركة | فهرس العدد | تعليق (اختياري) |
0.5 متر EDTA | Ambion | AM9261 | |
1M تريس، حمض الهيدروكلوريك | Ambion | AM9855G | pH8.0 |
10X PBS | Ambion | AM9625 | |
20X SSC | Ambion | AM9763 | |
1.5 مل أنابيب microfuge | Ambion | AM12400 | أقل غموضا من الأنابيب القياسية، ويساعد في تصور عينات |
منزوع الأيونات formamide | Ambion | AM9342 | التخزين في 4 درجات مئوية |
DEPC المياه | Ambion | AM9932 | |
بروتين K | Ambion | AM2546 | |
5.25٪ هيبوكلوريت الصوديوم | أوستن | A-1 الماركة | |
T3 رنا بوليميراز زائد | Ambion | AM2733 | التخزين عند درجة حرارة -20 درجة مئوية |
T7 رنا بوليميراز | Ambion | AM2082 | التخزين عند درجة حرارة -20 درجة مئوية |
95٪ من الإيثانول | فيشر العلمية | AC61511-0040 | |
Fisherbrand نقل البولي إيثيلين القابل للتصرف الماصات | فيشر العلمية | 13-711-7M | |
37٪ فورمالديهايد | فيشر العلمية | F79-500 | |
HPLC الصف الميثانول | فيشر العلمية | A452-1 | |
المغنيسيوم كلوريد | فيشر العلمية | M87-500 | |
مجهر غطاء زجاجي | فيشر العلمية | 12-542A | 18 X18 ملم |
N-الهيبتان | فيشر العلمية | H350-1 | |
ف الزيلين | فيشر العلمية | O5082-500 | |
بيركس اللوحة بقعة 9-جيدا | فيشر العلمية | 13-748B | 100x85 ملم |
كلوريد الصوديوم | فيشر العلمية | AC32730-0025 | |
هيدروكسيد الصوديوم | فيشر العلمية | SS255-1 | |
شرائح المجهر Superfrost / زائد | فيشر العلمية | 12-550-15 | 25x75x1.0 مم |
Davlyn الروتين الشعر المستعار واضح الخطوط الملاحية المنتظمة | مباشر الشعر | RED-75R12 | بولي / الجلد المادة الأساسية في 0،75 × 12 لفة شريط يارد |
أطلق عليه الرصاص عدة TOPOTA الاستنساخ للSequening مع واحد Top10 كيميائيا المختصة E. كولاي | إينفيتروجن | K457501 K457540 | 20 ردود الفعل 40 ردود الفعل |
Sonicated سمك السلمون الحمض النووي الحيوانات المنوية | إينفيتروجن | 15632-011 | التخزين عند درجة حرارة -20 درجة مئوية |
مكافحة digoxigenin-AP شظايا فاب | روش العلوم التطبيقية | 1093274 | التخزين في 4 درجات مئوية |
DIG RNA وضع العلامات مزيج | روش العلوم التطبيقية | 1277073 | التخزين عند درجة حرارة -20 درجة مئوية |
NBT / BCIP الأسهم حل | روش العلوم التطبيقية | 1681451 | التخزين في 4 درجات مئوية |
الكاشف الحظر الغربي | روش العلوم التطبيقية | 11921673001 | التخزين في 4 درجات مئوية |
Saatilene هايتك البوليستر شبكة (330.130) | الساعاتي طباعة | 330.34 UO PW | 330 مواضيع / بوصة، و 34 قطرها ميكرون الصفحات، واللون البرتقالي |
الغليسيرول | سيغما | G6279-1 | 70٪ في PBT |
هيبارين الصوديوم ملح | سيغما | H3393 | |
توين 20 | سيغما | P1379-500 | |
37٪ فورمالديهايد | تيد بيلا | 18508 | 10 aliquots مل في أمبولات العنبر |
16 أوقية. الحاويات ورقة منفردا مع اغطية | ورقة الشركة | SOLOKH16AJ8000 | |
البورسليكات الزجاج scintillatقارورة ايون مع قبعة المسمار غير مرتبط | VWR الدولية | 66022-128 | 20 حالة من 500 مل |
مختوم الهواء فقاعة توسيد celluar لف المواد | VWR الدولية | 500018-081 | 10 قدم / لفة 0.188 بوصة سميكة |
دجاج المصل | تم جمع الدم كله سواء من وريد الجناح أو بواسطة ثقب في القلب من الدجاج الأحداث. وقد حضنت الدم في 37 درجة مئوية لمدة 1 ساعة حتى متخثر ثم وضعت على الثلج لمدة 30 دقيقة. تم جمع الدم وطرد في 3000 XG لمدة 10 دقيقة. تم جمع طاف الناتج (توضيح المصل) وتخزينها في -20 درجة مئوية حتى استخدامها. |
الجدول 4. جدول محدد الكواشف والمعدات اللازمة لتهجين في الموقع.
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved