Method Article
Análisis de genes temporales y espaciales de expresión tiene un papel crucial en la genómica funcional. Todo el montaje hibridación In situ Es útil para determinar la localización de las transcripciones dentro de los tejidos y los compartimentos subcelulares. Aquí describimos una hibridación In situ Protocolo con las modificaciones de los tejidos diana específicos en los mosquitos.
Los mosquitos son vectores de un conjunto diverso de agentes patógenos como los arbovirus, parásitos protozoarios y nematodos. Investigación de las transcripciones y los reguladores de genes que se expresan en tejidos en los que el anfitrión de mosquitos e interactuar patógeno, y en los órganos implicados en la reproducción son de gran interés para las estrategias para reducir la transmitida por el mosquito transmisión de la enfermedad e interrumpir el desarrollo del óvulo. Un número de herramientas se han empleado para estudiar y validar la regulación temporal y tejidos específicos de la expresión génica. A continuación, describimos los protocolos que han sido desarrollados para obtener la información espacial, lo que aumenta nuestra comprensión de los genes específicos en donde se expresan y acumulan sus productos. El protocolo descrito se ha utilizado para validar la expresión y de determinar los patrones de acumulación de expedientes en los tejidos relacionados con la transmitida por el mosquito transmisión de patógenos, tales como las mujeres las glándulas salivales, así como los compartimentos subcelulares de los ovarios y los embriones, que vuelva atarde para la reproducción de mosquitos y el desarrollo.
Los procedimientos siguientes representan una metodología optimizada que mejora la eficiencia de varios pasos en el protocolo sin pérdida de las señales de hibridación específicos diana. Directrices para la preparación de la sonda de ARN, la disección de los tejidos blandos y el procedimiento general para la fijación y la hibridación se describen en la Parte A, mientras que los pasos específicos para la recogida, grabación, pre-hibridación y la hibridación de embriones de mosquitos se detallan en la Parte B.
A. Hibridación in situ para los tejidos blandos: glándulas salivales del mosquito y de los ovarios
Recetas para las soluciones y tampones necesarios para los procedimientos siguientes se describen en la Tabla 1.
1. Sonda de ARN Preparación y Análisis de la Calidad
2. La disección de las glándulas salivales del mosquito y de los ovarios
3. Fijación
4. Hibridación
5. RNasa A Tratamiento
6. Incubación de anticuerpos
7. Tinción de fosfatasa alcalina
8. El glicerol de montaje
B. Hibridación in situ para los embriones de mosquitos
Soluciones y tampones necesarios para la hibridación in situ para los embriones de mosquitos se ha descrito (Tabla 1). Los procedimientos de fijación y la hibridación que aquí se presentan se han modificado a partir de those informó por primera vez para el Anopheles gambiae, 5,6 Aedes aegypti y Culex quinquefasciatus 7 8.
1. Colector de Embriones
2. Dechorionation, fijación y EndochoriLa interrupción en la
3. Descamación
4. Aclaración de la yema
5. La fijación y la hibridación in situ
La fijación y la hibridación in situ en los procedimientos son idénticos a los descritos en el protocolo de la sección A.
C. Representante de los resultados
La hibridación in situ en el protocolo descrito aquí, se traduce en patrones de tinción de colores que indican la presencia y localización del ARNm objetivo. Es importante destacar que los niveles relativos de abundancia de transcripción no puede determinarse por hibridación in situ. Resultados de hibridación son dependientes de la sonda de ARNm específico utilizado para el procedimiento de hibridación, la abundancia del ARNm diana en el tejido hibridada, así como la concentración de la sonda y la temperatura de hibridación. Comparación de los tejidos se hibridó con antisentido y las correspondientes sondas de ARNm de sentido hacer posible la interpretación precisa de los patrones de coloración.
La hibridación in situ de todo el montaje de las glándulas salivales hembra de Aedes aegypti con sondas de ARNm que amylase1 objetivo (AAEL006719), D7s2 (AAEL006423), y D7L2 (AAEL006424) indican que la acumulación de estas transcripciones en proximal-lateral, distal-lateral y distal lóbulos laterales / medial, respectivamente (Figura 8). 1-Todo el montaje ovarios de tres especies de mosquitos se hibridó con sondas de ARNm que se dirigen específicamente a las transcripciones respectivos ortólogos de Oskar (Figura 9). 7,8 hibridación in situ de todo el montaje embriones de Ae. aegypti, Un. gambiae y Cx. quinquefasciatus se realizó con sondas de ARN antisentido dirigidos a las transcripciones de mosquitos oskar respectivos ortólogos (Figura 10) 7,8.
igura 1 "src =" / files/ftp_upload/3709/3709fig1.jpg "/>
Figura 1. Esquema de post-hibridación de montaje puesta en marcha.
Figura 2. Preparación de Kimwipe fregona utilizado durante montaje de las muestras. Un tejido Kimwipe se tuerce fuertemente para producir una fregona de punta fina para absorber el exceso de medio de montaje de las muestras y diapositivas.
Figura 3. Esquema de Saatilene tubo de malla de captura dechorionation. A) La parte inferior de un tubo cónico de 50 ml de poliestireno se corta para producir un tubo hueco de 4,5 cm de longitud, abierto en ambos extremos. Una abertura circular se corta de la tapa del tubo cónico para permitir que el líquido a ser lavado a través de un 6,5 cm 2 pieza cuadrada de malla Saatilene. Los 330 hilos por pulgada, 34 micras de diámetro hilo tamiz de malla retiene los embriones de mosquitos. B) Del culoembled coger el tubo.
Figura 4. Aedes aegypti y Anopheles gambiae huevos, antes y después dechorionation. A) Aedes aegypti los huevos antes de la dechorionation. El exochorion similar a una malla se encuentra por encima de la endochorion negro y le da al huevo una apariencia de textura (la ampliación del recuadro). Después de la eliminación de la exochorion, sólo el endochorion lisa y pulida permanece (ampliación B y recuadro). C) Los huevos de Anopheles gambiae antes de dechorionation. Estructuras Exochorion tales como flotadores son visibles (flechas). D) La superficie lisa y pulida de la endochorion es visible después de dechorionation. Bar = 100 micras.
Figura 5. Una serie de pasos secuenciales para la fijación y la interrupción endochorion de Ae. los huevos de Aedes aegypti. A) oblicuo-vista frontaly B) lateral vista de viales de centelleo que contienen Ae. aegypti huevos durante la secuencia de pasos de fijación y de la interrupción endochorion. 1) Los embriones en agua destilada. 2) Los embriones flotan en la interfase entre la fase superior heptano y la fase acuosa inferior. 3) Después de la fijación de los embriones empaquetarse en una masa redonda. Los embriones permanecen en la interfase entre las fases solución de heptano y fijador. 4) Después del tratamiento con agua hirviendo y la incubación en hielo, la fase de heptano se vuelve ligeramente opaca. 5) Los embriones con endochorions interrumpidas se muestran en la interfase entre una fase opaca heptano y metanol en fase transparente.
Figura 6. Endochorion interrupción de Ae fijo. aegypti huevos. A) Inmediatamente después de enérgica agitación de heptano y fases de metanol, la formación de burbujas y la interrupción de la endochorion puede ser visualizada. B) following cinco minutos de incubación, a temperatura ambiente.
Figura 7. Los huevos de mosquito después de la interrupción y la eliminación de la endochorion Los huevos de Ae. aegypti (a), una. gambiae (B) y Cx. quinquefasciatus (C) posterior a la fijación y la interrupción de la endochorion. Embriones traslúcidos de color blanco se puede ver en el endochorion agrietada. Tras la eliminación del endochorion, los embriones translúcidos de Ae. aegypti (D), Una. gambiae (E) y Cx. quinquefasciatus (F) son claramente visibles. Bar = 100 micras.
Figura 8. Hibridaciones in situ durante tres genes expresados en diferentes lóbulos de todo el montaje, hembra de Ae. aegypti glándulas salivales. La tinción es indicativo de la localización y la acumulación de amylase1 (AAE L006719) (A), D7s2 (AAEL006423) (B) y D7L2 (AAEL006424) (B). Bar = 100 micras.
Figura 9. La hibridación in situ por los mosquitos oskar sondas de ARN antisentido a los ovocitos de mosquitos todo el montaje y las células de la enfermera. Etapa IV ovocitos (OOC) disecado de los ovarios de una. gambiae (A), Ae. aegypti (B) y Cx. quinquefasciatus (C) y se hibridó con sondas de ARN dirigidas respectivos mRNAs oskar mosquitos. Folículos primarios están orientados con anterior a la izquierda. La tinción en el polo posterior (azul punta de flecha) indican acumulada ARNm Oskar. Secundarias (f2) y terciario (F3) se muestran los folículos y la tinción (negro punta de flecha) indican una acumulación de mRNA de oskar en el citoplasma de la célula enfermera (NCC). La tinción se excluye de los núcleos celulares enfermera (NCN). Bar = 50 micras.
ad/3709/3709fig10.jpg "/>
Figura 10. La hibridación in situ por los mosquitos oskar sondas de ARN antisentido a los embriones de mosquitos todo el montaje. Los embriones están orientados con anterior a la izquierda. Celulares de embriones Blastodermo etapa de una. gambiae (A) y Cx. quinquefasciatus (C) se hibridó con sondas de mosquitos respectivas especies específicas oskar ARN. B) Un blastodermo sincitial Ae etapa. embrión aegypti se hibridó con sondas de ARN dirigidas a Ae. aegypti oskar transcripción. La tinción es evidente en las células polo posterior de todos los embriones, lo que indica la localización y la acumulación de mRNA oskar mosquitos en estas células. Bar = 50 micras.
Tabla 1. Soluciones y tampones para electroforesis en gel de formaldehído, la fijación y la hibridación in situ.
ftp_upload/3709/3709table2.jpg "/>
Tabla 2. Eventos de desarrollo y observaciones morfológicas correspondientes a etapas consecutivas durante la embriogénesis del mosquito.
Tabla 3. Resumen de las diferencias principales en los pasos de pre-hibridación para diversos tipos de tejidos.
La hibridación in situ y el protocolo de tinción colorimétrica que aquí se presenta para los tejidos de mosquitos todo el montaje y los embriones es una técnica útil para la localización de las transcripciones en órganos específicos y tipos de células. Estos procedimientos son una mejora con respecto a los métodos ya se ha informado, tanto en la racionalización de amplias medidas de lavado y de proporcionar más detalles técnicos y las fuentes de reactivos.
En nuestra experiencia, la detección colorimétrica de las señales de hibridación es superior en sensibilidad y la claridad de la señal de hibridación en comparación con esquemas de detección basadas en fluorescencia. Por otra parte la detección colorimétrica elude las cuestiones relacionadas con la discriminación de la señal en los embriones, que son inherentemente auto-fluorescente. Las limitaciones en la detección de señales de hibridación ocurre, cuando baja abundancia transcripciones están dirigidos y tinción de fondo es evidente. El aumento de la temperatura de hibridación a 65 ° C se ha encontrado para reducir de nuevoseñales de hibridación de tierra, pero no es un sustituto sugerido para el diseño único objetivo sondas específicas de ARN.
Este protocolo se ha utilizado para llevar a cabo la hibridación in situ de todo el montaje las glándulas salivales del mosquito Aedes aegypti y los ovarios y los embriones de Anopheles gambiae, el Anopheles stephensi, Ae. aegypti y Culex quinquefasciatus. Este método también es aplicable a los tejidos de mosquitos otros, y presumiblemente los de otros insectos. Además, se compiló para las pautas de la primera vez comparativas para la puesta en escena del desarrollo embrionario de cada tres mosquitos vectores, Ae. aegypti, Un. gambiae y Cx. fatigans. Las observaciones se han reportado para cepas específicas de estas tres especies, bajo condiciones de cría discretos. Es importante señalar que el curso de tiempo de desarrollo puede variar para diferentes cepas de especies de mosquitos y bajo condiciones de cría diferentes. Hibridaciones en el suplemento in situ los esfuerzos en curso a analisar los transcriptomes de mosquitos y otros artrópodos, y puede ofrecer una mejor imagen de la regulación de la expresión génica en estos organismos.
Los autores no tienen revelaciones.
Los autores desean agradecer a Marika Walters para el asesoramiento en el desarrollo de la hibridación in situ en los métodos de los tejidos blandos y Goltsev Yury para la discusión de los protocolos para la hibridación in situ de Anopheles gambiae embriones, que fueron adaptados y modificados posteriormente para desarrollar el protocolo descrito aquí para la hibridación en in situ de Aedes y Culex embriones. Reconocemos también recomendaciones útiles dados por Adam Paré y Kosman David. Damos las gracias a Osvaldo Marinotti para la discusión científica y la edición del texto del protocolo.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Nombre del reactivo | Empresa | Número de catálogo | Comentarios (opcional) |
EDTA 0,5 M | Ambion | AM9261 | |
Tris-HCl 1M | Ambion | AM9855G | pH 8,0 |
PBS 10 veces | Ambion | AM9625 | |
SSC 20X | Ambion | AM9763 | |
1,5 ml tubos de microfuga | Ambion | AM12400 | Menos opaco que los tubos estándar, ayuda a visualizar las muestras |
Formamida desionizada | Ambion | AM9342 | El almacenamiento a 4 ° C |
DEPC agua | Ambion | AM9932 | |
Proteinasa K | Ambion | AM2546 | |
5,25% de hipoclorito de sodio | Austin | A-1 Marca | |
T3 ARN polimerasa-Plus | Ambion | AM2733 | El almacenamiento a -20 ° C |
T7 ARN polimerasa | Ambion | AM2082 | El almacenamiento a -20 ° C |
95% de etanol | Fisher Scientific | AC61511-0040 | |
Fisherbrand pipetas desechables de polietileno de transferencia | Fisher Scientific | 13-711-7M | |
37% de formaldehído | Fisher Scientific | F79-500 | |
HPLC-grado de metanol | Fisher Scientific | A452-1 | |
Cloruro de magnesio | Fisher Scientific | M87-500 | |
Microscopio cubierta de vidrio | Fisher Scientific | 12-542A | 18 x 18 mm |
N-heptano | Fisher Scientific | H350-1 | |
P-xileno | Fisher Scientific | O5082-500 | |
Pyrex de 9 y Punto Plate | Fisher Scientific | 13-748B | 100x85 mm |
Cloruro de sodio | Fisher Scientific | AC32730-0025 | |
Hidróxido de sodio | Fisher Scientific | SS255-1 | |
Superfrost / Plus portaobjetos | Fisher Scientific | 12-550-15 | 25x75x1.0 mm |
Davlyn Red Clear-liner Toupee cinta | Cabello directo | RED-75R12 | Poli / material de la piel base de 0,75 cm x 12 m rollo de cinta |
Kit de Clonación de TOPOTA Sequening con un disparo Top10 químicamente competente E. E. | Invitrogen | K457501 K457540 | 20 reacciones 40 reacciones |
De salmón sonicado ADN de los espermatozoides | Invitrogen | 15632-011 | El almacenamiento a -20 ° C |
Anti-digoxigenina-AP Fab | Roche Ciencias Aplicadas | 1093274 | El almacenamiento a 4 ° C |
DIG RNA etiquetado mezcla | Roche Ciencias Aplicadas | 1277073 | El almacenamiento a -20 ° C |
NBT / BCIP de la solución madre | Roche Ciencias Aplicadas | 1681451 | El almacenamiento a 4 ° C |
Reactivo de bloqueo occidental | Roche Ciencias Aplicadas | 11921673001 | El almacenamiento a 4 ° C |
Saatilene Hitech malla de poliéster (330.130) | Saati Imprimir | 330,34 UO PW | 330 hilos por pulgada, de 34 micras de diámetro de la rosca, color naranja |
Glicerol | Sigma | G6279-1 | 70% en PBT |
Sal de sodio de heparina | Sigma | H3393 | |
Tween 20 | Sigma | P1379-500 | |
37% de formaldehído | Ted Pella | 18508 | Alícuotas de 10 ml en ampollas ámbar |
16 oz Recipientes con tapas de papel solitario | El Paper Company | SOLOKH16AJ8000 | |
Vidrio borosilicato scintillatión vial con tapón de rosca sin ataduras | VWR International | 66022-128 | 20 ml caso de 500 |
Sealed Air Bubble Wrap o via un material de relleno | VWR International | 500018-081 | De 10 pies / rollo 0.188 pulgadas de espesor |
Suero de pollo | Toda la sangre se recoge ya sea desde la vena del ala, o por punción cardiaca de un pollo de menores. La sangre se incubó a 37 ° C durante 1 h hasta coagulada y luego se coloca en hielo durante 30 min. El suero se recogió y se centrifugó a 3000 xg durante 10 min. El sobrenadante resultante (aclarado suero) se recogió y se almacenó a -20 ° C hasta su uso. |
Tabla 4. Tabla de los reactivos específicos y equipos para la hibridación in situ.
Solicitar permiso para reutilizar el texto o las figuras de este JoVE artículos
Solicitar permisoThis article has been published
Video Coming Soon
ACERCA DE JoVE
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. Todos los derechos reservados