Method Article
時間的·空間的遺伝子発現解析は、ゲノム機能解析において重要な役割を持っています。ホールマウントハイブリダイゼーションその場で組織や細胞内コンパートメント内での転写産物の局在を決定するために有用である。ここでは、ハイブリダイゼーションを概説その場でプロトコル。
蚊はアルボウイルス、原虫や線虫を含む病原体の多様なセットのベクトルです。蚊の宿主と病原体相互作用の組織で発現し、臓器に繁殖に関与している転写産物や遺伝子レギュレータの調査では、戦略は蚊が媒介する病気の感染を減らすと卵の開発を混乱させるための大きな関心である。ツールの数は、遺伝子発現の時間的および組織特異的調節を研究し、検証するために用いられてきた。ここでは、特定の遺伝子が発現し、それらの製品が蓄積されている場所の我々の理解を高め、空間情報を取得するために開発されているプロトコルについて説明します。記述されているプロトコルは、再され、式を検証し、そのような女性の唾液腺と同様に、卵巣および胚の細胞内コンパートメントなど蚊が媒介する病原体の伝播に関連した組織では転写産物の蓄積パターンを決定するために使用されています蚊の再生と発展に遅い。
次の手順では、ターゲット固有のハイブリダイゼーションシグナルを失わずにプロトコルのさまざまなステップの効率を向上させる最適化された方法論を表しています。 RNAプローブの調製のためのガイドライン、軟組織と固定とハイブリダイゼーションのための一般的な手順の解剖は、蚊の胚の収集、固定、プレハイブリダイゼーションおよびハイブリダイゼーションのための具体的な手順は、パートBに記載されていながら、パートで説明されています
軟部組織のためにin situで A.ハイブリダイゼーション:蚊唾液腺、卵巣
次の手順に必要なソリューションとバッファのレシピを表1に概説されています。
1。 RNAプローブの調製と品質分析
2。蚊唾液腺、卵巣の解剖
3。固定
4。ハイブリダイゼーション
5。 RNase A処理
6。抗体インキュベーション
7。アルカリホスファターゼ染色
8。取付グリセロール
モスキート胚のin situで B.ハイブリダイゼーション
蚊胚のin situでのハイブリダイゼーションのために必要な溶液とバッファーは、( 表1)に記載されている。ここに提示さ固定とハイブリダイゼーション手順はthosから変更された電子は、最初にハマダラカ 、5,6 ネッタイシマカ 7とネッタイイエカのために報告した。8
1。胚コレクション
2。 Dechorionation、ボール、そしてEndochori中断に
3。剥離
4。卵黄の明確化
5。 in situで固定とハイブリダイゼーション
現場の手順で固定とハイブリダイゼーションは、プロトコルセクションAに記載されているものと同じです。
C.描写結果
現場プロトコルのハイブリダイゼーションは、ここで標的mRNAの存在および局在を示す色の染色パターンの結果を説明します。転写産物の存在量の相対的なレベルがin situでのハイブリダイゼーションにより決定することができないことを強調することが重要です。ハイブリダイゼーションの結果は、ハイブリダイゼーションの手順については、使用される特定のmRNAプローブ、ハイブリダイズ組織における標的mRNAと同様に、プローブ濃度、ハイブリダイゼーションの温度を豊富に依存しています。アンチセンスとハイブリダイズ組織の比較と対応するセンスmRNAのプローブは、染色パターンの正確な解釈を可能にします。
ターゲットamylase1(AAEL006719)、D7s2(AAEL006423)、およびD7L2(AAEL006424)は遠位側、近位側でこれらの転写産物の蓄積を示すことmRNAプローブの女性ネッタイシマカの全体のマウント唾液腺の in situ ハイブリダイゼーション、および遠位3蚊種の内側/外側それぞれのローブ、( 図8)。1ホールマウント卵巣は、特にオスカーのそれぞれのオルソログの転写産物を対象とします( 図9)のmRNAプローブとハイブリダイズさせた。ホールマウント胚のin situで 7,8ハイブリダイゼーションAEの。ネッタイシマカ、。ハマダラカとCx。ネッタイイエカは、それぞれの蚊オスカーオルソロガス転写( 図10)を標的とするアンチセンスRNAプローブを用いて行った。7,8
igure 1 "SRC =" / files/ftp_upload/3709/3709fig1.jpg "/>
図1。ハイブリダイゼーション後の模式図では、セットアップ取り付け。
図2。キムワイプモップの調製は、サンプルの取り付け時に使用される。キムワイプ組織をサンプルとスライドから余分な封入剤を吸収するために先の細いモップを生成するためにしっかりとツイストされています。
図3。 Saatileneメッシュdechorionationキャッチ管の概略図。)50 mlのポリスチレンコニカルチューブの底部は両端の長さは4.5センチ、開いた中空管を得るために切断されています。円形の開口部はSaatileneメッシュの6.5 cm 2の正方形片を洗浄する液体を許可するコニカルチューブの蓋から切り取られています。インチあたり330のスレッド、34ミクロン径のスレッドのメッシュスクリーンは、蚊の胚を保持します。 B)お尻チューブをキャッチembled。
4 ネッタイシマカやハマダラカの卵、dechorionation前後) ネッタイシマカの卵前dechorionationの図 。メッシュ状のexochorionは黒endochorion上に位置し、卵の質感の外観(挿入図の拡大)を与えます。 exochorionの除去に続いて、唯一の、滑らかで洗練されたendochorionは(Bとはめ込み拡大)のまま。 C)dechorionation前にハマダラカの卵。浮動小数点数などのExochorion構造(矢印)は表示されます。 D)endochorionの滑らかで洗練された表面はdechorionation後に表示されます。バー= 100μmである。
図5。 AEの固定とendochorion混乱の順次一連の手順。ネッタイシマカの卵)傾斜、正面と AE を含むシンチレーションバイアルのB)側面ビュー。固定とendochorionの混乱の連続工程中のネッタイシマカの卵。蒸留水の1)胚。 2)胚は、上部ヘプタン相と下層の水相との間の相間に浮かんでいる。 3)以下の固定胚は丸い塊に一緒にパックします。胚は、ヘプタンおよび固定液相間相間に残っています。 4)氷の沸騰したお湯とインキュベーションで処理した後、ヘプタン相はわずかに不透明になります。 5)中断endochorionsを持つ胚は不透明ヘプタン相と透明なメタノール相との間の相間に示されています。
図6。固定AEのEndochorionの中断。ネッタイシマカの卵 。 A)直後には、エネルギッシュなヘプタン、メタノール相から渦巻く、気泡の形成とendochorionの混乱を可視化することができます。 B)Followi室温でのインキュベーションのngの5分。
図7。混乱とendochorionを除去した後蚊の卵。 ヒトスジシマカの卵。ネッタイシマカ(A)、。ハマダラカ (B) とCx。ネッタイイエカ (C)は、以下の固定とendochorionの破壊。白、半透明の胚が割れendochorion内で見ることができます。 endochorionを除去した後、AEの半透明の胚。ネッタイシマカ(D)、。ハマダラカ (E) とCx。ネッタイイエカ (F)がはっきりと見える。バー= 100μmである。
図8。全マウント、メスAEの異なる葉で表現3遺伝子のin situでのハイブリダイゼーション。ネッタイシマカ唾液腺 。染色はamylase1の局在と蓄積の指標である(AAE L006719)()、D7s2(AAEL006423)(B)とD7L2(AAEL006424)(B)。バー= 100μmである。
図9。全体のマウント蚊の卵母細胞と看護師細胞への蚊オスカーアンチセンスRNAプローブのin situでのハイブリダイゼーション 。 IV期の卵母細胞(OOC)は、卵巣から解剖した。ハマダラカ(A)、AE。ネッタイシマカ (B) とCx。ネッタイイエカ (C)とそれぞれの蚊オスカーmRNAを標的RNAプローブでハイブリダイズした。主な卵胞は、左の前方の指向です。後極での染色(青矢印)が蓄積されたオスカー mRNAを示しています。二次(F2)および第三(F3)卵胞が示され、染色(黒矢印)は、看護師の細胞質(NCC)でオスカーmRNAの蓄積を示しています。染色は、看護師の細胞核(NCN)から除外されます。バーは=50μmである。
ad/3709/3709fig10.jpg "/>
図10。全体のマウント蚊の胚に蚊オスカーアンチセンスRNAプローブのin situでのハイブリダイゼーション 。胚は、左側前方の指向です。の細胞性胞胚期の胚。ハマダラカ () とCx。ネッタイイエカ (C)はそれぞれの蚊種特異オスカー RNAプローブとハイブリダイズされています。 B)シンシチウム胚盤葉期のAe。ネッタイシマカの胚は 、AE を標的RNAプローブでハイブリダイズした。ネッタイシマカオスカー転写。染色は、これらの細胞における蚊オスカーmRNAの局在化および蓄積を示す、すべての胚の後極細胞では明らかである。バーは=50μmである。
表1:in situでのホルムアルデヒドゲル電気泳動、固定とハイブリダイゼーションのためのソリューションおよびバッファ。
ftp_upload/3709/3709table2.jpg "/>
表2。蚊胚形成の間に連続した段階に対応した発達のイベントや形態学的観察。
表3種々の組織の種類のプレハイブリダイゼーションステップの主な相違点のまとめ。
全体のマウント蚊組織および胚のためにここで紹介する場と比色染色プロトコールでのハイブリダイゼーションは、特定の臓器や細胞型内転写産物の局在のために有用な技術である。これらの手順は、私たちの以前に報告された方法に比べて、両方の広範な洗浄工程の合理化と技術的な詳細および試薬ソースを提供することで改善されています。
我々の経験では、ハイブリダイゼーションシグナルの比色検出は、蛍光ベースの検出方式に比べてハイブリダイゼーションシグナルの感度と透明性に優れています。また、比色検出は、本質的に自動蛍光性である胚の信号差別に関連する問題を回避します。低濃度の転写産物をターゲットにされている場合ハイブリダイゼーションシグナルを検出するのに制限が発生し、バックグラウンド染色は明白である。 65ハイブリダイゼーション温度を上昇させる°Cは、バック減らすことが見出されているグラウンドハイブリダイゼーションシグナルが、固有のターゲットに特異的なRNAプローブを設計するための提案代わるものではありません。
このプロトコルは、全マウント唾液ネッタイシマカの腺、卵巣、 ハマダラカ、ハマダラカ、AEの胚の in situ ハイブリダイゼーションを行うために使用されています。ネッタイシマカとネッタイイエカ 。また、このメソッドは、他の蚊の組織に適用されると、おそらく他の昆虫のものです。さらに、我々は3つのベクトル蚊、 ヒトスジシマカにおける胚発生のステージングのための最初の時間の比較のガイドラインについては、コンパイルされます。ネッタイシマカ、。ハマダラカとCx。 fatigans。観測は控えめな飼育条件下では、これら3種の特定の株が報告されている。開発時間のコースは蚊種の異なる株のために、異なる飼育条件下で異なることに注意することが重要です。 ANAへの努力継続的にその場サプリメントでハイブリダイゼーション蚊やその他の節足動物のトランスクリプトームをlyze、これらの生物における遺伝子発現の調節の良い画像を提供することがあります。
著者らは開示しません。
著者らは、その後にハイブリダイゼーションのためにここで記述されたプロトコルを開発するために適応し、変更された、 ハマダラカの胚の in situ ハイブリダイゼーションのためのプロトコルの議論のための軟組織とユーリGoltsevその場の方法でハイブリダイゼーションの開発に助言をマリカ·ウォルターズに感謝したいと思いますヒトスジシマカとアカイエカの胚の in situ。我々はまた、アダム·パレとDavid Kosmanによって与えられた有用な提言を認める。我々は科学的な議論とプロトコルのテキストを編集するためのオズワルドMarinottiに感謝します。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
試薬の名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント(オプション) |
0.5 M EDTA | Ambionの | AM9261 | |
1MのTris-HCl | Ambionの | AM9855G | pH8.0 |
10×PBS | Ambionの | AM9625 | |
20X SSC | Ambionの | AM9763 | |
1.5mlマイクロチューブ | Ambionの | AM12400 | 可視化サンプル中のエイズ、標準のチューブよりも小さい不透明な |
脱イオン化ホルムアミド | Ambionの | AM9342 | 4°Cでの保存 |
DEPC水 | Ambionの | AM9932 | |
プロテイナーゼK | Ambionの | AM2546 | |
5.25%次亜塩素酸ナトリウム | オースティンの | A-1ブランド | |
T3 RNAポリメラーゼプラス | Ambionの | AM2733 | -20°Cでの貯蔵 |
T7 RNAポリメラーゼ | Ambionの | AM2082 | -20°Cでの貯蔵 |
95%エタノール | フィッシャー·サイエンティフィック | AC61511-0040 | |
Fisherbrand使い捨てポリエチレン転送ピペット | フィッシャー·サイエンティフィック | 13から711-7M | |
37%ホルムアルデヒド | フィッシャー·サイエンティフィック | F79-500 | |
HPLCグレードのメタノール | フィッシャー·サイエンティフィック | A452-1 | |
塩化マグネシウム | フィッシャー·サイエンティフィック | M87-500 | |
顕微鏡のカバーガラス | フィッシャー·サイエンティフィック | 12-542A | 18×18ミリメートル |
n-ヘプタン | フィッシャー·サイエンティフィック | H350-1 | |
P-キシレン | フィッシャー·サイエンティフィック | O5082-500 | |
パイレックス9ウェルスポットプレート | フィッシャー·サイエンティフィック | 13-748B | 100x85ミリメートル |
塩化ナトリウム | フィッシャー·サイエンティフィック | AC32730-0025 | |
水酸化ナトリウム | フィッシャー·サイエンティフィック | SS255-1 | |
Superfrost /プラス顕微鏡スライド | フィッシャー·サイエンティフィック | 12-550-15 | 25x75X1.0ミリメートル |
Davlynレッドクリアライナーかつらテープ | 直接髪 | RED-75R12 | ポリ/ X 12ヤードテープロールのスキン基材0.75 |
ワントップ10化学的にコンピテントE.とSequeningためのTOPOTAクローニングキット大腸菌 | インビトロジェン | K457501 K457540 | 20反応 40反応 |
超音波処理サケ精子DNA | インビトロジェン | 15632-011 | -20°Cでの貯蔵 |
抗ジゴキシゲニン-AP、Fabフラグメント | ロシュ·ダイアグノスティックス | 1093274 | 4°Cでの保存 |
DIG RNAラベリングミックス | ロシュ·ダイアグノスティックス | 1277073 | -20°Cでの貯蔵 |
NBT / BCIPストック溶液 | ロシュ·ダイアグノスティックス | 1681451 | 4°Cでの保存 |
西部のブロッキング試薬 | ロシュ·ダイアグノスティックス | 11921673001 | 4°Cでの保存 |
Saatileneハイテックポリエステルメッシュ(330.130) | Saatiプリント | 330.34 UO PW | 330スレッド/インチ、34ミクロンのネジ径、オレンジ色 |
グリセロール | シグマ | G6279-1 | PBTの70% |
ヘパリンナトリウム塩 | シグマ | H3393 | |
Tween 20を | シグマ | P1379-500 | |
37%ホルムアルデヒド | テッド·ペラ | 18508 | 琥珀色のアンプルに10 mlのアリコート |
16オンス蓋つきのソロ紙容器 | ペーパーカンパニー | SOLOKH16AJ8000 | |
ホウケイ酸ガラスscintillatアタッチされていないスクリューキャップ付きバイアルイオン | VWRインターナショナル | 66022-128 | 500の20ミリリットルの場合 |
シールドエアーバブルラップcelluar緩衝材 | VWRインターナショナル | 500018-081 | 10フィート/ロール0.188インチの厚さ |
鶏血清 | 全血は、どちらの翼静脈から、または幼若鶏から心臓穿刺により採取した。血液が凝固して、30分間氷上に置いたまでは1時間37℃でインキュベートした。血清を10分間3000×gで収集し、遠心分離した。得られた上清(明らかに血清)を使用するまで-20℃で収集し、格納されていました。 |
表4。in situでのハイブリダイゼーションの特異的試薬および機器の表。
このJoVE論文のテキスト又は図を再利用するための許可を申請します
許可を申請This article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2023 MyJoVE Corporation. All rights reserved