تحليل يستند الخلوي-Imaging- وتدفق الوظيفة خلية ودورة الخلية في 3D الميلانوما الأجسام الشبه الكروية

Summary

We describe two complementary methods using the fluorescence ubiquitination cell cycle indicator (FUCCI) and image analysis or flow cytometry to identify and isolate cells in the inner G1 arrested and outer proliferating regions of 3D spheroids.

Abstract

Three-dimensional (3D) tumor spheroids are utilized in cancer research as a more accurate model of the in vivo tumor microenvironment, compared to traditional two-dimensional (2D) cell culture. The spheroid model is able to mimic the effects of cell-cell interaction, hypoxia and nutrient deprivation, and drug penetration. One characteristic of this model is the development of a necrotic core, surrounded by a ring of G1 arrested cells, with proliferating cells on the outer layers of the spheroid. Of interest in the cancer field is how different regions of the spheroid respond to drug therapies as well as genetic or environmental manipulation. We describe here the use of the fluorescence ubiquitination cell cycle indicator (FUCCI) system along with cytometry and image analysis using commercial software to characterize the cell cycle status of cells with respect to their position inside melanoma spheroids. These methods may be used to track changes in cell cycle status, gene/protein expression or cell viability in different sub-regions of tumor spheroids over time and under different conditions.

Introduction

من المعروف أن الكروية متعددة الخلايا 3D كنموذج الورم لعدة عقود، إلا أنه في الآونة الأخيرة فقط أنهم جاءوا إلى استخدام أكثر شيوعا نموذجا في المختبر لكثير من السرطانات الصلبة. ويتزايد استخدامها في الإنتاجية العالية شاشات اكتشاف الأدوية كمادة وسيطة بين المجمع ومكلفة والنماذج الحية تستغرق وقتا طويلا وبسيط، وانخفاض تكلفة 2D نموذج أحادي الطبقة ^1-6. دراسات في الثقافة 2D غالبا ما تكون غير قادرة على تكرارها في الجسم الحي. نماذج كروي من أنواع عديدة من السرطان قادرة على محاكاة خصائص النمو، والحساسية المخدرات، واختراق المخدرات، والتفاعلات خلية خلية، وتوافر المقيد من الأوكسجين والمواد المغذية وتطوير نخر أن ينظر في الجسم الحي في الأورام الصلبة ^6-11. الكروية تطوير نواة نخرية، وهي منطقة هادئة أو G1 القبض المحيطة الأساسية، والخلايا المتكاثرة في محيط كروي ^7. تطوير هذه المناطققد تختلف تبعا لكثافة الخلايا، ومعدل انتشار وحجم كروي ^12. تم الافتراض بأن عدم التجانس الخلوية ينظر في هذه المناطق الفرعية المختلفة قد يسهم في علاج السرطان المقاومة ^13،14. وبالتالي القدرة على تحليل الخلايا في هذه المناطق أمر حاسم لردود المخدرات فهم الورم بشكل منفصل.

ويستند (FUCCI) نظام مضان ubiquitination مؤشر دورة الخلية على أحمر (Kusabira أورانج - KO) والأخضر (الأعظمي الأخضر - AG) العلامات الفلورية من Cdt1 وgeminin، والتي تدهورت في مراحل مختلفة من دورة الخلية ^15. وبالتالي نواة الخلية تظهر حمراء في G1، الأصفر في أوائل S والخضراء في S / G2 / M المرحلة. وصفنا هنا طريقتين التكميلية على حد سواء باستخدام FUCCI لتحديد دورة الخلية، جنبا إلى جنب مع استخدام برامج التصوير أو تدفق نشر صبغة الخلوي فحص لتحديد ما إذا كانت الخلايا الموجودة في مركز اعتقال G1 أو proliferatin الخارجيز حلقة، والمسافة من الخلايا الفردية من على حافة كروي. وقد وضعت هذه الأساليب لدينا في المنشور السابق، حيث أثبتنا أن خلايا سرطان الجلد في مناطق ميتة في وسط كروي و / أو في وجود العلاجات المستهدفة تكون قادرة على البقاء في اعتقال G1 لفترات طويلة من الزمن، ويمكن إعادة دخول دورة الخلية عندما تنشأ ظروف أكثر ملاءمة ^7.

Protocol

1. FUCCI تنبيغ والثقافة خلية

1. FUCCI تنبيغ
   1. إنشاء خطوط الخلايا معربا عن ستابلي FUCCI يبني mKO2-hCdt1 (30-120) وMAG-hGem (1-100) ¹⁵ باستخدام الفيروسة البطيئة المشارك تنبيغ كما هو موضح سابقا ^7.
      ملاحظة: نظام FUCCI هو الآن متاحة تجاريا.
   2. توليد الحيوانات المستنسخة الفرعية مع مضان مشرق من خلال الفرز وحيدة الخلية. خلايا النوع احدة إيجابية لكلا AG وKO (الأصفر) من خلال مضان خلية تنشيط الفرز في لوحة 96-جيدا كما هو موضح سابقا ^7،16.
2. ثقافة خلية سرطان الجلد
   1. ثقافة C8161 خلايا سرطان الجلد البشري كما هو موضح سابقا ^7،17.

2. 3D كروي تشكيل (كما هو موضح سابقا ^3،9)

1. إعداد لوحة الاغاروز
   1. حل 1.5٪ الاغاروز (أو أجار النبيل) في 100 مل من محلول هانك الملح المتوازن (HBSS) أو buffere الفوسفاتد المالحة (PBS) من الغليان في الميكروويف لمدة 3-5 دقائق مع دوامات. تأكد من حل الاغاروز تماما.
   2. الاستغناء على الفور 100 ميكرولتر من الحل الاغاروز لكل بئر إلى 96-جيدا لوحة زراعة الأنسجة مسطحة القاع باستخدام ماصة متعدد القنوات.
      ملاحظة: قد الاغاروز يصلب في نصائح بعد فترة قصيرة من الزمن، للتغلب يجب تغيير هذه المشكلة النصائح بين لوحات إذا جعل أكثر من لوحة الاغاروز.
   3. ترك لوحة 96-جيدا على سطح مستو لتتصلب الاغاروز لا يقل عن 1 ساعة.
2. إعداد الخلايا وتراكب على الاغاروز
   1. تنمو الخلايا إلى ما يقرب من 80٪ confluency في قارورة T75. تغسل مع 10 مل من HBSS.
   2. فصل الخلايا باستخدام 1.5 مل من 0.05٪ التربسين / ثنائي أمين الإيثيلين رباعي حمض الخل (EDTA) وresuspend في 10 مل من المتوسط ​​العادي.
   3. عد الخلايا باستخدام عدادة الكريات ¹⁸ أو غيرها من طريقة العد الآلي.
   4. الخلايا resuspend إلى تركيز النهائي من 25000 خلية / مل في القاعدةآل المتوسطة.
   5. تراكب الآبار الاغاروز مع 200 ميكرولتر من تعليق خلية لالعدد النهائي للخلايا في 5000 أيضا.
   6. لوحات عودة إلى حاضنة الثقافة الخلية (5٪ CO ₂ و 37 ج) لتشكيل الأجسام الشبه الكروية على ما يقرب من 3 أيام.
      ملاحظة: الوقت المستغرق لتشكيل كروي يختلف بين خطوط مختلفة من الخلايا. بعض خطوط الخلايا لا تشكل الأجسام الشبه الكروية باستخدام هذه الطريقة على الإطلاق.
   7. صورة كروي التشكل مع مجهر مقلوب باستخدام الهدف 4X ومرشح النقيض من المرحلة. A خط الخلية التي تشكل بنجاح سوف الكروية تنتج المدمجة، وحدات الخلايا كروية تقريبا، وينبغي أن يكون هناك كروي واحد فقط لكل بئر.
      ملاحظة: اختياري: مرة واحدة وقد شكلت الكروية، فإنها يمكن زرعها في الكولاجين أو مصفوفة أخرى لمزيد من التحليل للنمو والغزو ^3،7،17. لإزالة الأجسام الشبه الكروية من الكولاجين، علاج مع 500 ميكرولتر من 2 ملغ / مل كولاجيناز عند 37 درجة مئوية حتى يذوب الكولاجين يكفي لspherالكويكبات القادمة مجانية في وسائل الإعلام (حوالي 30 دقيقة). بلطف إزالة الأجسام الشبه الكروية باستخدام ماصة 1 مل.
   8. لباجتزاء / التصوير الكروية الإصلاح (إما معزولة من الكولاجين أو نمت لمدة 3-5 أيام على الاغاروز) في 10٪ من الفورمالين محايدة مخزنة (تنبيه: الفورمالين ينبغي أن تستخدم في خزانة الدخان) لا يقل عن 2 ساعة في درجة حرارة الغرفة (RT) ، أو بين عشية وضحاها (O / N) في 4 درجات مئوية. قد يتم تخزين الكروية في HBSS في 4 درجات مئوية لعدة أيام.

3. الجسم الشبه الكروي Vibratome باجتزاء

1. حل 5 غرام من انخفاض الاغاروز نقطة انصهار في 100 مل من HBSS في زجاجة 500 مل في الميكروويف. استخدام إعداد الحرارة المتوسطة مع دوامات. تنبيه: حافظ على غطاء فضفاض عند الغليان الحل بحيث يمكن أن يتم الافراج عن الضغط. استخدام القفازات المقاومة للحرارة وقائية لحماية اليدين من حروق عند التعامل مع زجاجة ساخنة.
2. انتظر حتى يبرد الاغاروز قليلا - حتى يمكن لمسه الزجاجة دون حرق اليدين.
3. صب approximately 2 مل من الاغاروز في الجزء السفلي من عداد كوب كولتر أو قالب من البلاستيك مماثلة. نضح على الفور كروي ثابت (انظر القسم 2.2.8) باستخدام ماصة 1 مل في أصغر حجم ممكن السائل. إضافة كروي إلى الاغاروز. ويمكن إضافة عدد قليل من الكروية (تصل إلى 10) للكوب الواحد.
4. تغطية الكروية مع 2 مل أكثر من الاغاروز. القيام بذلك بسرعة لتجنب تصلب الاغاروز قبل إضافة الطبقة الثانية.
5. السماح للالاغاروز لتتصلب في RT في الظلام لمدة لا تقل عن 3 ساعة. قد تكون مخزنة في هذه النقطة الكؤوس لفترة قصيرة في 4 ° C مع 2-3 مل من HBSS مضافين لمنع الجفاف.
6. إزالة الاغاروز من الكأس. تقليم الاغاروز التي تحتوي على الأجسام الشبه الكروية بحيث يناسب على كتلة معدنية vibratome، والكروية هي قريبة من الجزء العلوي من الاغاروز. ويمكن رؤية الأجسام الشبه الكروية ككائنات صغيرة بيضاء داخل الاغاروز. سوبر الغراء الاغاروز إلى كتلة.
7. ملء vibratome مع الماء المقطر وجبل كتلة في vibratome. تعيينvibratome لقطع 100 ميكرون المقاطع باستخدام سرعة منخفضة (وضع 2) والاهتزاز عالية (وضع 8). ضبط زاوية شفرة القطع إلى 16 درجة. تحويل vibratome على، بدوره على ضوء vibratome وقطع مقاطع من الجزء العلوي من الاغاروز حتى يتم قطع 100 ميكرون أقسام كروي. وضع المقاطع كروي يقتطع HBSS في 24 لوحة جيدا.
8. اختيار المقاطع المتوسطة لتحليل الصور. أقسام جبل على الشرائح عن طريق تحويل قسم شقة على الشريحة باستخدام الملقط. حقنة ملء برميل 10 مل مع الشحوم فراغ. إضافة سطر رقيقة من الشحوم فراغ حول حواف القسم من أجل منع وسائل الإعلام متزايدة من يلوذ بالفرار حواف الشريحة ومساعدة ختم هذا الباب في ساترة. تغطية القسم مع تصاعد المتوسطة وساترة. ختم حواف ساترة مع طلاء الأظافر. متجر الشرائح في 4 درجات مئوية قبل التصوير.

4. متحد البؤر الحصول على الصور

1. التقاط صورة ض شريحة من قسم كروي منتصف FUCCI باستخدام 10Xأو الهدف 20X كما هو موضح سابقا ^7. تأكد من عدم تداخل أو الحديث المتبادل يحدث بين Kusabira Orange2 والأعظمي الأخضر. إذا بمقارنة تحليل الصور بين أقسام كروي متعددة، والحفاظ على قوة الليزر وغيرها من الأماكن نفسها بين العينات.

5. هويشت صبغ إنتشار الفحص عن تدفق الفرز

1. نقل الكروية الحية (3-5 أيام بعد البذر الاغاروز) إلى أنبوب 15 مل. السماح الكروية خطورة تترسب في قاع الأنبوب. قد تكون ملطخة عدة الكروية في أنبوب. وهناك حاجة إلى ما يقرب من 20 الكروية للحصول على أرقام الخلية كافية لالتدفق الخلوي.
2. إزالة المتوسطة الزائد وإضافة 1 مل من 10 ميكرومتر هويشت مخففة في المتوسط ​​العادي. احتضان الكروية عند 37 درجة مئوية لمدة حوالي 1 ساعة. استخدام عبها لطيف ل resuspend الكروية مرة أو مرتين خلال الحضانة.
   ملاحظة: فترة حضانة قد تكون متنوعة لتغيير مدى تخترق صبغ هويشت في الكروية. وتختلف هذه القائمة علىحجم كروي والكثافة وخط الخلية. بالنسبة لبعض الكروية الكبيرة / الكثيفة قد يكون هناك اختراق صبغ الأقصى الذي هو أقل من 100٪.
3. غسل الكروية بلطف مع 5 مل من HBSS باستخدام الجاذبية تسوية.
   1. اختياري: لتصوير تغلغل الصبغة: إصلاح الكروية مع 10٪ من الفورمالين محايدة مخزنة لا يقل عن 2 ساعة على RT أو O / N عند 4 درجات مئوية. إعداد vibratome أقسام، جبل على الشرائح والصورة على مبائر كما هو موضح في الخطوات 3 و 4 أعلاه.
4. لإعداد الخلايا للالتدفق الخلوي، ويعرض للتريبسين الكروية مع 1 مل من 0.05٪ التربسين / EDTA عند 37 درجة مئوية لمدة حوالي 30 دقيقة مع التحريك كل 10 دقيقة لكسر الكروية على حدة.
   ملاحظة: الأجسام الشبه الكروية هي صعبة للوصول الى تعليق خلية واحدة، قد تكون هناك حاجة إلى أن يكون الأمثل الظروف. جدوى C8161 4 أيام الكروية القديمة بعد هذه العملية هي حوالي 95٪.
5. خلايا صمة عار مع العيش بالقرب من الأشعة تحت الحمراء / وصمة عار الميتة وفقا لبروتوكول المصنعين. يغسل مع HBSS ثم إصلاح مع 1مل من 10٪ من الفورمالين محايدة مخزنة لحوالي 30 دقيقة. قد يتم تخزين الخلايا في HBSS في 4 درجات مئوية لعدة أيام قبل تحليل التدفق.

6. تحليل تدفق الخلوي من هويشت الملون FUCCI الأجسام الشبه الكروية

1. لا تجمعت ضمان الخلايا معا عن طريق تمرير لهم من خلال مصفاة الخلية. و resuspend ملطخة هويشت الكروية FUCCI في الجليد غسل FACS الباردة (PBS مع 5٪ الجنين مصل العجل) بتركيز 1-5 × 10 ⁶ خلية / مل. نقل 200 ميكرولتر من عينة إلى 5 مل جولة أنابيب أسفل.
2. إعداد عينات السيطرة لون واحد التالية كما هو موضح في 6.1: خلايا سرطان الجلد الملون للأمم المتحدة؛ خلايا سرطان الجلد الملتصقة ملطخة 10 ميكرومتر هويشت لمدة 1 ساعة. AZAMI الأخضر يعبر فقط خلايا سرطان الجلد. وKusabira البرتقالي يعبر فقط خلايا سرطان الجلد.
   ملاحظة: الضوابط لون واحد قد تكون ثابتة في الفورمالين وتخزينها في FACS غسل بنسبة 0.1٪ أزيد الصوديوم في 4 درجة مئوية لمدة أسابيع أو حتى أشهر.
3. تعليق خلية واحدة تشغيل ستدفق غ الخلوي محلل مع الليزر المناسبة ولون واحد / الضوابط غير ملوثين كما سبق وصفه ^7،16.
4. استخدام البرمجيات الخلوي التجاري مثل FlowJo لتحليل الداخلية مقابل الخلايا كروي الخارجي على النحو التالي:
   1. إزالة الأنقاض التي تبوب على السكان الخلية الرئيسية في ضوء توجيه مبعثرة (FSC) مقابل الجانب على ضوء مبعثرة (SSC).
   2. إزالة الحلل التي تبوب على الخلايا واحدة باستخدام FSC (المنطقة) مقابل FSC (الارتفاع)
   3. بوابة للخلايا الحية النابضة على الحي / الميت السكان منخفضة.
   4. تعريف هويشت خلايا عالية، بوابات بناء على اشارة ايجابية من الخلايا الملتصقة ملطخة هويشت، وخلايا "الخارجي".
   5. تعريف هويشت خلايا منخفضة أو سلبية، بوابات بناء على إشارة من السيطرة الملطخة الأمم المتحدة، وخلايا "الداخلية".
   6. بعد النابضة للسكان الداخلي والخارجي، وخلايا يمكن بوابات أخرى لFUCCI الأحمر (G1)، والأصفر (S المبكر) والأخضر (S / G2 / M) أو السلبي (G1 المبكر).
      ملاحظة: Compensation باستخدام عناصر التحكم لون واحد قد تكون هناك حاجة لتعريف صحيح FUCCI السكان الأحمر والأصفر والأخضر والسلبية.
5. مرة واحدة وقد تم تحسين الفحص والتحقق من صحة هويشت الاختراق عن طريق الفحص المجهري متحد البؤر، تشغيل خلايا دون تحديد على فارز خلية تدفق كما هو موضح سابقا ^7،16 لمزيد من التحليل للخلية الحية الفرعية من السكان.

تحليل 7. صورة من أقسام FUCCI كروي

1. البرمجيات مفتوحة على سبيل المثال. Volocity، واختيار التكوين الوحيد الكميات.
2. إنشاء مكتبة جديدة. استيراد FUCCI كروي ملف صورة مبائر في البرنامج عن طريق سحب ملف البيانات الخام من متحد البؤر في المكتبة. بدلا من ذلك، استخدم ملف> الأمر استيراد.
3. انتقل إلى علامة التبويب قياسات لبناء بروتوكول تحليل الصور. هو مبني على البروتوكول عن طريق سحب وإسقاط الأوامر المناسبة في الترتيب الصحيح على النحو التالي في إطار البروتوكول.
4. البحث عن الكائناتالنظام الأوروبي في القناة الخضراء: اسحب الكائنات اكتشاف الأمر (وجدت في "الحقائق") في إطار بروتوكول، حدد القناة الصحيحة في الكائنات العثور protocol.Add أمر مفتوح (وجدت في "معالجة")، ثم اعترض لمس منفصلة الأمر (وجدت في "معالجة" - وهذا سوف فصل الخلايا). استبعاد الكائنات عن طريق حجم <50 ميكرون (وجدت في "تصفية" - وهذا سوف استبعاد الأشياء غير الخلوية الصغيرة).
   ملاحظة: متغيرات مثل الكائنات العثور على العتبة، عدد التكرارات مفتوحة، وحجم الكائنات التي سيتم فصلها وحجم الكائنات إلى استبعاد يجب أن يكون الأمثل يدويا حتى تطابق أقنعة وجوه الصورة.
5. العثور على كائنات في القناة الحمراء: تكرار عثور على الأشياء على النحو الوارد أعلاه للقناة الحمراء. قد تحتاج بروتوكولات الخضراء والحمراء لتعديلها بشكل منفصل.
   ملاحظة: نظرا لنوى يجري في G2، نوى الخضراء غالبا ما تكون أكبر قليلا.
6. تأكيد الأشياء التي يعثر عليها هي دقيقة: تأكيد الأحمر وتطابق الكائنات الخضراء للنوى الحمراء والخضراء في الصورة عن طريق إيقاف وعلى قنوات خضراء وحمراء (باستخدام إخفاء أو إظهار القيادة قناة) أثناء عرض أقنعة حمراء وخضراء وجدت من قبل البروتوكول. خيارات الملاحظات (القياسات> خيارات ردود الفعل) يمكن أن تستخدم لتعديل مظهر أقنعة وجوه.
7. العثور على كائنات صفراء (خلايا مرحلة مبكرة S): العثور على خلايا صفراء، إضافة تتقاطع مع الخلايا الحمراء الخضراء الأوامر (وجدت في "الجمع"). استبعاد الأشياء حسب الحجم (<50 ميكرون، وجدت في 'تصفية') لاستبعاد أي أشياء غير الخلوية الصغيرة.
8. البحث عن الكائنات الحمراء حصرا (خلايا المرحلة G1): لإيجاد نواة الحمراء حصرا، وطرح الخلايا الصفراء من خلايا الدم الحمراء (وجدت في "الجمع"). استبعاد الكائنات عن طريق حجم <50 ميكرون، (وجدت في 'تصفية') لإزالة أي أجسام غير الخلوية الصغيرة التي تم إنشاؤها.
9. البحث عن الكائنات الخضراء حصرا (خلايا المرحلة S / G2 / M): كرر لقناة الخضراء لتجد الأخضر حصرا.
   لاالشركة المصرية للاتصالات: إذا كان لا يزال هناك أشياء غير الخلوية المتبقية، يمكن إضافة أمر السكان مرشح لبروتوكولات الخضراء أو حصرية حصرية الحمراء (وجدت في 'تصفية') للاحتفاظ فقط الكائنات مع عامل شكل أكبر من 0.25. سيؤدي هذا إلى إزالة الكائنات غير دائرية.
10. العثور على مخطط كروي: العثور على مخطط كروي باستخدام العثور على كائنات الأوامر (وجدت في "الحقائق") مع قناة خضراء أو حمراء (أيهما ديه المزيد من الخلايا حول حافة كروي). A أقل بكثير عتبة (وجدت في العثور على الأشياء المتغيرات) سوف تحتاج إلى استخدامها للعثور على مخطط كروي مقارنة مع الخلايا الفردية.
    1. استخدام أمر وثيق للانضمام الأجسام (وجدت في "معالجة")، ثم ملء الثقوب في الأشياء (وجدت في "معالجة")، ثم استخدام عامل تصفية غرامة (وجدت في 'تصفية') لإزالة الضوضاء من الكائنات. وأخيرا، واستبعاد الكائنات عن طريق حجم لإزالة الأجسام الصغيرة <30000 ميكرون (اعتمادا على حجم كروي).
       ملاحظة: هذا البروتوكول سوف تحتاج إلى أن يكون الأمثل يدويا حتى مخطط كروي دقيق. ويمكن أيضا صورة brightfield استخدامها - ولكن هذا عادة ما يكون أقل دقة مع قسم كروي، وأمر قلب (وجدت في "الجمع") سوف تحتاج لاستخدامه.
11. قياس المسافات من نواة لمخطط كروي: قياس المسافات (وجدت في 'المتعلقة') من سكان الأصفر والأخضر والأحمر حصرا حصرا من النقطه الوسطى الخلية إلى حافة كروي outline.To تصور الحد الأدنى للمسافات التي ينبغي أن تكون من الخلية إلى أقرب حافة كروي، بدوره على عرض المسافات في علامة التبويب العلاقات في الخيارات ردود الفعل (القياسات> خيارات ملاحظات> العلاقات).
12. حفظ البروتوكول. هذا البروتوكول يجوز إعادة تطبيقها لغيرها من الصور باستخدام القياسات> الأمر استعادة البروتوكول.
13. إنشاء عنصر القياسات (القياسات> جعل قياس البند). يجوز تحليل البيانات باستخدام تحليلالدالات.
    1. انتقل إلى علامة التبويب تحليل في هذا البند القياسات. انتقل إلى القائمة التحليل (تحليل> تحليل) وتحليل الحد الأدنى للمسافة من النقطه الوسطى خلية (أحمر، أخضر أو ​​أصفر) إلى حافة كروي، لخصها العد والتي نظمتها السكان.
    2. لحساب عدد من الخلايا التي توجد على مسافة معينة من على حافة إنشاء فلتر (تحليل> تصفية). يستند عامل لمدة لا تقل عن بعد في الشكل 2 على هويشت الاختراق (مثل الحد الأدنى للمسافة أقل من 80 يعطي السكان "الخارجي"). بدلا من ذلك، تصدير البيانات الخام إلى جدول بيانات لمزيد من التحليل.

النتائج

هناك عدة طرق لإنتاج الأجسام الشبه الكروية الورم، ويستخدم هذا البروتوكول طريقة نمو غير ملتصقة، حيث يتم استزراع الخلايا على أجار أو ^3،7،9 الاغاروز الشكل يظهر 1 مثال على كروي C8161 سرطان الجلد بعد 3 أيام على أجار. الكروية C8161 شكل الكروية العادية الحج?...

Discussion

حدد تحليل الصور الآلي شبه والداخلية G1 القبض المنطقة كروي، وتنتشر الطبقات الخارجية. هذه الطريقة يمكن أن تستخدم في الكروية الحية باستخدام الجزء البصري، أو في أقسام كروي ثابت، لتحديد التغييرات ليس فقط في دورة الخلية ولكن علامة التعبير (عن طريق المناعي)، موت الخلايا، أو...

Materials

Name	Company	Catalog Number	Comments
Hoechst 33342	Life Technologies	H3570
agarose low melting point	Life Technologies	16520-050	For sectioning
noble agar	Sigma	A5431	For making spheroids
agarose for spheroids	Fisher Scientific	BP1356-100	For making spheroids
0.05% trypsin/EDTA	Life Technologies	25300-054
HBSS	Life Technologies	14175-103
10% formalin	Sigma	HT5014-1CS	CAUTION: Harmful, corrosive. Use Personal Protective Equipment, do  not breath fumes (open in a fume cupboard).
live/dead near IR	Life Technologies	L10119
vibratome	Technical Products International, Inc
coulture cup	Thermo-Fisher Scientific	SIE936	Mold for sectioning spheroids
hemocytometer	Sigma	Z359629
96-well tissue culture plate	Invitro	FAL353072
collagenase	Sigma	C5138
confocal microscope	Leica	TCS SP5
Flow cytometer analyser	Becton Dickinson	LSRFortessa
volocity	PerkinElmer		Imaging software
flowjo	Tree Star		Flow cytometry software
Vaccuum grease	Sigma	Z273554
Mounting media	Vector Laboratories	H1000
FUCCI (commercial constructs)	Life Technologies	P36238	Transient transfection only
Cell strainer 70 um	In Vitro	FAL352350
Round bottom 5 mL tubes (sterile)	In Vitro	FAL352003
Round bottom 5 mL tubes (non-sterile)	In Vitro	FAL352008