تظهر هنا طريقة قابلة للتكرار وبأسعار معقولة وقوية لعزل وتوسيع الخلايا الظهارية القصبية الأولية للبنوك الحيوية طويلة الأجل وتوليد الخلايا الظهارية المتمايزة عن طريق الثقافة في واجهة الهواء والسائل.
تشكل طبقة الخلايا الظهارية في مجرى الهواء الحاجز الأول بين أنسجة الرئة والبيئة الخارجية ، وبالتالي تتعرض باستمرار للمواد المستنشقة ، بما في ذلك العوامل المعدية وملوثات الهواء. تلعب الطبقة الظهارية في مجرى الهواء دورا مركزيا في مجموعة كبيرة ومتنوعة من أمراض الرئة الحادة والمزمنة ، ويتم إعطاء العلاجات المختلفة التي تستهدف هذه الظهارة عن طريق الاستنشاق. يتطلب فهم دور الظهارة في التسبب في المرض وكيف يمكن استهدافه للعلاج نماذج قوية وتمثيلية. يتم استخدام نماذج الثقافة الظهارية في المختبر بشكل متزايد وتوفر ميزة إجراء التجارب في بيئة خاضعة للرقابة ، مما يعرض الخلايا لأنواع مختلفة من المحفزات أو المواد السامة أو العوامل المعدية. يتميز استخدام الخلايا الأولية بدلا من خطوط الخلايا الخالدة أو السرطانية بأن هذه الخلايا تتمايز في الثقافة إلى طبقة الخلايا الظهارية المستقطبة الزائفة مع تمثيل أفضل للظهارة مقارنة بخطوط الخلايا.
يظهر هنا بروتوكول قوي ، تم تحسينه على مدار العقود الماضية ، لعزل وزراعة الخلايا الظهارية في مجرى الهواء من أنسجة الرئة. يسمح هذا الإجراء بالعزل الناجح والتوسع والثقافة والتمايز المخاطي الهدبي للخلايا الظهارية القصبية الأولية (PBECs) عن طريق الزراعة في واجهة الهواء والسائل (ALI) ويتضمن بروتوكولا للبنوك الحيوية. علاوة على ذلك ، يتم وصف توصيف هذه الثقافات باستخدام جينات علامة خاصة بالخلية. يمكن استخدام مزارع ALI-PBEC هذه لمجموعة من التطبيقات ، بما في ذلك التعرض لدخان السجائر الكامل أو الوسطاء الالتهابيين ، والمزارع المشتركة / العدوى بالفيروسات أو البكتيريا.
من المتوقع أن يوفر البروتوكول المقدم في هذه المخطوطة ، والذي يوضح الإجراء بطريقة تدريجية ، أساسا و / أو مرجعا للمهتمين بتنفيذ أو تكييف أنظمة الاستزراع هذه في مختبراتهم.
تم وصف دور ظهارة مجرى الهواء في مجموعة متنوعة من أمراض الرئة الحادة والمزمنة في مراجعات مختلفة1،2،3،4،5،6،7. تعد الثقافات المتمايزة جيدا للخلايا الظهارية في مجرى الهواء أداة مهمة لكشف دور ظهارة مجرى الهواء. يتم تطبيق ثقافة الخلايا الظهارية في مجرى الهواء والسائل (ALI) على نطاق واسع لتعزيز تمايز الخلايا الظهارية القاعدية في مجرى الهواء وبالتالي دراسة ظهارة مجرى الهواء بشكل موثوق في المختبر 8,9. في السنوات الماضية ، زاد استخدام هذه النماذج بشكل أكبر نتيجة للمبادرات البحثية الجديدة المتعلقة بجائحة COVID-19 والانتقال العالمي إلى البحوث الخالية من الحيوانات. لذلك ، فإن الاستخدام المتزايد لخط الخلايا النموذجي هذا يؤكد الحاجة إلى تبادل الإجراءات والخبرات للحصول على نتائج قوية. سيسمح هذا أيضا بمقارنة النتائج بين مجموعات البحث. متانة الإجراء هي السمة الرئيسية وبالتالي يجب أن تخضع لمراقبة الجودة. استثمرت العديد من المختبرات في تطوير بروتوكولات لزراعة الخلايا الظهارية في مجرى الهواء الأولي في ALI. يمكن تقليل الوقت والجهد والميزانية المطلوبة عند مشاركة هذه الإجراءات بالتفصيل. تتضمن هذه التفاصيل ، على سبيل المثال ، اختيار البلاستيك والوسائط المزروعة بالخلايا التي توفرها مختلف الشركات المصنعة ، حيث وجد أن هذا يؤثر على خصائص الثقافات التي تم الحصول عليها10،11،12. وهذا يؤكد على أهمية تبادل الخبرات وتفاصيل إجراءات الثقافة، لأنه في غياب مثل هذه الرؤى، قد تتأثر النتائج و / أو قد تعرقل جهود التحقق عبر مختلف المختبرات.
تتكون ظهارة الرئة البشرية من أنواع مختلفة من الخلايا ، بما في ذلك الأنواع الرئيسية مثل الخلايا القاعدية والخلايا المهدبة والخلايا الكأسية وخلايا النادي. من أجل محاكاة طبقة الخلايا الظهارية في الشعب الهوائية بشكل موثوق في المختبر ، يجب تمثيل أنواع الخلايا هذه في نماذج الثقافة ، والحفاظ على استقطابها ووظيفتها13،14،15،16. إن إدراك أن خصائص المانحين (بما في ذلك حالة المرض) والأصل التشريحي للخلايا (أي الأنف والقصبة الهوائية والممرات الهوائية الكبيرة والصغيرة) قد تؤثر على التركيب الخلوي والاستجابات الوظيفية لثقافة الخلية أمر مهم بنفس القدر. تعد الخبرة والممارسة ذات الصلة شرطا أساسيا لاستزراع الخلايا الظهارية الأولية في مجرى الهواء بنجاح وتقييم جودة الثقافة بشكل حدسي (عن طريق الفحص البصري أثناء الثقافة) وبشكل كمي. الهدف من هذه المساهمة هو توفير طريقة فعالة من حيث التكلفة والوقت لعزل وزراعة الخلايا الظهارية القصبية البشرية الأولية (PBECs) التي يمكن تطبيقها أيضا على زراعة الخلايا الظهارية القصبة الهوائية والهوائية الصغيرة. بالإضافة إلى وصف طريقة لعزل هذه الخلايا من أنسجة الرئة المقطوعة ، يتم تقديم ومناقشة طريقة للتوسع والبنوك الحيوية ، وأخيرا لإنشاء وتوصيف ثقافة ALI متمايزة جيدا ضمن تكلفة معقولة وفترة زمنية.
تم عزل الخلايا من أنسجة الرئة الطبيعية المجهرية التي تم الحصول عليها من المرضى الذين يخضعون لجراحة استئصال سرطان الرئة في المركز الطبي بجامعة ليدن ، هولندا. تم تسجيل المرضى الذين تم اشتقاق أنسجة الرئة منهم في البنك الحيوي عبر نظام عدم ممانعة للاستخدام الإضافي المجهول المشفر لمثل هذه الأنسجة (www.coreon.org). ومع ذلك ، منذ 01-09-2022 ، تم تسجيل المرضى في البنك الحيوي باستخدام الموافقة المستنيرة النشطة وفقا للوائح المحلية من البنك الحيوي LUMC بموافقة لجنة الأخلاقيات الطبية المؤسسية (B20.042 / Ab / ab و B20.042 / Kb / kb).
ملاحظة: يتم تنفيذ جميع الإجراءات في خزانة السلامة البيولوجية ، وفقا لقواعد السلامة البيولوجية المحلية ، وتحت ظروف عمل معقمة أثناء ارتداء القفازات الجراحية ومعطف المختبر ، ما لم ينص على خلاف ذلك. للاطلاع على جميع الوسائط والكواشف والحلول الأخرى المستخدمة في البروتوكول، يرجى الاطلاع على جدول المواد والجدول التكميلي 1. يرجى الاطلاع على الشكل 1 للحصول على خطوات البروتوكول التفصيلية
1. عزل الخلايا الظهارية الشعب الهوائية من أنسجة الرئة البشرية
ملاحظة: للحصول على معدل نجاح مثالي لعزل الخلايا الظهارية القصبية ، يجب أن تبقى حلقة الشعب الهوائية المستأصلة مغمورة عند 4 درجات مئوية لمدة أقصاها 24 ساعة في محلول ملحي مخزن بالفوسفات (PBS) مع إضافة Primocin.
2. الحفظ بالتبريد للخلايا الظهارية القصبية الأولية البشرية (PBECs)
ملاحظة: عند العمل مع درجات حرارة -80 درجة مئوية و -196 درجة مئوية ، يتم استخدام قفازات التبريد للحماية ، وتستخدم الملقط لنقل القوارير المجمدة. عند العمل مع النيتروجين السائل ، يتم استخدام قفازات التبريد ودرع الوجه للحماية الشخصية.
3. إذابة PBECs المحفوظة بالتبريد وتنميتها للثقافة على الإدخالات
4. إنشاء ثقافة واجهة الهواء السائل مع الخلايا الظهارية القصبية الأولية (ALI-PBEC)
ملاحظة: الإجراء التالي مخصص لاستزراع PBECs على إدخالات القطر الداخلي 11.9 مم.
5. إنشاء ثقافة ALI-PBEC من مجموعة مختلطة من المانحين
6. مراقبة جودة ثقافة ALI-PBEC
الشكل 1: نظرة عامة تخطيطية على إجراءات عزل الخلايا الطلائية القصبية الأولية وتمددها وزراعتها . (أ) يتم الحصول على أنسجة الرئة أثناء جراحة استئصال السرطان ويقوم أخصائي علم الأمراض باستئصال أنسجة حلقة الشعب الهوائية الطبيعية مجهريا وخالية من الورم. (ب) تنظف حلقة الشعب الهوائية وتخضع للعلاج الأنزيمي لفصل الطبقة الخلوية وفصلها. (ج) يغسل معلق الخلية المسترجعة وتوزع الخلايا في آبار صفيحة من 6 آبار للتمدد. (د) عند التوسع الكافي للخلايا المعزولة في c-KSFM مع بريموسين ، يتم فصل طبقات الخلايا عن طريق التربسين ويتم إعادة تعليق الخلايا في وسط التجمد للحفظ بالتبريد. عند الحاجة ، يتم إذابة الخلايا المحفوظة بالتبريد وتوسيعها مرة أخرى باستخدام c-KSFM مع البنسلين / الستربتومايسين في قوارير زراعة الخلايا. بعد التوسع ، يتم بذرها في وسط cBD على إدراج زراعة الخلايا. (هاء) تتم زراعة ALI-PBEC على مرحلتين رئيسيتين: المرحلة المغمورة في وسط cBD المكمل ب 1 نانومتر EC 23 حتى تصل الخلايا إلى الالتقاء الكامل ، تليها إزالة الوسط القمي والمزرعة في ALI للسماح بالتمايز. في مرحلة ALI هذه ، يتم استزراع الخلايا في وسط cBD مع استكمال 50 نانومتر EC 23. (إب) تمثيل رسومي للخلايا القاعدية التي تغطي الإدراج أثناء الاستزراع المغمور. (ه) تمثيل رسومي لطبقة الخلايا الظهارية المتمايزة التي تم الحصول عليها بعد الثقافة في ALI في وجود تركيزات متزايدة من EC 23. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
التوسع باستخدام الثقافة المغمورة
باستخدام الطريقة المعروضة هنا ، يمكن الحصول على ما معدله ثمانية كريوفيالات تحتوي على 400000 خلية / كريوفيال من صفيحة واحدة ذات 6 آبار للتخزين طويل الأجل في النيتروجين السائل (الشكل 2 أ). لتحقيق ذلك ، يتم استزراع PBECs المعزولة في ألواح من 6 آبار لمدة لا تقل عن 7 أيام وبحد أقصى 14 يوما (الشكل 2 ب) في وجود Primocin لاستبعاد التلوث الميكروبي (خاصة الميكوبلازما). يقدم الشكل 2 أ ، ب نظرة ثاقبة على أعداد الخلايا التي تم الحصول عليها ووقت المزرعة المطلوب بين عزلات مختلفة من مختلف المتبرعين. قبل حصاد الخلايا عن طريق التربسين للتخزين في النيتروجين السائل ، يجب أن يكون التقاء أكثر من 80 ٪. إذا لم يتحقق ذلك في غضون 14 يوما ، فلا ينبغي حفظ الخلايا بالتبريد. الأهم من ذلك ، عند الحصاد للتخزين والمرور ، يجب ألا يتجاوز التقاء طبقة الخلية ~ 95٪ (الشكل 2C). بعد التخزين في النيتروجين السائل ، يمكن إذابة الخلايا واستزراعها للتوسع حتى يتم الحصول على أعداد خلايا كافية لمزارع ALI. الوسط المستخدم لتوسيع الخلايا في هذه المرحلة هو c-KSFM ، على غرار ما حدث أثناء الاستزراع الأولي بعد الحصاد من حلقة الشعب الهوائية18. ومع ذلك ، ليست هناك حاجة إلى Primocin في هذه المرحلة ، لأن خطر التلوث الميكروبي الإضافي الناشئ عن أنسجة الرئة غائب ، وبالتالي يمكن تغيير Primocin للبنسلين / الستربتومايسين. تفضل هذه الوسيلة الخلايا الظهارية على الخلايا الليفية ، وبالتالي تمنع النمو الزائد المحتمل للثقافة عن طريق تكاثر الخلايا الليفيةبشكل أسرع 19،20،21. باستخدام وسط c-KSFM ، تنتشر الخلايا في القارورة ولا تتصل ببعضها البعض ، وهو ما يختلف بشكل ملحوظ عن مورفولوجيا الخلايا المستزرعة المغمورة في هذه المرحلة في وسط cBD (الشكل 2D ، E). بعد 5 أو 6 أيام من زراعة الخلايا المذابة في قارورة T75 ، يجب أن تكون طبقة الخلية متقاربة بنسبة 80٪ -95٪ ، وهو ما يترجم إلى ما يقرب من 3 × 106 خلايا في المجموع (الشكل 2F). من هذا ، يمكن إنشاء ما يقرب من 75 إدراج (حجم لوحة 12 بئرا) لثقافة ALI.
يمكن أيضا تكييف طريقة العزلة والثقافة الموصوفة في هذه المساهمة لاستخدامها مع خزعات الشعب الهوائية أو فرش الشعب الهوائية كمواد أولية.
الشكل 2: تمدد الخلايا القاعدية قبل الحفظ بالتبريد. تم عزل الخلايا وفقا للبروتوكول الموصوف واستزراعها باستخدام c-KSFM. تم رصد عدد الخلايا المتولدة لكل متبرع ، وتم إجراء عدد الخلايا الحية باستخدام عداد الخلايا الآلي (A) عند حصاد خلايا المرور 0 (P0) من ألواح الآبار ال 6 (الخطوة 2 من البروتوكول) ، n = 123 مانحا ، تم تقديم عدد الخلايا على أنه عدد الخلايا التي تم حصادها لكل بئر ؛ تمثل كل نقطة متبرعا واحدا ويشار إلى الوسيط بشريط أفقي. (ب) كجزء من مراقبة الجودة ، تم رصد الوقت المطلوب لخلايا P0 للوصول إلى التقاء 80٪ إلى 90٪ في ألواح 6 آبار وعرضها كأيام بعد بدء الثقافة المغمورة في c-KSFM (ن = 127 مانحا مختلفا). يشار إلى كل متبرع فردي بنقطة ، وجميع النقاط التي تنتمي إلى 1 يوم تندمج في خط ؛ كلما اتسع الخط كلما زاد عدد المانحين الذين يمثلهم ؛ يشار إلى متوسط عدد الأيام التي تكون فيها الخلايا في الثقافة بشريط أفقي أرق. (ج) صورة برايت فيلد تمثيلية لخلايا P0 المزروعة في c-KSFM في اللحظة التي تم فيها حصاد الخلايا للحفظ بالتبريد على المدى الطويل. (د) صورة برايت فيلد تمثيلية لخلايا P1 المزروعة في c-KSFM في اللحظة التي تم فيها حصاد الخلايا ونقلها إلى إدخالات و (ه) خلايا P1 المزروعة في وسط cBD. (و) تم رصد عدد الخلايا الحية المتولدة لكل متبرع باستخدام عداد خلايا آلي عند حصاد خلايا P1 من دورق T75 (القسم 4 من البروتوكول) ، ن = 63 متبرعا مختلفا ؛ يتم تقديم عدد الخلايا كعدد الخلايا لكل قارورة T75 ، ويشار إلى كل متبرع بنقطة ، ويشار إلى متوسط عدد الخلايا بشريط أفقي. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
ثقافة واجهة الهواء السائل (ALI)
في 7 أيام بعد بدء زراعة ALI ، يتم قياس المقاومة الكهربائية لطبقة الخلية ويجب أن تكون أكثر من 300 Ω (الشكل 3 أ) ؛ إذا لم يتحقق ذلك ، تعتبر الثقافة فاشلة بسبب احتمال عدم وجود تشكيل تقاطع ضيق. يوصى باستبعاد إمكانية الحصول على قيم TEER منخفضة ناتجة عن تلف الطبقة الظهارية في الإدخالات الفردية الناتجة ، على سبيل المثال ، عن تلف طبقة الخلية أثناء الغسيل والشفط. يمكن التحقق من ذلك عن طريق الفحص المجهري البصري لإدخالات الثقافة. في تجربتنا ، يمكن أن يكون التباين بين المانحين في المقاومة الكهربائية كبيرا (الشكل 3 ب) ، والذي تم الإبلاغ عنه أيضا في الأدبيات14 ، وكما لوحظ يتأثر أيضا بشكل ملحوظ بأصل وسيط النسر المعدل (DMEM) المستخدم في Dulbecco (الشكل 3C).
الشكل 3: المقاومة الكهربائية عبر الظهارة كمراقبة جودة لثقافات ALI-PBEC. تم عزل PBECs وتوسيعها ، وتم إنشاء ثقافات ALI-PBEC متباينة جيدا. في عدة نقاط زمنية أثناء الاستزراع ، تم قياس المقاومة الكهربائية ، وبعد ذلك تم حساب TEER (Ω · سم2). (أ) تم قياس المقاومة الكهربية على مدار 14 يوما بعد ALI. ن = 4 متبرعين مختلفين. يتم تصوير البيانات على أنها القيمة المتوسطة ± الانحراف المعياري (SD). (ب) كجزء من مراقبة جودة زراعة الخلايا ALI-PBEC ، تم قياس المقاومة الكهربائية في اليوم 7 (ن = 50) واليوم 14 بعد ALI (ن = 25) ؛ تمثل كل نقطة جهة مانحة واحدة ويشار إلى متوسط TEER (Ω · سم2) بشريط أفقي. تم اختبار البيانات للتأكد من أهميتها باستخدام اختبار مان ويتني غير المعلمية ، ولم يتم العثور على فرق كبير. (ج) تم اختبار وسائط من ثلاثة موردين مختلفين لإدارة نظم إدارة الوجهات السياحية لتقييم التأثير على تشكيل نظام التدريب والنقل البري الدولي. ن = 4 مانحين مختلفين ؛ يتم تصوير القيم المتوسطة ± SD. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
أثناء إنشاء ثقافة ALI-PBEC متباينة جيدا ، منذ بداية التعرض للهواء ، يزيد تركيز التهاب المفاصل الروماتويدي22. بهذه الطريقة ، تتحول الخلايا من الانتشار إلى التمايز المخاطي الهدبي ، والذي يكون مرئيا في وقت مبكر من 9 أيام (يعتمد على المتبرع) بعد التعرض للهواء باستخدام مجهر برايتفيلد. تكون حركة الأهداب الأولى مرئية في هذه المرحلة ، ومبكرة إلى حد ما عندما تستند إلى التعبير الجيني لعلامات الخلايا اللمعية المتمايزة23 (الشكل 4).
كما هو موضح في البروتوكول ، يمكن أيضا ملاحظة إنتاج المخاط عند شطف السطح القمي أثناء التغيير المتوسط. التهاب المفاصل الروماتويدي حساس للغاية للضوء ، مما يؤدي إلى نشاط متغير للغاية عند نفس تركيز المخزون. لهذا السبب ، يتم استبدال RA بنظير RA الاصطناعي EC 23 ويستخدم في نفس التركيز ، مع نتائج مماثلة كما هو محدد تجريبيا. لهذا السبب ولتجنب تغيير الإجراء ، تم الاحتفاظ بتركيز EC 23 المحدد مساويا لتركيز RA (أي 50 نانومتر) المستخدم سابقا24,25 (الشكل 5). ويبين الشكل 5 ألف قيم TEER التي تحققت عند استخدام تركيزات مختلفة من EC 23، ويبين الحد الأقصى ل TEER عند 50 نانومتر ضمن هذا النطاق من التركيزات المختبرة. تؤكد النتائج الموضحة في الشكل 5B أن التعبير الجيني لعلامات الخلايا المهدبة والكأس متشابه عند استخدام 50 نانومتر EC 23 أو RA. EC 23 مطلوب أيضا أثناء الاستزراع في المرحلة المغمورة (وإن كان بتركيز أقل بكثير) ، لأن حذفه في هذه المرحلة المغمورة وإضافته فقط في مرحلة ALI ينتج عنه ثقافة لا تصل أبدا إلى الالتقاء الكامل. الوقت اللازم لتوليد ثقافة ALI-PBEC متمايزة جيدا مع نشاط ضرب هدبي مرئي وإنتاج مخاط هو حوالي 14 يوما ، وبالتالي تبدأ معظم التجارب بين 14-21 يوما من مزارع ALI (الشكل 4). تتم ملاحظة جميع أنواع الخلايا الرئيسية المختلفة (الخلايا القاعدية ، المهدبة ، الكأسية ، وخلايا النادي) بعد 14 يوما من ثقافة ALI ، على الرغم من أن مستويات التعبير تعتمد بشكل كبير على المانحين. يتضح ذلك من خلال تقييم التعبير الجيني ل TP63 و FOXJ1 و MUC5AC و SCGB1A1 بواسطة RT-qPCR ، أو التعبير البروتيني باستخدام الأجسام المضادة الموجهة ضد p63 و α-tubulin و Muc5AC و CC-16 عن طريق تلطيخ التألق المناعي (IF) ، للكشف عن علامات الخلايا القاعدية والمهدبة والكأس والنادي ، على التوالي25,26. ومع ذلك ، في حين يمكن اعتبار 14-21 يوما كقاعدة عامة لمعظم التجارب ، بالنسبة للتجارب المختارة ، يمكن النظر في مدة تمايز أطول ، كما هو الحال بالنسبة لعملية التمثيل الغذائي للأجانب ، وعدوى SARS-CoV-2 ، وتقييم إزالة الغشاء المخاطي الهدبي27،28،29.
الشكل 4: ثقافة واجهة الهواء والسائل (ALI). تم عزل PBECs وتوسيعها ، وتم إنشاء ثقافات ALI-PBEC متباينة جيدا. تمت مراقبة ثقافات ALI-PBEC على مدار 14 يوما بعد ALI. تم تحليل مزارع الخلايا لعزل الحمض النووي الريبي في الأيام 0 و 7 و 14 بعد ALI. يتم عرض البيانات من متبرعين مختلفين ، وتمثل كل نقطة متبرعا فرديا واحدا يتم مراقبته بمرور الوقت ، ويشار إلى الوسيط بشريط أفقي. تم قياس التعبير الجيني لعلامات الخلايا القاعدية والمهدبة والكأس والنادي (TP63 و FOXJ1 و MUC5B و SCGB1A1 على التوالي) بواسطة qPCR وتطبيعها للتعبير الجيني RPL13A و ATP5B (انظر المرجع 23 للحصول على التفاصيل). يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 5: مقارنة بين حمض الريتينويك (RA) ونظيره الاصطناعي EC 23. تم عزل PBECs وتوسيعها ، وتم إنشاء ثقافات ALI-PBEC متباينة جيدا. عند بدء التعرض للهواء لمزارع PBEC ، تم استبدال RA (50 نانومتر) بتركيزات مختلفة من EC 23. (أ ) تم قياس المقاومة الكهربائية في اليوم 14 بعد ALI وبعد ذلك تم حساب TEER (Ω · سم 2) ، n =2 مانحين ، تصور القضبان القيمة المتوسطة ± SD. ( ب) في اليوم 14 بعد ALI ، تم تحليل مزارع الخلايا لعزل الحمض النووي الريبي وتحليل التعبير الجيني اللاحق لعلامات الخلايا للخلايا المهدبة والكأس على التوالي (FOXJ1 ، MUC5AC) باستخدام qPCR ، وتطبيع ل RPL13A (ن = 3 مانحين). تم إظهار زيادة أضعاف مقابل ALI-PBEC المستزرع ب 50 نانومتر RA وموضح على أنه القيمة المتوسطة ± SD. (انظر المرجع 23 للحصول على التفاصيل) يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
على مدى السنوات الماضية ، تم فحص أداء المنتجات البديلة في نظام الثقافة ، مثل وسائل الإعلام والبلاستيك الثقافي. كانت هناك أسباب مختلفة لمثل هذه التقييمات ، بما في ذلك التغييرات في التكوين المتوسط من قبل الشركات المصنعة ، ووسائل الإعلام الجديدة التي تم إدخالها ، فضلا عن نقص المنتجات خلال جائحة COVID-19 (2020-2022). وقد لوحظ أن المنتجات المماثلة من موردين مختلفين تؤدي إلى مزارع خلايا ظهارية متباينة بناء على تقييم علامات أنواع الخلايا الظهارية، على الرغم من أن التركيب الخلوي النهائي قد يختلف اختلافا كبيرا (الشكل 6 أ)، في حين أن الاختلافات في TEER كانت أقل وضوحا (الشكل 6 ب). من ناحية أخرى ، أدى الوسيط من موردين مختلفين إلى اختلافات كبيرة في التركيب الخلوي. عند استخدام إدخالات من علامات تجارية مختلفة ، كانت هذه الاختلافات محدودة (الشكل 6C). على وجه الخصوص ، عند استخدام وسط زراعة الخلايا الظهارية في مجرى الهواء PneumaCult من STEMCELL Technologies ، لوحظ مورفولوجيا مختلفة وتشكيل أسرع للنشاط الهدبي المرئي. إلى جانب هذه الملاحظات ، لوحظ أيضا اختلاف في قيم TEER واختلاف في التركيب الخلوي ل ALI-PBEC مقارنة بوسط cBD (الشكل 6D).
الشكل 6: مقارنة الموردين المختلفين لوسط الخلية الظهارية وإدراج زراعة الخلايا. تم عزل PBEC وتوسيعها وتم إنشاء ثقافات ALI-PBEC بشكل جيد. (أ) تم استزراع ALI-PBECs لمدة 14 يوما ، ثم تم تحليل طبقات الخلايا لعزل الحمض النووي الريبي. تم قياس التعبير الجيني لعلامات الخلايا القاعدية والهدبية والكأس والنادي (TP63 و FOXJ1 و MUC5AC و SCGB1A1 على التوالي) بواسطة qPCR وتطبيعها ل RPL13A و ATP5B. ن = 2 مانحين ؛ توضح الأشرطة القيمة المتوسطة ± SD. (B) على مدار 9 أيام بعد ALI ، تم قياس المقاومة الكهربائية وبعد ذلك تم حساب TEER (Ω · سم2). ن = 3 مانحين مختلفين ؛ (ج) تم استزراع ALI-PBECs لمدة 14 يوما باستخدام إدخالات زراعة الخلايا المشتراة من ثلاثة موردين مختلفين ، ثم تم تحليل طبقات الخلايا لعزل الحمض النووي الريبي.± تم قياس التعبير الجيني لعلامات الخلايا المهدبة والكأس والنادي (FOXJ1 و MUC5AC و SCGB1A1 على التوالي) بواسطة qPCR وتطبيعها ل RPL13A. n = 18 مانحا مختلفا ، تصور الأشرطة القيمة المتوسطة ± SD. تم اختبار البيانات للتأكد من أهميتها باستخدام اختبار ANOVA غير المعلمية أحادي الاتجاه Kruskal-Wallis ولم يتم العثور على فرق كبير. (د) تم استزراع ALI-PBECs إما في وسط cBD أو وسط PneumaCult (تقنيات STEMMCELL) لمدة 14 يوما بعد ALI ، ثم تم تحليل طبقات الخلايا لعزل الحمض النووي الريبي. تم قياس التعبير الجيني لعلامات الخلايا القاعدية والهدبية والكأس والنادي (TP63 و FOXJ1 و MUC5B و SCGB1A1 على التوالي) بواسطة qPCR وتطبيعها ل RPL13A (تصور القضبان القيمة المتوسطة ± SD) ، وتم قياس المقاومة الكهربائية في اليومين 5 و 12 بعد ALI واستخدمت لحساب TEER (Ω · سم2). ن = 2 ؛ يتم تصوير القيمة المتوسطة ± SD (انظر المرجع 23 للحصول على التفاصيل). يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الجدول التكميلي 1: تكوين المحاليل والوسائط المستخدمة في البروتوكول. الرجاء الضغط هنا لتنزيل هذا الملف.
يصف البروتوكول المقدم هنا عزل الخلايا الظهارية القصبية البشرية من أنسجة الرئة المقطوعة ، وطريقة للتوسع الأمثل للخلايا دون فقدان إمكانات التمايز ، وإجراء الحفظ بالتبريد ، وإجراء لتوليد ثقافات ALI-PBEC متمايزة جيدا. علاوة على ذلك ، يتم تقديم وصف لمراقبة الجودة ، بالإضافة إلى تعليمات لرصد وتقييم ALI-PBECs المتباينة.
يبدأ البروتوكول الموصوف بحلقة قصبية طبيعية مجهرية وخالية من الورم يتم استئصالها من فص الرئة من المرضى الذين يخضعون لعملية جراحية تتعلق بتشخيص سرطان الرئة. لذلك يجب ملاحظة أن هذه الحلقات لا يمكن اعتبارها نسيجا سليما ، مما قد يؤثر بالتالي على خصائص زراعة الخلايا. تشمل المصادر البديلة للحصول على الخلايا الظهارية للشعب الهوائية استخدام خزعات الشعب الهوائية أو تنظيف الشعب الهوائية أو الأنسجة من رئتي متبرع أو متلقي. بغض النظر عن المصدر ، عند استخدام أنسجة الرئة ، ينبغي النظر في خطر التلوث الميكروبي ، وبالتالي يتم استخدام المضادات الحيوية في وسائط الثقافة المختلفة لتقليل مخاطر التلوث الميكروبي لثقافة الخلية. على وجه الخصوص ، الميكوبلازما هي خطر كبير وشائع في زراعة الخلايا ، بسبب مجموعة واسعة من الآثار على ثقافة الخلايا ، ومقاومة المضادات الحيوية التي يشيع استخدامها في زراعة الخلايا ، وحقيقة أن تلوث الميكوبلازما لا يمكن تأكيده إلا من خلال فحوصات الكشف عن الميكوبلازما. لذلك ، في المرحلة الأولى من زراعة الخلايا بعد عزل الخلايا عن أنسجة الرئة ، يتم استخدام تركيبة مضادات الميكروبات واسعة الطيف Primocin ، وخلال عملية الاستزراع ، يتم اختبار العينات المختارة عشوائيا لوجود الميكوبلازما.
يوفر إجراء العزل الذي يبدأ بحلقة الشعب الهوائية مادة أولية كافية للسماح بدرجة توسع هذه الخلايا الأولية اللازمة لبدء المزارع في ALI دون المساس بقدرة التمايز. ومع ذلك ، فإن البدء في توسيع الخلايا الظهارية المعزولة بعدد محدود من الخلايا قد يطرح مشكلات في الحصول على عدد كاف من الإدخالات مع خلايا كافية يمكن بذرها لثقافة ALI. قد تؤدي الثقافة الممتدة والمرور المتكرر للخلايا الأولية إلى الشيخوخة المتماثلة. تم اقتراح حلول مختلفة للتغلب على هذا القيد. أظهر Horani et al. أن مثبط Rho kinase (ROCK) Y-27632 زاد من تكاثر الخلايا القاعدية30 ، واستخدم Mou et al. تثبيط Smad المزدوج لتوسيع الخلايا الجذعية القاعدية مع الحفاظ على خصائص طبقة الخلايا الظهارية المتمايزة 31 ، وطور Sachs et al. نظاما عضويا في مجرى الهواء يمكن استخدامه لتوسيع الخلايا الظهارية في مجرى الهواء والحفاظ على إمكانية تمايزها على مدار ممرات متعددة32. تم استخدام الطريقة الأخيرة أيضا لتوسيع الخلايا من مصادر ذات أعداد خلايا منخفضة للغاية ، مثل شفاطات القصبة الهوائية (TAs) من الخدج (< أسبوع من عمر الحمل) وسائل غسل القصبات الهوائية (BAL) ، قبل نقلها إلى ثقافة ALI كما هو موضح هنا33. وجد أن الخلايا المعزولة من BAL و TAs أظهرت قدرة تمايز مماثلة للخلايا المتولدة من أنسجة الشعب الهوائية ، على الرغم من ملاحظة الاختلافات عندما كان التمايز يميل نحو المزيد من الثقافات المحتوية على خلايا كأسية أو أكثر باستخدام تثبيط إشارات Notch أو Th2 cytokine IL-1333. لذلك يوصى بأنه إذا تم استزراع ALI-PBECs من مادة أولية ذات أعداد خلايا ظهارية منخفضة باستخدام طرق مماثلة ، للتحقق دائما من الثقافات لمعايير الجودة الأساسية ، كما تمت مناقشته في القسم 6 من البروتوكول. الأهم من ذلك ، أن استخدام الخلايا المغذية قد يساعد أيضا في الحصول على أعداد أكبر من الخلايا ، وهو أمر ضروري في إعداد هندسة السقالة القابلة للزرع حيث يكون الوقت ورقم الخلية ضروريين. يتضح ذلك من خلال دراسة تم فيها زراعة الخلايا الظهارية الذاتية من الخزعات المشتقة من مريض مصاب بمرض القصبة الهوائية وتم توسيع الخلايا بسرعة في وجود طبقة تغذية جنينية للفئران (الخلايا الليفية 3T3-J2 المعطلة انقساميا) والمثبط المذكور أعلاه لمسار Rho / ROCK (Y-27632) 34. تم العثور على ثقافة الخلايا الناتجة لتكون مفيدة لإعادة توطين سقالات القصبة الهوائية ، وبالتالي يمكن اعتبار هذا بروتوكولا مناسبا لنموذج الزرع.
عند استخدام البروتوكول الموضح في هذه المساهمة ، ولكن أيضا عند استخدام بروتوكولات الثقافة الأخرى ، يتم حتما تقديم تحيز في الاختيار. من المهم أن ندرك أن الاختلافات في تفاصيل البروتوكول ، مثل أصل الخلايا المستخدمة لبدء الثقافات ، والتكوين المتوسط ، وتفاصيل البروتوكول الأخرى ، يمكن أن تؤدي إلى تغييرات في التركيب الخلوي للثقافات وبالتالي تغييرات في استجابة ثقافة ALI33,35. بالإضافة إلى ذلك ، لوحظت أيضا اختلافات في خصائص الخلية عند مقارنة الوسائط المختلفة للتمييز بين خلايا مجرى الهواء10,11. عند مقارنة PneumaCult ووسط cBD ، لوحظت اختلافات في علامات mRNA للخلية الكأسية وخلية النادي ، وقيم TEER ، وسمك طبقة الخلية. بناء على هذه الملاحظات ، على الرغم من عدم وجود أساس إحصائي ، نظرا لانخفاض عدد المتبرعين المستخدمين ، فإن التركيب المتوسط غير معروف للعملاء ، وارتفاع تكاليف وسط PneumaCult ، تم اتخاذ القرار في مختبرنا لاستخدام وسط cBD.
كما تمت مناقشته ، يمكن توسيع الخلايا في البداية باستخدام ثقافة عضوي ثم نقلها لاحقا إلى نظام إدراج 2D ALI. هذا أمر مهم ، لأن الكائنات العضوية الظهارية في مجرى الهواء ليست مناسبة للتعرض للمواد المحمولة جوا ، في حين أن استخدام نظام ALI 2D يسمح بتقييم تأثير المواد المحمولة جوا مثل دخان السجائر23,36 على الخلايا الظهارية في مجرى الهواء المستزرع. هناك نهج مختلف لإنشاء مزارع الخلايا الظهارية في مجرى الهواء ALI وهو توليد خلايا ظهارية في مجرى الهواء عن طريق تمايز الخلايا الجذعية البشرية متعددة القدرات (hiPSCs)37. في مثل هذه البروتوكولات ، في المرحلة النهائية من بروتوكول التمايز بعد التمايز إلى أسلاف مجرى الهواء القريب ، يمكن تمييز الخلايا عن طريق الثقافة إلى ALI باستخدام إجراءات مماثلة لتلك الموصوفة هنا.
في البروتوكول الحالي ، يتم استخدام وسيط cBD للثقافة في ALI. وسط cBD هو وسيط خال من المصل يتم تحضيره عن طريق إضافة مزيج من المكملات الغذائية المختلفة ، مستوحاة من Fulcher et al.38 بالإضافة إلى دراسات أخرى. يحتوي المحلول المكمل على 52 ميكروغرام / مل من مستخلص الغدة النخامية البقري (BPE) ، و 0.5 ميكروغرام / مل هيدروكورتيزون ، و 0.5 نانوغرام / مل من EGF البشري ، و 0.5 ميكروغرام / مل من الإبينفرين ، و 10 ميكروغرام / مل من الترانسفيرين ، و 5 ميكروغرام / مل من الأنسولين ، و 6.5 نانوغرام / مل ثلاثي يودوثيرونين ، و 0.1 نانوغرام / مل RA39. نظرا لأن BPE عبارة عن مستخلص أنسجة ويخضع لتنوع دفعي حكيم ، فلا يمكن اعتبار الوسط وسيطا محددا بالكامل ، كما أنه ليس خاليا من الحيوانات. يفضل وسط زراعة الخلايا المحدد بالكامل لتقليل الاختلافات بين الدفعات والدفعات. وبالنظر إلى الانتقال إلى البحوث الخالية من الحيوانات، من المهم بذل الجهود لإنتاج وسائط محددة لا تحتوي على منتجات حيوانية وتكون ميسورة التكلفة بالنسبة للمجتمع العلمي.
يمكن استخدام إعدادات تجريبية مختلفة بناء على نموذج ALI ، اعتمادا على سؤال البحث. على سبيل المثال ، للتحقيق في تأثير المركبات التي قد تؤثر على عملية التمايز ، يمكن معالجة ذلك عن طريق إضافة المركبات إلى الثقافة خلال المراحل المختلفة للثقافة المغمورة ، أو أثناء التمايز ، أو في مرحلة التمايز الجيد. يمكن أن يتأثر التركيب الخلوي لثقافة ALI-PBEC بإضافة مركبات محددة. على سبيل المثال ، يؤدي التمييز بين ALI-PBECs في وجود IL-13 إلى توليد ثقافة تحتوي على المزيد من الخلايا الكأسية وعدد أقل من الخلايا المهدبة ، في حين أن العلاج بمثبط γ-secretase DAPT (المستخدم لمنع إشارات الشق) أثناء التمايز يؤدي إلى ثقافة بها خلايا مهدبة أكثر على حساب الخلايا الكأسية23،40،41،42.
علاوة على ذلك ، يمكن تطبيق عوامل لتحفيز الخلايا أو منع عمليات معينة إما على المقصورة القاعدية أو (بحجم صغير جدا) على المقصورة القمية للثقافة. يمكن أيضا أن تتعرض الخلايا للمواد المحمولة جوا من الجانب القمي. تم استخدام تصميمات التعرض هذه لدراسة تأثير عادم الديزل أو دخان السجائر الكامل على PBECs23،43،44. يمكن حصاد الوسط في كل مرة يتم فيها تغيير الوسط لمراقبة البروتينات المفرزة في الجانب القاعدي. الأمر نفسه ينطبق على الجانب القمي للخلايا التي يتم غسلها باستخدام PBS أثناء تحديث الوسط القاعدي. يتم حصاد ما يسمى بالغسيل القمي وإضافة ديثيوريثريتول اختياري (DTE) لفصل المخاط الذي تنتجه الخلايا الكأسية بشكل أكثر كفاءة. يمكن الحصول على محللات الخلايا لعزل البروتين الكلي والحمض النووي الريبي والحمض النووي للكروموسومات والميتوكوندريا. يمكن دراسة الخلايا بشكل أكبر باستخدام الأجسام المضادة لعلامات محددة ، عن طريق قطع غشاء البولي إيثيلين تيريفثاليت (PET) من الإدراج البلاستيكي وقطع هذا الغشاء إلى قطع أصغر للتلطيخ المناعي المتعدد45. علاوة على ذلك ، يمكن أيضا استخدام قياس التدفق الخلوي أو FACS بعد التربسين للخلايا في الإدراجات. خلال مرحلة ALI ، يمكن مراقبة تطور الحاجز الخلوي عن طريق قياس المقاومة الكهربائية ومن ثم حساب TEER ، حيث تتناسب المقاومة الكهربائية عكسيا مع مساحة سطح إدخال الغشاء. يعتمد الحساب على قانون أوم باستخدام الصيغة التالية: ، حيث Rm هي المقاومة الكهربائية المقاسة ، Rb هي المقاومة الكهربائية الأساسية للإدراج بدون طلاء وخلايا ، و SA هي مساحة سطح غشاء الإدخال. يعد قياس المقاومة الكهربائية باستخدام أقطاب EVOM2 و STX / عيدان تناول الطعام أمرا بسيطا ولكنه يعتمد بشكل كبير على إجراءات المناولة عند إدخاله في البئر. أيضا ، تم اقتراح شكل القطب للتأثير على قياس وظيفة الحاجز لمساحة السطح الكبيرة نسبيا17.
مزيد من التحسين في نظام زراعة الخلايا ALI ، الذي يهدف إلى زيادة التمثيل الدقيق للأنسجة ، يشمل الزراعة المشتركة لنوع إضافي من الخلايا ، مثل الكريات البيض أو الخلايا الليفية أو الخلايا البطانية46،47،48. وقد لوحظ أن الاستزراع المشترك ل ALI-PBEC مع عامل تحفيز مستعمرة الخلايا المحببة والبلاعم (GM-CSF) أو الضامة المتمايزة M-CSF يؤثر بشكل ملحوظ على الاستجابات الظهارية الفطرية والإصلاح48. من المهم ملاحظة أنه في نماذج الزراعة المشتركة هذه ، يمكن أن يكون التوافق المتوسط مشكلة. نظرا لأن الوسط المستخدم في زراعة الخلايا الظهارية في مجرى الهواء تم تطويره خصيصا ل PBECs وقد لا يكون مناسبا بشكل مثالي لأنواع الخلايا الأخرى ، فإن التحسين ضروري. نوع آخر من التقدم الذي شوهد في مجال بيولوجيا مجرى الهواء والذي يمكن استخدام PBECs المعزولة له هو استخدام تقنية Organ-on-Chips (OoC)49,50. باستخدام هذه التقنية ، يمكن دراسة تأثير القوى الميكانيكية للتنفس وتدفق الدم ، مثل التمدد والهواء والتدفق المتوسط ، 29.
يمكن أن يكون التباين بين المانحين كبيرا عند استخدام PBECs من مختلف الجهات المانحة ، وبالتالي من المهم التفكير في استخدام خلايا من عدة مانحين لحساب هذا التباين في دراسات زراعة الخلايا الظهارية. نظرا لأن ثقافة ALI-PBECs تستغرق وقتا طويلا وترتبط بتكاليف كبيرة ، يتم فحص خيار إنشاء ثقافات ALI-PBEC عن طريق خلط الخلايا من جهات مانحة مختلفة في إدراج مزرعة خلية واحدة. بهذه الطريقة ، يمكن إجراء التجارب التجريبية بسهولة باستخدام الخلايا الأولية ، قبل تحليل استجابات الثقافات المستمدة من مختلف الجهات المانحة الفردية . بالإضافة إلى ذلك ، يمكن تجميع الجهات المانحة ذات الخصائص المختلفة (على سبيل المثال ، فئة عمرية أو جنس مختلف) للدراسات الاستكشافية. عند استخدام مزيج المانحين ، من المهم التأكد من وجود أعداد متساوية من الخلايا لمختلف المانحين ، لمنع احتمال هيمنة أحد المانحين على النتائج نتيجة لارتفاع معدل الانتشار. لذلك ، يتم توسيع الخلايا من المتبرعين الفرديين بشكل منفصل وبذرها بكثافة أعلى في الإدراج مقارنة بخلايا البذر من متبرع فردي ، لتقليل الانتشار في الإدراج قبل الانتقال إلى ALI. تمت مقارنة استجابات مزيج المانحين والمتبرعين الأفراد المناظرين من خلال دراسة حركية العدوى ل SARS-CoV-2. وباستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل بالاستنساخ العكسي (RT-qPCR) والتلوين المناعي، لوحظ أن مزيج المتبرعين قدم تمثيلا جيدا لمختلف المتبرعين الأفراد، من خلال إظهار أعداد مماثلة من جزيئات الفيروس المنتجة وأعداد مماثلة من الخلايا المصابة28.
لتصبح بديلا مقبولا للنماذج الحيوانية ، يجب أن يكون تحرير الجينات للخلايا الظهارية القصبية المستزرعة ممكنا51. يتم فحص تقنية تداخل الحمض النووي الريبي باستخدام الحمض النووي الريبي الصغير المتداخل (siRNAs) في ALI-PBECs ، ولكن نظرا لأن الخلايا تحتاج إلى نقلها باستخدام siRNA خلال المرحلة المغمورة من المزرعة ، لا يتم الحفاظ على ضربة قاضية بشكل كاف أثناء زراعة ALI بسبب مدة المزرعة الطويلة ، ما لم يتكرر نقل siRNA بشكل متكرر أثناء الثقافة52. ومع ذلك ، يمكن استخدام siRNAs بنجاح لتعديل التعبير الجيني في الخلايا القاعدية المغمورة. استخدم آخرون بنجاح تقنية CRISPR / Cas9 لتحقيق تحرير الجينات في مزارع الخلايا الظهارية الأولية في مجرى الهواء ALI مع توصيل البروتين النووي الريبي (RNP) 53. عند استخدام هذه التقنيات ، من الضروري أن تحافظ الخلايا على قدرتها الكاملة على التمايز. نظرا لأنه لا يمكن تمرير مزارع خلايا مجرى الهواء الأولية إلى أجل غير مسمى ، فإن التوسع النسيلي للخلايا المحررة جينيا ليس بالأمر السهل وإضافة وسيط لاختيار الخلايا المنقولة أمر مرهق. لذلك ، من الصعب تحقيق ضربة قاضية مرغوبة في جميع الخلايا المستزرعة. بديل لتوليد استنساخ بالضربة القاضية هو استخدام استراتيجيات خروج المغلوب في hiPSCs54 واستخدام هذه الخلايا لتوليد الخلايا الظهارية في مجرى الهواء. بديل آخر ، وإن كان دون المستوى الأمثل ، هو إنشاء خط PBEC خالد من أجل توسيع الخلايا المحررة جينيا55.
البروتوكول المقدم هنا هو إحدى الطرق لتوليد ALI-PBEC شبه متباينة جيدا ، ولكن تم العثور أيضا على بروتوكولات أخرى لتأسيس مثل هذه الثقافة ، مع اختلافات أصغر وأكبر مقارنة بالبروتوكول المقدم. في رأينا ، عبر التحقق المختبري من طرق الاستزراع ومراقبة الجودة الصارمة ضرورية لنظام ALI-PBEC وأنظمة الاستزراع المماثلة للخلايا الظهارية في مجرى الهواء ، لتصبح بديلا صالحا للتجارب على الحيوانات.
يعلن أصحاب البلاغ أنه ليس لديهم تضارب في المصالح ذات صلة.
تم دعم الدراسات التي تستخدم النموذج الموصوف في هذه المساهمة من قبل مجموعة متنوعة من منظمات التمويل ، بما في ذلك مؤسسة الرئة الهولندية ، والمنظمة الهولندية للبحث والتطوير الصحي (ZonMw ، منحة COVID-19 MKMD) ، والجمعية الهولندية لاستبدال التجارب على الحيوانات (Stichting Proefdiervrij ، grant #114025007) ، بالإضافة إلى منح بحثية من شركات مثل Boehringer Ingelheim و Galapagos. تم إنشاء الشكل 1 باستخدام BioRender.com.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1,000 ohm test resistor | World Precision Instruments | N/A | Used to calibrate the EVOM2 Epithelial Voltohmmeter |
4-[2-(5,6,7,8-Tetrahydro-5,5,8,8-tetramethyl-2-naphthalenyl)ethynyl)-benzoic acid (EC 23) | Tocris | 4011 | Used in cBD medium |
6-well Clear TC-treated Multiple Well Plates | Corning | 3506 | Used in the first step to grow the cells isolated form the bronchial ring |
Airway Epithelial Cell Growth Medium Kit | PromoCell | C-21160 | Used to compare to cBD medium |
Bead Bath 20 Liter | Lab Armor | 74220-720 | Used to pre-warm cell culture solutions |
BEGM Bronchial Epithelial Cell Growth Medium BulletKit | LONZA | CC-3170 | Used to compare to cBD medium |
Bovine albumin fraction V (BSA) | Thermo Fisher Scientific | 15260037 | Used in coating solution |
Bovine pituitary extract (BPE) | Thermo Fisher Scientific | 37000-015 | Used in c-KSFM |
Bronchial epithelial cell growth supplement (BEpiCGS) | ScienCell Research Laboratories | 3262 | Used in cBD medium |
Bronchial epithelial cell medium-basal (BEpiCM-b) | ScienCell Research Laboratories | SCC3211-b | Used in cBD medium |
Cell culture inserts; 12 mm Transwell with 0.4 µm pore polyester membrane insert | Corning | 3460 | Cell culture inserts used in the protocol |
Cell culture inserts; 12-well inserts, 0.4 µm PET clear | CellQART made by SABEU | 9310412 | Cell culture inserts used to compare with Corning cell culture inserts |
Cell culture inserts; 12-well ThinCert Tissue culture Inserts | Greiner Bio-One | 82050-032 | Cell culture inserts used to compare with Corning cell culture inserts |
CELLSTAR flask, TC, PS, 250 ml, 75 cm2 | Greiner Bio-One | 658170 | Used to expand the number cells |
CFX Maestro 1.0 | Bio-Rad | N/A | Software program for analyzing qPCR data generated with the CFX384 System |
CFX384 Touch Real-Time PCR Detection System | Bio-Rad | 1855484 | qPCR detection system |
Chopstick electrode set | World Precision Instruments | STX2 | Used to measure electrical resistance in ALI-PBEC |
CO2-Incubator | PHCbi | MCO-170AICUV-PE | Cell culture incubator used for mycplasma free cell cultures |
CO2-Incubator | Hereaus | Heracell 150 | Cell culture incubator used for possibly mycplasma infected cell cultures |
Coolcell Container | Corning | 432006 | Used to cryopreserve cells at -80 °C before transfer to liquid N2 |
Countess 3 Automated cell counter | Thermo Fisher Scientific | AMQAX2000 | Used to count cells and determine the cell concentration |
Cryovials | Nalgene | 479-3224 | Used to cryopreserve cells in |
D-Glucose | Avantor VWR BDH CHEMICALS | 101174Y | Used in soft trypsin |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Avantor VWR | 0231 | Used in cell freeze medium |
dNTP (10 mM) | Promega | U1515 | Used in the synthesis of cDNA |
Dulbecco's Modified Eagle's Medium (DMEM) + 4500 mg/l D-Glucose | STEMCELL Technologies | 36250 | Used in cBD medium |
Dulbecco's Modified Eagle's Medium (DMEM) 4.5 g/l glucose with l-glutamine | LONZA | LOBE12-604F | Used in cBD medium to compare with DMEM from other manufacturers |
Dulbecco's Modified Eagle's Medium (DMEM), high glucose, pyruvate | Thermo Fisher Scientific | 41966029 | Used in cBD medium to compare with DMEM from other manufacturers |
Epidermal growth factor (EGF) | Thermo Fisher Scientific | 37000-015 | Used in c-KSFM |
Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) | Avantor VWR BDH CHEMICALS | 443885J | Used in soft trypsin |
EVOM2 Epithelial Voltohmmeter | World Precision Instruments | 91799 | Used with the chopstick electrode set to measure electrical resistance in ALI-PBEC |
Fibronectin solution, Human | PromoCell | C-43060 | Used in coating solution |
Glutamax | Thermo Fisher Scientific | 35050038 | Used in cBD medium |
Hanks balanced salt solution (HBSS) | ScienCell Research Laboratories | SCC0313 | Used to dissolve protease XIV |
IQ SYBR Green Super mix | Bio-Rad | 170887 | qPCR reagent |
Isoproterenol hydrochloride, (-)- | Sigma-Aldrich | I-6504 | Used in c-KSFM |
Keratinocyte-SFM (KSFM) | Thermo Fisher Scientific | 17005-034 | Used in c-KSFM |
Maxwell RSC Instrument | Promega | AS4500 | Automated RNA isolation system |
Maxwell RSC simplyRNA Tissue Kit | Promega | AS1340 | Used to isolate total RNA with the Maxwell RSC Instrument |
M-MLV Reverse transcriptase | Promega | M5301 | Used in the synthesis of cDNA |
M-MLV Reverse transcriptase 5X reaction buffer | Promega | M531A | Used in the synthesis of cDNA |
MycoStrip | InvivoGen | rep-mys-10 | Used to detect the presence of mycoplasma in cell culture samples |
N-2-hydroxyethylpiperazine-N-2-ethane sulfonic acid (HEPES) | Thermo Fisher Scientific | 15630056 | Used in cBD medium |
Oligo(dT)15 | Qiagen | 79237 | Used in the synthesis of cDNA |
Penicillin/Streptomycin solution (Pen/Strep) | ScienCell Research Laboratories | SCC0513 | Used as antibiotic in c-KSFM and cBD medium |
Phosphate buffered saline (PBS) | LUMC pharmacy | N/A | Used in different steps of the protocol |
Pneumacult-ALI Medium | STEMCELL Technologies | 05002 | Used to grow cells in the differentiation stage to compare to cBD medium |
Pneumacult-Ex Plus Medium | STEMCELL Technologies | 05040 | Used to grow cells in the submerged stage to compare to cBD medium |
Primer, ATP5B, forward | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: TCACCCAGGCTGGTTCAGA |
Primer, ATP5B, reverse | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: AGTGGCCAGGGTAGGCTGAT |
Primer, FOXJ1, forward | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: GGAGGGGACGTAAATCCCTA |
Primer, FOXJ1, reverse | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: TTGGTCCCAGTAGTTCCAGC |
Primer, MUC5AC, forward | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: CCTTCGACGGACAGAGCTAC |
Primer, MUC5AC, reverse | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: TCTCGGTGACAACACGAAAG |
Primer, MUC5B, forward | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: GGGCTTTGACAAGAGAGT |
Primer, MUC5B, reverse | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: AGGATGGTCGTGTTGATGCG |
Primer, RPL13A, forward | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: AAGGTGGTGGTCGTACGCTGTG |
Primer, RPL13A, reverse | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: CGGGAAGGGTTGGTGTTCATCC |
Primer, SCGB1A1, forward | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: ACATGAGGGAGGCAGGGGCTC |
Primer, SCGB1A1, reverse | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: ACTCAAAGCATGGCAGCGGCA |
Primer, TP63, forward | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: CCACCTGGACGTATTCCACTG |
Primer, TP63, reverse | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: TCGAATCAAATGACTAGGAGGGG |
Primocin | InvivoGen | ant-pm-2 | Used as antimicrobial agent against bacteria, mycoplasma, and fungi in c-KSFM medium |
Protease XIV | Sigma-Aldrich | P5147 | Used for the enzymatic treatment of the bronchial ring |
RNAsin Recombinant Ribonuclease inhibitor | Promega | N2515 | Used in the synthesis of cDNA |
Soybean trypsin inhibitor (SBTI) | Sigma-Aldrich | T9128 | Used to inhibit the action of soft trypsin |
T100 Thermal Cycler | Bio-Rad | 1861096 | Used in the synthesis of cDNA |
TissueSAFE plus | MILESTONE MEDICAL | N/A | Vacuum transfer system for biological specimens |
Trypan blue solution | Thermo Fisher Scientific | 15250061 | Used to count live- and dead cells |
Trypsin 1:250 | Thermo Fisher Scientific | 27250-018 | Used in soft trypsin |
Type I collagen solution (PureCol) | Advanced BioMatrix | 5005-B | Used in coating solution |
Universal container, PP, with PE screw cap | Avantor VWR | 216-2053 | Used in the protocol for the Protease XIV treatment of the bronchial ring |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionExplore More Articles
This article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved