A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
تقدم هذه الدراسة رؤى جديدة حول التفاعلات بين نقص الأكسجة والتهاب الحديد والتسلل المناعي في التسبب في التصلب المتعدد (MS) عبر تحليل المعلوماتية الحيوية. من خلال استخدام تحليل شبكة التعبير المشترك الجيني المرجح (WGCNA) وتحليل التفاعل بين البروتين والبروتين (PPI) ، حددنا ثلاثة جينات محورية محورية (ITGB1 و ITGB8 و VIM).
التصلب المتعدد (MS) هو اضطراب التهابي مزمن يتميز بإزالة الميالين ، مع فشل إعادة الميالين مما يؤدي إلى فقدان المحور العصبي التدريجي في المراحل المزمنة. تعتبر الخلايا السلائف قليلة التغصن (OPCs) ضرورية لإعادة تكوين الميالين. تشير الدراسات الحديثة إلى أن كلا من نقص الأكسجة والقنب الحديدي يلعبان أدوارا حاسمة في التمايز الوظيفي لمركبات OPCs. يسعى هذا البحث إلى تحديد الجينات الرئيسية المرتبطة بنقص الأكسجة والقطيبات الحديدية وخصائص التسلل المناعي في OPCs المشتقة من الخلايا الجذعية المستحثة متعددة القدرات (iPSCs) لمرضى التصلب العصبي المتعدد وبناء نموذج تشخيصي يركز على هذه الجينات المحورية.
قمنا بتحليل بيانات التعبير الجيني من مجموعات البيانات GSE196575 و GSE147315 وقارنا مرضى التصلب العصبي المتعدد بالأفراد الأصحاء. باستخدام تحليل شبكة التعبير المشترك الجيني المرجح (WGCNA) ، حددنا جينات الوحدة الأولية والجينات الأساسية المرتبطة بنقص الأكسجة والتهاب الحديد ومرض التصلب العصبي المتعدد. كانت درجة Z لموت الحديد ودرجة نقص الأكسجة Z المحسوبة عن طريق تحليل تباين مجموعة الجينات (GSVA) أكبر في OPCs المشتقة من iPSC لمرضى التصلب العصبي المتعدد من تلك الخاصة بالمجموعة الضابطة. ترتبط الجينات المتورطة في الغالب بمسار PI3K / Akt / mTOR ، كما تم تحديده من خلال تحليلات تخصيب مسار علم الوجود الجيني (GO) وموسوعة كيوتو للجينات والجينومات (KEGG).
كشفت شبكة تفاعل البروتين والبروتين (PPI) من الجينات الحاسمة عن 10 جينات محورية مركزية (COL4A1 و COL4A2 و ITGB5 و ITGB1 و ITGB8 و ITGAV و VIM و FLNA و VCL و SPARC). تم التحقق من صحة التعبير القوي ل ITGB1 و ITGB8 و VIM في مجموعة بيانات GSE151306 ، مما يدعم دورها كجينات محورية رئيسية. بالإضافة إلى ذلك ، تم إنشاء شبكة تفاعل بين عوامل النسخ (TFs) والجينات المحورية عبر العلاقات التنظيمية النسخية التي تم الكشف عنها بواسطة النص المستند إلى الجملة (TRRUST) ، والتي حددت خمسة TFs رئيسية. يمكن أن تساعد نتائج هذه الدراسة في توضيح المؤشرات الحيوية الجديدة أو الأهداف العلاجية لمرض التصلب المتعدد.
التصلب المتعدد (MS) هو حالة التهابية مزمنة تتميز بإزالة الميالين ، وتصيب ما يقرب من 2.5 مليون شخص على مستوى العالم. يظهر غالبية الأشخاص الذين تم تشخيص إصابتهم بمرض التصلب العصبي المتعدد مسار مرض الانتكاسي (RR). خلال مرحلة الانتكاس، يؤدي الالتهاب الحاد إلى فقدان لا مفر منه من المايلين والمحاور. على العكس من ذلك ، أثناء المغفرة ، يمكن إصلاح آفات إزالة الميالين عن طريق إعادة تكوين الميالين ، مما يوفر دعما غذائيا للمحاور ومنع فقدان المحاور العصبيالتدريجي 1. يحدث فشل إعادة تكوين الميالين في المراحل المزمنة من مرض التصلب العصبي المتعدد ويؤدي إلى التنكس المحوريالتدريجي 2.
ترتبط عملية إعادة تكوين الميالين ارتباطا حاسما بالخلايا السليفة قليلة التغصن (OPCs) ، والتي تتضمن تكاثر وهجرة OPCs للتمايز إلى الخلايا قليلة التغصن الناضجة (OLs) ، وهي الخلايا المكونة للمايلين في الجهاز العصبي المركزي (CNS)3. في مراحل المرض الأولية ، يتم الحفاظ على عدد OLs الجديدة الناتجة عن OPCs حول الآفات مزيلة الميالين نسبيا ويمكن أن تعزز بنجاح إعادة الميالين4. ومع ذلك ، خلال مراحل التصلب العصبي المتعدد المتقدمة ، يؤدي عدم كفاية الهجرة والتمايز ل OPCs إلى انخفاض في OLs الجديدة وضعف إعادة تكوين الميالين5 ، مما يؤدي إلى تنكس الأعصاب وتراكم الإعاقة.
تم اقتراح فرضيتين لشرح التنكس العصبي في مرض التصلب العصبي المتعدد. تشير الفرضية الخارجية إلى أن الاستجابة المناعية التي تبدأها الخلايا التائية المنشطة تسبب إزالة الميالين وكذلك التنكس العصبي6. ومع ذلك ، يشير النموذج الجوهري إلى أن التشوهات الجوهرية في OPCs7 و OLs8 والخلايا الأخرى في الجهاز العصبي المركزي قد تساهم في التنكس العصبي. كان النموذج الجوهري يعتبر سابقا قابلا للتطبيق فقط في المراحل الأكثر تقدما من مرض التصلب العصبي المتعدد ، مثل التصلب العصبي المتعدد التقدمي الأولي أو الثانوي (PPMS و SPMS). ومع ذلك ، فقد لوحظ مؤخرا تنكس عصبي مستقل عن الالتهاب أو الانتكاس في RRMS9،10 ، مما يشير إلى أن التشوهات الخلوية الجوهرية قد تكون متورطة في جميع مراحل المرض ، بما في ذلك RRMS.
علاوة على ذلك ، يلعب داء الحديد ، وهو مسار موت خلوي مميز مرتبط باضطرابات التمثيل الغذائي للدهون بوساطة الحديد ، دورا محوريا في التنكس العصبي. يتضمن هذا المسار عدم توازن حالات الأكسدة والاختزال داخل الخلايا مدفوعة بالحديد الزائد ، مما يؤدي إلى تراكم بيروكسيد الدهون وإنتاج أنواع الأكسجين التفاعلية (ROS) ، مما يؤدي في النهاية إلى موت الخلايا المؤكسدة11. غالبا ما تنشأ الأمراض التنكسية العصبية مثل مرض الزهايمر ومرض باركنسون ومرض هنتنغتون من التلف التأكسدي للخلايا العصبية ، والذي غالبا ما يحدث بسبب تركيزات الحديد العالية بشكل غير عادي داخل الآفات. في مرض التصلب العصبي المتعدد ، زيادة التعرض للضرر التأكسدي ، جنبا إلى جنب مع الخلل الوظيفي في الميتوكوندريا بسبب ارتفاع محتوى الدهون واستهلاك الأكسجين لخلايا الجهاز العصبي المركزي ، يعزز بيروكسيد الدهون ، وهو عامل حاسم في داء الحديد. OLs حساسة لبيروكسيد الدهون ، وهي سمة أساسية لداء الحديد12. يسلط ترسب الحديد بالقرب من الآفات الالتهابية في العمود الفقري13 وتعرض OLs لبيروكسيد الدهون14 والجذور الحرة15 الضوء على قابلية مرض التصلب العصبي المتعدد للإصابة بالتهاب الحديد.
نقص الأكسجة هو عامل حاسم آخر في التسبب في مرض التصلب العصبي المتعدد الذي يساهم في فقدان الخلايا قليلة التغصن. تشير الأدلة على الضرر الشبيه بنقص الأكسجة وتوليد أنواع الأكسجين التفاعلية وأكسيد النيتروجين (NO) في آفات التصلب العصبي المتعدد الحادة إلى أن مثل هذه الضغوطات قد تعجل بخلل في الميتوكوندريا ونقص الطاقة اللاحق16. لا يؤثر هذا الإجهاد الأيضي على OLs فحسب ، بل يضعف أيضا المحاور المجاورة من خلال نقل الطاقة المتعطل17 ، حيث تنقل القنوات النخاعية الطاقة بين غمد المايلين والمساحات المحيطة بالمحور.
من الصعب للغاية الوصول إلى OPCs البشرية الأولية و OLs في الجهاز العصبي المركزي في مرضى التصلب العصبي المتعدد. ومن ثم ، ظهرت الخلايا الجذعية المستحثة متعددة القدرات (iPSCs) OPCs البشرية المشتقة من OPs و OLs كأدوات واعدة لدراسة الاضطرابات الجوهرية لمرض التصلب العصبي المتعدد. في ضوء الأدوار الحاسمة لالتهاب الحديد ونقص الأكسجة في التسبب في مرض التصلب العصبي المتعدد وتأثيرهما على سلالة الخلايا قليلة التغصن ، استخدمت هذه الدراسة تحليل شبكة التعبير المشترك الجيني المرجح (WGCNA) لاستخراج معلومات الوحدة18 ولتوضيح أنماط التعبير الجيني المرتبطة بهذه الظواهر في مرض التصلب العصبي المتعدد. من خلال فحص معاملات الارتباط بين الجينات ، يمكننا تحديد نفس شبكات أو وحدات التعبير المشترك أو ما شابهها ، مما يلقي الضوء على المؤشرات الحيوية الجديدة أو الأهداف العلاجية المحتملة للتصلب المتعدد. بالإضافة إلى ذلك ، من خلال التركيز على عوامل النسخ (TFs) التي تنظم الجينات الحرجة ، توفر هذه الدراسة أساسا لمزيد من الاستكشاف للآليات واستراتيجيات التدخل المحتملة لمرض التصلب العصبي المتعدد.
1. تنزيل البيانات ومعالجتها المسبقة
2. التحليل الجيني المعبر عنه التفاضلي
3. تحليل التخصيب الوظيفي (GO و KEGG)
4. تحليل تباين مجموعة الجينات لمرض الحديد ونقص الأكسجة (GSVA)
5. تحليل شبكة التعبير المشترك للجينات المرجحة (WGCNA)
6. تحديد الجينات المعبر عنها تفاضليا المتعلقة بالتهاب الحديد ونقص الأكسجة لدى مرضى التصلب العصبي المتعدد
7. تحليل شبكة التفاعل بين البروتين والبروتين (PPI)
8. التحقق من الصحة باستخدام مجموعة بيانات GSE151306
9. تخطيط منحنى ROC لجينات المحور
10. التنبؤ بالشبكات التنظيمية للجينات لمحور عامل النسخ
تم تحليل مجموعة البيانات المدمجة المكونة من أربعة أفراد أصحاء كعناصر تحكم وتسعة أشخاص مصابين بالتصلب العصبي المتعدد (PwMS) ، ثم التحقق من صحتها في مجموعة بيانات أخرى من أربعة PwMS وأربعة عناصر تحكم صحية. يظهر بروتوكول التحليل في الشكل 1 ، والمعلومات ...
نظرا لدورها المحوري في عملية إعادة تكوين الميالين ، فقد تم تحديد هجرة وتمايز وموت OPCs منذ فترة طويلة لتكون عوامل حاسمة في التسبب في مرض التصلب العصبي المتعدد والأهداف العلاجية لمرض التصلب العصبي المتعدد. لوحظ تنكس الأعصاب التدريجي المستقل عن الالتهاب في جميع الأنواع الث...
ليس لدى المؤلفين مصالح متنافسة للإعلان عن أنها ذات صلة بمحتوى هذه المقالة.
تم دعم هذه الدراسة وتمويلها من قبل تمويل البحوث السريرية للمستشفيات الوطنية عالية المستوى (2022-PUMCH-B-103). يود المؤلفون أن يشكروا الدكتورة شوانغ سونغ ، قسم الإحصاء الحيوي ، كلية هارفارد تي إتش تشان للصحة العامة ، جامعة هارفارد ، على نصائحها وتوجيهاتها القيمة في مرحلة مراجعة هذه المقالة.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
BioInfoTools | / | online analysis website http://biowinford.site:3838/patrick_wang87/ | |
Cytoscape | / | bioinformatics network analysis software | |
GSE196575,GSE147315 and GSE151306 | / | RNA-seq from GEO dataset | |
Omicshare | GENE DENOVO | online analysis tools https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/getsoft | |
R-studio | RStudio, Inc | R integrated development environment software |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionExplore More Articles
This article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved