طريقة فعالة لتصوير رئتي الفئران التي تحافظ على الديناميكيات المكانية للجراثيم الفطرية في الشعب الهوائية

Summary

نقدم طريقة لنموذج التسبب في المرض الفطري الذي يحافظ على الوضع الطبيعي للجراثيم الفطرية في الشعب الهوائية للرئة لتحليلها عبر الفحص المجهري الفلوري.

Abstract

تصيب الفطريات البشر عندما يتم استنشاق الجراثيم البيئية في الرئتين. الرئة عضو غير متجانس. تفرع المسالك الهوائية الموصلة ، بما في ذلك الشعب الهوائية والقصيبات الهوائية ، حتى تنتهي في المجال الجوي السنخي حيث يحدث تبادل الغازات. تثير العدوى التي تنشأ في القصيبات أو الحويصلات الهوائية استجابات مميزة للمضيف ومظاهر مرضية. لذلك ، فإن الفهم الدقيق لمكان تتموضع الجراثيم بشكل طبيعي في الرئتين ، خاصة بعد فترة وجيزة من الإصابة ، يوسع فرص التحقيق في تفاعلات المضيف والمسببات المرضية. هنا ، نشرح بالتفصيل تحليلا في الموقع للرئتين من الفئران المصابة ب Coccidioides posadasii cts2 / ard1 / cts3Δ arthroconidia. تتضمن الطرق التقليدية للحفظ النسيجي تضخما سائلا للممرات الهوائية بمحلول مثبت ، مما يزيح الموقع الطبيعي للجزيئات الفطرية المستنشقة ، مما يدفع الجراثيم من القصيبات القريبة إلى المساحات الطرفية.

على العكس من ذلك ، فإن طريقة نفخ الهواء هذه مع تثبيت نضح الأوعية الدموية تحافظ على الوضع الفسيولوجي للجراثيم الفطرية داخل القصيبات. علاوة على ذلك ، نصف نهجا بسيطا لحفظ عينات الرئة بالتبريد وتضمينها وتصويرها. نشارك أيضا التقنيات الحسابية عالية الإنتاجية عبر برنامج QuPath مفتوح المصدر لتحليل التوزيع المكاني للجراثيم الفطرية داخل الرئة. الطريقة المعروضة هنا بسيطة وسريعة ، وتتطلب الحد الأدنى من المعدات لأدائها ، ويمكن تكييفها بسهولة للاستخدام مع العديد من نماذج العدوى الفطرية التنفسية.

Introduction

يمكن للبشر استنشاق ما يصل إلى مليارات الجراثيم يوميا من مجموعة متنوعة من الفطريات البيئية¹. لفهم دفاعاتنا الحاجزة ضد هذه الجراثيم المستنشقة ، يجب أن نقدر البيئات التشريحية الدقيقة حيث تهبط هذه الجراثيم داخل الشعب الهوائية وحمة الرئة. يتحول التركيب الخلوي للممرات الهوائية (أي الخلايا الظهارية) بشكل كبير على طول القصبة الهوائية والشعب الهوائية والقصيبات الهوائية والحويصلات الهوائية. تتكون كل منطقة من هذه المناطق المتميزة من أنواع مختلفة من الخلايا ذات الوظائف المنفصلة التي توفر ترسانة من الدفاعات لمنع العدوى المرضية.

يمكن أن يختلف الموقع الدقيق لترسب الأبواغ الفطرية الرئوية بين تجويف مجرى الهواء للقصيبات العمودية المبطنة بالظهارة أو القنوات السنخية أو الحويصلات^{الهوائية 2}. تنتج معظم الأنواع الفطرية ذات الصلة سريريا جراثيم يتراوح قطرها بين 1 ميكرومتر و 10 ميكرومتر³. يعتمد ترسب جزيئات البوغ هذه في الرئة على عدة عوامل ، مثل الديناميكا الهوائية والكثافة والشحنة الكهربائية والقوى الفوريتية ، والتي يمكن أن تؤثر على آلية الترسيب بعد الاستنشاق⁴. بشكل عام ، ترسيب الجسيمات الكبيرة (> 6 ميكرومتر) في مجرى الهواء العلوي ، ويمكن للجزيئات متوسطة الحجم (2-6 ميكرومتر) أن تترسب في الشعب الهوائية الأصغر ، وتصل الجسيمات الصغيرة (<2 ميكرومتر) إلى المنطقة السنخية⁵. تم الإبلاغ عن وصول جراثيم الرشاشيات (2-3 ميكرومتر) إلى الفراغات السنخية ، لكن تقارير علم الأمراض السريرية تشير أيضا إلى عبء كبير من مرض الشعب الهوائية والقصيبات^{الهوائية 6}. هناك أيضا اعتراف متزايد بالالتهابات الفطرية داخل القصبات من Aspergillus fumigatus و Coccidioides immitis و Candida و Cryptococcus neoformans و Histoplasma capsulatum و Zygomycetes بسبب الشعبية المتزايدة لتنظير القصبات المرن⁷. كشفت التطورات الحديثة في التصوير المجهري لعدوى الرشاشيات في الفئران أيضا أن المزيد من المساحات الجوية القريبة مثل الشعب الهوائية والقصيبات الهوائية قد تتحمل العبء الأكبر لتكاثر الفطريات المرضية⁸. أظهرت الأبحاث التي أجريت على استجابة المضيف للالتهابات الفطرية الرئوية أن كلا من الخلايا الظهارية القصبية والخلايا الظهارية السنخية تلعب أدوارا مهمة كحراس مناعيين ، لذا فإن توضيح المواقع الدقيقة لترسب الأبواغ والتفاعل الظهاري سيكون أمرا حيويا للعمل المستقبلي^2،9،10.

من الصعب دراسة ديناميكيات التسبب في مجرى الهواء القريب لأن تقنيات تثبيت الرئة القياسية وتحضير المقطع يمكن أن تحل محل الجراثيم من هذه المواضع القريبة في الشعب الهوائية المبطنة بالظهارة وتدفعها نحو المناطق السنخية الطرفية البعيدة. بشكل عام ، يتم استخدام 10٪ فورمالين أو 4٪ بارافورمالدهايد لتضخيم الرئتين وتعريض الرئة بأكملها بسرعة للتثبيت. عند تحضير الرئتين للاستئصال بالتبريد ، تقوم بعض المجموعات بإدارة مركب درجة حرارة القطع المثلى (OCT) في الرئتين لتحسين أداء القطع بالتبريد¹¹. هذه الممارسات مفيدة في السياق الصحيح ولكن وجد مختبرنا ومجموعات أخرى أنها تحل محل الجراثيم والجسيمات من المواقع القريبة ، وبالتالي تتداخل مع التفسيرات حول أنواع الخلايا المعرضة للأبواغ واستجابة المضيف^{اللاحقة 12}.

لتحديد التوطين التشريحي الدقيق للجراثيم الفطرية المستنشقة بدقة ، قمنا بتطوير طريقة سريعة ومنخفضة الموارد للحفاظ على موقع الجراثيم الفطرية في الشعب الهوائية للفئران. قمنا بتكييف طريقة تثبيت نضح الأوعية الدموية لتضخم هواء الفئران من Thomas et al. (2021) ، حيث قمنا بتقليل كمية المعدات والوقت والمهارة الفنية المطلوبة لتحقيق نتيجة مرضية¹³. من الطريقة الموضحة هنا ، لاحظنا أن Coccidioides posadasii cts2 / ard1 / cts3Δ arthroconidia (حجم 3-5 ميكرومتر) يتراكم بشكل قريب أكثر مما هو موضح سابقا ، أي في القصيبات البعيدة والوصلات القصبية السنخية بدلا من الحويصلات الهوائية الطرفية. يمكن أن تركز هذه المعلومات على الأسئلة البيولوجية المتعلقة بأنواع الخلايا الحرجة المرتبطة بهذه المناطق من الرئة وتأثيرها على الاستجابات المبكرة للجراثيم الفطرية المستنشقة.

Protocol

تمت الموافقة على جميع الطرق الموضحة في هذا البروتوكول من قبل اللجنة المؤسسية لرعاية واستخدامه (IACUC) التابعة لعلوم روتجرز الطبية الحيوية.

1. تسمية الجراثيم مع التألق داخل الخلايا

1. صبغ 1 × 10⁶ جراثيم في كربوكسي فلوريسين إستر السكسينيميديل (CFSE) ، أو Cell Tracker Orange ، أو Cell Tracker Red (أو صبغة داخل الخلايا المفضلة) عند 5 ميكرومتر لمدة 30 دقيقة عند 30 درجة مئوية ، ثم اغسلها باستخدام PBS ، وقم بتدوير الجراثيم عند 12,000 × جم. كرر هذا الغسيل مرة واحدة.
2. تحضير لقاح البوغ بالتركيز المناسب بحيث يحتوي 25 ميكرولتر على جرعة البوغ المناسبة لفأر واحد.

2. تلقيح الفأر بالجراثيم من خلال استنشاق الشفط باستخدام تخدير الأيزوفلوران

تنبيه: الأيزوفلوران هو عامل تخدير متطاير ويجب استخدامه داخل خزانة السلامة الحيوية الأنبوبية أو غطاء الدخان.

1. لتحضير جرة التعرض للأيزوفلوران ، ضع منديلا مطويا في وعاء Nalgene بحجم 1 لتر وضع دائرة شبكية بلاستيكية فوق المنديل كمنصة للفئران. أضف 2 مل من الأيزوفلوران إلى المنديل ، وأغلق البرطمان ، وانتظر 1-2 دقيقة حتى يتوازن الغاز في الحاوية.

الشكل 1: جهاز لطريقة الإسقاط المفتوح للإيزوفلوران لتلقيح الأبواغ. يتم وضع منديل مطوي في الجزء السفلي من جرة علوية لولبية سعة 1 لتر ، ثم يتم إدخال شبكة بلاستيكية دائرية لتكون بمثابة منصة للفئران. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

2. قبل تعريض الفأر للتخدير ، قم بإعداد ماصة تحتوي على 25 ميكرولتر من اللقاح. ضع الماوس في حاوية الأيزوفلوران وقم بإمالة الحاوية لمراقبة فقدان منعكس التصحيح، حيث فقد الماوس وعيه ويكون مقلوبا رأسا على عقب. يستغرق هذا عادة حوالي 10 ثوان.
3. راقب معدل التنفس (RR) حتى يتباطأ إلى 50-80 نفسا ثابتا في الدقيقة (نبضة في الدقيقة) ، أي حوالي 50٪ من RR أثناء الراحة. يستغرق هذا عادة 10 ثوان أخرى. في هذا الوقت ، قم بإزالة الماوس من جرة الأيزوفلوران.
   ملاحظة: هذا تركيز عال من الأيزوفلوران ، والذي سينتج عنه تحريض سريع للتخدير ، ويجب مراقبة الفأر عن كثب. تعد جرعة زائدة من الأيزوفلوران المميتة خطرا ، حيث يمكن أن يكون تركيز الأيزوفلوران متغيرا ، ومنحنى الاستجابة للجرعة إلى الأيزوفلوران شديد الانحدار. إذا انخفض معدل التنفس إلى أقل من 50 نبضة في الدقيقة و / أو كان غير منتظم ، فقم بإزالة الفأر من الأيزوفلوران ، واتركه يتعافى لمدة 3-5 دقائق ، وحاول مرة أخرى (بحد أقصى محاولتين متكررتين).
4. تأكد من عمق التخدير من خلال عدم الاستجابة لقرص إصبع القدم. بعد ذلك ، ضع الماوس في وضع ضعيف بيد واحدة ، واسمح للفأر بأخذ 3-5 أنفاس شهقة منتظمة بمعدل متزايد (يبدأ من 50-60 نبضة في الدقيقة) وقوة. عندما يبدأ هذا ، ضع طرف الماصة في الجزء الخلفي من البلعوم الفموي للفأر وحرر اللقاح أثناء الاستنشاق.
   ملاحظة: هذه الشهقات من خلال الفم تهز الرأس بشكل أدنى بسبب تجنيد العضلات الملحقة للتنفس. عندما يتم إدخال الماصة أثناء هذه اللحظات ، يجب أن يفتح الفم مع كل شهقة. إذا لم يفتح الفم ، فإن الفأر غير مخدر بشكل كاف ومن المحتمل ألا يستنشق محتويات من البلعوم الفموي. يجب أن تضغط الماصة على اللسان ، وتدفعه نحو أسفل وأمام الفم لمنع ابتلاع اللقاح. عندما تكون الماصة في الفم ويتم تخدير الفأر بشكل كاف ، سيفتح الفأر فمه مع كل شهقة.
5. مع إمساك اليد والإبهام بالفأر ، اشعر بالخشخشة على الجوانب الخلفية والأمامية لصدر الفأر لتأكيد استنشاق اللقاح.

3. القتل الرحيم للفئران

1. حقن الفأر داخل الصفاق بمزيج من 200 مجم / كجم من الكيتامين و 24 مجم / كجم زيلازين قبل 10 دقائق من نقطة وقت التضحية.
2. انتظر 10 دقائق بعد الحقن حتى يدخل الفأر في مستوى التخدير الجراحي ، وهو ما يؤكده عدم الاستجابة لقرص إصبع القدم.

4. نضح الرئتين مع PBS والفورمالين

1. رش الفأر المخدر بنسبة 70٪ من الإيثانول. استخدم المقص لقص جلد الماوس وتفكيك الجلد لكشف الصفاق من جميع الجوانب. اسحب الجلد من النصف العلوي للفأر فوق رأسه ، واسحب الذراعين من الجلد.
2. قطع الغشاء البريتوني عند القص وعلى طول الجانب السفلي من القفص الصدري ، وتعريض الصفاق. إزاحة الكبد بشكل أدنى ، وكشف عن الحجاب الحاجز. استخدم المقص لثقب الحجاب الحاجز بعناية بعيدا عن حمة الرئة لتجنب ثقب ثقب في الرئتين نفسها.
   ملاحظة: سيؤدي ثقب الرئتين عن غير قصد إلى جعل تضخم الهواء اللاحق مستحيلا.
3. بعد ثقب الحجاب الحاجز ، يدخل الهواء إلى الصدر ، مما يؤدي إلى انهيار الرئتين. قطع القفص الصدري على الجانب الأيسر للكشف عن القلب. حقن 5-10 مل من PBS في البطين الأيمن بإبرة 30 جم بمعدل 1 مل لكل 5 ثوان (لتجنب إتلاف الأوعية) ، وتبييض الرئتين بسرعة.
   تنبيه: الفورمالين مادة متطايرة خطرة يجب التعامل معها داخل خزانة السلامة الحيوية الأنبوبية أو غطاء الدخان.
4. عند الانتهاء ، قم بإزالة الإبرة واستخدم إبرة جديدة لحقن 5 مل من الفورمالين المحايد 10٪ (NBF) في البطين الأيمن بنفس المعدل.

5. تضخيم الرئة المنفوخة بالهواء

1. قم بإزالة النصف الأمامي من القفص الصدري. لفضح القصبة الهوائية ، قم بقص الأضلاع العلوية وعظام الترقوة على يمين ويسار الرقبة. احرص على تجنب القطع بالقرب من خط الوسط حيث تقع القصبة الهوائية. باستخدام الملقط ، قم بتثبيت الأضلاع العلوية وعظام الترقوة المتبقية على خط الوسط للرقبة واسحبها بشكل متفوق حتى تنكشف القصبة الهوائية.
2. قم بإعداد خيط خياطة بطول 10 سم ، واسحبه تحت القصبة الهوائية ، واربط عقدة فضفاضة مسبقا في الطرف السفلي من القصبة الهوائية المكشوفة. قم بإعداد حقنة هواء سعة 1 مل بقسطرة 18 جرام. استخدم إبرة 18 جم لإحداث ثقب في القصبة الهوائية في الطرف العلوي من المنطقة المكشوفة.
3. ضع القسطرة في تلك الفتحة ، مما يضمن ملاءمة محكمة نسبيا لمنع الهواء من الهروب. قم بحقن 1 مل من الهواء ببطء في الرئتين على مدار 10 ثوان ، مع مراقبة تضخم الرئة في جميع الفصوص. ينتج عن التضخم الكامل الرئتين الالتفاف قليلا حول القلب وملء الحجم الذي تشغلانه في الحجاب الحاجز غير المثقوب.
4. اسحب العقدة بإحكام حول القصبة الهوائية ، وقم بإزالة القسطرة. أمسك القصبة الهوائية واستخدم مقصا غير حاد لإزالة الرئتين من الفأر ، مع الحرص على عدم ثقب الرئة.

6. الغمر التثبيت والجفاف

1. ضع الرئتين على الحافة العلوية لأنبوب مخروطي سعة 50 مل مملوء ب 20 مل من 10٪ NBF. احتفظ بخيوط الخياطة خارج المخروطي ، وقم بلف الغطاء ، واقلب المخروطي بحيث يتم تعليق الرئتين رأسا على عقب في 20 مل من NBF. ضعه في 4 درجات مئوية لمدة 24-48 ساعة.
2. اشطف الرئتين في PBS ، ثم ضعه في محلول 30٪ من السكروز PBS (وزن / حجم) لمدة 72-96 ساعة عند 4 درجات مئوية لتجفيف الرئتين استعدادا للحفظ بالتبريد. قم بإزالة الرئتين من السكروز ، ووضع الرئتين في CRYOOLD بدرجة حرارة القطع المثلى (OCT) ، وتجميد العينة عند -80 درجة مئوية.

7. التقطيع بالتبريد

1. قم بموازنة العينات في كتل التبريد OCT إلى درجة حرارة -20 درجة مئوية للناظم لمدة ساعة واحدة قبل التقسيم. قسم الكتل بسماكة 20-100 ميكرومتر.
   ملاحظة: يمكن أن يؤدي تضخم الهواء إلى زيادة هشاشة العينة ، ويمكن أن يمنع القطع بزيادة السماكة كسر الأنسجة أثناء التقطع.
2. اجمع الأقسام على شرائح زجاجية واتركها تجف لمدة 30 دقيقة إلى 1 ساعة لضمان التصاق الأنسجة بالشريحة.
   ملاحظة: يمكن الاحتفاظ بالشرائح عند -80 درجة مئوية في هذه المرحلة.

8. إعداد الشرائح وحجب

1. ضع الشرائح في حمام PBS (في طبق أو برطمان كوبلين) لمدة 30 دقيقة في درجة حرارة الغرفة (RT) لإزالة OCT من الشرائح.
   ملاحظة: قد لا تلتصق المقاطع السميكة (40-100 ميكرومتر) بالشرائح الزجاجية وكذلك الأقسام الرقيقة ، لذلك من الأفضل إبقائها مسطحة ومنتصبة في طبق بدلا من وضعها على جانبها في جرة كوبلين.
2. جفف الشرائح بعد ذوبان OCT بعيدا عن الأنسجة. استخدم منديلا لتجفيف القطرات الزائدة من محيط الشريحة حول عينة الأنسجة.
3. استخدم قلم عنق الرحم المقاوم للماء لرسم محيط حول العينة ، واتركه يجف لمدة 5 دقائق.
4. قم بإعداد مخزن مؤقت مانع لمحلول حجب خال من مع 0.3٪ Tween-20 و 1: 100 Fc Block في 300 مل لكل شريحة.
   ملاحظة: بالنسبة للأهداف داخل الخلايا ، يمكن استخدام 1٪ Tween-20. عادة ما يكون حجم 300 ميكرولتر كافيا ، لكن الحجم اللازم لتغطية الأنسجة يعتمد بشكل كامل على حجم محيط العلامة الكارهة للماء. يجب ألا تجف الأنسجة من هذه النقطة فصاعدا.
5. اترك محلول الحظر على الشرائح لمدة 1 ساعة في RT.

9. تلطيخ المناعة

1. اغسل الشريحة عن طريق سحب السائل وإضافة 300-500 ميكرولتر من PBS. كرر الغسيل مرة واحدة.
2. قم بإعداد الجسم المضاد الأولي للفئران المترافقة AlexaFluor-647 (استنساخ G8.8) (علامة ظهارية مجرى الهواء) في محلول مانع خال من مع 0.33٪ Tween-20 (أو 1٪ للأهداف داخل الخلايا). أضف 300 ميكرولتر لكل شريحة من هذا المحلول وصمة عار طوال الليل عند 4 درجات مئوية.
   ملاحظة: يجب اختبار الأجسام المضادة تجريبيا لتركيز التلوين والوقت ودرجة الحرارة. يتم تلطيخ الأجزاء الرقيقة (8-20 ميكرومتر) لمدة 30 دقيقة عند 37 درجة مئوية والأقسام السميكة (20-100 ميكرومتر) عند 4 درجات مئوية طوال الليل باستخدام 1: 100 تخفيفات لمعظم الأجسام المضادة. في حالة استخدام الأجسام المضادة غير المترافقة ، اغسل 2x (كما هو مذكور أعلاه) وقم بتطبيق جسم مضاد فلوري ثانوي لفترة ودرجة حرارة محددة تجريبيا. بشكل عام ، يتم تلطيخ الأجسام المضادة الثانوية في RT لمدة ساعة واحدة عند تخفيف 1: 1000.
3. قم بإزالة محلول الجسم المضاد من العينة ، واغسل الشريحة ب 300 مل من PBS لمدة 5 دقائق. كرر هذا الغسيل مرة واحدة. جفف الشرائح ، وإزالة كل السوائل الزائدة من العينة والزجاج المحيط.
4. أضف قطرة واحدة من وسائط التثبيت ذات الضبط الناعم RT (على سبيل المثال ، زجاج SlowFade) إلى كل قطعة من المناديل. احرص على تجنب الفقاعات عن طريق ترك الزجاجة تستقر وهي مقلوبة وإسقاط كل قطرة ببطء على المناديل. ضع زلة غطاء بحجم مناسب لتمتد إلى ما وراء العينة ومحيط العلامة الكارهة للماء.

10. التصوير عن طريق المجهر الفلوري

1. استخدم مجهر فلوري متعدد القنوات لمسح أقسام الرئة بأكملها بطريقة غير متحيزة باستخدام هدف ذو دقة كافية لحل الجراثيم الفردية والخلايا المضيفة (على سبيل المثال ، Zeiss Axioscan 7 باستخدام هدف الزيت 20x مع NA = 0.8 أو ما شابه ذلك).
   ملاحظة: تأكد من ضبط طاقة الليزر وكسب جهد PMT لزيادة نسب الإشارة إلى الضوضاء للهدف على الخلفية المحددة باستخدام عنصر تحكم مضان ناقص واحد (FMO).
2. اجمع بلاطات صور كافية لالتقاط فص الرئة بالكامل (على سبيل المثال ، ~ 200 بلاطة بحجم 400 ميكرومتر × 400 ميكرومتر). استخدم برنامج المجهر (على سبيل المثال ، Zeiss ZEN 3.7 أو ما شابه) لتصدير صورة البلاط المدمجة للمعالجة النهائية.

11. التحليل المكاني عبر QuPath

1. في QuPath ، وهو برنامج مجاني مفتوح المصدر¹⁴ ، قم بإنشاء ملف مشروع وإضافة صور الفلورسنت إلى الملف.
2. صنف وحدات بكسل EpCAM+ على أنها ظهارة بالنقر فوق خيار القائمة العلوية تصنيف، ثم تصنيف البكسل > إنشاء عتبة. حدد الدقة والقناة وسينعي سيجما وقيمة العتبة التي تحدد المنطقة المستهدفة بشكل أفضل. احفظ المصنف تحت اسم فريد، وحدد إنشاء كائنات.
3. في نافذة إنشاء كائنات الجديدة، حدد نوع كائن جديد كتعليق توضيحي. بالنسبة لظهارة الرئة ، اضبط الحد الأدنى لحجم الجسم والحد الأدنى لحجم الثقب على 100 مم². ليست هناك حاجة لتحديد تقسيم الكائنات هنا. بعد تحديد OK ، سيتم إنشاء التعليقات التوضيحية ، ويمكن تعديلها بالعين باستخدام أداة Brush في المنطقة العلوية اليسرى.
4. لتصنيف الجراثيم ، كرر الخطوات من 11.3-11.4 باستخدام القناة التي تم التقاط الجراثيم فيها وجعل نوع الكائن الجديد الكشف بدلا من التعليق التوضيحي. قم بتعيين الحد الأدنى لحجم الكائن والحد الأدنى لحجم الثقب إلى 0 مم²، وحدد تقسيم الكائنات.
5. لإجراء التحليل المكاني للجراثيم ، حدد خيار القائمة العلوية تحليل > التحليل المكاني > حساب المسافة الموقعة للتعليقات التوضيحية 2D. سيتم حساب المسافات إلى ظهارة EpCAM+ لكل بوغ تم اكتشافه. قم بتصديرها عبر خيار القائمة العلوية قياس > تصدير القياسات.

النتائج

تنتج هذه الطريقة في النهاية صورا مناعية فلورية لرئتي الفئران باستخدام نفخ الهواء الفسيولوجي لترك الشعب الهوائية دون إزعاج. الأهم من ذلك ، أن نقاط التفتيش المتعددة على طول الطريق ستؤكد أن مكونات البروتوكول قد تم تنفيذها بنجاح. أثناء التلقيح ، من المهم التأكد من أن اللقاح...

Discussion

لقد أنشأنا خط أنابيب لاستنشاق الأبواغ وتحليل الترسب المكاني للجراثيم المستنشقة. يوفر خط الأنابيب هذا معلومات قيمة لتحديد المناطق اللحمية ذات الصلة في الرئة المتأثرة باستنشاق Coccidioides posadasii cts2 / ard1 / cts3Δ arthroconidia. لقد لاحظنا أن جراثيم Coccidioides والجسيمات الخاملة ذات ?...

Materials

Name	Company	Catalog Number	Comments
18 G, 1 1/2 needle (305185)	Fisher	305185
1 L  Screwtop Jar  (Nalgene)	Fisher Scientific	11-823-33
Air-Tite Bulk Unsterile Syringes 10 mL Luer Lock	Fisher	14-817-175
AnaSed Injection (xylazine sterile solution)	Akorn	59399-110-20
Animal-Free Blocker and Diluent, R.T.U.	Vector	SP-5035-100
BD Insyte Autoguard Winged Shielded IV Catheter with BD Vialon Catheter Material 18 G x 1.88 in	BD	381547
BD Pharmingen Purified Rat Anti-Mouse CD16/CD32 (Mouse BD Fc Block™)	BD	553142
CellTracker Orange CMRA Dye	Fisher Scientific	NC0873640
CFSE	Labviva	75003
Coccidioides posadasii cts2/ard1/cts3Δ	BEI Resources	NR-166
Corning 70 micron strainers	VWR	10054-456
EpCAM AlexaFluor647 monoclonal antibody	Biolegend	118211
Exel International HYpodermic Needles 30 G x 1/2"	Labviva	EN3012
Fisherbrand Sterile Syringes for Single Use (1mL, Leur Slip)	Fisher	14-955-462
Glucose Monohydrate	Azer Scientific	ES17530-500G
High Vacuum Grease	VWR	59344-055
Hoechst 33342 Solution 20 mM (5 mL)	ThermoFischer	62249
Isoflurane USP	Covetrus	29405
Ketamine Hydrochloride	Dechra	1000001250
KIMWIPES Delicate Task Wipers (4.4'' x 8.4")	VWR	21905-026
Lexer Baby Scissors	FST	14078-10
Micro-Adson Forceps	FST	11018-12
Neutral Buffered Formalin (10%) (Azer Scientific)	Fisher	22-026-350
Nunc EasYFlask tissue culture flasks, T75, filter caps	VWR	15708-134
PBS	VWR	45000-446
Peel-A-Way embedding molds	Sigma	E6032-1CS
QuPath 0.5.1 Software	Open-source	https://qupath.github.io/
Silk Suture thread size 3/0	FST	18020-30
SlidesMicro Slides Superfrost Plus	VWR	48311-703
SlowFade Glass Soft-set Antifade Mountant (2 mL)	ThermoFischer	S36917
Sucrose	Sigma	S0389-500G
Tissue-Tek O.C.T. Compound, Sakura Finetek	VWR	25608-930
Tween 20	ThermoFischer	J20605.AP
Vector Laboratories ImmEDGE Hydrophobic Barrier Pen Set Of 2	Fisher Scientific	NC9545623
VWR Micro Cover Glasses, Rectangular (24 mm x 40 mm #1.5)	VWR	48393-230
White Plastic Wire Mesh	MAPORCH	789862904922
Yeast Extract	Fisher	BP9727-500
Zeiss AxioScan 7	Carl Zeiss Microscopy GmbH	https://www.zeiss.com/microscopy/us/products/imaging-systems/axioscan-for-biology.html	multichannel fluorescent microscope
ZEN 3.7 Software	Carl Zeiss Microscopy GmbH	https://www.zeiss.com/microscopy/us/products/software/zeiss-zen.html	microscopy software