للبدء ، قم بتشغيل برنامج التقاط الصور للمجهر. احسب عدد البلاطات المطلوبة لتغطية قلب الماوس بالكامل. التقط صور القلب بدءا من البلاط الأول.
التقط صورا بالتتابع للبلاطات المتبقية مع تداخل بنسبة 10٪ بين المربعات المتتالية حتى يتم تغطية القلب بالكامل. الآن ، افتح المكون الإضافي BigStitcher واستورد جميع المربعات الضرورية من خلال دليل ملف الصورة. احفظ مجموعة البيانات كملف HDF5.
استخدم لوحة النقل بواسطة وظيفة الشبكة العادية لتنظيم البلاطات. ثم حدد النمط المستخدم لتحريك القلب وحدد تداخلا بنسبة 10٪ بين كل بلاطة. غرزة البلاطات باستخدام خيار معالج الخياطة.
قم بإنشاء ملف TIFF باستخدام دمج الصور لتصدير البيانات المخيطة. لفك الالتفاف متعدد العرض للعينة. استخدم حبات الفلورسنت لتسجيل صور إعادة الإعمار متعددة العروض على طول القلب.
امسح مجموعة القلب عبر محور الكشف لالتقاط صور متسلسلة لقلب الماوس من القسم المضيء. قم بتدوير قلب الماوس بمقدار 60 درجة على طول المحور Y لالتقاط الحزم اللاحقة من زوايا متعددة. ثم افتح المكون الإضافي BigStitcher واستورد جميع الصور من خلال دليل ملف الصورة.
احفظ مجموعة البيانات كملف HDF5. اختر اكتشاف نقاط الاهتمام وحدد يدويا حبات الاهتمام للتسجيل. حدد نموذج التحويل الدقيق للتسجيل وقم بتعيين PSF لجميع طرق العرض.
انقر فوق Multi-view Deconvolution واختر نوع التكرار على أنه Efficient Bayesian. حدد عدد التكرارات على أنها 10 وقم بتنفيذها. أخيرا ، انقر فوق دمج الصور لتصدير ملف TIFF.
حققت طريقة الالتفاف متعددة المشاهدات دقة قريبة من الخواص بعد 15 ساعة من الحساب. كان الفحص المجهري للصفائح الضوئية الإبطية القائمة على ETL قادرا على تقليل الخلفية خارج التركيز البؤري وتحسين تباين الصورة. سمح دمج الخياطة مع الفحص المجهري للصفائح الضوئية التي اجتاحتها محوريا بتغطية قلب فأر كامل عمره ثمانية أسابيع بدقة موحدة.
