عزل النوى من الأنسجة الدهنية العضلية البشرية وتسلسل الحمض النووي الريبي أحادي النوى في اتجاه مجرى النهر

تحاول مجموعتنا البحثية فهم تكوين الخلية وملامح النسخ الخاصة بالخلية للأنسجة الدهنية العضلية أو IMAT في البشر. IMAT هو في الواقع مستودع دهني خارج الرحم يقيم بين ألياف العضلات وحولها. تمكن التصوير المقطعي المحوسب والتصوير بالرنين المغناطيسي من تحديد حجم IMAT وأظهر مؤخرا أنه يزداد مع تقدم العمر ومؤشر كتلة الجسم ، ويرتبط أيضا بالأمراض التنكسية العضلية.

أظهرت الدراسات الإفرازية في المختبر مؤخرا أن البروتينات المفرزة IMAT لديها القدرة على التأثير على حساسية الأنسولين ، والملامح الالتهابية ، وكذلك تعبيرات البروتين المقلص في العضلات الهيكلية البشرية. إن الكمية المحدودة من أنسجة IMAT التي تم جمعها أثناء الخزعات والطبيعة المحملة بالدهون للخلايا الشحمية تجعل هذا النسيج غير متوافق مع هضم الأنسجة وخلية واحدة RNA-Seq. لذلك ، أردنا تطوير بروتوكول يقوم بعزل النوى على كميات صغيرة من الأنسجة التي يمكن استخدامها بعد ذلك في RNA-Seq أحادي النواة في المصب.

سيمكن هذا البروتوكول الباحثين من تحديد التغيرات النسخية التركيبية والخاصة بالخلية التي تحدث في IMAT في حالات أمراض التمثيل الغذائي المختلفة واستجابة للتدخلات. نأمل أن تكون هذه المعلومات حاسمة في تطوير استراتيجيات علاجية جديدة للمساعدة في التخفيف من أمراض التمثيل الغذائي إما عن طريق استهداف IMAT مباشرة أو عواملها المفرزة. يفتقر المجال بشدة إلى بيانات حول بيولوجيا IMAT ، وأصوله الخلوية ، والتواصل مع الخلايا الأخرى ، المقيمة داخل وخارج IMAT ، بالإضافة إلى استجاباته الجزيئية لتدخلات نمط الحياة ، مثل النظام الغذائي والتمارين الرياضية أو العلاج الدوائي.

كل هذه أسئلة بحثية رئيسية لمجموعتنا.