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将赖氨酸的 cyclopropene 衍生物加入抗体, 就能使四嗪类分子的特异性、快速和有效的联系产生抗体-药物共轭。
抗体-药物结合 (ADCs) 在临床实践中使用的是抗体分子的混合物, 与不同数量的毒素在各个位置。临床前研究表明, 这些传统 ADCs 的治疗指标可以通过特定部位的毒素联系来改善。然而, 目前生产同类 ADCs 的方法存在着蛋白质表达低、反应动力学慢等诸多局限性。在本协议中, 我们描述了如何建立一个表达系统, 将赖氨酸 (一种改进) 的 cyclopropene 衍生物纳入基因编码扩展的抗体中。这种极小的 bioorthogonal 手柄允许四嗪类衍生物通过逆需求翅果-桤木 cycloaddition 快速共轭。这里的表达系统可以使曲妥珠单抗轴承一种改进在每个重链中都能进行简便的生产和纯化。我们解释了如何将抗体与毒素单 auristatin E 联系起来, 并通过疏水性相互作用色谱和质谱对 immunoconjugate 进行表征。最后, 我们描述了检测 dihydropyridazine 联系产生的人血清的稳定性, 并测试 ADC 对高 HER2 受体乳腺癌细胞的选择性细胞毒性的测定。
抗体-药物共轭 (ADCs) 结合 biotherapeutics 的选择性和小细胞毒性分子的效力。大多数 ADCs 的目的是减少传统化疗的副作用, 靶向药物, 影响 DNA 或微管聚合到癌细胞1。由食品和药物管理局 (FDA) 批准的第一代 ADCs 依赖于 lysines 和半胱氨酸的改性, 从而产生不同位置改性的分子混合物, 其药代动力学特性降低2。相比之下, 特定部位的药物与抗体的结合可以产生化合物, 改善治疗 indeces3,4。为了解决生产同类 ADCs 的挑战, 已报告了几种选择性化学和酶改性的1、5。然而, 目前的方法只能针对抗体的某些位置, 低蛋白表达, 提供连接器低稳定性, 或依赖于缓慢和低收益的反应。
通过遗传代码扩展将非标准氨基酸 (ncAA) 结合在一起, 使站点特定的 bioorthogonal 反应组的安装成为蛋白质, 有可能克服其他方法的局限性, 用于生成Adc。编码 ncAAs 响应目标 (停止) 密码子依赖于氨酰-tRNA 合成酶/tRNA 对, 是正交的内源对纳入标准氨基酸6。一些 ncAAs 已被纳入抗体, 以产生 ADCs。然而, 大多数患者在治疗药物共轭中的应用受到各种责任。对 acetylphenylalanine (pAcF)7,8不是完全 bioorthogonal, 需要低 pH 值 (4.5) 和长反应时间 (> 60 h), 而叠氮化合物如 p azidophenylalanine (pAzF)7,9,10,p-azidomethylphenylalanine (pAMF)11, 和一叠氮化物衍生物的赖氨酸 (AzK)12,13可以减少在细胞14, 和铜用于催化 Huisgen cycloadditions 可诱发氧化损伤15。
虽然基于环辛烯 (TCO)、cyclooctyne (上海合作组织) 和双环 [6.1. 0] 壬烯 (BCN) 的替代 ncAAs 最近被编码为生物成像的抗体, 表达系统的产量非常低 (0.5 毫克/升)16。此外, cyclooctenes 和 cyclooctynes 是大而疏水手柄, 可能增加 adc 的易感性的聚合-ADC 有效载荷传统上是疏水性的, 并显示了链接器的物理化学性质大大影响药代动力学和治疗指标17。相比之下, 13-disubstitued cyclopropenes 是小的反应组, 应导致最小的改变蛋白质结构和 physichochemical 属性18。Cyclopropenes 有选择地和快速地反应与 tetrazines 通过逆电子需求翅果-桤木 cycloaddition19。在本协议中, 我们利用赖氨酸 (一种改进,图 1b) 的导数, 其轴承是一个甲基 cyclopropene, 它受空间障碍的影响小于较大的非饱和循环, 且反应速率常数为1-30 米-1s 。-1在水介质18,20。
我们最近报告了如何将一种改进纳入抗体, 以产生 ADCs 通过反应这个最小的 bioorthogonal 处理与四嗪类分子21。在这里, 我们更详细地描述了 ADC 准备过程, 重点是最具挑战性的步骤。一种改进的成立是针对抗体重链 (HC)22中引入的琥珀密码子, 采用 pyrrolysyl-tRNA 合成酶 (PylRS)/tRNACUA(PylT) 对。在这里, 我们使用两种质粒进行瞬变转染 (图 1a), 一个编码重链的抗体和另一个编码的光链 (LC), 包括 PylRS/PylT 盒。另外, 可以通过更费力的程序21生成稳定的细胞线, 使抗体产生更高的产量。
上述表达系统可以产生治疗 anti-HER2 免疫球蛋白 1 (IgG1) 曲妥珠单抗与一种改进在类似水平的野生型抗体。我们选择了重链上的 CH1 域的第一个位置来编码 ncAA (HC-118TAG)。这是 ADCs23中最常用的修改站点, 被称为 HC-118 (欧盟编号), 但也被称为 HC-121 (序列位置) 和 HC-114 (卡巴金编号)24。由于这个位置是保存在所有 IgG1s, 这些表达系统应服从大多数治疗抗体。
我们显示曲妥珠单抗 (一种改进)2可以很容易地纯化蛋白质 A 后, 快速蛋白液相色谱与疏水性相互作用柱 (FPLC-生境)。随后, 抗体在3小时内与微管聚合抑制剂单 auristatin E (MMAE) 中的共价键相连, 在 FDA 批准的 ADC Adcetris 中使用。在这里, 我们使用 MMAE (四嗪类-vcMMAE) 的苄基四嗪类衍生物, 其链接器包括戊间隔和缬氨酸瓜蛋白酶不稳定成分, 后跟一个p氨基苯甲醇自 immolative 单元;该链接器是由蛋白酶 B 在溶酶体的内部化后, 导致无影无踪释放毒素25。为了显示反应的广泛范围, 抗体也链接到荧光四甲基罗丹明 (TAMRA)。本文介绍了用液相色谱联用质谱 (LC) 对共轭的鉴别方法, 并用高效液相色谱法 (HPLC-HIC) 计算药物与抗体比值 (DAR).
作为抗体表现特征的一部分, 我们描述了如何检测人血清中 dihydropyridazine 的稳定性。这个参数更容易评估曲妥珠单抗-TAMRA, 因为它可以量化的简单 ELISA 和解释的结果是不复杂的蛋白酶不稳定成分的曲妥珠单抗 (MMAE)2。最后, 对曲妥珠单抗 (MMAE)2的选择性和效力进行了比较, 通过对不同细胞线的 ADC cytoxicity 进行了对比, 表达了 HER2 的水平。这种检测还提供了一个功能证明的 ADC 稳定性时, 孵化后, immunoconjugate 的人血清。
1. 抗体的产生和表征
2. 共轭抗体并表征 ADC
3. 曲妥珠单抗 (TAMRA)2血清中 Dihydropyridazine 链的稳定性测定
4. 评估 ADC 的细胞毒性
注: 本协议是根据以前报告的化验23,26和一些修改。
所报告的瞬态表达系统 (图 1a) 产生 22 2 毫克的曲妥珠单抗 (一种改进)2每公升培养基, 代表2/3 的野生型抗体生产在相同条件下 (图 1c)。稳定的细胞线可以提高这一产量高达 31, 2 毫克/升21。
曲妥珠单抗 (一种改进)2可与四嗪类 vcMMAE 共轭, 在25摄氏度 (图 2) 的3小时内产生准均质曲妥珠单抗 (MMAE)2 。这种毒素的高疏水性需要增加10% 乙腈, 当5或更多的摩尔当量的毒素每一种改进使用。另外, cycloaddition 也在20小时内完成, 使用2当量的四嗪类 vcMMAE, 不带乙腈 (图 2c)。曲妥珠单抗 (一种改进)2反应与四嗪类 TAMRA 在2小时内25°c 和 3-6 h 是必要的, 当温度降到4摄氏度 (图 3c)。
用 HPLC 法测定的曲妥珠单抗 (MMAE)2的预期 DAR 为 1.9 (图 2b)。在色谱中最初观察到的峰值为8.0 分钟, 代表游离抗体 (DAR 0), 当反应完成时应该完全消失。与 DAR 1 elutes 的种类在 9.1-9.6 分钟, 并且应该有一个区域 < 10% 在 3 h 以后;与 DAR 2 的目标产品的保留时间为 10.5-11.0, 预期区域 > 90%。SDS 页凝胶中的移动和荧光证实了 TAMRA (图 3b) 的成立, immunoconjugates 的身份被 LC MS (图 2d-e和图 3d) 验证。
曲妥珠单抗 (TAMRA)2在人血清中的孵化和随后的酶联免疫分析证实, 有效载荷仍然附着在抗体上 (图 4b)。对于细胞毒性检测, 曲妥珠单抗 (MMAE)2显示 SK-BR-3 (HER2 高) 乳腺癌细胞的高效能, 一半最大有效浓度 (EC50) 55 下午10点 (图 4d)。曲妥珠单抗 (MMAE)2在人类血清中5天的孵化后保持细胞毒性 (图 4c)。反之, 当 ADC 在 MCF-7 (HER2 低) 上进行测定时, EC50是200倍低 (图 4d)。野生型抗体, 曲妥珠单抗 (一种改进)2和四嗪类 vcMMAE 显示极低的毒性 (图4d 和 4e), 而 MMAE 显示高无选择性细胞毒性在两个细胞系 (图 4e)。
图 1: 瞬态表达式系统。A.用于 HEK293 细胞瞬态转染的质粒的相关区域。CMV: 巨细胞病毒启动子, WPRE: 土拨鼠肝炎毒转录后水平调控元素, PylT: pyrrolysyl tRNA, U6: 具体促进者, PylRS: pyrrolysil tRNA 合成酶, > 和 <: 转录方向。 ((2-methylcycloprop 2 en 1 基) 甲氧基) 羰基-l-赖氨酸 (一种改进)。C.野生型 (曲妥珠单抗) 和曲妥珠单抗 (一种改进)2的表达率, 在蛋白 a 纯化后在西方印迹中测定。误差条表示生物 triplicates 的标准偏差。此图经 Oller-丹参等的许可修改。201821。请单击此处查看此图的较大版本.
图 2: 曲妥珠单抗 (一种改进)2与四嗪类 vcMMAE 的共轭。cycloaddition 一种改进残留与 MMAE 四嗪类衍生物之间的逆电子需求翅果-桤木。反应组以红色突出显示, p-氨基苯甲醇在绿色和缬氨酸瓜二肽在蓝色被描述。B. HPLC-图谱显示抗体共轭的进展。C.使用不同试剂浓度对最大 DAR 1.9 的转换程度。D-E.Deconvoluted 在共轭前后的全长度抗体的质谱。曲妥珠单抗 (一种改进)2是使用稳定细胞线获得的。此图经 Oller-丹参等的许可修改。201821。请单击此处查看此图的较大版本.
图 3: 曲妥珠单抗 (一种改进)2与四嗪类 TAMRA 的共轭。cycloaddition 一种改进残留与 TAMRA 四嗪类衍生物之间的逆电子需求翅果-桤木。B. SDS 页凝胶显示移动转移和凝胶荧光起源于 TAMRA 的共轭。C.在两种不同温度下的共轭动力学。D. Deconvoluted 质量谱曲妥珠单抗 (TAMRA)2.曲妥珠单抗 (一种改进)2是使用稳定细胞线获得的。此图经 Oller-丹参等的许可修改。201821。请单击此处查看此图的较大版本.
图 4: 血清的稳定性和曲妥珠单抗共轭物的细胞毒性。A.卡通突出显示 ADC 中所需的功能。B.曲妥珠单抗 (TAMRA)2在人血清中的稳定性, 以 ELISA 测定。C.细胞活性测定与曲妥珠单抗 (MMAE)2后5天的人血清 (+ 血清, 黑色)。以 PBS 代替血清 (-血清、红) 的对照样品纳入同一化验。用新鲜稀释的抗体样品进行细胞活性测定。用新鲜稀释的 MMAE 衍生物进行细胞活性测定。误差条表示3独立实验平均值的标准误差。此图经 Oller-丹参等的许可修改。201821。请单击此处查看此图的较大版本.
该协议中描述的曲妥珠单抗 (一种改进)2的瞬态表达过程简单, 允许高模块化。获得的收益率在一个学术设置27和稳定的细胞系可以产生, 以进一步提高产量21。在表达过程中, 一种改进低于5毫米的浓度可能会导致更低的 ncAA 合并, 更高的数量可能会影响细胞生长和降低抗体产量。一种改进作为游离氨基酸具有低水溶性, 因此应首先溶解在100毫米在0.1 米氢氧化钠, 然后添加到培养基中。在培养基中稀释一种改进, 在将其添加到细胞之前, 用 HCl 和过滤器对培养基进行杀菌是至关重要的。随后, 使用本协议中指定的转染试剂, 并遵循制造商推荐的孵化时间, 对高产表达具有重要意义。有关人体抗体瞬态表达的进一步细节, 读者可以参考其他已发布的协议31,32。
当抗体被纯化后, 需要高过量的蛋白质 a 树脂, 以确保完全抗体从上清下拉。为防止曲妥珠单抗在洗脱过程中沉淀, 可推荐采用高缓冲容量的溶液, 立即稀释 PBS, 交换缓冲液, 避免过量浓度。始终保持抗体 < 5 毫克/毫升。
曲妥珠单抗 (一种改进)2与四嗪类 vcMMAE 的共轭比大多数与 bioorthogonal 处理 ADCs 的反应要快。此外, 这种 cycladdition 发生在非常温和的条件下: 室温或较低的生理 pH 值。在添加 PBS 和抗体之前, 用乙腈稀释反应物的亚砜溶液是很重要的;否则, 四嗪类衍生物将沉淀。乙腈仅由于 MMAE 和 TAMRA 的高疏水性而需要, 但疏水性分子可能不需要加入共溶剂。另外, 四嗪类-vcMMAE 可以共轭不乙腈, 只有2摩尔当量的四嗪类 vcMMAE 在20小时内。与目前基于 ncAA 的技术相比, 这种少量的毒素可能会导致 ADC 的制造成本大幅下降。曲妥珠单抗 (一种改进)2是完全活性的至少4月, 当保存在4摄氏度。
高效液相色谱-生境可精确测定 DAR, 因为 MMAE 是高度疏水性的, 并提供了与 0, 1 和2毒素相对应的抗体共轭峰的优良分辨率。反应四嗪类-vcMMAE elutes 约13.7 分钟, 并检测到 280 nm。这种技术要求具有高纯度的起始材料。此外, 它是不可取的, 以淬火与其他四嗪类反应分子, 如 BCN-OH, 因为它们可以改变的保留时间和形状的峰值。在梯度开始时, 试样的盐浓度与流动相匹配, 以获得良好的分离, 特别是在注入10-20 µL 的情况下。
对于 LC-MS 分析, deglycosylation 的抗体样本需要获得一个单一的峰值后, 反褶积的原始光谱。总抗体和 ADC 质量的准确性可能取决于仪器的 callibration。因此, 为了计算质量的修改, 减去获得的质量为未修改的抗体从一个获得的 ADC。现代高分辨率质谱仪应提供低于1:10000 的相对误差。虽然 LC MS 也可以用来计算不同物种之间的比值, 但这个值通常是高估的, 因为修改可能会影响产生的物种的电离能力, 而且可能无法检测到少量杂质。
由于药物的过早释放导致毒性更高, 疗效较低, ADCs 中链接器的稳定性至关重要;自由毒素损害健康组织和裸抗体竞争与武装一个为目标结合点在患病的细胞。预计在稳定性试验的可变性范围内, 5% 以下的释放。
最后, 通过比较 SK-BR-3 细胞 (HER2 高) 和 MCF-7 细胞的细胞毒性 (HER2 低), 可以评估 ADC 靶向 HER2 如曲妥珠单抗 (MMAE)2的选择性, 因为后者表达的比前28的 HER2 受体少15倍..与 MCF-7 相比, immunoconjugate 有望在 SK-BR-3 中产生至少2级低的细胞活力。EC50在 SK-BR-3 应该是在两位数 nanomolar 范围内, 反映了这个 ADC29,30的高效能。未经修改的抗体, 无论是曲妥珠单抗 (MMAE)2或曲妥珠单抗, 应显示没有毒性的这一化验。四嗪类-vcMMAE 的效果比 ADC 低3级, 因为链接器去除了 peptidomimetic 毒素的活性。相反, 由于 MMAE 能够渗透细胞膜30, 它应该有一个类似的毒性 ADC, 但不显示 HER2 高和 HER2 低细胞线之间的歧视。此外, 如果这一检测是在5天的 ADC 的孵化后进行的血清, 它可以用来提供一个功能证明的连接器的稳定性: 毒素的释放将导致 SK-BR-3 ADC 效率的下降, 如果 MMAE 释放与 p链接器的艺术或如果链接器以无影无踪的方式被切割, 则选择性降低。
本文所描述的 ADC 技术允许高效地将赖氨酸 cyclopropene 衍生物纳入 IgG1s。经过一种简便的纯化后, 抗体可以迅速与含有四嗪类的分子结合, 产生均匀的产物。由于 cyclopropene 最小手柄的体积小、反应性高, 该方法应能使 sterically 受阻载荷的共轭。结果 immunoconjugates 在血清中稳定, 具有较强的选择性。总的来说, 一种改进支持快速, 站点特定和稳定的 bioorthogonal 联系, 用于抗体和其他蛋白质共轭物用于治疗或诊断。
作者没有什么可透露的。
这项工作得到英国医学研究委员会的支持。狐臭。持有 EMBO 奖学金 (ATLF 158-2016), 并感谢 h. 佩勒姆和 J.W. 下巴的支持, 以及 g 许姆、波斯特摩根和 o. Perisic 的帮助和建议。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Expi293F | ThermoFisher Scientific | A14527 | HEK suspension cells |
Expi293 Expression Medium | ThermoFisher Scientific | A1435101 | Expression medium |
Antibiotic-antimycotic | ThermoFisher Scientific | 15240062 | Penicillin-streptomycin-amphotericin B |
125mL Polycarbonate Erlenmeyer Flask with Vent Cap | Corning | 431143 | Shake flasks |
Brunswick S41i incubator | Eppendorf | S41I230011 | CO2 incubator with a shaker |
Sodium hydroxide 4 mol/l (4 N) in aqueous solution | VWR | 191373M | |
Cyclopropene lysine | Sichem | SC-8017 | In this study it was synthesized as described by Elliot et al. 2014 |
Steriflip-GP, 0.22 µm, polyethersulfone, gamma irradiated | Merck Millipore | SCGP00525 | |
Opti-MEM, Reduced Serum Medium | ThermoFisher Scientific | 31985070 | Reduced serum medium |
ExpiFectamine 293 Transfection Kit | ThermoFisher Scientific | A14525 | Transfection reagent |
5810 R centrifuge | Eppendorf | 5811000460 | |
Millex-GP Syringe Filter Unit, 0.22 µm, polyethersulfone, 33 mm, gamma sterilized | Merck Millipore | SLGP033RS | |
Protein A resin | Sino Biological | 10600-P07E-RN-25 | |
Poly-Prep Chromatography Columns, Pkg of 50 | Bio-Rad | 7311550 | Polypropylene chromatography column |
Econo-Column Funnel | Bio-Rad | 7310003 | |
Sodium citrate | Fluka | 71635 | |
ÄKTA explorer FPLC | GE Healthcare | ||
HiTrap HIC Selection Kit | GE Healthcare | 28-4110-07 | Includes HiTrap 1 mL Butyl HP |
Ammonium sulfate | VWR | 2133.296 | |
Isopropanol | Honywell | 34863-2.5L | |
Dymethyl sulfoxide | Sigma-Aldrich | D8418-50ML | |
Tetrazine-vcMMAE | ChemPartner | - | Costum synthesized |
Tetrazine-5-TAMRA | Jena Bioscience | CLK-017-05 | |
NuPAGE 4-12% Bis-Tris Gel 1.0mm x 10 well | ThermoFisherScientific | NP0321BOX | |
Xcell SureLock Mini-Cell | ThermoFisherScientific | EI0001 | |
UltiMate 3000 HPLC | ThermoFisherScientific | ||
Thermo Scientific MAbPac, HIC-20, 4.6 x 100 mm, 5 µm | ThermoFisherScientific | 088553 | |
PNGase F | New England BioLabs | P0704S | |
NanoAcquity | Waters | ||
C4 BEH 1-5 µm 1.0 x 100 mm UPLC column | Waters | ||
96-well microplates for cell culture | ThermoFisherScientific | 156545 | |
Human serum | Sigma-Aldrich | H4522-20mL | |
CO2 incubator | Panasonic | ||
HER2 ECD | Sino Biological | 10004-HCCH | |
Anti-TAMRA | Abcam | an171120 | |
Anti-mouse HRP | Santa Cruz | sc-2005 | |
TMB | BioLengend | 421101 | |
Sulfuric acid | Sigma-Aldrich | 84727-500ML | |
PHERAstar FS | BMG Labtech | Plate reader | |
DMEM | Sigma-Aldrich | D5671-500ML | |
SK-BR-3 | ATCC | HTB-30 | |
MCF-7 | ATCC | HTB-22 | |
CellTiterGlo 2.0 Assay | Promega | G9242 | Cell viability assay based on the measurement of ATP released after cell lysis. The output signal is luminscence. |
Monomethyl Auristatin E | Cayman Chemical | 16267 | |
NanoDrop 2000 | ThermoFisherScientific | Microvolume spectrophotometer | |
Human IgG ELISA Quantificaiton Set | Bethyl | E80-104 | |
MaxEnt1 in MassLynx | Waters | Software application for mass spectrum deconvolution | |
IntantBlue | Expedeon | ISB1L | Coomassie-based stain |
Intact MMAE-ADC ELISA Kit (Sandwich Assay) | Epitope Diagnostics, Inc. | KTR 782 | |
Tube 50 mL, 114x28mm, PP | Sarstedt | 62.547.254 | Conical tube |
Amicon Ultra-15 Centrifugal Filter Units 50,000 NMWL | Merck | UFC905024 | Centrifugal filtration concentrator (after protein A pull down) |
Amicon Ultra-4 Centrifugal Filter Units 50,000 NMWL | Merck | UFC805024 | Centrifugal filtration concentrators (after FPLC or HPLC purification) |
Zeba Spin Desalting Columns, 7K MWCO, 0.5 mL | ThermoFisherScientific | 89882 | Size exclusion spin columns |
Tube PCR 0.2ml Flat Cap | Thistle Scientific Ltd | AX-PCR-02-C-CS | PCR tubes |
Nunc MaxiSorpª flat-bottom | ThermoFisherScientific | 44-2404-21 | Plates for ELISA |
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