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电生理学是研究离子通道活性的金标准。但是,有很多替代方法,包括光学方法。在这里,我们描述了一种使用基于亚基间 Förster 共振能量转移 (FRET) 的方法监测包含 8 个通道 (LRRC8) 形成的阴离子通道的富含亮氨酸重复序列的活性的方法。
LRRC8 蛋白家族的成员形成异聚离子和渗透离子通道,在许多生理过程中发挥作用。作为体积调节阴离子通道 (VRACs)/体积敏感的外向整流通道 (VSORs),它们在渗透细胞膨胀时被激活并介导氯离子和有机渗透液的挤出,导致水外流,从而导致细胞收缩。除了在渗透压调节中的作用外,VRAC 还与分化、迁移和细胞凋亡等细胞过程有关。通过它们对膜电位及其各种信号分子转运的影响,包含 8 个富含亮氨酸的重复序列 (LRRC8) 通道在神经元-胶质细胞通讯、胰岛素分泌和免疫反应中发挥作用。激活机制仍然难以捉摸。与其他离子通道一样,LRRC8 通道通常使用电生理学方法进行研究。在这里,我们描述了一种通过测量与 LRRC8 亚基的 C 末端富含亮氨酸重复结构域融合的荧光蛋白之间的复合物内敏化发射 Förster 共振能量转移 (SE-FRET) 来检测 LRRC8 通道激活的方法。这种方法提供了在没有交换胞质环境的情况下以及在细胞分化和细胞凋亡等过程中原位研究通道激活的可能性。
由含有 8 种富含亮氨酸重复序列的异聚体组成的离子通道 8 (LRRC8) 家族蛋白遍布整个脊椎动物细胞,参与广泛的生理功能 1,2。这些 LRRC8 通道最初被确定为容量调节阴离子通道 (VRAC) 或容量敏感的向外整流通道 (VSOR),在细胞调节体积减少中起着至关重要的作用 3,4。它们促进氯离子和有机渗透物的排出,然后随着渗透膨胀而出现水外排。除了在渗透应激反应中的作用外,它们在细胞体积调节中的作用还与细胞增殖和迁移、细胞凋亡、精子发生和上皮完整性有关 5,6,7。LRRC8/VRAC 激活后膜电位的改变已被证明有助于肌管分化8 和胰腺β细胞分泌胰岛素 9,10,11。此外,LRRC8 通道传导多种有机渗透物,例如嘌呤能信号分子 ATP 和 cGAMP 或兴奋性氨基酸谷氨酸,将这些通道置于免疫系统的细胞间通讯或神经胶质细胞-神经元相互作用中 12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22.甚至外源性物质,如染料荧光素、抗生素杀稻瘟菌素 S 或抗癌药物顺铂,也是由 LRRC8 通道传导的 23,24,25。
关于导致 LRRC8/VRAC 激活的信号转导,有许多报道 26,27,28。然而,其机制仍不清楚,文献提出了可能取决于特定生理过程的广泛潜在机制。这些包括胞质离子强度的变化、与细胞骨架的相互作用、膜组成、G 蛋白、氧化还原状态和磷酸化级联反应 2,27,29,30,31。
LRRC8/VRAC 通道包含 LRRC8A 作为必需亚基 3,4,它必须与至少一个旁系同源物 LRRC8B-E 异聚化以形成生理功能通道 4,14,32。亚基组成决定了通道的生物物理特性,例如整流和去极化依赖性失活 4,29,32,33,34,底物特异性 15,17,20,21,24,35 和一些激活途径 36,37.冷冻电子显微镜 (cryo-EM) 结构显示,LRRC8A 同源体以及异聚体组装为六聚体 38,39,40,而形成功能通道的 LRRC8A/LRRC8C 嵌合体是七聚体 41。所有 LRRC8 蛋白的 N 端部分由四个跨膜螺旋组成,C 端部分包含一个富含亮氨酸重复序列 (LRRD) 的结构域。可用的 LRRC8 复合物结构提供了证据,证明延伸到胞质溶胶 3,4,23 的 LRRD 可能在通道门控期间发生构象重排 34,42,43。荧光蛋白的 C 端融合导致基底通道活性14,并且纳米抗体与结构域的结合可以调节通道活性44,这一发现证实了这一概念。此外,复合体内 Förster 共振能量转移 (FRET) 显示 C 末端的构象改变45。
研究离子通道活性的最常用方法是电生理学测量46,在分子鉴定之前,它被广泛应用于 VRAC 的研究47。然而,还有各种其他方法可以间接监测 VRAC 活性,包括测量其传导底物 - 卤化物离子或有机渗透剂 - 或其对细胞体积的影响48。事实上,LRRC8 蛋白是否为 VRAC 依赖于基于碘化物通过活化的 VRAC 进入细胞来淬灭卤化物敏感荧光蛋白49 的测定 3,4。另一种监测 LRRC8/VRAC 通道活性的方法是利用胞质结构域的运动,这可以通过 FRET45 的变化观察到,就像在其他离子通道 50,51,52,53 中一样。为此,将用作 FRET 对的荧光蛋白,例如作为供体的青色荧光蛋白 (CFP)/mCerulean3 和作为受体的黄色荧光蛋白 (YFP)/mVenus,与 LRRC8 蛋白的 C 末端融合(图 1)。受体光漂白实验显示了 LRRC8 亚基之间的复合物内FRET45。避免了破坏性光漂白方法,通过敏化发射 FRET (SE-FRET) 监测 FRET 随时间的变化,其中基本上由于供体的发射光谱与受体的激发光谱重叠,测量了受体在供体激发时的敏化发射。应用细胞外低渗性,刺激 LRRC8/VRAC 激活,导致 SE-FRET 强度可逆降低45。重要的是,在低渗治疗期间同时进行的全细胞膜片钳测量和 FRET 监测表明,FRET 的这种降低确实反映了 LRRC8/VRAC 激活45。这种方法避免了通过移液器溶液破坏质膜或改变细胞内环境,为监测 LRRC8/VRAC 活性提供了一种替代方案。它在维持天然胞质溶胶至关重要、需要亚细胞分辨率或需要长时间观察通道活动的生理环境中特别有用。
在这里,我们提出了一种使用这种基于 FRET 的读数来研究 LRRC8/VRAC 的方案。该方案描述了如何处理和转染细胞、采集样品和控制图像、分析数据以及计算敏化发射 FRET (SE-FRET) 值。
图 1:LRRC8 FRET 对系统示意图。 mCerulean3 以青色显示,mVenus 以黄色显示。VRAC 打开后,荧光团之间的距离(和/或空间方向)发生变化,导致供体 (Don) 和受体 (Acc) 之间的能量传递减少,进而降低观察到的 FRET。使用 BioRender.com 创建。请单击此处查看此图的较大版本。
1. 缓冲液和试剂的制备
2. 贴壁细胞在玻璃底培养皿上的生长
3. 细胞转染
注:此处使用 FuGENE 作为转染试剂。其他转染试剂和方法也适用。需要根据经验评估质粒 DNA (pDNA) 与转染试剂的最佳比例以及每种 POI 和细胞模型的最佳表达时间。在这里,每 35 mm 培养皿使用 2 μg 总 pDNA。FRET 供体和受体构建体以 1:1 的比例使用,pDNA 与转染试剂的比例为 1:4(表 1)。
条件 | 构造体 (s) | 样本 | 用于 |
1 | LRRC8A-m蔚蓝 | 仅供体构建体 | 确定校正因子 β |
2 | LRRC8E-mVenus | 仅受体结构 | 确定校正因子 γ |
3 | LRRC8A-mCerulean 和 LRRC8E-mVenus | 品丝对 | SE-FRET 定量 |
表 1:典型 SE-FRET 实验所需的条件示例,以测量由与供体融合的 LRRC8A 亚基 (mCerulean3) 和与受体融合的 LRRC8E 亚基 (mVenus) 荧光团组成的通道的 LRRC8/VRAC 活性。
4. 用于校正因子确定的图像采集
注意:在 FRET 期间,供体发射会渗入检测到的受体发射中。此外,受体荧光团通过供体激发波长进行交叉激发。在计算 SE-FRET 期间,必须对这些过程进行补偿。为此,在转染后 24 小时,在仅表达 FRET 供体或受体的细胞中测定校正因子。在这里,成像是在配备 Leica LED8 灯、滤光片立方体CYR71010、HC PL APO 63x/1.40 OIL 物镜、460/80 和 553/70 长通滤光片以及 Leica DFC9000GTC 相机的 Leica THUNDER 成像仪上进行的。实验在没有环境控制的情况下进行,但在成像缓冲液中存在 HEPES 的情况下进行,以稳定 pH 值。对于长期观察/测量,建议使用环境控制系统。为了进行分析,SE-FRET 是根据捕获的原始图像计算的。这可以在采集期间或采集后同时进行。在这里,带有 SE-FRET 插件的 Leica LAS X 软件用于简化有关校正因子计算和在图像采集过程中实时可视化 SE-FRET 值变化的实验程序。对于采集后,可以根据下面提供的协议在原始数据采集后使用其他软件包(例如,FIJI)确定校正因子和 SE-FRETs。
激发 | 发射 | 频道名称 | LED 线 | Filter cube(过滤立方体) | 长通滤波器 |
施主 | 施主 | DD 系列 | 440 纳米 | CYR71010 | 460/80 纳米 |
施主 | 受主 | 大 | 440 纳米 | CYR71010 | 535/70 纳米 |
受主 | 受主 | 机 管 局 | 510 纳米 | CYR71010 | 535/70 纳米 |
表 2:SE-FRET 实验所需的通道总结。
图 2:样品的代表性荧光图像,用于计算校正因子 β 和 γ 确定由与供体 mCerulean3 (mCer) 融合的 LRRC8A 亚基和通过 SE-FRET 测量与受体 mVenus (mVen) 荧光团融合的 LRRC8E 亚基组成的通道的 VRAC 活性。 (A,B)在仅表达供体 (A) LRRC8A-mCer 或受体 (B) LRRC8E-mVen 的 HeLa 细胞中检测供体/供体 DD、受体/受体 AA 和供体/受体 DA 通道。(C) 在共转染供体和受体对 LRRC8A-mCer 和 LRRC8E-mVen 的 HeLa 细胞中检测 DD、AA 和 DA 通道。面板 a-i 显示在供体检测通道中拍摄的图像(供体的激发和供体信号的检测;DD;a、d 和 g)、受体检测通道(受体的激励和受体信号的检测;机 管 局;b、e 和 h)和 FRET 信号检测通道(激发供体和检测受体信号;大;c、f 和 i)。面板 j 是面板 g 和 h 的叠加层,DD 通道以绿色显示,AA 通道以洋红色显示。比例尺 = 10 μm。请点击此处查看此图的较大版本。
5. 用于 SE-FRET 定量的延时成像
图 3:代表性荧光图像和 SE-FRET 定量。(A) 代表性荧光图像和时间循环实验第一个时间点的表观 SE-FRET图像,用于测量由 LRRC8A 和 LRRC8E 亚基组成的通道的 VRAC 活性,具体取决于张力。比例尺 = 10 μm。相同的单元格如图 2C 所示。图 a-i 显示了 DD、AA 和 DA 通道的检测以及计算的表观 SE-FRET。白色轮廓表示用于测量 DD、AA 和 DA 中平均信号强度以及表观 SE-FRET 图像的 ROI(图 d 中的单元格 i-iii)。(B) SE-FRET 值随时间变化的定量。条件顺序是 12 个周期的等渗成像缓冲液 (基线),然后是 15 个周期的低渗和 15 个周期的高渗成像缓冲液。将每个 ROI (单元格 i-iii) 和时间点的原始平均 SE-FRET 值标准化为相应 ROI 的基线 (等渗) 值的平均值。请单击此处查看此图的较大版本。
使用这种基于 FRET 的方法,可以在渗透刺激期间监测 LRRC8/VRAC 活性,并且 SE-FRET 的降低与细胞外低渗程度相关45。此处还显示了低渗诱导的通道激活的代表性结果(图 3 和 图 4)。此外,可以观察到不同等渗刺激的 LRRC8/VRAC 激活,例如纵甘油二酯信号传导45 或心肌细胞激活期间 56。
图 4:SE-FRET 轨迹。 (A) 来自 5 个独立实验的表观 SE-FRET 轨迹。数据表示每个视野 (FOV) N = 2 至 N = 7 个细胞的平均 ± SD。(B) 所有细胞的平均 ± SD (N = 31 个细胞)。 请单击此处查看此图的较大版本。
由于 LRRC8/VRAC 通道也参与凋亡体积减少24,57,因此在诱导细胞凋亡时观察通道活动将是此处描述的方法的另一个应用。因此,在应用死亡受体介导的细胞凋亡诱导药物的同时,在表达 LRRC8A-mCerulean3 和 LRRC8E-mVenus 的 HeLa 细胞中监测 SE-FRET 的方案。肿瘤坏死因子 (TNF)-α 和放线菌酮 (CHX) 先前显示可在几分钟内诱发 VRAC 电流58。在等渗缓冲液中加入 2 ng/mL TNF-α 和 1 μg/mL CHX 后,SE-FRET 明显降低(图 5)。用高渗培养基代替缓冲液,即使含有 TNF-α 和 CHX,SE-FRET 值也恢复到接近基线(图 5A),对应于在用诱导细胞凋亡的 Fas 配体58 处理期间高渗浴溶液中 VRAC 电流的减少。用 DMSO(TNF-α 和 CHX 的溶剂)处理细胞不会导致 SE-FRET 降低。TNF-α + CHX 不影响 CFP-18aa-YFP 的 SE-FRETs,CFP-18aa-YFP 是一种 EYFP 和 ECFP 串联构建体作为 FRET 对照59,证明了对 LRRC8/VRAC 的特异性(图 5B)。
图 5:死亡受体介导的细胞凋亡引起的等渗 VRAC 激活。 (A) 表达 LRRC8A-mCer/LRRC8E-mVen 的 HeLa 细胞 (n = 8 个培养皿,23 个细胞) 随时间推移的标准化 SE-FRET 值。在等渗成像缓冲液 (基线) 中循环 15 次后,将浴液替换为补充有 2 ng/mL TNF-α 和 1 μg/mL 放线菌酮 (CHX) 的等渗缓冲液 30 个循环,然后用 TNF-α 和 CHX 进行 20 次循环的高渗成像缓冲液。将每个 ROI 和时间点的原始平均 SE-FRET 值标准化为相应 ROI 的基线(等渗)值的平均值。(B) 用含有 DMSO 的等渗溶液作为 CHX 的载体对照(n = 5 个培养皿,12 个细胞)或含有细胞凋亡诱导剂的等渗缓冲液(如 A 中,n = 8 个培养皿,23 个细胞)或表达 CFP-18aa-YFP 的 HeLa 细胞(n = 3 个培养皿,9 个细胞)定量标准化 SE-FRET 值。数据表示单个单元格(符号)的相应缓冲区中最后 10 个时间点的平均值和所有单元格的平均值± SD;** p < 0.01 普通单向方差分析,然后是 Tukey 的多重比较事后检验。 请单击此处查看此图的较大版本。
FRET 显微镜是一种成熟且广泛使用的技术,用于研究蛋白质之间的相互作用。因此,基于 FRET 的方法可以应用于许多具有不同专业知识的实验室。使用基于 FRET 的分析法,已经对广泛的离子通道监测了门控过程中的构象重排(例如,参见参考文献 34,50,51,52,53,60,61,62,63,64,65,66,67),在某些情况下与膜片钳荧光法中的电生理学相结合 68,69,70,71。FRET可用于研究这些离子通道的结构-功能关系,或独立于离子传输监测它们的活性。与电生理学相比,这里介绍的方法具有明显的优势,因为它允许原位监测 LRRC8/VRAC 通道的活性。
该方案中的关键步骤包括对细胞进行铺板,以达到转染和成像的最佳汇合度,这理想地有助于轻松区分细胞以供以后分析。不同亚基的有效共转染对于正确的亚细胞定位至关重要;例如,非 LRRC8A 亚基的过量将导致内质网 (ER) 定位增强4。因此,可能需要调整质粒比例。根据系统的不同,应验证新生成的 FRET 对,例如,通过受体漂白。像素合并和曝光时间必须相互平衡,以便为研究问题实现最佳的时间和空间分辨率。像素合并可以缩短曝光时间,从而减少 FRET 传感器的潜在漂白,同时降低空间分辨率。因此,如果实验设置需要,例如,LRRC8/VRAC 活性的亚细胞区分,则应避免分箱。研究问题同样决定了延时序列中周期的数量和间隔。仅当需要 FRET 的动力学变化(以及 LRRC8/VRAC 激活/失活)时,该间隔才相关;否则,也可以执行简单的 "before-and-after" 录音。实验的长短取决于生理过程。理想情况下,应监测刺激时的 LRRC8/VRAC 活性,直到 SE-FRET 稳定。这些因素可以在试点实验中确定。必须确定所有条件下计算实际 SE-FRET 信号的校正因子。错误确定的校正因子可能导致高估或低估 SE-FRET 强度。最后,在建立稳定的基线后,图像之间的时间间隔必须足够短,以捕捉感兴趣的生理过程。
该方法有一些限制。其中之一是 LRRC8 间 FRET 强度的变化虽然反映了 LRRD 的运动,但不一定对应于离子或渗透液通过孔的传输。这从用 LRRC8A 同源体45 观察到的 FRET 变化中可以清楚地看出,尽管它们的电流最小 4,32,72。LRRC8/VRAC 通道的孔阻塞剂可能不会影响 FRET 信号,因此该方法不适合寻找特定通道调制剂。此外,过表达 LRRC8 蛋白的表达水平会影响观察到的生理过程,尤其是当 C 端标记的 LRRC8 蛋白显示基础活性时14。
根据特定的研究问题,可以被认为是限制或优势的一个方面是,在这种方法中,只有异位表达的 LRRC8 亚基被选择性地测量。因此,内源性蛋白质的背景水平几乎不会干扰测量。另一方面,过表达的蛋白质可能不像内源性 LRRC8 通道那样表现,具有可能不同的亚基组成和化学计量学。例如,氧化等各种刺激可能对不同组成的 LRRC8 通道产生相反的调节作用36。通过改变共表达亚基之间的比率,可以调整它们的化学计量和整体离子电导14,73,但它们的天然组成(一个复合物中可能通常有两个以上的旁系同源物21)尚不清楚,并且可能因细胞类型而异 74,75,76.此外,荧光蛋白与 LRRC8 蛋白的胞质 C 末端融合显示会增加非洲爪蟾卵母细胞中的基础 LRRC8/VRAC 通道活性14,这可能是因为大标签调节 LRRD 的构象,这可能控制通道开放 14,44,45.因此,荧光蛋白的大小、接头及其方向可能不仅影响 FRET 效率,还可能影响通道活性。然而,重要的是,与荧光蛋白融合的 LRRC8 蛋白的 VRAC 通道对低渗刺激保持反应14,使其能够用作 FRET 传感器45。
与其他方法相比,这种非侵入性方法通过光学显微镜监测 LRRC8/VRAC 通道活动的优势包括:(i) 它允许在通常无法进行电生理学的细胞或隔室内观察 LRRC8/VRAC。这包括可以找到或靶向 LRRC8 复合物 45,77,78 的细胞器内细胞器。(ii) 该方法保持胞质溶质组成不变,而在全细胞膜片钳测量期间,胞质溶胶在很大程度上被移液管溶液取代,这可能会影响佛波醇-12-肉豆蔻酸酯-13-乙酸酯 (PMA) 诱导的 LRRC8/VRAC 激活所观察到的信号通路45。(iii) 它提供了以亚细胞分辨率观察 LRRC8/VRAC 激活的可能性,例如区分细胞迁移过程中前缘和后缘的活动,其中 - 仅限于狭窄空间 - VRAC 已涉及79,80。(iv) 它能够在心肌细胞分化等扩展生理过程中连续监测 LRRC8/VRAC 活性56。
虽然这种方法存在局限性和挑战,但它有望进一步探索,包括在动物模型中的潜在应用。结合其他方法来研究该离子和渗透通道家族,这种基于 FRET 的测定可能有助于解开激活机制和探索 LRRC8 通道在其天然环境中的不同生理功能。
作者没有需要披露的利益冲突。
我们感谢 C.F. Kaminski 的慷慨馈赠,即编码 CFP-18aa-YFP 构建体的质粒,感谢 A. Klemmer 的技术援助,以及为该方法的开发做出贡献的 Stauber 实验室的所有现任和前任成员。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
0.05% Trypsin-EDTA | gibco | 25300-054 | |
Camera DFC9000GTC | Leica | 11547007 | |
CFP-18aa-YFP | N/A | N/A | Elder et al. 2009 PMCID: PMC2706461; Gift from C.F. Kaminski (University of Cambridge, UK) |
Cycloheximide (CHX) | Sigma-Aldrich | 66-81-9 | |
D(-)-Mannitol | Carl Roth | 4175.1 | |
D(+)-Glucose | Carl Roth | HN06.1 | |
DMEM (Dulbeccos Modified Eagle Medium) | PAN-Biotech | P04-03590 | |
DPBS (Dulbecco's Phosphate Buffer Saline) | PAN-Biotech | P04-36500 | |
Emission filter wheel (460/80, 535/70, 590/50, 642/80, 100%) | Leica | 11525480 | |
FBS (Fetal Bovine Serum) | PAN-Biotech | P30-3302 | |
Filter cube CYR71010 | Leica | 11525416 | |
FuGENE | Promega | E2691 | |
Glas Bottom Culture Dishes 35 mm | MatTek | P35G-0-10-C | |
HeLa cells | Leibniz Forschungsinstitut DSMZ | ACC 57 | Mammalian cervix carcinoma/ Obtained from Leibniz Forschungsinstitut DSMZ |
HEPES | Carl Roth | 9105.4 | |
ibidi µ-Disch 35 mm | ibidi | 81156 | |
KCl (Potassium chloride) | Carl Roth | 6781.1 | |
LAS X FRET Wizard | Leica | 11640862 | |
Light source LED8 | Leica | 11504256 | |
LRRC8A-mCerulean3 | N/A | N/A | König et al. 2019 |
LRRC8E-mVenus | N/A | N/A | König et al. 2019 |
Luna-II Automated Cell Counter | logos biosystems | L40002 | |
Luna-II Cell Counter Slides | logos biosystems | L12001 | |
MgCl2 (Magnesium chloride) | Carl Roth | KK36.1 | |
Microscope THUNDER Imager live cell | Leica | 11525681 | |
NaCl (Sodium chloride) | Carl Roth | 9263 | |
Objective HC PL APO 63x/1.40 OIL | Leica | 11506349 | |
Opti-Minimal Essential Medium (MEM) | gibco | 11058 | |
Osmometer OM807 | Vogel | V04807 | |
Penicillin Streptomycin (Pen Step) | gibco | 15070-063 | |
Trypan blue solution (0,4%) | Sigma | T8154 | |
Tumor necrosis factor (TNF)-a | Sigma-Aldrich | 94948-59-1 | |
Valve Controlled Gravity Perfusion System | ALA Scientific Instruments | VC3-4xG |
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