Method Article
Elektrofizyoloji, iyon kanalı aktivitesini araştırmak için altın standarttır. Bununla birlikte, optik yöntemler de dahil olmak üzere birçok alternatif yaklaşım vardır. Burada, alt birimler arası Förster rezonans enerji transferi (FRET) tabanlı bir yöntem kullanarak 8 kanal (LRRC8) ile oluşturulmuş anyon kanalı içeren lösin açısından zengin tekrarın aktivitesini izlemek için bir yöntem açıklıyoruz.
LRRC8 protein ailesinin üyeleri, çok sayıda fizyolojik süreçte rol oynayan heteromerik iyon ve ozmolit kanalları oluşturur. Hacim ayarlı anyon kanalları (VRAC'ler) / hacme duyarlı dışa doğru doğrultucu kanallar (VSOR'lar) olarak, ozmotik hücre şişmesi üzerine aktive olurlar ve klorür ve organik ozmolitlerin ekstrüzyonuna aracılık ederek su akışına ve dolayısıyla hücre büzülmesine yol açarlar. Ozmotik hacim regülasyonundaki rollerinin ötesinde, VRAC'ler farklılaşma, göç ve apoptoz gibi hücresel süreçlerde rol oynamıştır. Membran potansiyeli üzerindeki etkileri ve çeşitli sinyal moleküllerini taşımaları sayesinde, 8 (LRRC8) kanal içeren lösin açısından zengin tekrar, nöron-glia iletişiminde, insülin sekresyonunda ve immün yanıtta rol oynar. Aktivasyon mekanizması belirsiz kaldı. LRRC8 kanalları, diğer iyon kanalları gibi, tipik olarak elektrofizyolojik yöntemler kullanılarak incelenir. Burada, LRRC8 alt birimlerinin C-terminal lösin açısından zengin tekrar alanlarına kaynaşmış floresan proteinler arasındaki kompleks içi hassaslaştırılmış emisyonlu Förster rezonans enerji transferini (SE-FRET) ölçerek LRRC8 kanal aktivasyonunu tespit etmek için bir yöntem açıklıyoruz. Bu yöntem, sitozolik ortamın değişimi olmadan ve hücre farklılaşması ve apoptoz gibi süreçler sırasında kanal aktivasyonunu yerinde inceleme imkanı sunar.
8 (LRRC8) ailesi proteini içeren lösin açısından zengin tekrar heteromerlerinden oluşan iyon kanalları, omurgalı hücreleri boyunca bulunur ve çok çeşitli fizyolojik işlevlere katılır 1,2. İlk olarak hacim regüle anyon kanalları (VRAC'ler) veya hacim duyarlı dışa doğru doğrultucu kanallar (VSOR) olarak tanımlanan bu LRRC8 kanalları, hücresel düzenleyici hacim azalmasında çok önemli bir rol oynar 3,4. Klorür iyonlarının ve organik ozmolitlerin atılmasını kolaylaştırırlar, bunu ozmotik şişmeye yanıt olarak su akışı izler. Ozmotik stres yanıtındaki rollerinin ötesinde, hücresel hacim regülasyonundaki rolleri hücre proliferasyonu ve göçü, apoptoz, spermiyogenez ve epitel bütünlüğü ile ilişkilendirilmiştir 5,6,7. LRRC8 / VRAC aktivasyonu üzerine membran potansiyelinin değişmesinin, miyotüp farklılaşmasına8 ve pankreas β hücreleri 9,10,11 tarafından insülin sekresyonuna katkıda bulunduğu gösterilmiştir. Ayrıca, LRRC8 kanalları, purinerjik sinyal molekülleri ATP ve cGAMP veya uyarıcı amino asit glutamat gibi çeşitli organik ozmolitleri iletir ve bu kanalları bağışıklık sisteminde hücre-hücre iletişimine veya glia-nöron etkileşimine yerleştirir 12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22. Floresein boyası, antibiyotik blasticidin S veya antikanser ilacı sisplatin gibi ksenobiyotikler bile LRRC8 kanalları 23,24,25 tarafından gerçekleştirilir.
LRRC8/VRAC aktivasyonuna yol açan sinyal iletimi hakkında çok sayıda rapor vardır 26,27,28. Bununla birlikte, mekanizma belirsizliğini korumaktadır ve literatür, spesifik fizyolojik sürece bağlı olabilecek çok çeşitli potansiyel mekanizmalar sunmaktadır. Bunlar, sitozolik iyon kuvvetindeki değişiklikleri, hücre iskeleti ile etkileşimi, zar bileşimini, G proteinlerini, redoks durumunu ve fosforilasyon kaskadlarını 2,27,29,30,31 içerir.
LRRC8/VRAC kanalları, fizyolojik olarak işlevsel kanallar 4,14,32 oluşturmak için LRRC8B-E paraloglarından en az biri LRRC8B E ile heteromerize olması gereken temel bir alt birim 3,4 olarak LRRC8A'yı içerir. Alt birim bileşimi, kanalın rektifikasyon ve depolarizasyona bağlı inaktivasyon 4,29,32,33,34, substrat özgüllüğü 15,17,20,21,24,35 ve bazı aktivasyon yolları 36,37 gibi biyofiziksel özelliklerini belirler. Kriyo-elektron mikroskobu (kriyo-EM) yapıları, LRRC8A homomerlerinin yanı sıra heteromerlerin heksamer38,39,40 olarak bir araya geldiğini, fonksiyonel kanalları oluşturan LRRC8A/LRRC8C kimeralarının ise heptamer41 olduğunu göstermektedir. Tüm LRRC8 proteinlerinin N-terminal kısmı, dört transmembran sarmal içerir ve C-terminal kısmı, lösin açısından zengin tekrarlara (LRRD) sahip bir alan içerir. Mevcut LRRC8 kompleks yapıları, sitozol 3,4,23'e uzanan LRRD'lerin, kanal geçitlemesi 34,42,43 sırasında konformasyonel yeniden düzenlemelere uğrayabileceğine dair kanıt sağlar. Bu fikir, floresan proteinlerin C-terminal füzyonunun bazal kanal aktivitesi14 ile sonuçlandığı ve nanocisimlerin alanlara bağlanmasının kanal aktivitesi44 ile modüle edebileceği bulgusu ile desteklenmektedir. Ayrıca, C-terminalinin konformasyonel değişiklikleri, kompleks içi Förster rezonans enerji transferi (FRET)45 ile gösterilmiştir.
İyon kanalı aktivitesini incelemek için en yaygın yöntem, moleküler tanımlamalarından47 önce VRAC'lerin araştırılmasında yaygın olarak uygulanan elektrofizyolojik ölçümlerdir46. Bununla birlikte, iletilen substratlarının (halojenür iyonları veya organik ozmolitler) ölçümü veya hücre hacmi48 üzerindeki etkisi de dahil olmak üzere, VRAC aktivitesini dolaylı olarak izlemenin çeşitli ek yolları vardır. Aslında, LRRC8 proteinlerinin VRAC olarak tanımlanması, halojenüre duyarlı bir floresan proteinin49 aktive edilmiş VRAC'ler 3,4 yoluyla hücreye giren iyodür ile söndürülmesine dayanan bir teste dayanıyordu. LRRC8/VRAC kanal aktivitesini izlemek için başka bir yöntem, diğer iyon kanallarında olduğu gibi 50,51,52,53 FRET 45'teki değişikliklerle gözlemlenebilen sitozolik alanların hareketini kullanır. Bu amaçla, donör olarak camgöbeği-floresan proteini (CFP)/mCerulean3 ve alıcı olarak sarı-floresan proteini (YFP)/mVenüs gibi FRET çiftleri olarak hizmet eden floresan proteinler, LRRC8 proteinlerinin C-terminaline kaynaştırıldı (Şekil 1). LRRC8 alt birimleri arasındaki kompleks içi FRET , alıcı fotoağartma deneyleri45 ile gösterilmiştir. Yıkıcı foto-ağartma yönteminden kaçınarak, zaman içindeki FRET değişiklikleri, temel olarak vericinin emisyon spektrumunun alıcının uyarma spektrumu ile örtüşmesi nedeniyle vericinin uyarılması üzerine alıcının duyarlı emisyonunun ölçüldüğü hassaslaştırılmış emisyon FRET (SE-FRET) ile izlendi. LRRC8 / VRAC aktivasyonu için bir uyaran olan hücre dışı hipotonisitenin uygulanması, SE-FRET yoğunluğunda45 geri dönüşümlü bir azalma ile sonuçlandı. Daha da önemlisi, hipotonik tedavi sırasında eşzamanlı tüm hücre yama kelepçesi ölçümleri ve FRET izlemesi, FRET'teki bu azalmanın gerçekten de LRRC8 / VRAC aktivasyonunuyansıttığını gösterdi 45. Pipet çözeltisi ile plazma zarının bozulmasını veya hücre içi ortamın değiştirilmesini önleyen bu yöntem, LRRC8/VRAC aktivitesinin izlenmesi için bir alternatif sunar. Doğal sitozolün korunmasının çok önemli olduğu, hücre altı çözünürlüğün gerekli olduğu veya kanal aktivitesinin uzun süreli gözleminin gerekli olduğu fizyolojik ortamlarda özellikle yararlıdır.
Burada, LRRC8/VRAC'ı böyle bir FRET tabanlı okuma ile incelemek için bir protokol sunuyoruz. Protokol, hücrelerin nasıl işleneceğini ve transfekte edileceğini, numune ve kontrol görüntülerinin nasıl elde edileceğini, verilerin nasıl analiz edileceğini ve hassaslaştırılmış emisyon FRET (SE-FRET) değerlerinin nasıl hesaplanacağını gösterir.
Şekil 1: LRRC8 FRET çift sisteminin şeması. mCerulean3 camgöbeği, mVenüs ise sarı renkle gösterilir. VRAC açılmasını takiben, floroforlar arasındaki mesafe (ve/veya uzamsal yönelim) değişir, bu da verici (Don) ve alıcı (Acc) arasında enerji transferinin azalmasına ve dolayısıyla gözlemlenen FRET'in düşmesine neden olur. BioRender.com ile oluşturuldu. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
1. Tampon ve reaktiflerin hazırlanması
2. Cam tabanlı tabaklarda yapışık hücrelerin büyümesi
3. Hücre transfeksiyonu
NOT: Burada, FuGENE bir transfeksiyon reaktifi olarak kullanılmıştır. Diğer transfeksiyon reaktifleri ve yöntemleri de uygulanabilir. Plazmid DNA'nın (pDNA) transfeksiyon reaktiflerine optimal oranları ve her POI ve hücre modeli için optimal ekspresyon süresi ampirik olarak değerlendirilmelidir. Burada, 35 mm'lik çanak başına 2 μg toplam pDNA kullanıldı. FRET donör ve alıcı yapıları 1:1 oranında kullanıldı ve pDNA-transfeksiyon reaktif oranı 1:4 idi (Tablo 1).
Koşul | Yapı (lar) | Örnek | İçin kullanılır |
1 | LRRC8A-mGök Mavisi | Sadece donör yapısı | Düzeltme faktörü β belirleyin |
2 | LRRC8E-mVenüs | Yalnızca alıcı yapısı | Düzeltme faktörü γ belirleyin |
3 | LRRC8A-mCerulean ve LRRC8E-mVenüs | FRET çifti | SE-FRET miktar tayini |
Tablo 1: Vericiye kaynaşmış LRRC8A alt biriminden (mCerulean3) ve alıcıya kaynaşmış LRRC8E alt biriminden (mVenüs) oluşan bir kanalın LRRC8/VRAC aktivitesini ölçmek için tipik bir SE-FRET deneyi için gerekli koşulların örneği florofor.
4. Düzeltme faktörü belirleme için görüntü elde etme
NOT: FRET sırasında alıcının tespit edilen emisyonuna verici emisyonunda bir kanama vardır. Ayrıca, alıcı floroforun donör uyarma dalga boyu tarafından çapraz uyarımı vardır. SE-FRET'in hesaplanması sırasında bu işlemler telafi edilmelidir. Bu amaçla, transfeksiyondan 24 saat sonra sadece FRET donörünü veya alıcısını eksprese eden hücrelerde düzeltme faktörleri belirlenir. Burada görüntüleme, bir Leica LED8 lamba, filtre küpü CYR71010, bir HC PL APO 63x/1.40 OIL objektif, 460/80 ve 553/70 için uzun geçiren filtre ve bir Leica DFC9000GTC kamera ile donatılmış bir Leica THUNDER Görüntüleyici üzerinde gerçekleştirildi. Deneyler, çevresel kontrol olmadan, ancak pH'ı stabilize etmek için görüntüleme tamponlarında HEPES varlığında gerçekleştirildi. Uzun süreli gözlem/ölçümler için bir çevresel kontrol sistemi kullanılması tavsiye edilir. Analiz için SE-FRET, yakalanan ham görüntülerden hesaplanır. Bu, satın alma sırasında veya daha sonra aynı anda yapılabilir. Burada, görüntü elde etme sırasında düzeltme faktörlerinin hesaplanması ve SE-FRET değer değişikliklerinin gerçek zamanlı olarak görselleştirilmesi ile ilgili deneysel prosedürü basitleştirmek için SE-FRET eklentisine sahip Leica LAS X yazılımı kullanılmıştır. Edinme sonrası için, düzeltme faktörleri ve SE-FRET, aşağıda verilen protokole göre ham veri alımından sonra diğer yazılım paketleri (örneğin, FIJI) ile belirlenebilir.
Uyarılması | Emisyonu | Kanal adı | LED hattı | Filtre küpü | Uzun geçiren filtre |
Donör | Donör | DD | 440 deniz mili | CYR71010 | 460/80 deniz mili |
Donör | Acceptor | DA | 440 deniz mili | CYR71010 | 535/70 deniz mili |
Acceptor | Acceptor | ACAR | 510 deniz mili | CYR71010 | 535/70 deniz mili |
Tablo 2: SE-FRET deneyleri için gerekli kanalların özeti.
Şekil 2: Donör mCerulean3'e (mCer) kaynaşmış LRRC8A alt biriminden ve SE-FRET ölçümleri ile alıcı mVenüs (mVen) floroforuna kaynaşmış LRRC8E alt biriminden oluşan bir kanalın VRAC aktivitesini belirlemek için gerekli olan β ve γ düzeltme faktörlerini hesaplamak için kullanılan numunelerin temsili floresan görüntüleri. (A,B) HeLa hücrelerinde verici/verici DD, alıcı/alıcı AA ve verici/alıcı DA kanalının saptanması, yalnızca verici (A) LRRC8A-mCer veya alıcı (B) LRRC8E-mVen'i eksprese eder. (C) Donör ve alıcı çifti LRRC8A-mCer ve LRRC8E-mVen ile birlikte transfekte edilen HeLa hücrelerinde DD, AA ve DA kanallarının tespiti. Paneller a-i, donör tespit kanalında çekilen görüntüleri gösterir (donörün uyarılması ve donör sinyalinin tespiti; DD; a, d ve g), alıcı algılama kanalı (alıcının uyarılması ve alıcı sinyalinin algılanması; ACAR; b, e ve h ) ve FRET sinyal algılama kanalı (vericinin uyarılması ve alıcı sinyalinin algılanması; DA; c, f ve i). Panel j, g ve h panellerinin kaplamasıdır. DD kanalı yeşil ve AA kanalı macenta olarak gösterilir. Ölçek çubuğu = 10 μm. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
5. SE-FRET miktar tayini için hızlandırılmış görüntüleme
Şekil 3: Temsili floresan görüntüleri ve SE-FRET nicelemesi. (A) Tonisiteye bağlı olarak LRRC8A ve LRRC8E alt birimlerinden oluşan bir kanalın SE-FRET ile VRAC aktivitesini ölçmek için bir zaman turları deneyinin ilk zaman noktasının temsili floresan görüntüleri ve görünen SE-FRET'i. Ölçek çubuğu = 10 μm. Aynı hücreler Şekil 2C'de gösterilmiştir. Paneller a-i, DD, AA ve DA kanallarının algılanmasını ve hesaplanan görünür SE-FRET'i gösterir. Beyaz anahatlar, DD, AA ve DA'daki ortalama sinyal yoğunluklarını ve görünen SE-FRET görüntüsünü ölçmek için kullanılan ROI'leri (panel d'deki hücreler i-iii) temsil eder. (B) SE-FRET değerlerinin zaman içinde ölçülmesi. Koşulların sırası 12 döngü izotonik görüntüleme tamponu (başlangıç), ardından 15 döngü hipotonik ve 15 döngü hipertonik görüntüleme tamponu idi. Her bir ROI'nin (hücre i-iii) ve zaman noktasının ham ortalama SE-FRET değeri, karşılık gelen ROI için temel (izotonik) değerin ortalamasına normalleştirildi. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Bu FRET tabanlı yöntemle, ozmotik stimülasyon sırasında LRRC8 / VRAC aktivitesi izlenebilir ve SE-FRET'teki azalma, hücre dışı hipotonisitederecesi 45 ile ilişkilidir. Hipotonisite ile indüklenen kanal aktivasyonu için temsili sonuçlar da burada gösterilmektedir (Şekil 3 ve Şekil 4). Ek olarak, diasilgliserol sinyalinin45 manipülasyonu veya miyosit aktivasyonu56 sırasında farklı izozmotik uyaranlarla LRRC8/VRAC aktivasyonu gözlemlenebilir.
Şekil 4: SE-FRET izleri. (A) 5 bağımsız deneyden görünen SE-FRET izleri. Veriler, görüş alanı (FOV) başına N = 2 ila N = 7 hücrenin ortalama ± SD'sini temsil eder. (B) Tüm hücrelerin ortalama ± SD'si (N = 31 hücre). Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
LRRC8/VRAC kanalları da apoptotik hacim azalmasında rol oynadığından24,57, apoptozun indüklenmesi üzerine kanal aktivitesini gözlemlemek burada açıklanan yöntem için başka bir uygulama olacaktır. Buna göre, LRRC8A-mCerulean3 ve LRRC8E-mVenüs eksprese eden HeLa hücrelerinde SE-FRET izleme protokolü, ölüm reseptörü aracılı apoptozu indükleyen ilaçlar uygulanırken gerçekleştirildi. Tümör nekroz faktörü (TNF)-α ve sikloheksimidin (CHX) daha önce birkaç dakika içinde VRAC akımlarını uyandırdığı gösterilmişti58. İzotonik tamponda 2 ng/mL TNF-α ve 1 μg/mL CHX ilavesinden sonra, SE-FRET'te sağlam bir azalma olmuştur (Şekil 5). TNF-α ve CHX içermesine rağmen tamponun hipertonik bir ortamla değiştirilmesi, SE-FRET değerleri taban çizgisine yakın bir yerde geri kazanıldı (Şekil 5A), apoptozu indükleyen Fas ligandı58 ile tedavi sırasında hipertonik banyo çözeltisindeki azalan VRAC akımlarına karşılık geldi. Hücrelerin TNF-α ve CHX için çözücü olan DMSO ile muamelesi, SE-FRET azalması ile sonuçlanmadı. TNF-α + CHX, FRET kontrolü59 olarak bir EYFP ve ECFP tandem yapısı olan CFP-18aa-YFP'nin SE-FRET'ini etkilemedi ve LRRC8 / VRAC için özgüllüğü gösterdi (Şekil 5B).
Şekil 5: Ölüm reseptörü aracılı apoptoz ile izomotik VRAC aktivasyonu. (A) Zaman içinde LRRC8A-mCer / LRRC8E-mVen eksprese eden HeLa hücrelerinden (n = 8 tabak, 23 hücre) normalleştirilmiş SE-FRET değerleri. İzotonik görüntüleme tamponunda (taban çizgisi) 15 döngüden sonra, banyo çözeltisi, 30 döngü için 2 ng / mL TNF-α ve 1 μg / mL sikloheksimid (CHX) ile takviye edilmiş izotonik tampon ile değiştirildi, ardından TNF-α ve CHX ile 20 döngü hipertonik görüntüleme tamponu izledi. Her bir ROI ve zaman noktasının ham ortalama SE-FRET değeri, ilgili ROI için temel (izotonik) değerin ortalamasına normalleştirildi. (B) CHX (n = 5 tabak, 12 hücre) veya A'daki gibi apoptoz indükleyicileri içeren izotonik tampon (n = 8 tabak, 23 hücre) için araç kontrolü olarak DMSO içeren izotonik çözelti ile A'daki gibi LRRC8A / E eksprese eden HeLa hücrelerinin normalleştirilmiş SE-FRET değerlerinin ölçülmesi veya apoptoz indükleyicileri ile CFP-18aa-YFP eksprese eden HeLa hücrelerinin (n = 3 tabak, 9 hücre). Veriler, tek tek hücrelerin (semboller) ilgili tamponundaki son 10 zaman noktasının ortalamasını ve SD'± tüm hücrelerin ortalamasını temsil eder; ** p < 0.01 sıradan tek yönlü ANOVA ve ardından Tukey'in çoklu karşılaştırma post-hoc testi. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
FRET mikroskobu, proteinler arasındaki etkileşimi incelemek için iyi bilinen, yaygın olarak kullanılan bir tekniktir. Bu nedenle, FRET tabanlı yöntemler, değişken uzmanlığa sahip birçok laboratuvarda uygulanabilir. Geçit oluşturma sırasındaki konformasyonel yeniden düzenlemeler, FRET tabanlı tahliller kullanılarak çok çeşitli iyon kanalları için izlenmiştir (örneğin, bkz. referanslar 34,50,51,52,53,60,61,62,63,64,65,66,67), bazı durumlarda yama kelepçeli florometride elektrofizyoloji ile birleştirilir 68,69,70,71. FRET, bu iyon kanallarının yapı-işlev ilişkilerini incelemek veya iyon taşınmasından bağımsız olarak aktivitelerini izlemek için kullanılabilir. Burada sunulan yöntem, LRRC8/VRAC kanallarının aktivitesinin yerinde izlenmesine izin verdiği için elektrofizyolojiye göre açık avantajlara sahip olabilir.
Protokoldeki kritik adımlar, transfeksiyon ve görüntüleme için en uygun birleşmeye ulaşmak için hücrelerin kaplanmasını içerir, bu da daha sonraki analizler için ideal olarak kolay hücre ayrımını kolaylaştırır. Farklı alt birimlerin etkili bir şekilde birlikte transfeksiyonu, doğru hücre altı lokalizasyonu için çok önemlidir; örneğin, LRRC8A olmayan alt birimin fazlalığı, gelişmiş endoplazmik retikulum (ER) lokalizasyonuna yol açacaktır4. Bu nedenle, plazmit oranlarının ayarlanması gerekebilir. Sisteme bağlı olarak, yeni oluşturulan FRET çiftleri, örneğin alıcı ağartma ile doğrulanmalıdır. Araştırma sorusu için en uygun zamansal ve uzamsal çözünürlüğü sağlamak için gruplama ve maruz kalma süresi birbirine karşı dengelenmelidir. Gruplama, daha kısa pozlama süreleri sağlar ve dolayısıyla uzamsal çözünürlüğü azaltırken FRET sensörünün potansiyel ağarmasını azaltır. Bu nedenle, deney düzeneği, örneğin LRRC8/VRAC aktivitesinin hücre altı ayrımını gerektiriyorsa, gruplamadan kaçınılmalıdır. Araştırma sorusu, hızlandırılmış bir serideki döngülerin sayısını ve aralığını eşit olarak belirler. Aralık, yalnızca FRET değişikliklerinin kinetiği (ve dolayısıyla LRRC8/VRAC etkinleştirme/inaktivasyonu) gerekliyse geçerlidir; Aksi takdirde, basit "öncesi ve sonrası" kayıtları da yapılabilir. Deneyin uzunluğu fizyolojik sürece bağlıdır. İdeal olarak, uyaranlar üzerindeki LRRC8/VRAC aktivitesi, SE-FRET stabilize olana kadar izlenmelidir. Bu faktörler pilot deneylerde belirlenebilir. Gerçek SE-FRET sinyalini hesaplamak için düzeltme faktörleri tüm koşullar için belirlenmelidir. Yanlış belirlenen düzeltme faktörleri, SE-FRET yoğunluklarının fazla veya eksik tahmin edilmesine neden olabilir. Son olarak, istikrarlı bir taban çizgisi oluşturduktan sonra, görüntüler arasındaki zaman aralığı, ilgilenilen fizyolojik süreci yakalamak için yeterince kısa olmalıdır.
Yöntem bazı sınırlamalar taşır. Bunlardan biri, LRRD'lerin hareketlerini yansıtırken LRRC8 FRET yoğunlukları arasındaki değişikliklerin, gözenek boyunca iyon veya ozmolit taşınmasına karşılık gelmesi gerekmemesidir. Bu, minimum akımlarına 4,32,72 rağmen LRRC8A homomerleri45 ile gözlemlenen FRET değişikliklerinden açıkça anlaşılmaktadır. LRRC8/VRAC kanallarının gözenek blokerleri FRET sinyalini etkilemeyebilir, bu da bu yöntemi belirli kanal modülatörlerinin aranması için uygun hale getirmez. Ayrıca, aşırı eksprese edilen LRRC8 proteinlerinin ekspresyon seviyeleri, özellikle C-terminal etiketli LRRC8 proteinleri bazal aktivite14 gösterdiğinden, gözlemlenen fizyolojik süreçleri etkileyebilir.
Belirli bir araştırma sorusuna bağlı olarak bir sınırlama veya avantaj olarak kabul edilebilecek bir husus, bu yöntemde yalnızca ektopik olarak ifade edilen LRRC8 alt birimlerinin seçici olarak ölçülmesidir. Bu nedenle, endojen proteinlerin arka plan seviyeleri ölçümlere neredeyse hiç müdahale etmez. Öte yandan, aşırı eksprese edilen proteinler, potansiyel olarak farklı alt birim bileşimi ve stokiyometrisi ile endojen LRRC8 kanalları gibi davranmayabilir. Örneğin, oksidasyon gibi çeşitli uyaranlar, farklı şekilde oluşturulmuş LRRC8 kanalları36 üzerinde zıt modülatör etkilere sahip olabilir. Birlikte ifade edilen alt birimler arasındaki oranları değiştirerek, stokiyometrileri ve genel iyon iletkenliği ayarlanabilir14,73, ancak bir kompleks21 içinde muhtemelen genellikle ikiden fazla paralog içeren doğal bileşimleri net değildir ve hücre tipleriarasında değişebilir 74,75,76. Ayrıca, floresan proteinlerin LRRC8 proteinlerinin sitozolik C-terminaline füzyonunun, Xenopus oositlerinde14 bazal LRRC8/VRAC kanal aktivitesini arttırdığı gösterilmiştir, çünkü büyük etiketler, kanal açılışını yönetebilen LRRD'lerin konformasyonunu modüle eder 14,44,45. Bu nedenle, floresan proteinlerin boyutu, bağlayıcı ve yönelimleri sadece FRET verimliliğini değil, aynı zamanda kanal aktivitesini de etkileyebilir. Bununla birlikte, daha da önemlisi, floresan proteinlerle kaynaşmış LRRC8 proteinlerinin VRAC kanalları, hipotonik stimülasyona14 yanıt vermeye devam etti ve bu da FRET sensörleri45 olarak kullanılmalarını sağladı.
LRRC8 / VRAC kanal aktivitesini ışık mikroskobu ile izlemek için bu non-invaziv yöntemin diğer yöntemlere kıyasla avantajları şunları içerir: (i) Elektrofizyoloji için tipik olarak erişilemeyen hücreler veya bölmeler içinde LRRC8 / VRAC'ın gözlemlenmesine izin verir. Bu, LRRC8 komplekslerinin bulunabileceği veya 45,77,78'e hedeflenebileceği hücre içi organelleri içerir. (ii) Sitozolik bileşim yöntem tarafından değiştirilmeden kalırken, tüm hücre yama-kelepçe ölçümleri sırasında, sitozol büyük ölçüde pipet çözeltisi ile değiştirilir, bu da forbol-12-miristat-13-asetat (PMA) ile gözlemlendiği gibi sinyal yollarını etkileyebilir LRRC8 / VRAC aktivasyonu45. (iii) Hücre göçü sırasında ön ve arka kenarlardaki aktiviteyi ayırt etmek gibi hücre altı çözünürlükle LRRC8/VRAC aktivasyonunu gözlemleme imkanı sunar, burada -kapalı alanlarla sınırlı- VRACdahil edilmiştir 79,80. (iv) Miyosit farklılaşması56 gibi genişletilmiş fizyolojik süreçler sırasında LRRC8/VRAC aktivitesinin sürekli izlenmesini sağlar.
Bu yöntemle ilgili sınırlamalar ve zorluklar olsa da, hayvan modellerindeki potansiyel uygulamalar da dahil olmak üzere daha fazla araştırma için umut vaat ediyor. Bu iyon ve ozmolit kanal ailesini incelemek için diğer yöntemlerle birlikte, bu FRET bazlı tahlil, aktivasyon mekanizmalarının çözülmesine ve LRRC8 kanallarının doğal ortamlarında çeşitli fizyolojik işlevlerinin araştırılmasına önemli ölçüde katkıda bulunabilir.
Yazarların açıklanacak herhangi bir çıkar çatışması yoktur.
CFP-18aa-YFP yapısını kodlayan plazmidin nazik hediyesi için C.F. Kaminski'ye, teknik yardım için A. Klemmer'e ve bu yöntemin geliştirilmesine katkıda bulunan Stauber laboratuvarının tüm mevcut ve eski üyelerine teşekkür ederiz.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
0.05% Trypsin-EDTA | gibco | 25300-054 | |
Camera DFC9000GTC | Leica | 11547007 | |
CFP-18aa-YFP | N/A | N/A | Elder et al. 2009 PMCID: PMC2706461; Gift from C.F. Kaminski (University of Cambridge, UK) |
Cycloheximide (CHX) | Sigma-Aldrich | 66-81-9 | |
D(-)-Mannitol | Carl Roth | 4175.1 | |
D(+)-Glucose | Carl Roth | HN06.1 | |
DMEM (Dulbeccos Modified Eagle Medium) | PAN-Biotech | P04-03590 | |
DPBS (Dulbecco's Phosphate Buffer Saline) | PAN-Biotech | P04-36500 | |
Emission filter wheel (460/80, 535/70, 590/50, 642/80, 100%) | Leica | 11525480 | |
FBS (Fetal Bovine Serum) | PAN-Biotech | P30-3302 | |
Filter cube CYR71010 | Leica | 11525416 | |
FuGENE | Promega | E2691 | |
Glas Bottom Culture Dishes 35 mm | MatTek | P35G-0-10-C | |
HeLa cells | Leibniz Forschungsinstitut DSMZ | ACC 57 | Mammalian cervix carcinoma/ Obtained from Leibniz Forschungsinstitut DSMZ |
HEPES | Carl Roth | 9105.4 | |
ibidi µ-Disch 35 mm | ibidi | 81156 | |
KCl (Potassium chloride) | Carl Roth | 6781.1 | |
LAS X FRET Wizard | Leica | 11640862 | |
Light source LED8 | Leica | 11504256 | |
LRRC8A-mCerulean3 | N/A | N/A | König et al. 2019 |
LRRC8E-mVenus | N/A | N/A | König et al. 2019 |
Luna-II Automated Cell Counter | logos biosystems | L40002 | |
Luna-II Cell Counter Slides | logos biosystems | L12001 | |
MgCl2 (Magnesium chloride) | Carl Roth | KK36.1 | |
Microscope THUNDER Imager live cell | Leica | 11525681 | |
NaCl (Sodium chloride) | Carl Roth | 9263 | |
Objective HC PL APO 63x/1.40 OIL | Leica | 11506349 | |
Opti-Minimal Essential Medium (MEM) | gibco | 11058 | |
Osmometer OM807 | Vogel | V04807 | |
Penicillin Streptomycin (Pen Step) | gibco | 15070-063 | |
Trypan blue solution (0,4%) | Sigma | T8154 | |
Tumor necrosis factor (TNF)-a | Sigma-Aldrich | 94948-59-1 | |
Valve Controlled Gravity Perfusion System | ALA Scientific Instruments | VC3-4xG |
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiThis article has been published
Video Coming Soon
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır