3D器官系统被认为比2D测定在生理上更相关，它可以提供有关生物学的宝贵信息，否则将难以获得。这是一个适应性强的系统，我们可以用更少的时间和更低的成本来测试药理学和基因操作，比使用体内的方法要低得多。矩阵试验是很难处理，因为它凝固时，它达到室温。
它只能通过移液器在液体时绘制，并且必须在冰上维护。环的完整性很重要。如果结构被破坏，可能会对器官生长产生负面影响，在更换介质时很容易丢失材料。
从编写小鼠基础和发光前列腺上皮细胞开始此过程，如文本协议中所述。在500微升小鼠器官介质中清洗细胞颗粒，然后以每微升1000个细胞的细胞密度重新悬浮颗粒。为了准备主混合物，将悬浮在小鼠器官介质中的上皮细胞与基质凝胶混合，以生成含有25%介质细胞和75%基质凝胶的最终混合物。
根据下游应用的不同，基底细胞通常镀在每80微升100至2000个细胞的浓度，而发光细胞的镀金浓度为每80微升2000至10000个细胞。对于每个细胞混合物，每24井板的井中加入80微升的基质凝胶。将水滴滴滴到井壁的下半部分，同时避免与多血球涂层直接接触。
添加基质凝胶后，旋转板，使基体凝胶细胞混合物在井边缘周围形成环。将 24 井板放入 37 摄氏度、5%C02 培养箱右侧 10 分钟，让基质凝胶部分硬化。孵育10分钟后，将24井板倒置，再孵育50分钟，使基质凝胶完全硬化。
然后，在每一个井的中心添加350微升预热小鼠风琴介质滴。添加介质后，将 24 井板返回孵化器。要补充小鼠管风介质，请以 45 度角倾斜 24 井板，并使用 P1000 移液器从每个井的中心轻轻去除现有介质，同时避开矩阵凝胶环。
添加350微升预热小鼠器官介质，如上前。建议在培养超过五天的器官中加入大量培养的介质，以防止关键营养素和生长因子的快速耗竭。与之前一样，从每个介质中卸下介质。
为了收集器官，通过将一毫升预加热的不含酶介质直接移液到基质凝胶环上，反复爆破基体凝胶，直到整个环脱落。将脱落的基质凝胶有机体混合物转移到1.5毫升微离心管中。在文本协议中描述的完全消化后，将磷酸盐缓冲盐水添加到有机体颗粒中，然后轻轻轻拂重新悬浮。
在室温下，在800次G下离心，将器官中去除5分钟，然后使用微移液器去除上流液。每10微升包装细胞体积将有机体颗粒重新悬浮在100微升蛋白质解解缓冲液中。轻拂以重新挂起。
现在，通过将管子淹没在湿冰中，将声波分离器的尖端轻轻应用到微离心管的外方，对器官进行声波化。声波 40 秒在 20 千赫， 然后继续西方印迹与既定的协议。要从 24 孔板中收集前列腺器官，请从每个孔板和之前一样去除介质。
在37摄氏度、5%CO2培养箱中，用500微升含糖的介质孵育30分钟，消化基质凝胶。在微离心管中收集消化的器官悬浮液。然后，在室温下以800倍G的离心对器官进行颗粒状，三分钟，然后去除上经剂。
为了对前列腺器官进行全安装免疫荧光染色，首先在PBS中加入500微升4%的甲状甲醛。在室温下用温和的摇动孵育器官两小时。如文本协议所述，洗涤颗粒后，在阻尼溶液中每毫升 DAPI 污渍中加入一微克，并在室温下孵育两小时。
保护样品在孵育过程中免受光线的光，从这一步前进。与以前一样，在器官离心后，在阻断溶液中加入原抗体，并在四摄氏度下孵育，轻轻摇晃。再次将器官取出，用一毫升 PBS 清洗颗粒 15 分钟，轻轻摇动。
重复此洗涤程序两次。然后在阻断溶液中加入二次抗体，在四摄氏度下孵育，轻轻摇晃。孵育后，对器官进行颗粒，再洗两次颗粒。
在PBS中加入一毫升30%蔗糖，在颗粒状有机体中加入1%Triton X-100。然后在室温下孵育两小时，轻轻摇晃。再次对器官进行造粒后，在PBS中加入1%Triton X-100的1毫米45%蔗糖，并在室温下轻轻摇动两小时。
然后，重复该过程，除了在 PBS 中加入 1%Triton X-100 的 60% 蔗糖一毫升。在室温下，在800次G下离心，将器官中除，三分钟，去除95%的上经剂。在紫外线下观察颗粒，确认在去除上清液时颗粒未丢失。
当蔗糖浓度增加时，颗粒变得更松。将剩余悬架的 10 至 20 微升转移到室盖玻片中，然后进行共合显微镜。基础细胞和发光细胞形成具有不同形态的器官。
虽然大多数基底衍生器官在培养七天后大小相似，但发光衍生的器官表现出显著的异质性。此外，大多数基底衍生器官包含被多层上皮包围的流明，而发光衍生的器官在形态学上范围从空心与单层上皮到固体与多层细胞线不通化。西方的印迹分析显示，基底和发光衍生的器官保留了与基底和发光原细胞相关的特征。
基底衍生器官表达基底标记细胞蛋白5的较高水平，而发光衍生器官表达较高水平的发光标记细胞蛋白8。在大量种群的基底和发光衍生器官中检测到基底标记和发光标记，这或许暗示了分化。基底衍生器官包含多层上皮，外层表示基底标记p63的高水平，内层具有不可检测的水平。
外层还表示中度亮度标记细胞素8，内层具有高水平。虽然单层发光衍生器官中的所有细胞对细胞蛋白8呈正染色，但只有部分细胞含有核p63。处理基质凝胶时必须小心，以确保在将细胞电镀到器官培养体之前，它不会硬化。
用于显微镜的 DAPI 可引起皮肤刺激。紫外线也可能有害。充足的个人防护装备是必不可少的。
我们可以从器官中收集RNA来执行RNA测序，这将告诉我们基因表达特征在器官形成过程中或对操纵的反应中是如何变化的。该模型使前列腺场具有可重复的体外检测，以研究上皮生物学的基本方面，并确定发育和分化中的调节器。
