在我们的实验室中,我们有兴趣了解哪些脂质和蛋白质机制参与ATG9A囊泡运输。ATG9A在吞噬团形成和成熟的自噬途径中至关重要。然而,我们最近一直在研究ATG9A对细胞器稳态的影响。
最大的挑战是揭示蛋白质和蛋白质机器如何运作的分子细节。基于AlphaFold的蛋白质工程和高分辨率原位冷冻电镜等技术目前取得了最大的进步。我实验室的工作已经建立了对自噬体如何形成的基本见解。
这些见解得到了先进的分子细胞生物学技术的支持,例如这里描述的技术。我们描述了使用某些蛋白质标签的一些缺点,以及ATG9A的行为如何根据标签的定位而改变。因此,要么是 N 端,要么是 C 端。
我们还提出了检测这些缺点以及如何避免这些缺点的方法。除此之外,我们还提供了以可重现的方式量化ATG9A扩散的工作流程。在这里,我们提供了一个从免疫荧光和实时成像到图像采集和分析的工作流程,用于分析ATG9在不同细胞区室中的扩散。
我们确实认为,图像分析管道的标准化是细胞生物学家的首要任务,以便能够提高我们结果的可靠性和可重复性。