Richtig gefaltete und zusammengesetzte Proteine werden selektiv in Vesikel verpackt, die das ER verlassen. Motorproteine transportieren diese Vesikel zum Golgi-Apparat, um Modifikationen hinzuzufügen, die diese Proteine an ihrem Zielort funktionsfähig machen.

Der Golgi-Apparat ist eine eukaryotische Organelle, die ein charakteristisches bandartiges Aussehen hat. Es ist eine primäre Sortier- und Versandstation für Fracht, die aus der Notaufnahme kommt. Neu ankommende Vesikel gelangen in die cis-Seite des Golgi, die der Notaufnahme am nächsten liegt, und werden durch einen Stapel membranumschlossener Zisternen transportiert. Jede Zisterne enthält einzigartige Zusammensetzungen von Enzymen und führt spezifische Proteinmodifikationen durch, wie z. B. Phosphorylierung und Glykosylierung. Nach Modifikationen in der Transzisterne erhalten Proteine Markierungen, die ihr zelluläres Ziel definieren.

Abhängig von den molekularen Markierungen werden Proteine in Vesikel verpackt und zu bestimmten zellulären Orten, wie z. B. der Plasmamembran, transportiert. Spezifische Marker auf den Membranen dieser Vesikel ermöglichen es ihnen, an der entsprechenden zellulären Stelle anzudocken.