Le proteine correttamente ripiegate e assemblate vengono confezionate selettivamente in vescicole che escono dall'ER. Le proteine motorie trasportano queste vescicole all'apparato di Golgi per aggiungere modifiche che rendono queste proteine funzionali a destinazione.

L'apparato di Golgi è un organello eucariotico che ha un caratteristico aspetto nastriforme. Si tratta di una stazione primaria di smistamento e spedizione per le merci che arrivano dal pronto soccorso. Le vescicole appena arrivate entrano nella parete cis del Golgi, più vicina al pronto soccorso, e vengono trasportate attraverso una pila di cisterne racchiuse da membrana. Ogni cisterna contiene composizioni uniche di enzimi ed esegue specifiche modifiche proteiche, come la fosforilazione e la glicosilazione. Dopo le modifiche nella trans cisterna, alle proteine vengono dati tag che definiscono la loro destinazione cellulare.

A seconda dei tag molecolari, le proteine vengono impacchettate in vescicole e trasportate in particolari posizioni cellulari, come la membrana plasmatica. Marcatori specifici sulle membrane di queste vescicole consentono loro di attraccare nella posizione cellulare appropriata.