Quantifizierung von Drosophila melanogaster Augenphänotypen: Ein computergestützter Ansatz zur Integration von Ilastik und Flynotyper

Wir sind daran interessiert, Krankheitsmodelle für Krankheiten wie ALS, FTD und Multisystem-Proteinopathie zu entwickeln, um ihre molekularen Pathologien zu verstehen. Ein Modell, das wir verwenden, ist das Drosophila-Augensystem. Die Regelmäßigkeit und das symmetrische Muster des Auges können verwendet werden, um die Auswirkungen der Einführung von Mutationen und Veränderungen der Genexpression zu bewerten.

Unser Protokoll schließt eine Lücke in der Quantifizierung von groben Augenphänotypen, insbesondere die Lücke, die durch manuelles Ranking entsteht. Die manuelle Rangfolge basiert auf Fusion, Verlust von Ommatidien und Borstenorganisation. Es kann jedoch zu Verzerrungen führen.

Daher schafft die Kombination von Ilastik und Flynotyper eine robustere Methode zur Einstufung abnormaler Augenphänotypen. Unser Protokoll kann aufgrund seiner Robustheit für ein manuelles Ranking von Vorteil sein. Auch nicht geschulte Labormitglieder können eine erfolgreiche Quantifizierung durchführen, während für das manuelle Ranking wahrscheinlich ein besser ausgebildeter Forscher erforderlich ist, um Unterschiede zwischen zwei verschiedenen Forschern zu vermeiden.

Daher kann dieses Protokoll Zeit und Ressourcen sparen. Unsere Ergebnisse bringen die Forschung voran, da dieses Protokoll eine genauere Quantifizierung von groben Augenphänotypen ermöglicht, insbesondere von schwachen Veränderungen in der Augenmorphologie. Aufgrund der Verzerrung bei der manuellen Einstufung führt die Kombination von Ilastik und Flynotyper zu einer genaueren Bewertung und damit zu genaueren veröffentlichten Ergebnissen.