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Method Article
Un test de fréquence pour mesurer la cinétique de l'adhérence d'interaction récepteur-ligand, lorsque les deux molécules sont ancrées sur les surfaces des cellules en interaction est décrite. Ce test mécanique à base est illustrée à l'aide d'une micropipette pressurisés cellules rouges du sang humain en tant que capteur d'adhérence et de l'intégrine αLβ2 et de la molécule d'adhésion intercellulaire-1 que l'interaction des récepteurs et des ligands.
Le test d'adhérence micropipette a été développé en 1998 pour mesurer deux dimensions (2D) récepteur-ligand cinétique de liaison 1. L'essai utilise un globule rouge humain (RBC) en tant que capteur d'adhérence et de cellules présentant l'une des molécules en interaction. Elle emploie micromanipulation pour amener le RBC en contact avec une autre cellule qui exprime la molécule interagissant avec d'autres zone contrôlée avec précision et le temps pour permettre la formation de liaison. L'événement d'adhérence est détecté comme un allongement de RBC sur la tirant les deux cellules à part. En contrôlant la densité des ligands immobilisés sur la surface du globule, la probabilité de l'adhésion est maintenu à la mi-chemin entre 0 et 1. La probabilité d'adhérence est estimée à partir de la fréquence des événements d'adhésion dans une séquence de cycles de contacts répétés entre les deux cellules pour un temps de contact donné. Varier le temps de contact génère une courbe de liaison. Le montage d'un modèle probabiliste pour récepteur-ligand de réaction cinétique de 1 à la liaisoncourbe de revient de l'affinité 2D et hors-taux.
Le test a été validé en utilisant des interactions avec des récepteurs Fcy IgG Fc 1-6, avec des ligands des sélectines glycoconjugués 6-9, les intégrines avec des ligands 10-13, homotypical cadhérine contraignante 14, récepteur des cellules T et des complexes d'histocompatibilité corécepteur peptide-major 15 - 19.
La méthode a été utilisée pour quantifier les règlements de la cinétique 2D par des facteurs biophysiques, comme la membrane microtopology 5, la membrane d'ancrage 2, l'orientation moléculaire et de la longueur 6, 9 raideurs transporteur, la courbure 20 et 20 vigueur impact, ainsi que les facteurs biochimiques, tels que des modulateurs du microenvironnement du cytosquelette et la membrane où les molécules interagissant résident et l'organisation de surface de ces molécules 15,17,19.
La méthode a également été utilisé to Etude de la liaison simultanée de deux espèces récepteur-ligand 3,4, et les interactions trimoléculaire 19 en utilisant un modèle modifié 21.
L'avantage majeur de cette méthode est qu'elle permet l'étude des récepteurs membranaires dans leur environnement natif. Les résultats pourraient être très différents de ceux obtenus en utilisant des récepteurs purifiés 17. Il permet également d'étudier les interactions récepteur-ligand dans un délai inférieur à la seconde avec une résolution temporelle bien au-delà des méthodes typiques biochimiques.
Pour illustrer la méthode de fréquence micropipette adhésion, nous montrons mesure cinétique de la molécule d'adhésion intercellulaire 1 (ICAM-1) fonctionnalisés sur les globules rouges se liant à l'intégrine α L β 2 sur les neutrophiles avec des dimères de la E-sélectine dans la solution pour activer α L β 2.
1. Isolément les globules rouges du sang total
Remarque: l'étape 1.2 doit être effectuée par un médecin formé professionnel comme une infirmière, avec un Institutional Review Board protocole approuvé.
2. Biotinylation globules rouges
3. La fonctionnalisation de la biotine * lié ligands sur les globules rouges
* Si votre protéine n'a aucun lien de biotine, vous pouvez utiliser un des kits disponibles dans le commerce d'une biotinylation de protéines (par exemple, Thermo Scientific # 21955 EZ-Link Micro-NHS-PEG4 Biotinylation Kit) ou d'utiliser des anticorps biotinylés capture comme une étape intermédiaire comme le montre dans la vidéo.
4. Quantification des densités de récepteurs et des ligands
5. Préparation pour micropipette et la chambre cellulaire
6. Dosage de la fréquence d'adhérence Micropipette
8. Les résultats représentatifs:
Figure 1: Détermination de l'intégrine α L β 2 densité du site sur les neutrophiles. Les neutrophiles ont d'abord été incubées avec des 1μg/ml E-sélectine-Ig pour 10min pour correspondre à la condition expérimentale utilisée dans les figures 3,4 ou sans E-sélectine-Ig, et ensuite avec des concentrations saturantes (10μg/ml) de PE-conjugué anti- -humain CD11a mAb (Clone HI111, voir le tableau des particuliersréactifs et du matériel) ou IgG1 de souris non pertinentes pour le contrôle, lavées, et analysées immédiatement. Les échantillons ont été lus sur cytomètre de flux BD LSR avec des perles QuantiBRITE étalon PE. Le panneau A montre les histogrammes de fluorescence des billes de calibration (rose) avec celles de la E-sélectine-Ig cellules traitées (couleur bleu) ou non traitées (couleur verte). Spécifiques CD11a mAb coloration est montré dans les courbes solides et pertinents coloration apparié par isotype d'anticorps de contrôle est représenté dans les courbes en pointillés. Les cellules traitées avec la E-sélectine-Ig (présence dans tous les étapes de lavage et dans un tampon de FACS) n'a pas d'incidence sur la densité CD11a vu de la comparaison avec les cellules non traitées. Groupe B montre le processus de quantification de densité. Log10 a été calculé pour l'intensité moyenne fluorescentes (FI) de chaque valeur de crête de quatre histogrammes billes de calibration à partir du Panneau A (cercles roses) et pour les molécules PE spécifique du lot par bille (du fabricant). Une régression linéaire de molécules PE Log10 par bille contre la Log10 fluorescrence a été tracée. Pour la E-sélectine des cellules traitées Log10 FI (y) des valeurs égales 3,99 (cercle bleu solide) et 2,23 (bleu cercle ouvert) pour des anticorps monoclonaux spécifiques et des anticorps de contrôle, respectivly. Nous avons résolu l'équation linéaire pour x (les valeurs sont tracées comme des cercles vert et bleu sur le panneau B) x = log10 PE / cellule et, comme PE:. Ratio de mAb était de 1:1, le nombre total d'α L β 2 sur les neutrophiles était calculé comme 9587. La densité de surface a été calculée à 43 molécules / um 2, en utilisant 8.4μm que le diamètre des neutrophiles 22. Densité de ICAM-1 était également mesurée par écoulement à l'aide cytometery PE-anti-humains CD54 monoclonal, ce qui équivalait à 65 mol / um 2.
Figure 2 schémas des systèmes Micropipette. Notre système micropipette a été assemblé dans la maison et se compose de trois sous-systèmes: un sous-système d'imagerie permettant d'observer, record et d'analyser les mouvements de la cellule micropipette-atmosphérique; un sous-système de micromanipulation pour permettre de sélectionner les cellules de la chambre de la cellule, et un sous-système de pression pour permettre d'aspirer les cellules dans des micropipettes. La pièce centrale du sous-système d'imagerie est microscope inversé (Olympus IMT-2 IMT2) avec un objectif à immersion 100x 1,25 NA. L'image est envoyée à un enregistreur de cassette vidéo à travers un dispositif à couplage de charge (CCD). Une minuterie vidéo est couplé au système de garder trace du temps. Chaque micropipette peut être manipulé par un entraînement mécanique montée sur le microscope et finement positionné avec un micromanipulateur trois axes hydrauliques. Manipulateurs mécaniques de Newport pourrait être utilisé aussi bien. L'un des détenteurs micropipette est monté sur un translateur piézoélectrique, le conducteur est contrôlé par un code informatique LabView (disponible sur demande) et les traduit signal à travers une carte DAQ via un amplificateur de tension (fait maison) à l'actionneur piézo-électrique. Ceci est unllows de se déplacer la pipette précise et reproductible dans un cycle de test d'adhérence. Le sous-système de régulation de pression est utilisé pour contrôler d'aspiration pendant l'expérience. Une ligne hydraulique relie le titulaire micropipette à un réservoir de fluide. Un positionneur mécanique fine permet à la hauteur du réservoir pour être manipulé avec précision.
Micropipettes sont générés en utilisant la fusion Kimax tubes capillaires en verre borosilicate points (avec un diamètre extérieur de 1,0 ± 0,07 mm et un diamètre intérieur de 0,7 ± 0,07 mm. Abord, les micropipettes de tubes capillaires sont tirés à l'aide PN-30 Narishige 'extracteur magnétique microélectrodes de verre horizontale (Sutter Instruments Micropipette Extracteur est une autre option extracteur). Deuxièmement, le système microforge (construit dans la maison) est utilisé pour couper les micropipettes à l'ouverture de la taille désirée. modèles commerciaux de systèmes microforge sont disponibles aussi bien.
Pour éviter les vibrations de l'micropipettes pendant l'expérience, le microscOPE, avec les micromanipulateurs, est placé sur une table de suspension à air.
Figure 3 Exécution fréquence F i pour une adhérence spécifique (A) et non spécifiques (B) se liant à 1s (rouge) et 10s temps de contact (en bleu) mesurée à partir des cycles répétés test d'adhérence entre les globules rouges revêtus d'ICAM-1 (A) ou hIgG (B ) avec des neutrophiles humains exprimant l'intégrine α L β 2. F i = (X 1 + X 2 + ... + X i) / i (1 ≤ i ≤ n), où i est l'indice du cycle d'essai, X i est égal à "1" (adhérence) ou "0" (pas d'adhérence). F n (n = 50) a été utilisé comme la meilleure estimation de la probabilité d'adhérence.
Figure 4 Cinétique deICAM-1 se liant à des neutrophiles intégrine β α L 2 ( ). La probabilité d'adhésion mesurée, comme illustré dans la Figure 3 pour les trois paires de cellules à chaque temps de contact est en moyenne et la portée en fonction du temps de contact. Le milieu de chambre a été HBSS avec 1 mM chacun de Ca 2 + et Mg 2 + en plus du dimère 1μg/ml E-sélectine-Ig à réguler positivement β α 2 L contraignant. Pour capturer l'ICAM-1-Ig sur les globules rouges, une étape intermédiaire a été ajouté à incuber avec des anticorps de capture globules rouges 10μg/ml (biotinylé de chèvre anti-anticorps humain Fc, eBioscience) après l'étape d'incubation streptavidine. Pour contrôler la liaison non spécifique deux conditions différentes ont été utilisées: 1) les globules rouges enduits de l'anticorps de capture anti-humain-Fc et incubées avec des IgG humaines au lieu d'ICAM-1-Ig (O) et 2) se liant à des neutrophiles globules rouges n'est pas revêtu de la captage d'anticorps (Δ). 10μg/ml IgG humaines a été ajouté au milieu afin de minimiser la liaison de E-Sélectine-Ig dans la solution d'anticorps de capture sur la surface du globule. La liaison non spécifique enregistrée IgG humaines contrôle de la courbe a été utilisée pour obtenir une courbe d'adhérence spécifiques probabilité (
) En utilisant l'équation. 2. Ajustement de courbe spécifiques de probabilité d'adhésion avec Eq. 1 (ligne continue) retourné efficaces affinité de liaison A, K = 1,4 c une μm4 • 10 -4 et k off = 0,3 s -1.
Réactif | MW (g / mol) | Concentration (mM) | Montant (g) |
---|---|---|---|
Adénine | 135,13 | 2 | 0,27 |
D-glucose (dextrose) | 180,16 | 110 | 19,82 |
D-mannitol | 182,17 | 55 | 10,02 |
Chlorure de sodium (NaCl) | 58,44 | 50 | 2,92 |
Phosphate de sodium dibasique (Na HPO ) | 141,95 | 20 | 2,84 |
L-glutamine | 146,15 | 10 | 1,46 |
Tableau 1. Préparation EAS-45 tampon (1L).
25 mg de biotine dans 550 ul XHS de DMF | 0,1 M biotine solution |
Dilution 1:10 de 0,1 biotine w / DMF | 0,01 biotine solution |
1:100 dilution de 0,1 biotine w / DMF | 0,001 M la biotine solution |
Tableau 2. Préparation de la solution de biotine.
biotine concentration finale (M) | 4 | 10 | 20 | 50 | 100 | 160 |
---|---|---|---|---|---|---|
Globules rouges granulés de stock (ul) | 10 | 10 | 10 | 10 | 10 | 10 |
1x PBS (ul) | 179,2 | 178 | 176 | 179 | 178 | 176,8 |
0,1 M de tampon borate (ul) | 10 | 10 | 10 | 10 | 10 | 10 |
0,01 biotine solution (ul) | 1 | 2 | 3.2 | |||
0,001 M la biotine solution (ul) | 0.8 | 2 | 4 |
Tableau 3. Biotinylation de globules rouges.
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Pour utiliser avec succès le test de fréquence d'adhérence micropipette on doit considérer plusieurs étapes critiques. Premièrement, assurez-vous d'enregistrer les interactions spécifiques pour le système récepteur-ligand d'intérêt. Mesures de contrôle non spécifiques (cf. Fig. 3, 4) assurer la spécificité. Idéalement, les probabilités d'adhérence non spécifique doit être inférieur à 0,05 pour toutes les durées de contact et d'avoir une différence significative entre les proba...
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Pas de conflits d'intérêt déclarés.
Cette étude a été financée par des subventions du NIH R01HL091020, R01HL093723, R01AI077343 et R01GM096187.
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Name | Company | Catalog Number | Comments |
Nom du réactif | Société | Catalogue # | Commentaires |
---|---|---|---|
10x PBS | BioWhittaker | 17-517Q | Diluer à 1x à l'eau déminéralisée avant de l'utiliser |
Vacutainer EDTA | BD | 366643 | Isolément les globules rouges |
10ML PK100 | |||
Histopaque 1077 | Sigma-Aldrich | 10771 | Isolément les globules rouges |
Adénine | Sigma-Aldrich | A2786 | EAS-45 la préparation |
D-glucose (dextrose) | Sigma-Aldrich | G7528 | EAS-45 la préparation |
D-mannitol | Sigma-Aldrich | 6360 | EAS-45 la préparation |
Chlorure de sodium (NaCl) | Sigma-Aldrich | S7653 | EAS-45 la préparation |
Phosphate de sodium dibasique (Na & # x2082; HPO ₄) | Fisher Scientific | S374 | EAS-45 la préparation |
L-glutamine | Sigma-Aldrich | G5763 | EAS-45 la préparation |
Biotine-X-NHS | Calbiochem | 203188 | Biotinylation globules rouges |
Diméthylformamide (DMF) | Thermo Scientific | 20673 | Biotinylation globules rouges |
Tampon borate (0,1 M) | Sciences Electron Microscopy | 11455-90 | Biotinylation globules rouges |
Streptavidine | Thermo Scientific | 21125 | Ligand fonctionnalisation |
BSA | Sigma-Aldrich | A0336 | Ligand fonctionnalisation |
Quantibrite Perles PE | BD Biosciences | 340495 | La quantification de densité |
Cytomètre en flux | BD Systèmes Immunocytometry | BD LSR II | Densité Quantification |
Tube capillaire 0.7-1.0mm x 30 " | Kimble Glass Inc | 46485-1 | Micropipette tirant |
Huile minérale | Fisher Scientific | BP2629-1 | Chambre de l'Assemblée |
Verre Couverture Microscope | Fisher Scientific | 12 à 544-G | Chambre de l'Assemblée |
PE α-humain CD11a Clone HI 111 | eBioscience | 12-0119-71 | Réactif pour Fig.1 |
PE anti-humain CD54 | eBioscience | 12-0549 | Réactif pour Fig.1 |
Souris IgG1 isotype contrôle PE | eBioscience | 12-4714 | Réactif pour Fig.1 |
micromanipulateur hydraulique | Narishige | MO-303 | Micropipette système |
Manipulateur mécanique | Newport | 461-XYZ-M, LM-13, DM-13 | Micropipette système |
translateur piézoélectrique | Physik Instrumente | P-840 | Micropipette système |
LabVIEW | National Instruments | Version 8.6 | Micropipette système |
DAQ conseil d'administration | National Instruments | USB-6008 | Micropipette système |
Table optique | Kinetics Systems | Série 5200 | Micropipette système |
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