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Dans cet article

  • Résumé
  • Résumé
  • Introduction
  • Protocole
  • Résultats
  • Discussion
  • Déclarations de divulgation
  • Remerciements
  • matériels
  • Références
  • Réimpressions et Autorisations

Résumé

Arrière-plan autofluorescence des échantillons biologiques complique souvent basés sur la fluorescence des techniques d’imagerie, en particulier dans les tissus de postmitotiques humains âgés. Ce protocole décrit comment l’autofluorescence de ces échantillons peut être efficacement enlevé avec une lampe disponible dans le commerce, émettant une lumière diode source vers photobleach l’échantillon avant immunostaining.

Résumé

Immunofluorescence est une méthode couramment utilisée pour visualiser les compartiments subcellulaires et déterminer la localisation des protéines spécifiques au sein d’un échantillon de tissu. Un grand obstacle à l’acquisition d’images de haute qualité immunofluorescence est endogène autofluorescence des tissus causés par des pigments de vieillissement tels que de lipofuscine ou par des procédés de préparation échantillon commun comme la fixation de l’aldéhyde. Ce protocole décrit comment la fluorescence de fond peut être considérablement réduit par le biais de photoblanchiment de l’utilisation de phosphore blanc luminescent baies de diode électroluminescente (del) avant le traitement avec des sondes fluorescentes. L’émission à large spectre de phosphore blanc LED permettre pour la décoloration des fluorophores dans un éventail de pics d’émission. L’appareil de photoblanchiment peut être construits à partir des composants sur étagère à très bas prix et offre une alternative accessible aux extincteurs chimiques disponibles dans le commerce. Un prétraitement de photoblanchiment du tissu suivi classique immunofluorescence souillant génère des images sans fond autofluorescence. Par rapport à mis en place des extincteurs chimiques qui réduit la sonde comme arrière-plan signale, photoblanchiment traitement n’a eu aucun effet sur l’intensité de fluorescence sonde alors qu’elle a effectivement réduit fluorescence de fond et de lipofuscine. Bien que photoblanchiment nécessite plus de temps pour le prétraitement, supérieur intensité LED tableaux peuvent servir à réduire le temps de photoblanchiment. Cette méthode simple peut potentiellement être appliquée à une variété de tissus, tissus particulièrement mitotiques qui s’accumulent lipofuscine tels que le cerveau et les muscles cardiaques ou squelettiques.

Introduction

La microscopie de fluorescence en utilisant des anticorps ciblant les protéines spécifiques est régulièrement utilisée pour visualiser les protéines d’intérêt dans la culture de cellules et de tissus. Une complication majeure à l’acquisition des images claires et définitives en immunofluorescence est autofluorescence, qui peut être causée endogène dans les tissus de mammifères de la lipofuscine de pigment d’âge et de protéines telles que l’élastine et du collagène1, 2. Autres sources d’autofluorescence peuvent être introduits par étapes de préparation d’échantillon comme aldéhyde fixation3. Granules de lipofuscine, composés essentiellement de protéines modifiées par oxydation et résidus de dégradation des lipides, s’accumulent dans les cellules longue durée de vie accrue âge2. Cela provoque des difficultés dans l’imagerie des tissus postmitotiques comme le cerveau et les muscles cardiaques ou squelettiques, comme le spectre d’émission de fluorescence de lipofuscine est large et variable, qui coïncide souvent avec la longueur d’onde d’émission des fluorophores courants utilisés pour 4l’étiquetage. Ces facteurs rendent l’imagerie des tissus cérébraux humains provenant de cas de maladies neurodégénératives tardives comme la dégénérescence lobaire fronto-temporale (FTLD) particulièrement difficile.

Pour réduire l’autofluorescence, nous avons mis au point une technique dans laquelle nous irradier les sections de tissu monté sur glissière avec une lumière blanche émettant réseau de diodes (LED) à l’aide d’une lampe de bureau domestique5. Cette technique simple fournit une alternative aux techniques qui utilisent des extincteurs chimiques telles que CuSO4 dans l’acétate d’ammonium, ou disponible dans le commerce de trempe des colorants tels que le Soudan noir B et noir d’ériochrome T6. Il dispose également d’importante économies sur multispectral conduit techniques de photoblanchiment de lampe et évite les complications et les objets générés à partir des méthodes d’épilation autofluorescence numérique comme spectrale non mélange7,8. Phosphore blanc LEDs ont un large spectre d’émission, une haute luminosité et un coût de fabrication faible, ce qui les rend idéales comme une composante standard de photoblanchiment une variété de chromophores5,9.

Dans ce protocole, nous démontrer la construction d’un appareil de photoblanchiment utilisant des composants accessibles et appliquent le photoblanchiment à un cas de tissu FTLD contenant des inclusions tau-positive (FTLD-T) à l’aide d’un anticorps spécifique de la protéine tau phosphorylée. Nous démontrons l’effet de photoblanchiment sur l’imagerie des anticorps fluorescent marqués employant deux chromophores couramment utilisés : Alexa 488 et Texas Red. L’effet de photoblanchiment versus sections non traitées ou ceux traités avec un extincteur chimique commercial sont quantifiés et comparés. Ce prétraitement photobleaching peut être incorporé à n’importe quel protocole de coloration standard immunofluorescence pour enlever l’autofluorescence dans un échantillon biologique.

Protocole

Remarque : le travaux présenté ont été réalisés en conformité avec les normes internationales reconnues, y compris la Conférence internationale sur l’harmonisation (CIH), le Conseil des organisations internationales des Sciences médicales (CIOMS) et les principes de la déclaration d’Helsinki. Utilisation de tissus humains a été avec l’approbation du University Health Network Research Ethics Board. Le cerveau humain ont été échantillonnés dans le cadre de la Banque de tissus de cerveau Maritime. Au moment de la collecte, le consentement éclairé a été obtenu de tous les patients.

1. construction d’appareils de photoblanchiment et solutions

  1. préparation des solutions mères.
    1. Préparer 1 L de solution stock tampon Tris salin (1 x TBS) (NaCl 150 mM, 50 mM Tris-Cl, pH 7,4) en dissolvant 8,77 g de NaCl et 6,06 g de Tris 1 x base dans 800 mL de ddH 2 O et ajuster le pH à 7.4 à l’aide de HCl. amener le volume à 1 L et autoclave. < / Li >
    2. préparer l’azoture de sodium 10 % (stock de 200 x) dissoudre 1 g de l’azide de sodium dans 10 mL de ddH 2 O (10 %, stock 200 x).
  2. Pour les lames de 1-3 de taille standard, utiliser un seul 100 x 100 mm transparent, carré Pétri comme une chambre de la diapositive. Pour une chambre seule diapositive, ajouter 0,25 mL de 200 actions de l’azoture de sodium x à 50 mL de 1 x TBS pour faire une solution d’azoture-TBS de 0,05 %. Empiler les 2-3 chambres de glisser verticalement pour traiter des diapositives supplémentaires. Préparer une supplémentaire 50 mL de solution d’azoture-TBS pour chaque chambre.
  3. Créer un échafaudage pour élever les glissière ou des chambres, telle qu’une tête de la lampe peut s’adapter sous. Chambre de diapositive
    1. pour un 100 mm x 100 mm, découper des ouvertures dans le fond et les côtés d’un 100 mm x 100 mm x 30 mm en plastique alimentaire contenant et renverser le conteneur. S’assurer que les ouvertures latérales sont assez grands pour s’adapter à une source lumineuse de LED et de garantir l’ouverture inférieure est assez grand, telles que la lumière de la source lumineuse atteigne le compartiment de mesure sans entrave.
    2. Appliquer du ruban adhésif électrique à l’échafaud pour augmenter l’adhérence entre l’échantillon chambre/portatifs et d’établi l’échafaud. Utiliser des matériaux alternatifs pour construire l’échafaud tant qu’il élève solidement la chambre diapositive sans empêcher la lumière d’atteindre l’échantillon.
  4. Retirer des diffuseurs ou plastique opaque de la lampe de bureau qui peut entraver la lumière LED de parvenir directement à l’échantillon (si possible) et orienter la matrice de LED vers le haut. Placer l’échafaudage et la faire glisser ou des chambres au-dessus de la matrice de LED. Utiliser une lampe avec un cou flexible pour une manipulation facile.
  5. Construire un dôme réfléchissant couvre pour l’appareil de doublure à l’intérieur d’une zone assez large pour couvrir la chambre diapositive et échafaudage avec du papier aluminium. Utilisez une boîte de pointe de pipette de 1 mL pour une seule chambre ou un 150 mm x 150 mm x 150 mm carton multiples, verticalement empilés chambres.

2. Photoblanchiment prétraitement des sections de tissu

Remarque : préparation du tissu section peut varier selon la provenance du tissu et fixation et incorporation des méthodes utilisées. Ici, les tissus cérébraux (orbitofrontal gyri) d’un cas de FTLD-T a été fixé pour environ 2 jours dans du formol, traversent un gradient de sucrose, incorporé en OCT et couper à 10 µm de coupes épaisses à l’aide d’un cryostat.

  1. Froid ° c dans un 4 chambre, armoire froide ou réfrigérateur, orienter la lampe sous l’échafaud et placer la chambre de mesure sur l’échafaud. Verser 50 mL de solution d’azoture-TBS dans le compartiment de mesure.
  2. Des sections de tissu Submerge monté sur lames de microscope standard verre dans la chambre de la diapositive contenant l’azoture-TBS avec une pincette propre. Pour plusieurs diapositives, assurez-vous que les lames soient placés dans la chambre sur une seule couche.
  3. Couvrir l’appareil avec la coupole réfléchissante, allumez la lampe LED et incuber pendant 48 h à 4 ° c.

3. Immunofluorescence

  1. à tacher le tissu pour la protéine tau phosphorylée utilisant contre-colorant DAPI et Alexa 488 - et anticorps secondaires conjugué Texas Red, d’abord préparer des solutions pour la recherche d’antigène, perméabilisation, blocage et primaire liaison de l’anticorps. Tampon de
    1. préparer 500 mL de recherche d’antigène (acide citrique 10 mM, 2 mM d’acide éthylènediaminetétraacétique, 0,05 % Tween 20 ; pH 6.2) en dissolvant 0,92 g d’acide citrique et 0,37 g de l’acide éthylènediaminetétraacétique (EDTA) dans 500 mL de ddH 2 O. ajuster le pH 6.2 avec NaOH et ajouter 0,25 mL de Tween 20.
    2. Préparer 500 mL de 0.025 % X-100 Triton dans la solution du SCT (SCT-Triton) en ajoutant 0,125 mL de Triton X-100 à 500 mL 1 x directives du SCT.
    3. Préparer une solution de 1 % d’albumine sérique bovine (BSA) au SCT (tampon BSA-TBS) dissoudre 0,1 g de BSA dans 10 mL de directives du SCT.
    4. Préparer une solution de blocage en ajoutant 0,2 mL de sérum de chèvre normal à 1,8 mL de 1 % BSA/directives du SCT.
    5. Pour chaque diapositive, préparer 150 µL de solution d’anticorps primaire (dilution 1 : 100) en pipettant : 1,5 l d’anti-phospho-PHF-tau pSer202 + Thr205 (AT8) anticorps dans 148,5 µL de 1 % BSA-TBS tampon et laisser sur glace
  2. Pour effectuer la recherche d’antigène, submerger les diapositives photobleached verticalement dans un collecteur de diapositive contenant 25 mL de tampon d’extraction antigène. Fixer le collecteur avec du ruban et/ou chaînes telles que le collecteur ne tombe pas dans l’eau du bain. Chauffer le collecteur dans un bain d’eau à 90 ° c pendant 30 min et laisser le collecteur refroidir à température ambiante pendant 30 min avant de retirer les lames. Ne supprimez pas les diapositives immédiatement car il provoquera les sections à se dessécher.
  3. Transférer les lames du collecteur de récupération de l’antigène dans un pot de coloration contenant 30 mL de SCT-Triton et laver les sections pendant 5 min dans un agitateur orbital avec agitant doucement. Répéter le lavage une fois avec frais de SCT-Triton. Évacue l’excès de tampon à l’extérieur avec un chiffon non pelucheux et contournez le tissu avec un stylo hydrophobe. Prendre soin de ne pas pour laisser les diapositives à sécher.
    1. Pour chaque diapositive, bloquer le tissu par pipetage 200 µL de solution sur le tissu de blocage et placez la lame dans une chambre humidifiée. Aménager la chambre en plaçant une grille coulissante à l’intérieur d’une boîte de pointe de pipette contenant une serviette de papier humide. Incuber à température ambiante pendant 2 h sur une surface plane. S’assurer que la solution de saturation couvre entièrement le tissu.
  4. Enlever la solution de saturation par aspiration et distribuer 100-150 µL de solution d’anticorps primaire sur le tissu. Assurer un volume suffisant d’anticorps est présent et que la section est sur une surface plane afin d’éviter la mise en commun de la solution d’anticorps d’un côté. Incuber à 4 ºC pendant la nuit dans une chambre humidifiée.
  5. Préparer le mélange de l’anticorps secondaire et le contre-colorant nucléaire DAPI.
    1. Pour chaque diapositive, préparer 150 µL du mélange d’anticorps secondaire (dilution au 1/100) en ajoutant 1,5 µL de chèvre anti-souris Alexa 488 et 1,5 µL de chèvre anti-souris Texas Red à 147 µL de BSA-TBS et laisser sur la glace.
    2. Prepare 0,1 µg/mL DAPI contre-coloration par dilution en série. Bien mélanger la solution étalon et diluer 1 µL de stock 5 mg/mL DAPI dans 999 du SCT pour faire 1 mL de 5 µg/mL de solution. Pour chaque diapositive, diluer 3 µL de 5 µg/mL de solution avec 147 µL du SCT à une concentration finale de 0,1 µg/mL.
      ATTENTION : DAPI est un mutagène connu et doit être manipulé avec soin.
  6. Enlever l’anticorps primaire par aspiration. Plonger les lames dans un verre de coloration jar contenant 30 mL de SCT-Triton et lavage pendant 5 min avec un mélange doux dans un agitateur orbital. Répétez l’étape de lavage avec frais de SCT-Triton. Mèche extérieur excédentaire du SCT-Triton et distribuer 100 à 150 µL du mélange d’anticorps secondaire à chaque diapositive.
    1. S’assurer que le tissu est entièrement couvert par le mélange d’anticorps. Incuber pendant 2 h à température ambiante dans la chambre humidifiée dans le noir.
  7. Enlever le mélange d’anticorps secondaire par aspiration et transférer la lame dans un verre à coloration jar contenant 30 mL du SCT (aucun Triton). Laver pendant 5 min avec un mélange doux dans un agitateur orbital. Répéter l’étape de lavage avec frais SCT. déposer 100 à 150 µL de contre-colorant DAPI 0,1 µg/mL dans chaque diapositive et incuber pendant 10 min à température ambiante dans l’obscurité.
  8. Transférer les diapositives à un verre bocal contenant du SCT de coloration et laver 3 fois avec un mélange doux de 5 min chacun, à l’aide du SCT frais pour chaque lavage. Excès loin de tampon mèche.
  9. Appliquer 3 gouttes de milieu de montage aqueux pour le tissu. À l’aide de pinces, abaissez doucement une lamelle de verre propre sur le tissu, en commençant par un bord et abaisser lentement l’autre bord pour éviter le piégeage de bulles d’air. Prendre soin de ne pas pour déloger la lamelle si imagerie immédiatement. Sinon, laisser sécher avant de les stocker à 4 ° c dans l’obscurité, le milieu de montage.

4. La microscopie en fluorescence

  1. tournant sur la lampe à fluorescence, le microscope et l’ordinateur et laisser réchauffer pendant 15 min. Place le tissu taché les lames dans le stade de microscope de fluorescence de la lampe. L’image du champ lumineux permet de localiser le tissu à un grossissement de 10 x.
  2. Une goûte de ddH 2 O à la surface de la lamelle couvre-objet et utilisez un objectif d’immersion de l’eau 20 x (NA = 1,0). Sélectionnez le scan de plan moyen 4 lignes définissant. Définir la taille de trou d’épingle à 1 unité aérée qui donne une tranche optique de ~ 3 microns. Choisissez les laser d’excitation et d’émission longueurs d’onde pour chaque fluorophore dans des pistes séparées pour la meilleure qualité de signal.
    NOTE : Alexa 488 : λ ex = 488 nm (laser à l’argon) λ em = 493-570 nm ; Texas Red : λ ex = 561 nm (laser de DPSS 561 nm), λ em = 601-635 nm ; DAPI : λ ex = 405 nm (laser Diode 405), λ em = 410-507 nm.
    1. Régler la puissance du laser et réglages pour optimiser l’intensité du signal pour chaque piste de gain. Collecter l’image composite et sauver. Utiliser les mêmes paramètres de laser pour comparer les intensités de fluorescence dans une diapositive différente.
  3. Pour la visualisation de l’intensité de la fluorescence dans chaque canal, installer la macro d’outils profil RVB pour ImageJ 10. Enregistrez la macro à partir de la page Web comme un fichier texte (https://imagej.nih.gov/ij/macros/tools/RGBProfilesTool.txt). Dans le menu de ImageJ, sélectionnez Plugins - > Macros - > installer ; Sélectionnez le fichier texte pour installer l’outil de profils RVB.
    1. Ouvrir le fichier image confocale dans ImageJ et convertir les images composites depuis les 3 piles en RVB en procédant comme suit : Image - > Color - > outil de canal. Sélectionnez " Composite " depuis le menu déroulant et vérifier tous les trois canaux. Puis, sélectionnez Image - > Type - > couleur RVB.
    2. Sélectionner l’icône d’outils profil RVB et tracez une ligne à travers la section dans l’image que nous vous présentons. Enregistrer les données d’intensité dans une feuille de calcul pour le traçage.

Résultats

L’étape de prétraitement photobleaching peut être ajoutée à un protocole standard d’immunofluorescence immédiatement avant la recherche d’antigène et immunostaining (Figure 1 a). Assemblage de l’appareil de photoblanchiment peut également être effectuée à l’aide de divers, composants sur étagère peu coûteux (Figure 1 b). Le spectre d’émission du phosphore blanc LED couvre un large éventail de longueurs...

Discussion

Le prétraitement de photoblanchiment de tissus visés dans ce manuscrit permet une élimination effective d’autofluorescence utilisant des composants sur étagère. Le protocole décrit l’imagerie immunofluorescence des agrégats de protéine tau phosphorylée dans les tissus fixés au formol un cerveau humain en utilisant des anticorps secondaires conjugués à Alexa 488 et Texas Red, au DAPI comme contre-colorant nucléaire. Pour appliquer la méthode à d’autres tissus, nous recommandons de procéder à un trai...

Déclarations de divulgation

Les auteurs n’ont rien à divulguer.

Remerciements

Cette étude a été financée en tout ou en partie par le Consortium canadien de neurodégénérescence et vieillissement (CCNA), l’Institut canadien de recherche en santé (IRSC), la société de la SLA de SLA (Canada) et la société Alzheimer du Canada (sac). Les auteurs aimeraient remercier Sultan Darvesh et Andrew Reid de la Maritime cerveau Banque de tissus pour fournir les tissus cérébraux FTLD, Gauthier de Milan depuis le programme ciblant les spatio-temporelle et Amplification de rayonnement réponse (STTARR) et ses affiliés bailleurs de fonds pour le tissu l’incorporation et la section des services et le Advanced optique Microscopy Facility (AOMF) pour fournir des instruments de microscopie. Kevin Hadley est remerciée pour l’examen critique du manuscrit.

matériels

NameCompanyCatalog NumberComments
Trizma BaseSigma-AldrichT6066
Sodium CholorideSigma-AldrichS7653
Hydrochloric AcidCaledon Laboratory Chemicals1506656
Sodium AzideBioShop CanadaSAZ001
100 mm x 100 mm x 20 mm Pitri dishSarstedt82.9923.422All components of photobleacher can be substituted based on availability
6 W LED Dimmable Desk LampDBPowerDS501All components of photobleacher can be substituted based on availability
Citric AcidSigma-AldrichC-2404
Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA)BioShop CanadaEDT001
Tween 20Sigma-AldrichP-7949
Sodium HydroxideBioShop CanadaSHY700.1
Water bathHaake FisonsK15
Slide collectorFisherScientific12-587-17B
Staining JarFisherScientificE94
Orbital ShakerBellco Glass 7744-08115
Triton X-100Sigma-AldrichT7878
Bovine Serum AlbuminFisherScientificBP1600-1
Normal Goat SerumAurion905.002
Hydrophobic penSigma-AldrichZ672548-1EA
Phospho-Tau (Ser202, Thr205) Monoclonal Antibody (AT8)ThermoFisherMN1020
Goat anti-Mouse Secondary Antibody, Texas Red-XThermoFisherT862
Goat anti-Mouse Secondary Antibody, Alexa Fluor 488ThermoFisherA-11029
DAPISigma-AldrichD9542
Mounting mediumThermoScientific28-600-42
Glass soverslip
Confocal MicroscopeZeissLSM710
Imaging software ZEN 2012 Black Edition 11.0ZeissLSM710Software accompanies the Confocal Microscope
ImageJNIHhttps://imagej.nih.gov/ij/download.html
RGB Profile Tools macroNIHhttps://imagej.nih.gov/ij/macros/tools/RGBProfilesTool.txt
Commercial chemical quencherBiotum23007

Références

  1. Banerjee, B., Miedema, B. E., Chandrasekhar, H. R. Role of basement membrane collagen and elastin in the autofluorescence spectra of the colon. J Investig Med. 47 (6), 326-332 (1999).
  2. Terman, A., Brunk, U. T. Lipofuscin . Int J Biochem Cell Biol. 36 (8), 1400-1404 (2004).
  3. Del Castillo, P., Llorente, A. R., Stockert, J. C. Influence of fixation, exciting light and section thickness on the primary fluorescence of samples for microfluorometric analysis. Basic Appl Histochem. 33 (3), 251-257 (1989).
  4. Ottis, P., Koppe, K., et al. Human and rat brain lipofuscin proteome. Proteomics. 12 (15-16), 2445-2454 (2012).
  5. Sun, Y., Chakrabartty, A. Cost-effective elimination of lipofuscin fluorescence from formalin-fixed brain tissue by white phosphor light emitting diode array. Biochem Cell Biol. 94 (6), 545-550 (2016).
  6. Davis, A. S., Richter, A., et al. Characterizing and Diminishing Autofluorescence in Formalin-fixed Paraffin-embedded Human Respiratory Tissue. J Histochem Cytochem. 62 (6), 405-423 (2014).
  7. Zimmermann, T., Rietdorf, J., Pepperkok, R. Spectral imaging and its applications in live cell microscopy. FEBS Lett. 546 (1), 87-92 (2003).
  8. Duong, H., Han, M. A multispectral LED array for the reduction of background autofluorescence in brain tissue. J Neurosci Methods. 220 (1), 46-54 (2013).
  9. Albeanu, D. F., Soucy, E., Sato, T. F., Meister, M., Murthy, V. N. LED arrays as cost effective and efficient light sources for widefield microscopy. PLoS One. 3 (5), 1-7 (2008).
  10. Schneider, C. A., Rasband, W. S., Eliceiri, K. W. NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis. Nat Methods. 9 (7), 671-675 (2012).
  11. Robertson, J. B., Zhang, Y., Johnson, C. H. Light-emitting diode flashlights as effective and inexpensive light sources for fluorescence microscopy. J Microsc. 236 (1), 1-4 (2009).
  12. Mackenzie, I. R. A., Neumann, M. Molecular neuropathology of frontotemporal dementia: insights into disease mechanisms from postmortem studies. J Neurochem. 138 (S1), 54-70 (2016).
  13. Kouri, N., Whitwell, J. L., Josephs, K. A., Rademakers, R., Dickson, D. W. Corticobasal degeneration: a pathologically distinct 4R tauopathy. Nat Rev Neurol. 7 (5), 263-272 (2011).

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