Préparation d’îlots fœtaux de primates non humains congelés pour le séquençage combiné de l’ARN à noyau unique et du séquençage ATAC, et la métabolomique en vrac

Nous utilisons un modèle de primate non humain hautement translationnel pour évaluer comment l’alimentation maternelle et la consommation de médicaments pendant la grossesse influencent le développement embryonnaire et la fonction postnatale des îlots pancréatiques chez la progéniture. Des changements programmés par le développement pourraient modifier la susceptibilité à la maladie plus tard dans la vie. Lorsque l’on travaille avec des échantillons difficiles à acquérir, tels que ceux provenant de primates non humains, il est difficile d’évaluer efficacement plusieurs questions provenant du même individu.

Malheureusement, l’extraction simultanée d’informations du métabolome et du génome peut être difficile en raison de l’incompatibilité des réactifs de dosage dans la dégradation sensible au temps des molécules à quantifier. Notre protocole permet l’extrapolation de l’abondance des métabolites, de l’accessibilité de la chromatine et de l’expression différentielle des gènes à partir du même matériel de départ. Cette approche à plusieurs niveaux donne un aperçu de la façon dont le métabolisme peut modifier le génome des îlots pancréatiques.