Method Article
כאן, אנו מציגים פרוטוקול לחקור את התכונות המכניות התאיות של תאי זברה עובריים מבודדים בכליאה תלת מימדית עם מדידת כוח ישירה על ידי מלכודת אופטית.
במהלך התפתחותו של אורגניזם רב תאי, תא מופרית יחיד מתחלק ומוליד רקמות מרובות עם פונקציות מגוונות. מורפוגנזה רקמות הולך ביד עם שינויים מולקולריים ומבניים ברמת התא הבודד שתוצאתם וריאציות של תכונות מכניות תת תאיות. כתוצאה מכך, אפילו בתוך אותו תא, אברונים ותאים שונים להתנגד באופן שונה לחצים מכניים; ומסלולי mechanotransduction יכול לווסת באופן פעיל את המאפיינים המכניים שלהם. היכולת של תא להסתגל למיקרו-סביבה של נישה הרקמה ולכן נובעת בחלקה מהיכולת לחוש ולהגיב ללחצים מכניים. לאחרונה הצענו פרדיגמת מינוזנסציה חדשה שבה עיוות ומיקום גרעיניים מאפשרים לתא לאמוד את הסביבה התלת-ממדית הפיזית ומעניקים לתא תחושה של פרופריוספציה כדי לפענח שינויים בצורת התא. במאמר זה אנו מתארים שיטה חדשה למדידת הכוחות ומאפייני החומר המעצבים את גרעין התא בתוך תאים חיים, המודגמים על תאים דבקים ותאים מוגבלים מכנית. המדידות יכולות להתבצע באופן לא פולשני עם מלכודות אופטיות בתוך תאים, והכוחות נגישים ישירות באמצעות זיהוי ללא כיול של תנופת אור. זה מאפשר למדוד את המכניקה של הגרעין באופן עצמאי מן העיוותים פני התא ומאפשר ניתוח של נתיבי mechanotransduction exteroceptive ו interoceptive. חשוב לציין, ניתן לשלב את ניסוי ההשמנה עם מיקרוסקופיה אופטית כדי לחקור את התגובה התאית ואת הדינמיקה התת-תאית באמצעות הדמיית פלואורסצנטיות של הציטוסקלטון, יוני הסידן או המורפולוגיה הגרעינית. השיטה המוצגת היא פשוטה ליישום, תואמת פתרונות מסחריים למדידות כוח, וניתן להרחיב אותה בקלות כדי לחקור את המכניקה של תאים תת-תאיים אחרים, למשל, מיטוכונדריה, סיבי מתח ואנדוזומים.
מורפוגנזה של רקמות הוא תהליך מורכב שבו אותות ביוכימיים וכוחות פיזיים מתואמים באופן מרחבי. בעובר המתפתח, שיפועים של גורמי איתות ביוכימיים מכתיבים את מפרט הגורל ומבטיחים דפוסי רקמות נכונים 1,2. יחד עם זאת, כוחות פנימיים וחיצוניים ממלאים תפקיד בבניית הארכיטקטורה של העובר3,4. ההשפעה של מכניקת קליפת המוח התאית בהקשר זה נחקרה בהרחבה 5,6. החיבור ההדוק בין תהליכים מכניים-כימיים במהלך מורפוגנזה מסתמך על המאפיינים של תאים בודדים לחוש ולהגיב לכוחות מכניים במיקרו-סביבה של הרקמה שלהם. תאים, ובכך לפענח אותות מכניים באמצעות נוכחות של אלמנטים תת-תאיים ומולקולריים רגישים לכוח המעבירים מידע מכני למסלולי איתות ספציפיים השולטים בהתנהגות התאים, בגורל התא ובמכניקת התאים.
סימן ההיכר של תהליכים התפתחותיים הוא שתאים מתארגנים כקבוצות לבניית מבנים רב-תאיים. ככזה, תאים בודדים לעתים רחוקות לסדר מחדש ולנוע לבד אבל קשורים סוציוטופה הדוקה שבו הם מראים התנהגות קולקטיבית כגון הגירה על-תאית7, (un)שיבוש מעברים8,9 או דחיסת blastocyst10. כוחות מכניים הנוצרים בתוך ובין התאים משמשים כרמזים חשובים להנחיית דינמיקת תאים קולקטיבית7,11. אבל גם כאשר תאים נעים לבד, כגון תאים אבהיים שסוחטים את דרכם בין יריעות רקמות או נישות רקמות צרות, הם חווים כוחות מכניים אניסוטרופיים נרחבים בעת ניווט בסביבה תלת ממדית. ללחצים מכניים אלה על תאים יש השלכות עמוקות על התנהגות התאים12,13. מספר מנגנונים נחקרו המתכנסים על הגרעין כאלמנט mechanotransduction העיקרי14,15, כאלמנט מכני פסיבי או פעיל במהלך הנדידה בתוך סביבת רקמה תלת-ממדית צפופה15,16.
לאחרונה הצענו מנגנון שמצייד תאים למדידת עיוותי צורה באמצעות הגרעין כמכנו-מד תאי אלסטי12. הגרעין, בהיותו האברונית הגדולה ביותר בתא, עובר עיוותים גדולים כאשר תאים מקוטבים, נודדים או משנים את צורתם תחת מתיחה מכנית, כליאה או מתח אוסמוטי16,17,18,19. מצאנו כי מעטפה גרעינית למתוח יחד עם המיקום התאי של הגרעין מספק תאים עם מידע על סדר הגודל וסוג של עיוות התא (כגון דחיסת תאים לעומת נפיחות תאים). מתיחה של הגרעין קשורה להתפתחות של הממברנה הגרעינית הפנימית (INM), אשר מקדם cPLA2 תלוי סידן (פוספוליפאז A2) פעילות ליפאז ב- INM ואחריו שחרור של חומצה ארכידונית (AA) והפעלה מהירה של מיוזין II בקליפת התא. זה מוביל להתכווצות תאים מוגברת ונדידת תאים אמבואואידית מעל סף של התכווצות קליפת המוח6. התגובה המכנית לעיוות התא מתרחשת תוך פחות מדקה והיא הפיכה עם שחרור הכליאה, דבר המצביע על כך שהגרעין פועל כמד מאמץ עבור פרופריוספציה תאית המסדירה את התנהגות התא האדפטיבית בתנאי לחץ מכניים. מסלול מכני זה מוצג כפעיל בתאי גזע של אבות המופקים מעוברי דגי זברה, הן בתאים פלוריפוטנטיים והן בתאים מחויבים לשושלת שושלת12 והוא נשמר במינים שונים ובקווי תאים20.
בנוסף למאפיינים הגרעיניים כמכנוזנסור תאים, ארכיטקטורה גרעינית ומכניקה מוסדרות באופן מהותי במהלך הפיתוח ובתגובה למפרט גורל התא21, ומכאן כוונון רגישות המכנית התאית22,23. התוצאה עשויה להיות שינוי בציות הגרעיני המאפשר שינויים מורפולוגיים ומעברים מקדם-כבידה למצב נודד ולהיפך8.
מספר טכניקות למדידת מכניקת גרעין התא יושמו, כגון מיקרוסקופיה של כוח אטומי24,25, שאיפה מיקרופיפט26,27, טכנולוגיה מיקרופלואידית28 ומיקרונידלס29. עם זאת, רבות מהטכניקות הללו פולשניות במובן זה שיש לעוות את התא כולו, מה שמגביל את מדידת המאפיינים המכניים ואת התגובות התלויות בכוח של הגרעין עצמו. כדי לעקוף את העיוות בו זמנית של פני השטח של התא וקליפת המוח המכנית שלו30, גרעינים מבודדים נחקרו בהקשרים שונים31,32. עם זאת, לא ניתן לשלול כי בידוד גרעיני קשור לשינוי במאפייני הגרעין המכני וברגולציה שלהם (התייחסות24 ותצפיות שלא פורסמו).
פינצטה אופטית (OTs) היא טכנולוגיה רב-תכליתית שאפשרה שפע של ניסויים במכנוביולוגיה של תאים והיוו אינסטרומנטלי בהבנתנו כיצד מכונות מולקולריות ממירות כימיקלים לאנרגיה מכנית33,34. פינצטה אופטית משתמשת בקרן לייזר ממוקדת היטב כדי להפעיל כוחות אופטיים על חלקיקים דיאלקטריים בעלי אינדקס שבירה גבוה יותר מהמדיום הסובב. כוחות כאלה יכולים להיות בסדר גודל של מאות פיקו-ניוטון ולגרום לכליאה יעילה של החלקיק בתוך מוקד מלכודת הלייזר, המאפשר מניפולציה של החלקיק הלכוד בשלושה ממדים. לשימוש באור יש יתרון חשוב בכך שניתן לבצע את המדידה באופן לא פולשני בתוך תאים חיים. מניפולציות אופטיות מוגבלות עוד יותר למיקוד המלכודת של קרן הלייזר. לפיכך, המניפולציה יכולה להתבצע מבלי לעורר את הממברנות התאיות שמסביב ואינה מטרידה את קליפת המוח האקטין או תהליכים mechanosensitive בקרום הפלזמה, כגון הפעלה תלוית כוח של תעלות יונים.
הקושי של גישת הפינצטה האופטית הוא לקבוע במדויק את הכוחות המוחלים על המיקרוספירה באמצעות גישות קלאסיות המסתמכות על כיול כוח עקיף המבוסס על משפט השווי-חלקיקים או על שימוש בכוחות סטוקס-גרירה מוגדרים כדי למדוד כוח בריחה תלוי כוח לייזר35. בעוד ששיטות אלה פשוטות ליישום בניסוי במבחנה, בדרך כלל לא ניתן לתרגם אותן לסביבה תאית. מספר אסטרטגיות הוכנסו לשטח המסתמכות על כיול כוח ישיר, הנגזר מהעקרונות הראשונים של שימור המומנטום36,37. שלא כמו גישות ספקטרוסקופיות כוח אחרות, מדידות כוח מושרות מחילופי אור מקומיים עם החלקיק הלכוד בעל הצורה השרירותית 38,39. במערך הניסיוני שלנו, שינויים בתנופת האור הנובעים מכוחות אופטיים נמדדים ישירות ללא צורך בכיול מלכודת מיקום40,41,42,42,43. לכן, המדידות הופכות לאפשריות בסביבה צמיגה כגון פנים התא או אפילו בתוך רקמה, וכוחות ניתן לכמת בקלות עד לרמת pN.
בפרוטוקול זה, אנו מתארים בדיקה לתפעל באופן מכני אברונים או מבנים תאיים ולהעריך כמותית את המאפיינים המכניים שלהם על ידי הגדרת פינצטה אופטית. הגדרה זו משולבת במיקרוסקופ פלואורסצנטי של דיסק מסתובב המאפשר הדמיה מקבילה של התנהגות תאית או דינמיקה תאית. הבדיקה מאפשרת אפיון של המאפיינים המכניים של תאים תאיים ספציפיים, כגון הגרעין, ובו זמנית ללמוד את mechanoresponse אפשרי והפעלה של מסלולי איתות מולקולרי כתוצאה מהעיוות עצמו. יתר על כן, השמנה אופטית של מיקרואורגניזמים מוזרקים בתוך התאים מאפשרת עלייה בכוח הכניסה הודות לאינדקס שבירה גבוה בהרבה של חרוז הפוליסטירן (n = 1.59) בהשוואה לשבירה הפנימית 44 של הגרעין (n ~ 1.35) לעומת ציטופלסמה (n ~ 1.38). ניתן להתאים בקלות את האסטרטגיה המוצגת לחקר מבנים ואברונים תאיים אחרים, כמו גם לגישות אחרות הכרוכות במיקרו-ולוגיה פעילה, שימוש במלכודות אופטיות מרובות כדי לחקור את אותם מבנים תת-תאיים שונים בו זמנית, ומדידות המתמקדות במכנוביולוגיה של תאים בעובר החי.
כל הפרוטוקולים בהם נעשה שימוש אושרו על ידי הוועדה המוסדית לטיפול בבעלי חיים ולשימוש (PRBB-IACUEC) ויושמה על פי תקנות לאומיות ואירופאיות. כל הניסויים בוצעו בהתאם לעקרונות של 3Rs. דגי זברה (דניו ריו) נשמרו כפי שתואר בעבר.
1. הכנת תאי גזע עובריים ראשוניים מבודדים של דגי זברה
2. הכנה והכתמה של תא יחיד
3. הכנת תאי השמנה אופטיים באמצעות ריווח פולידימתילסילוקסן (PDMS)
הערה: מדידות כוח אופטיות המבוססות על זיהוי מומנטום אור דורשות לכידה של כל האור היוצא מהמלכודות האופטיות40. עבור החוסן של גורם הכיול invariant α (pN /V), התפלגות האור במישור המוקד האחורי (BFP) של חיישן הכוח האופטי חייבת לשאת התאמה מדויקת לתנופת הפוטון. זה קובע את המרחק מפני השטח של העדשה האוסף למישור הלכידה לכ -2 מ"מ, שהוא הגובה המרבי של תאי ההשמנה האופטיים.
4. אפשרויות חלופיות עבור מרווח תא OT
הערה: ניתן לבצע שלבים אלה אם אין סדנת מיקרו-פבריקציה או מעיל ספין זמינים.
5. הגדרת המלכודת האופטית למדידות תאיות
הערה: השלבים הבאים ממוטבים לפלטפורמת פינצטה אופטית מסחרית הכוללת מודול מיקרו-מניפולציה אופטי המבוסס על הסטה אקוסטו-אופטית (AOD) וחיישן כוח אופטי המבוסס על זיהוי ישיר של שינויים בתנופת האור (איור 2, reference12,40,49). פרטים ורכיבים אופטיים של ההגדרה ניתן למצוא באיור 2F. כדי לבחון עיוות שנגרם על ידי כוח במהלך מניפולציות פינצטה אופטית, מיקרוסקופ קונפוקו ספינינג-דיסק Nipkow מצמיד לתוך היציאה השמאלית של מיקרוסקופ הפוך להדמיית פלואורסצנטיות צבע כפול. ללא חוסר כלליות, ניתן ליישם פרוטוקול זה עם כל מערכת OTs דינמית המצוידת במדידות כוח ישירות המבוססות על זיהוי מומנטום אור. הליכים מפורטים שלב אחר שלב זמינים לבניית השמנות הדרגתיות אופטיות ביתיות עבור יישומי vivo50. אלה המבוססים על אפנון AOD להתבלט עבור ניסויים בסופו של דבר עם מלכודות מרובות ומדידות מהירות51,52. מספר פרוטוקולים לבניית מכשיר מבוסס תנופה אור קיימים בספרות36,39,40,53, וכל שיטת הדמיה אחרת (ניגוד הפרעות דיפרנציאליות, פלואורסצנטיות רחבת שדה וכו ') יכולה להיות מועסקת.
6. אופטימיזציה פינצטה אופטית
הערה: מדידת הכוח הישיר מסתמכת אך ורק על שינוי תנופת האור הנובעת מהכוח המופעל על החלקיק הלכוד, ולכן, בניגוד לשיטות עקיפות, אין צורך לכייל נוקשות מלכודת לפני כל ניסוי. ההמרה הספציפית לכלי של גורם הסטה/כוח (α; pN/V, reference41) מכוילת על ידי היצרן ולכן היא ניסוי invariant. עם זאת, מכיוון שנקודת הלייזר עוברת מניפולציה על שטח של 70 מיקרומטר x 70 מיקרומטר, שלבים 6.2-6.5 הם קריטיים כדי להבטיח השמנה ויציבות הספק אופטימלית. השלבים הבאים מסופקים בתוכנת היצרן כך ש- OTs מקבלים מיטוב מעל אזור העבודה באופן חצי אוטומטי.
7. ספינינג דיסק קונפוקלי מיקרוסקופיה
8. ביצוע ניסויי חריץ הגרעין
הערה: כבה תמיד את המלכודות האופטיות - הן באמצעות תוכנה והן סגירת התריס ביציאת epifluorescence 2 - בעת הרמת מודול חיישן הכוח ושינוי המדגם. אם לא, נזק חמור לאלמנטים אופטיים והנסיין עלול להתרחש. היזהרו עם המרחק הרוחבי בין מחזיק העדשה לקצה המנה התחתונה כשאתם מחפשים תאים כדי להימנע מהתנגשות העדשה בצלחת הבמה/התרבות (איור 2).
מיקרו-ג'ינטציה של חרוזים לוכדים:
מיקרוספרות שהוזרקו לעובר דגי הזברה של תא אחד התפשטו על כל מכסה בעלי החיים במהלך מורפוגנזה. להדמיה ברורה יותר, חזרנו על פרוטוקול ההזרקה עם מיקרואורגניזמים פלואורסצנטיים אדומים וצילמנו תמונות נפחיות עם מיקרוסקופ הקונפוקלי שלנו בשלבים התפתחותיים שונים. באיור 4A-D, חרוזים מוזרקים מתוארים בציטופלסמה של תאי גזע של אבות ב-vivo ב-5 hfp. מאוחר יותר, מיקרוספרות הופיעו פרושות על כל העובר במהירות של 24 כ"ס (איור 4E). עוברים בשני השלבים התפתחו כרגיל ושיעורי ההישרדות היו דומים לעוברים שאינם מוזרקים או מוזרקים מדומים (ראו איור S3). זה עולה בקנה אחד עם מחקרים אחרים המדווחים על הישרדות בלתי מעורערת של דגי זברה מוזרקים חרוזים עד 5 ימים לאחר ההפריה55.
המיקרוסקופ הקונפוקלי של הדיסק המסתובב שלנו תואם למיקרוסקופיה פלואורסצנטית רב-ערוצית. באיור 5A, אנו מראים תאי גזע מבודדים עם חרוז אחד או שניים בציטופלסמה. ניתן להשתמש בתוויות פלואורסצנטיות מרובות כדי לחקור היבטים שונים של התא (איור 5B). ניתן לעקוב אחר מורפולוגיה גרעינית באמצעות צבע Hoechst או באמצעות ביטוי H2A::mCherry mRNA, בעוד קרום גרעיני פנימי ניתן לנתח עם Lap2b-eGFP12. דינמיקה של קליפת המוח actomyosin, כמו גם רמות סידן תאיים, ניתן לראות עם My12.1:::eGFP קו מהונדס56 ו Calbryte-520 דגירה, בהתאמה. הפרוטוקול שתואר כאן נועד להשוות את מכניקת גרעין התא של תאי בר משותקים על מצעים דביקים (המכונים מאוחר יותר השעיה) ובכליאה מכנית. תאי גזע מבודדים הכלואים במיקרוצ'מברים בגובה 10 מיקרומטר הציגו התפתחות חלקית של הממברנה הגרעינית הפנימית (INM) ועלייה מאוחרת יותר בהתכווצות actomyosin12. באיור 5C מוצגים תאים סגורים עם חרוז אחד או שניים בציטופלזמה. כליאה מוצלחת תהיה גלויה באמצעות תאים שטוחים ומורחבים עם חתך רחב יותר של הגרעין. הממברנה הגרעינית נפתחת עוד יותר בתאים סגורים ואמורה להיראות מוחלקת בהשוואה לתאים בהשעיה (איור 5C).
ניתוח כוח-זמן ועיוות כוח
ניתוח התוצאות שהושגו תלוי מאוד בדגימה הנחקרת ובשאלת העניין ולכן לא ניתן להכליל אותן כאן. כדוגמה, דרך נפוצה לנתח מדידת כניסה היא לחלץ מודולוס של יאנג על ידי התאמת מודל הרץ שונה לנתוני כניסת הכוח57. עם זאת, ההנחה לטיפול כזה צריכה להיות מוערכת בקפידה ולא תמיד להיות מוצדק כראוי (כגון המבנה הנחקר להיות איזוטרופי, הומוגני, עם גמישות ליניארית וכניסות להיות קטן יותר מרדיוס חרוזים). לכן אנו רואים כאן רק מדידות עצמאיות למודל המאפשרות להשוות את ההתנהגות המכנית של המבנה הנחקר בין תרחישים ניסיוניים שונים.
כנקודת התחלה, מדידת השיפוע של עקומת תזוזת הכוח בעומק כניסה מסוים מספקת מידה של קשיחות מבנית עצמאית מודל58 של הגרעין. לאחר מכן ניתן לאסוף ערך זה מדגימות מרובות ולהשוות אותו בין הגדרות ניסיוניות משתנות לבין הפרעות מדגם.
מדידת כניסה
בשורות הבאות, אנו מתמקדים בתגובה המכנית של גרעין התא במהלך עיוות התא בכליאה. ניסויים בשלב 8 של פרוטוקול זה בדרך כלל להוביל פסגות כוח של עד 200 pN עבור עומקים כניסה של כ 2-3 מיקרומטר. עם זאת, ערכים אלה יכולים להיות שונים במידה רבה, בהתאם לסוג התא ולתנאים הניסיוניים, עם גרעינים רכים יותר המובילים לכוח נמוך יותר עבור כניסה נתונה. לכן יש צורך למדוד במדויק את העיוות הגרעיני, יחד עם כוח, לאפיון מכני מדויק של גרעין התא. בחלק זה, נקבל את הנוקשות הגרעינית של התא ממדידות כניסת כוח ייצוגיות.
באיור 6, אנו מציגים את העיוותים של הצדדים הדיסטליים והקרובים של גרעין בתא תלוי ומרותק. ניתן לראות התנהגות מכנית עשירה. בתא מושעה טיפוסי על מצע דבק, הגרעין הוכנס בחוזקה על ידי החרוז, אך גם נעקר מעט על ידי אירועי דחיפה חוזרים ונשנים. מדדנו את כניסת החרוזים לגרעין על ידי ניתוח הקימוגרפים שהתקבלו מהדמיית פלואורסצנטיות של גרעיני תאים מוכתמים בהוכסט. הקימוגרפות חושבו בקלות באמצעות תוסף Multi Kymograph של פיג'י לאורך כיוון הכניסה (איור 6A,B) ויובאו ל- Matlab (גרסה 2021, Mathworks) לעיבוד נוסף. פונקציית שלב הותאמה לפרופיל העוצמה הגולמית במטרה לעקוב אחר הקצוות המפרידים של הגרעין לאורך המסלול של שגרת הכניסה. כפי שניתן לראות, הוא נושא מידע מדויק על השינוי הגרעיני בצורתו (איור 6 ואיור S2). השתמשנו בעקומה הכפולה-סיגמואידית הבאה כגרסה אנליטית של פונקציית שלב:
(משוואה 1)
כאן, x1 ו- x2 מציינים את הקצוות הדיסטליים והפרקסימליים של הגרעין, בעוד ש- A ו- B הם הערכים המקסימליים והרקעיים של הערוץ הכחול (צבע הוכשט) של התמונה (איור 6B). רוחב הקצה נחשב (e0 = 0.25 מ"מ). בעוד שקצה הגרעין הפרוקסימלי (x2) בעל הסט פנימה עקב אחר המסלול המיושם על ידי שגרת המלכודת האופטית לאחר מגע המיקרוספירה-גרעין, הקצה ההפוך, הדיסטלי (x1) מציג דינמיקת הרפיה כצפוי עבור חומר ויסקולסטי כגון הציטופלסמה (איור 6D). לעומת זאת, גרעינים בתאים הסגורים במיקרו-צ'מברים בגובה 10 מיקרומטר אינם מפגינים התנהגות טרנסלוקציה כזו של הגרעין עם הכניסה לתא (איור 6B,D). כמו כן, באיור 6D, הקצוות האחוריים של הגרעינים נותרים ללא שינוי על ידי החרוז הדוחף מהצד הפרוקסימלי, ככל הנראה בשל כוחות חזקים יותר הנובעים התכווצות התא וחיכוך הפועלים נגד כוח הכניסה. כדי לקבל את עומק העיוות הנכון, ההעתק x1 הופחת מהמדד המוזרם x2: Δx = x2 - x1 (ראו גם איור 6D).
כפה ניתוח נתונים
הכוח הגורם לעיוות גרעיני נמדד מהשינוי בתנע האור שמקורו במיקרואורגניזם הלכוד אופטית (איור 7A). הכוח בעת החלת מסלולים טרפזיים (שלב 8.4.3, איור 7B) גדל בתחילה באופן ליניארי עד שהמלכודת הפסיקה לנוע, אך לאחר מכן נרגע לערך מצב יציב. התנהגות זו הצביעה על חומר ויסקולסטי המציג אובדן ומדולי אחסון. מיד לאחר אירוע הכניסה, הכוח הגיע לערך שיא, Fp, ואחריו הרפיה בלחץ (איור 7C):
(משוואה 2)
כאשר F0 הוא הכוח המאוחסן עבור הרכיב האלסטי ו- f(t) היא פונקציית הרפיה ללא ממדים. ניתחנו התנהגות זו בשלוש דרכים:
1. בהתחשב במוצק ליניארי סטנדרטי עם הרפיה מעריכית בלחץ, כלומר, f(t) = e-t/τ, המיוצג באופן סכמטי באיור 7C.
2. שימוש בריקבון כללי, כפול אקספוננציאלי:
F(t) = A + B1e-t/τ1 + B2e-t/τ2.
3. שימוש בחוק כוח ואחריו ריקבון מעריכי59:
f(t) = t-pe-t/τ, המצויד באיור 7C.
בעוד שההתאמה לדגם 1 יכולה להתבצע בצורה פשוטה, אנו ממליצים להעריך את הניחושים הראשוניים עבור (τ1, τ2) ו- (p, τ) עבור דגמים 2 ו -3, בהתאמה. ניתן לבצע זאת, בהתאמה, על-ידי התאמת קווים לנתונים בקנה מידה לוגריתמי-לעומת-ליניארי (איור 7D, משמאל) ולוגריתמי-לעומת-לוגריתמי (איור 7D, מימין). טבלה S3 מסכמת את התוצאות עבור הדוגמה שניתחה באיור 7. בסעיף הבא נשקול שילוב של חוק כוח וחוק אקספוננציאלי לאפיון מכניקת גרעין התא.
קשר תזוזת כוח
כמו כן, ניתן להשתמש בהגדרה הניסיונית המתוארת כדי להשיג את יחסי תזוזת הכוח של אירועי כניסה מרובים. על-ידי ביצוע שגרות משולשות (שלב 8.4.4, איור 8A), ניתן לקשר את הכוח לעיוות ולהתוות עקומת כניסת כוח. תוצאה מופתית מוצגת באיור 8B, שבו קו בסיס שטוח השתנה בצורה חלקה בשיפוע ברגע שהחרוז בא במגע עם הגרעין. זיהוי נקודת המגע האמיתית בנתונים הרועשים הוא אתגר, ויש לנקוט משנה זהירות כדי לראות אם אזור המגע מתאים לדגמים אלסטיים60. בניסוי מסוים זה, ניתן היה לראות גם כי הכניסות הבאות גורמות לעקומות עם נקודות מגע עמוקות יותר, מה שמעיד על התאוששות איטית מדי של צורה גרעינית לאחר נסיגה חרוזים ושינוי במחזור ההיסטרטי שהוגדר על ידי תכונות החומר הוויסקולסטיות של הגרעין (איור 8C). לכן, החוקר צריך להיות מודע אם זה קורה ולשלב את זה לתוך הצינור האנליטי, או להגביל את מספר המדידות הבאות, כך אפקט זה אינו משנה את המדידה.
מכניקת הגרעין בתאים בהשעיה ותחת 10 מיקרומטר כליאה
הגישה הנ"ל שימשה לניתוח הדינמיקה של הרפיה בלחץ גרעין בתאים מושעים על מצעים דביקים ותאים סגורים. התוצאות שלנו מראות שהכליאה גורמת להרחבת האזור הצפוי (איור 9A), אך שינוי לא משמעותי בנוקשות הגרעינית (איור 9B). מדדנו הרפיה דומה עם τ = 6.08 ± 1.1 s (לא מסוכם) ו τ = 4.00 ± 0.6 s (כליאה), אשר מצביע על פיזור ויסקולסטי מהיר, ואחריו ערך כוח מאוחסן התואם את מודולוס אלסטי של הגרעין. על מנת להסביר וריאציות ניסיוניות, אשר עשויות להיות מיוצרות על ידי תנאים ראשוניים שונים בשגרת הכניסה, כוחות מאוחסנים נמדדו היו מנורמלים לעומק הכניסה, כמו . פרמטר זה מסביר את קשיחות הגרעין ומתאר את הכוח, או את הלחץ, הנחוץ לכניסה מסוימת. השגנו קשיחות דומה תחת כליאה ובתאים לא מוגדרים:
= 20.1 ± 12.6 pN / μm ו
= 24.6 ± 13.6 pN / μm (ממוצע ± סטיית תקן), בהתאמה.
איור 1: מיקרו-הזנה של עוברים דגי זברה בשלב של תא אחד (זיגוטה). (A) צלחת הזרקה: צלחת הזרקה בצורת משולשת משמשת להזרקה. הצלחת עשויה מ-1% אגרווז אולטרה-פור ב-E3 (המדיום של הביצה). תצוגות עליונות וצדדיות מוצגות מימין. (B) מיקום העובר: כוון בעדינות את העוברים באמצעות מברשת וכוון כך שהתא הבודד נראה בבירור ונגיש בקלות עם המחט. אנו מציעים לכוון את העוברים עם התא הממוקם בצד הנגדי של המחט, כפי שמוצג בסקיצה. (ג) הליך הזרקה לתוך העובר שלב תא אחד: לנקב את הכוריון המקיף את העובר ואת התא הבודד עם המחט. ודא כי קצה המחט הוא בתוך התא ולשחרר את הלחץ להזריק. (ד) לדגור על העוברים בטמפרטורה של 28-31 מעלות צלזיוס עד שיתפתחו עד לשלב הבלסטולה (כדור) (4 כ"ס). בצע את פרוטוקול בידוד התא ואת כתמי התא (שלב 2) והכן את תא ההשמנה האופטי עם תאים מבודדים בהשעיה ו/או כליאה בשילוב עם ציפוי משטח המצע המתאים (שלב 3). לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 2: הכנת מנגנון הפינצטה האופטי. (A) שכבות ציפוי ספין של PDMS עם גובה מוגדר על כלים תחתונים מזכוכית. הירידה ב-PDMS תתפרס באופן שווה בגלל הכוח הצנטריפוגלי. (ב) הכנת תא הדגימה מתוך שכבת ה-PDMS. 1: לחתוך ריבוע עם אזמל, 2: לכסות את הבאר הפנימית עם concanavalin A (ConA), לשטוף ולזרע תאים; 3: לכסות עם שקופית זכוכית או להחליק לכסות כדי לאטום את הבאר. (ג) תמונה של חיתוך מרובע עם אזמל והסרת PDMS היטב עם מלקחיים. (D) הרכבה של עדשת האיסוף של חיישן הכוח האופטי מעל תא ההשמנה. טיפת שמן טבילה משמשת כאמצעי טבילה בין העדשה האוסף לכיסוי הזכוכית העליונה. סכמטי לא בקנה מידה. היזהר בעת הורדת העדשה האוסף כדי לא לגעת בכיסוי הזכוכית של צלחת מדגם. (ה) תמונה של יחידת איתור הכוח במגע עם המדגם. (ו) סכמטי של המערך הניסיוני. מודול המיקרו-מניפיולציה האופטי משתמש בקרן לייזר גל רציפה (5W, λ = 1064 ננומטר) עם בקרת הספק דרך צלחת חצי גל (HWP) ומפצל קרן מקוטבת (BS). לאחר מווסת עם זוג AODs, הוא מצמיד ליציאת epifluorescence העליונה של מיקרוסקופ הפוך. קרן הלייזר משתקפת לאחר מכן על ידי מראה דיכרואית קצרה של 950 ננומטר (IR-DM), המאפשרת העברה של עירור פלואורסצנטי ופליטה. לייזר ההשמנה מונחה לתוך החלק האחורי, יציאת אפיפלואורסצנטיות של המיקרוסקופ (הצריח העליון). ה- OTs נוצרים במישור המוקד של עדשה אובייקטיבית לטבילה במים (60x, NA = 1.2). חיישן הכוח האופטי נתון על ידי צריח המיקרוסקופ ולוכד את אור הלייזר היוצא מה- OTs עם עדשת טבילה גבוהה בנפט. במקביל, חיישן הכוח מאפשר תאורת שדה בהיר. יחידת הקונפוקל של הדיסק המסתובב מוצמדת ליציאה השמאלית. הוא מצויד בשני מנועי לייזר משולבים (ILE) השולטים בשבעה לייזרי עירור פלואורסצנטיים ושתי מצלמות sCMOS עם תאורה אחורית, המאפשרים הדמיית פלואורופור כפולה במקביל Abb: TI, Transilluminator; נ.ב., עצירת שדה; AOD, דפלקטור acustooptical; HWP, חצי צלחת גל; מצלמת, מצלמה (G) צילום של ציוד ההשמנה האופטי. עיגול אדום מציין את עדשת ברטרנד, שניתן להחליף לנתיב האופטי באופן ידני. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 3: בחירת הדגימות והפרמטרים הנכונים. (א) תמונה מייצגת של תא גזע מבודד של דגי זברה עם מיקרוספירה אחת הממוקמת קרוב מספיק לגרעין כדי לבצע את ניסוי הכניסה. סרגל קנה מידה = 10 מיקרומטר. (B) מסלול מלכודת למופת; עומק כניסה 5 מיקרומטר; מהירות כניסה = 5 מיקרומטר /s; זמן הרפיה 10 שניות. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
איור 4: לוקליזציה של חיידקים בתוך עוברים של דגי זברה במהלך הפיתוח. 0.5 nL של 1 מיקרומטר חרוזים פלואורסצנטיים אדומים מוזרקים יחד עם GPI-GFP mRNA (100 pg/ עובר, קרום פלזמה) בעוברי WT כדי לדמיין לוקליזציה חרוזים. (א-ד) התפלגות של מיקרוספירה 5 h הזרקת פוסט בתוך עובר רכוב ב 0.75% agarose. (A) תמונת ברייטפילד ופלואורסצנטיות. החרוזים מפוזרים בצורה הומוגנית על פני רקמת העובר כפי שניתן לראות במיקרוגרף קונפוקלי. (B) הקרנה מקסימלית של פלואורסצנטיות קונפוקלית z-מחסנית. החרוזים מקודדים בצבע מסגול לצהוב בהתאם למיקום z שלהם בערימת התמונה. סגול/מגנטה מתאים לחרוזים/תאים החיצוניים ביותר (EVL; שכבת עוטף אפיתל; או תאי גזע של אבות הממוקמים קרוב לפני השטח של EVL), צהוב מתאים לחרוזים הפנימיים (תאים עמוקים של אבות), כפי שמוצג בסקיצה מימין. (C) גזירה והקרנה מרבית של תת-מחסנית של (B) המתאימה לאזור בתיבה הכתומה: חלק גדול מהתאים העמוקים מכילים 1-2 חרוזים. (D) גזירה והקרנה מרבית של תת-מחסנית של (B) המתאימה לתיבת מגנטה: חלק מתאי ה- EVL מכילים 1-2 חרוזים. (E) תמונת ברייטפילד והקרנה מקסימלית של מחסנית z של עובר 24 כ"ס מותקן ב 0.75% אגרווז ומורדם עם tricaine. עוברים היו דגירה מראש עם tricaine במשך 15 דקות. משמאל לימין: מיקרוספרות (קוטר 1 מיקרומטר), GPI-GFP וחפיפת תמונה. החרוזים מופצים בכל גוף העובר. ממד סרגל קנה המידה המצוין בכל חלונית. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 5: תאי גזע מבודדים של דגי זברה עם תיוג שונה. (A) תמונת מיקרוסקופיה אור שידור של תאי השעיה עם 1 (למעלה) או 2 (למטה) חרוזים מוזרקים. חיצי ציאן מצביעים על חרוזים. (B) תמונות קונפוקליות פלואורסצנטיות של תאי השעיה עם כתמים שונים. משמאל למעלה: Lap2b-eGFP (קרום גרעיני פנימי, 80 pg/עובר) ו- H2A-mCherry. מימין למעלה: GPI-GFP (קרום פלזמה, 100 pg/ עובר) ו- DNA-Hoechst (מוכתם כמתואר בסעיף 2). משמאל למטה: MyI12.1-eGFP (קו מהונדס) ו- DNA-Hoechst. מימין למטה: Calbryte488 ו- DNA-Hoechst (מוכתם כמתואר בסעיף 2). (ג) תמונת מיקרוסקופיה של אור שידור של תאים מוגבלים עם 1 (למעלה) או 2 (למטה) חרוזים מוזרקים. חיצי ציאן מצביעים על חרוזים. סרגלי קנה מידה = 10 מיקרומטר. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 6: הערכת עיוות גרעיני מסרטי דיסק מסתובבים. (A,B) זמן לשגות של ניסוי חריץ של הגרעין ב(A) תא מושעה ו-(B) תא מוגבל. סרגל קנה מידה 10 מיקרומטר. תמונות מייצגות של גרעינים המסומנים על ידי Hoechst מוצגות 5 שניות לפני, במהלך, ו 5 שניות לאחר הכניסה עם מיקרוספירה לכודה אופטית (ראש חץ לבן). קימוגרפיות לאורך מקטע הכניסה (קו אדום, החלונית הימנית). x1 ו- x2 הם הגבולות הדיסטליים והפרוקסיביים (קרוב לחרוזים) של הגרעין במהלך ניסוי הכניסה שחולצו מההתאמה של פרופיל האינטנסיביות למשוואה 1. (ג) פרופילי עוצמה לאורך מקטע הכניסה עבור שלוש מסגרות שונות (לפני, במהלך ואחרי הכניסה) והותאמו למשוואה 1 כדי להעריך את המיקומים הדיסטליים, ה- x1 והקומקסימליים, x2, של קצות הגרעין. (D) מסלולים מייצגים של x1(t) בכחול ו- x2(t) בענבר במהלך ניסוי כניסה של תאים מושעים ומוגבלים (10 מיקרומטר). אזורים מוצללים מציינים את הכניסה, המרחק בין x1 ל- x2 מציין את קוטר הגרעין. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 7: עיבוד אותות כוח. (א) סכמטי של מיקרוספירה לכודה אופטית מעוותת את גרעין התא עם הכניסה. קרום גרעיני וכוחות אופטיים מסומנים על ידי החצים השחורים. השינוי בתנופת הקרן מסומן על ידי החץ הירוק Pout. (ב) מסלול מלכודת (למעלה) וכוח (למטה) שחווים המיקרוספירה הלכודה אופטית במהלך ניסוי חוזר ונשנה בכניסה גרעינית. (ג) כפה ריקבון הרפיה לאחר שיא הכוח בעומק הכניסה המקסימלי. Inset מציג סכמטי של מוצק ליניארי סטנדרטי שהדינמיקה שלו משוערת לתצפיות הפנומנולוגיות כאן. (ד) משמאל: לוגריתם של הכוח המנורמל לעומת הזמן. האזורים המוצללים מציינים את חלק הנתונים המשמש להתאמה לריקבון המעריכי הכפול (קווים אדומים). מימין: לוגריתם של הכוח המנורמל לעומת הלוגריתם של הזמן. האזור המוצל מציין את חלק הנתונים המשמש להתאמה לחוק החשמל. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 8: שגרת כניסת כוח עם תזוזות מלכודת משולשות. (A) מסלול מייצג של x1(t) בכחול ו x2(t) בענבר במהלך ניסוי חריץ משולש שנערך על תא בגובה כליאה של 10 מיקרומטר. למעלה: מיקום מלכודת. אמצעי: ניתוח צורת גרעין. המרחק בין x1 ל- x2 מציין את קוטר הגרעין. למטה: אות כוח. (ב) כוח לעומת מיקום השמנה במשך שמונה חריצים רצופים. (ג) התפתחות הפיזור, הנגזרת מההיסטריה שבין חלק הגישה והנסיגה של עקומת ה- f-d, של הגרעין עבור כל אירוע כניסה עוקב. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 9. תכונות גרעיניות של תאים בהשעיה (משטח דבק) וכליאה משגרות טרפזואידיות. (A) שטח מוקרן של הגרעין מתאים בהשעיה ותחת 10 מיקרומטר כליאה. פס שחור מייצג את החציון. (ב) קשיחות גרעינית של תאים בהשעיה ותחת כליאה. פס שחור מייצג את החציון. ערכי P הנגזרים ממבחן קרוסקל-וואליס באמצעות MatLab. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
טבלה משלימה 1: מסלול טרפזי המוגדר על ידי תוכנת פינצטה אופטית. השורה הראשונה (השניה) היא המרחק x (y) שההשמנה תוסר באופן ליניארי. בשורה השלישית, משך השלב הנתון מוגדר בשניות. מסלול זה מורכב משבע נקודות ומתאים לטרפז שנטען פעמיים כנגד הגרעין באיור 7B. לחץ כאן כדי להוריד טבלה זו.
טבלה משלימה 2: מסלול משולש המוגדר על ידי תוכנת פינצטה אופטית. מקביל לטבלה 2, מסלול זה מורכב מ-16 נקודות, המתאימות לשמונה אירועי כניסה בעומק של 5 מיקרומטר ומהירות של 2.5 מיקרומטר לשנייה. אנא לחץ כאן כדי להוריד טבלה זו.
טבלה משלימה 3: פרמטרים מתאימים לנתונים באיור 7. IG: ניחוש ראשוני. לחץ כאן כדי להוריד טבלה זו.
איור S1 משלים: יישור חיישן כוח אופטי ופיצוי בסיסי מומנטום. (א) עצירת שדה המצולמת במצלמת העזר (AUX, איור 2) דרך עדשת ברטרנד. בועת אוויר מופיעה בשמן הטבילה, שאינו נראה דרך העינית. (ב) נתיב אופטי נקי. ליישור מדויק, פתח את עצירת השדה והפוך אותה לחפוף עם חרוט האור NA = 1.2. (ג) תמונה של מישור הדגימה. הריבוע האדום מציין את אזור העבודה של OT. סרגל קנה מידה: 20 מיקרומטר. (D) כוח מלכודת נמדד על פני FOV, לאורך חצים כפולים לבנים המצוינים ב- C. באדום, שינוי צריכת חשמל של השמנה כאשר לא מוחל תיקון. בכחול, כוח המלכודת תוקן על כל שדה הראייה. (ה) רכיב X של בסיס המומנטום לאורך אותו טווח. במעקב אדום, לא מתוקן. בכחול, עקבות תוקנו עבור כוח מלכודת. בירוק, מעקב תוקן עבור תוכנית בסיסית של מומנטום באמצעות פיצוי היסט גלובלי בתוכנת היצרן. (ו) זהה ל- E, עבור רכיב ה- Y. שים לב שתחת פעולה רגילה, הרכיבים המוצללים משמשים למכניקה ומדידות כוח, למשל, רכיב כוח x במהלך התנועה לאורך קואורדינטת x ורכיב כוח y במהלך התנועה לאורך ציר ה- y. לאחר שכל התיקונים מיושמים, מתקבל רעש RMSD של <0.5 pN. נא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
איור S2 משלים: שגרה שנכשלה עקב מלכודות חלשות. (א) Kymograph המציג כניסת גרעין משגרה שנכשלה. רק עיוותים קצרים וחולפים נראים לעין עקב בריחה של החרוז מהמלכודת. חשוב לציין, לייזר הלכידה עדיין נע ללא חרוזים כדי להשלים את המסלול המוגדר מראש (קו מנוקד ירוק). סרגל קנה מידה = 10 מיקרומטר. (B) עליון: מיקום השמנה לעומת זמן. אמצע: תוצאת מעקב קצה של קצה הגרעין הפרוקסימלי והדיסטלי המוזרם פנימה. שים לב כי הקצה הדיסטלי אינו זז ללא הכניסה כפי שנצפה בדרך כלל עבור שגרות שהושלמו על תאים מבודדים על מצעים דביקים. למטה: כוח לעומת זמן המציג את אובדן המיקרוספירה המצוינת על ידי ירידה ברעש התרמי וירידה פתאומית לאפס כוח. נא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
איור S3 משלים: הישרדות של עוברים מוזרקים. עוברים שהוזרקו עם 1 מיקרומטר חרוזים ו 100 pg / עובר של mRNA בריכוזים המתוארים בפרוטוקול הושוו לעוברים שלא הוכנסו ואינם מראים הבדלים משמעותיים 24 שעות לאחר ההפריה. ממוצע וחריגת תקן של שלושה ניסויים עצמאיים עם N > 21 עוברים לכל תנאי לכל ניסוי. נא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
בפרוטוקול זה, אנו מתארים שיטה ייחודית לחקור את התכונות המכניות של גרעין התא בתוך התאים החיים. בשונה מטכניקות ספקטרוסקופיות כוח אחרות, השמנה אופטית לא פולשנית אפשרה לנו לנתק את תרומת קרום התא ואת הציטוסקלטון מהנוקשות הגרעינית של התא. חשוב לציין, מיקרו-מניפולציה אופטית תואמת למיקרוסקופיה רב-מודולרית, שתאפשר לנסיין לחקור תהליכים שונים המעורבים במכנוביולוגיה גרעינית של התא. כתוצאה מייצגת, השתמשנו בהכתמת DNA-Hoechst כדי למדוד את עיוות הגרעין על כניסה שבוצעה על ידי כוחות בסדר גודל של כמה מאות picoNewton.
יישומים פוטנציאליים של השיטה שלנו מעבר לדוגמאות המתוארות בפרוטוקול זה
האפשרות לחלץ מידע מכני כמותי ממדידות בתוך תאים חיים ללא הפרעות חיצוניות מאפשרת שפע של הזדמנויות חסרות תקדים שרק מתחילות להיחקר. לכן, הפרוטוקול המוצג של פלטפורמת המיקרו-מניפולציה האופטית שלנו יכול להיות מורחב לניסויים מורכבים יותר עם צדדיות רבה. דפלקטורים אקוסטו-אופטיים (AOD) יכולים ליצור השמנות אופטיות מרובות למדידות כוח סינכרוניות במיקומי תאים שונים, כמו גם ניתן להשתמש בהם למיקרו-התחממות פעילה בטווח תדרים רחב51,61. כפי שהוזכר, תגובת הכוח עם הכניסה יכולה להתגבר על כוח ההשמנה המרבי, מה שמוביל לבריחה של החרוז מהמלכודת האופטית. במקרה זה, ניתן להגדיר משוב כוח עם AOD על מנת להדק את הכוח האופטי. בסך הכל, גישות מיקרו-המיקרו-הסביבתיות מרובות, כגון הרפיה בלחץ המתוארת בפרוטוקול זה, אך גם מיקרו-התחממות פעילה או תאימות לזחילה, ניתן להשיג באופן ניסיוני עם פלטפורמה זו ולנתח ביסודיות על ידי חבילות תוכנה חדשניות61,62,62,63,64,65 . יתר על כן, היישום של כוחות אינו מוגבל לגרעין אבל יכול להתבצע באופן עקרוני כדי למדוד מבנים תאיים מגוונים וברקמות מורכבות כפי שהוכח ללכידת תאי דם אדומים זורמים בתוך כלי דם שלמים66,67 או לכידה ועיוות כלורופלסטים ומיטוכונדריה68 . כיול תנופת האור אינו תלוי בצורתו ובגודלו של העצם הנלכד, ולכן מאפשר מדידות כוח ישירות על כל גשושית כוח בעלת צורה שרירותית38,39. השימוש במיקרוספירות מוזרקות אפשר לנו להפעיל כוחות גבוהים על הגרעין עם כוח לייזר נמוך יחסית בהשוואה למניפולציה ישירה של מבנים תאיים69,70,71. עם זאת, בהינתן הפרש אינדקס שבירה גבוה מספיק, אין צורך בבדיקת כוח מיושמת חיצונית וניתן לתמרן אברונים תאיים ישירות ללא חרוזים מוזרקים (תצפיות שלא פורסמו והפניה70).
שינויים פוטנציאליים בשיטה שלנו להרחבת היישומים
ניתן להזריק גדלים שונים של חיידקים בהתאם לניסוי, אך יש לבצע את הבקרות היחסיות. לדוגמה, כדי ללמוד תאים בשלבים מאוחרים יותר חרוזים קטנים יותר ניתן להזריק. פעולה זו תפחית את הכוח המרבי שניתן להפעיל על ידי המלכודת האופטית (כגון מוצג בהפניה55). חרוזים גדולים יותר ניתן להזריק כדי להפעיל כוחות גבוהים יותר, אבל אלה עשויים להשפיע על התפתחות העובר בהתאם לגודלם או שלב העניין שלהם. בניסויים שבהם הזרקת חיידקים אינה אופציה, אברונים שונים המציגים הבדלי מדדי שבירה בהשוואה לזה של הציטופלסמה עדיין יכולים להיות מניפולציה אופטית, מה שמוליד כוחות אופטיים הניתנים למדידה משינויי תנופה אור42. כפי שהוזכר לעיל, שיטות אלה שימשו על ידי Bambardekar ואח 'כדי לעוות צמתים תא-תא בעובר Drosophila70. כמו כן, לגרעין התא יש אינדקס שבירה נמוך יותר מאשר ל- medium44 שמסביב, המאפשר כניסה ללא חרוזים (תצפיות שלא פורסמו והפניה72) למרות שעוצמת השמנה נמוכה יותר. לפיכך, לא ניתן ללכוד את הגרעין בקלות ונמלט מהמלכודת.
מרווח PDMS מצופה ספין מפוברק בשיטה נוחה ומהירה, אך עשוי להיות מחוץ להישג ידם של מעבדות ללא גישה למתקן מיקרו/ננו-פבריקציה או למעבדות הנדסה. לכן, spacer ניתן להרכיב בקלות מ קלטת מעבדה או parafilm (שלב 4). הפרוטוקול יכול גם להיות מותאם על ידי ייצור ערוצים microfluidic להפוך את המסירה של תאים בודדים לתוך בארות מדידה מוגדרות מראש או לתוך תא עם גובה מוגדר כדי להעריך את אפקט הכליאה בתוך אותה דגימה. עם זאת, יש לתכנן התקנים מיקרופלואידיים כאלה כך שיתאימו את הרווח בין מטרת המיקרוסקופ לעדשת האיסוף של חיישן הכוח האופטי, של כ -2 מ"מ (ראה שלב 3). שים לב כי חיישן הכוח האופטי חייב להיות ממוקם בגובה המתאים, כך שאין סטיות אופטיות מן defocusing להשפיע על מדידת מומנטום פוטון.
שינויים אחרים עשויים לכלול שינוי של כתבים ביולוגיים. מצאנו כי פלואורסצנטיות Hoechst מדממת באופן ספקטרלי לתוך ערוץ GFP ולכן אנו מעדיפים את השילוב עם histone מתויג mCherry כסמן גרעיני למדידה בו זמנית בשני ערוצים פלואורסצנטיים. לחלופין, ניתן לעקוב בקלות אחר עיוות גרעיני באמצעות תווית המיועדת לקרום הגרעיני הפנימי כגון Lap2b-GFP (איור 2).
הכניסה לגרעין התא הייתה בסדר גודל של 2-3 מיקרון, אשר אנו יכולים למדוד במדויק על ידי ניתוח תמונה של עקיפה מוגבלת ספינינג-דיסק מיקרוסקופיה קונפוקלית. במקרה של גרעינים נוקשים יותר או כוחות קטנים יותר, הכניסה תהיה בקושי ניתנת למדידה באמצעות גישה זו. עם זאת, ניתן לכייל גם את הפינצטה האופטית המכוילת בכוח המוחלטת למדידות מיקום של החרוז הלכוד במקום באמצעות אינטרפרומטריה BFP עם דיוק ננומטר51. באמצעות גישה זו, ניתן לתרגם את אות המתח ואת חיישן הכוח האופטי למיקום של הגשושית הלכודה באמצעות β פרמטר [nm/V], בעוד הפרמטר invariant α [pN/V] מניב ערכי כוח באמצעות כיול תנופת האור הנ"ל41 (ראה להלן לפרטים).
פתרון בעיות
מצאנו כי האתגרים הבאים יכולים להתרחש במהלך הניסוי:
לא נוצרת מלכודת יציבה והמיקרוספירה בורחת בקלות
כל לכלוך על מטרת המיקרוסקופ או צווארון תיקון לא מיושר עלול להוביל לכישלון של מלכודת יציבה. אם לא נמצא פתרון מיידי, מדוד את פונקציית התפשטות הנקודות של העדשה האובייקטיבית. אם דגימת העניין נמצאת עמוק בתוך רקמה צפופה אופטית, מוקד הלייזר עלול לחוות סטיות אופטיות חמורות המובילות ללכידה לא יציבה (אפקט זה הוא בדרך כלל זניח בתאים מבודדים אך הופך בולט יותר ברקמות עבות יותר). עבור קשיחות גבוהה, כוח השיקום של הגרעין יכול לחרוג מכוח המילוט של המלכודת, כך שהמיקרוספירה הולכת לאיבוד ושגרת הכניסה נכשלת. בתחילה, קצה הממברנה הגרעינית הפרוקסימלי למלכודת האופטית כמעט ולא נכנס פנימה (איור S2A). כאשר זה קורה, לייזר ההשמנה אינו מושפע עוד מכוח ומתנועה בראונית, מה שמוביל לירידה בכוח לאפס ולירידה ברעש האות (איור S2B). במקרה שזה קורה, כוח לייזר יכול להיות מוגבר יש מלכודת חזקה יותר, משרעת של המסלול הטרפזי דוחף את החרוז לתוך הגרעין ניתן להפחית, או המיקום הראשוני של המיקרואורגניזם הלכוד ניתן להגדיר רחוק יותר את הגרעין.
התא נע במהלך הגירוי
אם התאים אינם מחוברים מספיק, השמנת ההשמנה ההדרגתית האופטית תזיז את התאים בעת ביצוע שגרת הכניסה התאית, כך שהכוחות והמכניקה הבסיסית של הגרעין הם אובייקטים. כדי למנוע תזוזה של התא כולו, אנו ממליצים להגדיל את הריכוז של מולקולות הידבקות תאים על פני השטח, למשל, ConA.
פיצוי מומנטום ראשוני
אם שגרת פיצוי מומנטום ראשונית אינה זמינה בפלטפורמת ה- OTs (שלב 6.5), יש לתקן אות בסיסי מלאכותי ובלתי תלוי בכוח. זה נראה כשיפוע בעקומת הכוח גם ללא חרוז לכוד (איור S1E). כדי לבצע את התיקון, אותו מסלול צריך להתבצע ללא חרוז, מחוץ לתא בדיוק באותה תנוחה. לשם כך, הרחק את התא מההשמנה באמצעות פקד הבמה. כהפניה, היסט הכוח משתנה 5 pN על פני FOV ב 200 mW במערכת שלנו; לפיכך, הוא הופך להיות זניח עבור מסלולים קצרים. לחלופין, ניתן להשתמש בשלב סריקת פיזו כדי להזיז את התאים על המדגם, משאיר את מיקום הלייזר קבוע.
שלבים קריטיים של הפרוטוקול המוצג
יש להזריק מיקרוספירות בשלב הימני של תא אחד כדי להבטיח חלוקה מקסימלית על העובר. חרוזים לא צריכים להיות פלואורסצנטיים כך שאין דליפת אור לתוך ערוצי פלורסנט המשמשים להדמיה. לדוגמה, אפילו חרוזים אדומים-פלואורסצנטיים טיפוסיים נראים בבירור בערוץ הכחול המשמש להדמיית גרעין התא לאחר הכתמת Hoechst בשל הבהירות שלהם (עירור: 405 ננומטר; פליטה: 445 ננומטר). התקשרות יציבה של התא למצע היא קריטית כדי למנוע תזוזה לרוחב במהלך שגרת הכניסה. אם התא נע במהלך השגרה, לא מעריכים את הכוחות. במקרה שהדבר יקרה לעתים קרובות, מטב את פרוטוקול הקובץ המצורף. עבור תאי תרבית רקמות, חלבוני הידבקות תאים אחרים, כגון פיברונקטין, קולגן או פולי-L-ליזין מובילים לחיבור משביע רצון (תצפיות שלא פורסמו). במהלך הכליאה, תאים נתונים ללחץ מכני פתאומי וחמור. זה יכול לגרום נזק לתאים ולעתים קרובות הנסיין ייתקל תאים מפוצצים אם ההליך לא מתבצע בזהירות. כמו כן, אם גובה הכליאה קטן מדי, כל התאים יסבלו משבירת עוטף גרעינית או נזק בלתי הפיך. כדי למתן את אלה, הנמך את כיסוי הכיסוי העליון לאט יותר ו/או הגדל את המרווח בין כיסוי הכיסוי.
מגבלות הטכניקה והצעות להתגבר עליהם
מגבלה ברורה של הטכניקה היא חדירת אור הלייזר לחלקים עמוקים של הרקמה, מה שמוביל לסטיות וללכידה לא יציבה. לכן, גבול נמוך יותר של עומק החדירה תלוי בבהירות המדגם, תיקון הסטייה שניתן להשתמש בו73 וכוח הלייזר המיושם. יש לקחת בחשבון כי כוח לייזר גבוה יותר מוביל עירור תרמי של המדגם בקרבת המיקרוספירה. עם זאת, חימום המדגם שמקורו בנקודה לייזר באורך גל 1064 ננומטר ממוזער כדי למנוע מתח הקשור לחום מתקבל על הדעת על הדגימות הביולוגיות שלנו74.
מגבלה נוספת היא הכוח המרבי שניתן למדוד. למרות שגילוי ישיר של תנופת אור מאפשר מדידות כוח הרבה מעבר למשטר התגובה הליניארית של המלכודת האופטית40,41, הכוח המיושם המרבי הוא בסדר גודל של כמה מאות picoNewtons. זה מוגבל על ידי כוח לייזר ואת סף הנזק כתוצאה מכך של חומר ביולוגי רך ואת ההבדלים אינדקס שבירה, אשר בדרך כלל אינם גדולים יותר מ 0.1 או 0.344. מספר שיטות הוצעו כדי להגדיל את מגבלת זיהוי הכוח, למשל, באמצעות אור מובנה75, מיקרוספרות מצופות אנטי רפלקטיבי76, חלקיקי אינדקס שבירה גבוהה77 או נקודות קוונטיות מסוממות מאוד78.
OTs יכול לשמש מדידות מיקום בקנה מידה ננומטרי באמצעות אינטרפרומטריה BFP, כך המיקום של החרוז בתוך המלכודת הוא Δx = β Sx, שבו Sx הוא אות המתח של החיישן, וניתן לכייל β [μm/V] תוך כדי תנועה בעקבות פרוטוקולים שונים35,54. עבור חיישן כוח אופטי, ניתן להוכיח כי גורם ההמרה invariant מתח לכוח α [pN /V] מתייחס ישירות β ואת נוקשות המלכודת, k [pN / μm], באמצעות α = kβ 37) בניסויים עם עקירות חרוזים כי הם קטנים מדי כדי להיות מזוהה מן הדמיה אופטית, אסטרטגיה זו יכולה לשמש כדי להשלים מדידות כוח עם זיהוי מיקום קטן. דוגמה לכך היא יישום השגרה הניסיונית המוצגת כאן על גרעינים נוקשים מאוד, אשר כוחות בכוחות לייזר סבירים (200-500 mW) אינם מספיקים כדי לגרום לערכי כניסה גדולים מספיק. במקרה זה, יש להביא את החרוז במגע עם הגרעין ויש לכייל את נוקשות הלכידה לפני המדידה (שלב 8.6). הכניסה d של הגרעין כפונקציה של כוח ניתן לקבוע בעקיפין כמו:
d = xtrap - F/k
כאשר xtrap הוא מיקום המלכודת. בשונה מגורם אור-מומנטום invariant α [pN/V], גורם β [μm/V] צריך להיות מכויל לפני כל ניסוי שכן הוא תלוי משתנים מקומיים רבים הקובעים את דינמיקת ההשמנה, כגון גודל החלקיקים, גודל ספוט מלכודת אופטית, ומדדי שבירה יחסית.
למחברים אין מה לחשוף.
ח"כ מכיר בתמיכה כספית של משרד הכלכלה והתחרותיות הספרדי באמצעות התוכנית הלאומית (PGC2018-097882-A-I00), FEDER (EQC2018-005048-P), תוכנית Severo Ochoa למרכזי מצוינות במו"פ (CEX2019-000910-S; RYC-2016-21062), מ Fundació Privada Cellex, Fundació Mir-Puig, ומ Generalitat de Catalunya באמצעות CERCA ותוכנית המחקר (2017 SGR 1012), בנוסף למימון באמצעות ERC (MechanoSystems) ו- HFSP (CDA00023/2018). V.R. מכיר בתמיכת משרד המדע והחדשנות הספרדי לשותפות EMBL, סנטרו דה אקסלנסיה סוורו אוצ'ואה, תוכנית נאסיונאל של MINECO (BFU2017-86296-P, PID2020-117011GB-I00) וג'נרליטט דה קטלוניה (CERCA). V.V. מודה בתמיכתה של תוכנית הדוקטורט ICFOstepstone הממומנת על ידי תוכנית המחקר והחדשנות Horizon 2020 של האיחוד האירופי תחת הסכם המענקים מארי Skłodowska-Curie 665884. אנו מודים לארנו פארה על הקריאה הביקורתית של כתב היד; מריה מרסל לעזרה עם הדמיה והרכבה של העובר 24 hpf; סנדרה חימנס-דלגאדו לתמיכה עם מיקרונג'ים של דגי זברה.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
#1.5 22 mm cover glasses | Ted Pella | 260148 | |
#1.5 22x60 mm Coverglasses | Ted Pella | 260152 | |
#1.5H glass bottom dishes | Willco | GWST-5040 | |
10-um beads | Supelco | 72986 | |
1-mm glass capillaries | Harvard Apparatus | 30-0020 GC100F-15 | |
1-um polystyrene microbeads | Sigma | 89904 | |
1-um red-fluorescent beads | ThermoFisher | F8816 | |
Agar | ThermoFisher | 16500500 | |
Aqcuisition cameras sCMOS | Andor | Sona-4BV11-UNI | |
Auxiliary camera (Figure 3, AUX) | Blackfly, FLIR | BFS-U3-200S6M-C | |
Calbryte 520 | AAT Bioquest | 520 AM | |
Centrifuge | Eppendorf | 5453000011 | |
Concanavalin A | Sigma | C5275 | |
DMEM | Sigma | D2906 | |
DNA-Hoechst | ThermoFisher | 33342 | |
Double scotch tape | Biesse Adesivi | ||
E3 | 5 mM NaCl. 0.17 mM KCl. 0.33 mM CaCl2. 0.33 mM MgSO4 | ||
Eclipse Ti2 | Nikon | ||
Forceps | Fine Science Tools | 11252-20 | |
GPI-GFP | |||
H2A-mCh | |||
Image acquisition software | Fusion-Andor | ||
Immersion Oil | Cargille | Type B: 16484 | |
IR protection googles | Thorlabs | LG1 | |
Lap2b-eGFP | |||
Micro loader pipette | Eppendorf | GELoader | |
Microinjector | World Precision Instruments | SYS-PV820 | |
MicroManager 2.0 | |||
Micromiter slide | ID5243 GXMGRAT-5 5mm/100 divisions | ||
Mineral oil | Sigma | M3616 | |
Motorized stage | ASI | ||
Needle puller | Sutter instrument Co. | Model P-97 | |
Optical tweezers platform | Impetux Optics | Sensocell | |
OTs software (LightAce) | Impetux Optics | ||
PDMS | Sigma | Sylgard 184 | |
PDMS Curing agent | Sigma | Sylgard 184 | |
Post processing software (Matlab) | Mathworks | ||
RNAse free water | Thermofisher | AM9937 | |
Short-pass dichroic mirror (Figure 3, IR-F) | Semrock | FF01-950/SP-25 | |
Spin-coater | Specialty Coating Systems | Spincoat G3P-8 | |
Spinning-disk confocal microscope | Andor | DragonFly 502 | |
Stereomicroscope | Leica M80 | ||
Triangular microinjection mold | Adaptive Science Tools | TU1 | |
Universal oven | Memmert | UNB 200 | |
Water immersion objective | Nikon | MRD07602 |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved