בדיקת מיקרו-צלחות מותאמת מבוססת צפיפות אופטית לאפיון זיהום אקטינובקטריופאג'

בסופו של דבר, אנו מתעניינים באינטראקציות בין בקטריופאג'ים למארחים. פרוטוקול זה מאפשר מדידה של זיהום פאגים בחיידקים הגדלים לאט, ומייצר מדדי זיהום תיאוריים. מתודולוגיה זו היא חיונית בחקר קו-אבולוציה של בקטריופאג'-מארח בחיידקי אקטינומיצט הגדלים לאט.

שיטות מיקרו-צלחות מהירות מספקות תוצאות מצוינות עבור פונדקאים חיידקיים הגדלים במהירות, אך הן קצרות מכדי להציג את התקדמות זיהום חיידקי-פאג' בפונדקאים חיידקיים הגדלים לאט יותר, כגון אקטינומיצטים. השיטה שלנו מותאמת לחיידקים הגדלים לאט, ומאפשרת תרבית משותפת של חיידקים ופאגים במשך הימים המרובים הנדרשים כדי לאפיין את דינמיקת הזיהום של הבקטריופאג'ים. הפרוטוקול שלנו מאפשר להעריך אינטראקציות בקטריופאג'-מארח עבור חיידקים הגדלים לאט בצלחות מיקרו, במקום לדרוש תת-דגימה מבקבוק תרבית גדול יותר.

פרוטוקול זה משתמש בחומרים זמינים כדי להסתגל לזמני תרבית ארוכים יותר ומאפשר לצפות עותקים משוכפלים מרובים במיקרו-צלחת אחת.