מטרת העל שלנו היא לחקור כיצד תאי מערכת החיסון ותאי גלייה במערכת העצבים המרכזית תורמים להתפתחות ולהתקדמות של הפרעות נוירולוגיות כגון טרשת נפוצה. מיקרוסקופיה אימונופלואורסצנטית היא טכניקה סטנדרטית ובשימוש נרחב על פני דיסציפלינות ביולוגיות והיא חיונית למדעי המוח ולמחקר האימונולוגיה. אחת הבעיות העיקריות המטרידות חוקרים היא שמיקרוסקופ אימונופלואורסצנטי מוגבל בדרך כלל במספר הגשושיות שניתן לצלם בו זמנית בשל מגבלות המיקרוסקופים הקונבנציונליים.
בפרוטוקול זה, אנו מתארים שיטה להרחבת מספר הגשושיות שמיקרוסקופים רבים יכולים לצלם בו זמנית, ומספקים צינור ניתוח לעיבוד תמונות צפופות מידע. היתרון של פרוטוקול זה הוא שניתן להתאים אותו למיקרוסקופים רבים הזמינים באופן נרחב וקל לביצוע, מה שיהפוך את ניתוח ההיסטולוגיה המרובב לזמין למספר רב יותר של מעבדות.