Kapsayıcı hedefimiz, bağışıklık sistemi hücrelerinin ve merkezi sinir sistemi içindeki glial hücrelerin, multipl skleroz gibi nörolojik bozuklukların gelişimine ve ilerlemesine nasıl katkıda bulunduğunu incelemektir. İmmünofloresan mikroskopi, biyolojik disiplinler arasında standart ve yaygın olarak kullanılan bir tekniktir ve sinirbilim ve immünoloji araştırmaları için gereklidir. Araştırmacıları rahatsız eden ana konulardan biri, immünofloresan mikroskobunun tipik olarak geleneksel mikroskopların sınırlamaları nedeniyle tek bir seferde görüntülenebilen prob sayısında sınırlı olmasıdır.
Bu protokolde, birçok mikroskobun tek seferde görüntüleyebileceği prob sayısını genişletmek için bir yöntem açıklıyoruz ve bilgi yoğun görüntüleri işlemek için bir analiz hattı sağlıyoruz. Bu protokolün avantajı, yaygın olarak bulunan birçok mikroskoba uyarlanabilmesi ve yürütülmesinin kolay olmasıdır, bu da multipleks histoloji analizini daha fazla sayıda laboratuvara uygun hale getirecektir.