Il nostro obiettivo generale è studiare come le cellule del sistema immunitario e le cellule gliali all'interno del sistema nervoso centrale contribuiscono allo sviluppo e alla progressione di disturbi neurologici come la sclerosi multipla. La microscopia a immunofluorescenza è una tecnica standard e ampiamente utilizzata in tutte le discipline biologiche ed è essenziale per la ricerca nelle neuroscienze e nell'immunologia. Uno dei problemi principali che affliggono i ricercatori è che la microscopia a immunofluorescenza è in genere limitata nel numero di sonde che possono essere visualizzate contemporaneamente a causa delle limitazioni dei microscopi convenzionali.
In questo protocollo, descriviamo un metodo per espandere il numero di sonde che molti microscopi possono visualizzare contemporaneamente e fornire una pipeline di analisi per elaborare immagini dense di informazioni. Il vantaggio di questo protocollo è che può essere adattato a molti microscopi ampiamente disponibili ed è facile da eseguire, il che renderebbe l'analisi istologica multiplex disponibile a un numero maggiore di laboratori.