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Method Article
* Questi autori hanno contribuito in egual misura
Che caratterizzano la funzione dei recettori odorant serve una parte indispensabile nel processo di deorphanization. Descriviamo un metodo per misurare l'attivazione di recettori di odorizzante in tempo reale usando un'analisi di campo.
Le enormi dimensioni delle famiglie dei mammiferi odorant receptor (OR) presentano difficoltà per trovare loro ligandi affine fra numerosi prodotti chimici volatili. Per efficientemente ed esattamente deorphanize ORs, uniamo l'uso di una linea cellulare eterologo di esprimere dei mammiferi ORs e un plasmide biosensore geneticamente per misurare la produzione di cAMP a valle dell'attivazione di OR in tempo reale. Questa analisi può essere usata per schermo odoranti contro ORs e viceversa. Interazioni positive odorant-recettore degli schermi possono essere successivamente confermate dalla prova contro varie concentrazioni di odore, generando curve concentrazione-risposta. Qui abbiamo usato questo metodo per eseguire uno screening di alto-rendimento di un composto odoroso contro una libreria OR umana espressa in cellule Hana3A e confermato che il recettore risponde positivamente il recettore affine per il composto di interesse. Abbiamo trovato questo metodo di rilevamento ad alta velocità per essere efficiente e affidabile nel valutare l'attivazione OR e i nostri dati forniscono un esempio del suo uso potenziale negli studi funzionali OR.
L'odorato svolge un ruolo importante nella sopravvivenza degli animali come si basano sulla loro capacità olfattive per procurarsi il cibo, evitare i predatori e pericolo, distinguere specie e selezionare mate1,2. La realizzazione di queste funzioni dipende i recettori odorant (ORs), che individualmente sono espressi sulla superficie ciliare dei neuroni sensoriali olfattivi (OSNs) situato nell'epitelio olfattivo (OE). RUP costituiscono la più grande famiglia della superfamiglia del recettore (GPCR) accoppiati a proteine G con circa 400 e 1200 diversi OR geni nell'uomo e topo, rispettivamente3,4,5. ORs attivato da odoranti condurre ai livelli aumentati di cAMP intracellulari attraverso l'attivazione sequenza di olfattiva G-proteina (Golf) e digitare adenilil ciclasi III (AC3). Il risultante aumento del livello di cAMP intracellulare potrebbe funzionare come un secondo messaggero, che apre il canale del nucleotide-gated sulla superficie delle cellule, innescando l'afflusso dei cationi inclusi Ca2 + e potenziali d'azione e in ultima analisi, avviare neuro-potenziale trasmissione e percezione olfattiva. Il processo di rilevamento e discriminare un gran numero di odorizzazione da ORs è considerato come il primo passo di percezione olfattiva6,7.
Poiché Buck e Axel8 prima con successo odorant recettori clonati e chiarito il meccanismo di percezione olfattiva iniziata da ORs, deorphanization della famiglia OR è diventato uno dei punti caldi in questo campo. Vari metodi in vivo, ex vivo ed in vitro per misurare l'attivazione OR sono stati segnalati9,10,11,12. Un metodo tradizionale che utilizzato Ca2 + imaging seguita da unicellulare RT-PCR su OSNs permesso l'identificazione di differenti ORs a alifatici odoranti13,14,15. Più recentemente, l'avvento delle analisi su larga scala del trascrittoma promosso lo sviluppo di metodi di più alto-rendimento in vivo . Il dosaggio di Kentucky identificato ORs eugenolo e muscone-reattivo del mouse con l'uso di S100a5-tauGFP reporter del mouse ceppo e microarray analisi9. Basato sulla diminuzione nei livelli di mRNA di OR dopo l'esposizione odorant, la tecnologia di sogno impiegato un approccio di trascrittomica per determinare i profili di attivazione OR in due specie di vertebrati e non-vertebrato16. Allo stesso modo, data la fosforilazione di S6 in attivazioni neuronali, il Matsunami gruppo sequenziata mRNA dal ribosoma fosforilato immunoprecipitati per identificare reattivo ORs12. Infine, il gruppo di Feinstein segnalato topi super sniffer che potrebbero fungere da piattaforma per lo studio di odore di codifica in vivo, conosciuto come il MouSensor tecnologia17.
Nel Regno in vitro , la sfida di coltura OSNs rende un sistema di espressione eterologa che imita OR espressione funzionale in vivo una soluzione ideale per condurre lo screening su larga scala di prodotti chimici odorosi per ORs. Tuttavia, dal momento che diverse linee cellulari coltivate di origine non-olfattiva OSNs nativo, o proteine vengono mantenute nel reticolo endoplasmatico e incapace di traffico alla membrana plasmatica, con conseguente OR degrado e la perdita di funzione del ricevitore18 , 19. per risolvere questo problema, vasti impianti sono stati fatti per replicare o funzionale espressione sulla membrana cellulare nelle linee cellulari eterologhi. Krautwurst et al collegato in primo luogo i primi 20 amminoacidi di rodopsina (Rho-tag) al N-terminale della proteina OR e questo ha promosso l'espressione di superficie delle cellule di alcuni ORs di cellule embrionali umane del rene (HEK)20. Effettuando un'analisi di serie di analisi del gene expression (SAGE) libreria dal singolo OSNs, Saito et al. in primo luogo clonato i membri della famiglia della proteina (RTP) del ricevitore-trasporto, RTP1 e RTP2 e la proteina di enhancer di espressione di recettore 1 (REEP1) che ha facilitato OR traffico alla membrana cellulare e migliorato risposte odorant-mediata di ORs in HEK293T cellule 21. basato su questi risultati, il gruppo Matsunami stabilito con successo la linea cellulare Hana3A, trasfettata stabilmente con RTP1, RTP2, REEP1 e Gαolf in HEK293T e transfected transitoriamente con ORs Rho-etichetta, per efficiente o funzionale espressione. Successivi studi hanno rivelato 1) una forma più breve di RTP1, RTP1S, che potrebbe più robustamente promuovono o funzione che la proteina RTP1 originale e 2) il recettore muscarinico tipo 3 (M3R) poteva migliorare attività OR via inibizione di β-arrestina-2 reclutamento, entrambi i quali sono state introdotte per il sistema di espressione eterologa per ottimizzare sperimentale uscita22,23.
Diversi metodi di rilevamento sono stati utilizzati per quantificare l'attivazione del recettore in sistemi eterologhi. Il dosaggio di fosfatasi alcalina placentare secrete (SEAP) funziona con un enzima di reporter trascrizionalmente regolato da elementi di risposta del campo (CREs), che lo rende un'opzione attraente per valutare l'attivazione OR. La fluorescenza è facilmente rilevata in un campione di terreno di coltura dopo incubazione con SEAP rilevamento reagente24. Utilizzando questo metodo, le funzioni di RUP, nonché una classe secondaria di chemosensory recettori espressi nella traccia di OE-i recettori ammina-associati (TAARs) sono stati caratterizzati25,26,27. Un altro metodo comune, l'analisi di luciferase, utilizza un gene reporter luciferasi di lucciola sotto il controllo dell'elemento di risposta del campo (CRE). Luminescenza generato dalla produzione di luciferasi di misurazione fornisce un mezzo efficiente e robusto di quantificare OR attivazione10,11,28.
Analisi di campo in tempo reale anche sono stati ampiamente usate nel monitoraggio in modo dinamico la funzione dei GPCR eterologo o endogena. Un esempio di tali dosaggi avanzate si avvale di una variante di biosensore codificato geneticamente, che possiede un dominio di legame al cAMP fuso ad una forma mutante della luciferasi. Quando si lega l'accampamento, il cambiamento conformazionale conduce all'attivazione della luciferasi, luminescenza da cui poi può essere misurata con un lettore di chemiluminescenza29,30. La tecnologia di campo in tempo reale è stata segnalata per la de-orfano di umano odorant recettori nelle cellule 108CC15 HEK293 e NxGculo = "xrif" > 31,32,33, come pure il Hana3A derivato di HEK293T cellule34,35. Il gruppo Krautwurst anche descritto in dettaglio la tecnologia di campo in tempo reale per essere adatti alla bi-direzionale su larga scala o screening approcci32,33.
Qui descriviamo un protocollo per la misurazione di attivazione OR usando un'analisi in tempo reale di cAMP nelle cellule Hana3A. In questo protocollo, la luminescenza di pre-equilibrato di cellule vive è cineticamente misurata per 30 min dopo il trattamento con specifici composti volatili, che rappresentano un'analisi più efficiente e accurata di attivazione OR che sono meno suscettibili artefatti che si verificano nell'ambiente cellulare con tempo prolungato e le tossicità indotta da odore delle cellule. Questa misura in tempo reale consente uno screening su larga scala di ORs e di ligandi, come pure la caratterizzazione di coppie di OR-ligando specifiche di interesse. Usando questo metodo, correttamente identificato OR5AN1 come il recettore per il muschio composto muscone eseguendo uno screening contro 379 ORs umano e successivamente conferma il risultato di screening positivo.
1. Culturing e manutenzione di celle Hana3A
2. Placcatura di cellule per la transfezione
3. Transfezione di plasmidi
4. Stimolazione e misurazione o attività usando l'analisi di Campo Real-Time
5. Analisi dei dati
Muscone è il principale componente aromatico da muschio naturale. Recenti studi OR5AN1 identificato come un recettore umano per muscone e altri composti di muschio macrociclici basati su omologia con il mouse o, MOR215-1, clonato da glomeruli muscone-sensible a reagire a comportarsi topi37,38. Per il repertorio umano OR, il nostro gruppo e il gruppo Touhara di screening anche identificati OR5AN1 come un ricevitore importante per ...
Misurare accuratamente l'attivazione di un OR sopra l'esposizione ad una certa odorant è il primo passo nel decifrare la codificazione delle informazioni olfattive. Gli esperimenti dimostrato in questo studio rappresentano che un esempio di come uno può identificare, mediante uno in vitro sistema di espressione OR, ORs reattivo tra il repertorio umano OR per l'industria chimica odorosa di interesse e successivamente che caratterizzano il recettore farmacologia utilizzando varie concentrazioni della sostanza ch...
Gli autori non hanno nulla a rivelare.
Il lavoro è stato supportato dal Chinese National Science Foundation (31070972), scienza e tecnologia della Commissione della municipalità di Shanghai (16ZR1418300), il programma per Innovative Research Team di Shanghai Municipal Education Commission, orientale di Shanghai Programma di studioso (J50201) e il programma di ricerca di base nazionale della Cina (2012CB910401).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Amphotericin B | Sigma | A2942 | |
DMSO | Sigma | D2650 | |
FBS | Gibco | 10099-141 | |
GloSensor cAMP reagent | Promega | E1290 | |
pGloSensor-20F cAMP plasmid | Promega | E1171 | |
Hana3A cells | available from authors upon request | ||
HBSS, without calcium or magnesium | GIBCO | 14175095 | |
HEPES | Hyclone | SH30237 | |
Lipofectamine2000 | Invitrogen | 11668-019 | |
M3R plasmid | cloned into a mammalian expression vector such as pCI | ||
MEM, with EBSS and L-glutamine | Hyclone | SH30024 | |
Muscone | Santa Cruz | sc-200528 | |
Musk tibetene | Sigma-Aldrich | S359165 | |
OR plasmids | cloned with a Rho-tag into a mammalian expression vector such as pCI | ||
PBS, without calcium or magnesium | Cellgro | 21-040-CV | |
Penicillin-streptomycin | Hyclone | SV30010 | |
Plasmid miniprep kit | Tiangen | DP103-03 | |
Puromycin | Sigma | P8833 | |
RTP1S plasmid | cloned into a mammalian expression vector such as pCI | ||
Trypsin-EDTA | Hyclone | SH30236 | |
0.2-mL PCR tube | Axygen | PCR-02-C | |
1.5-mL Eppendorf tube | Eppendorf | ||
15-mL 17 mm x 120 mm conical tube | BD Falcon | 352096 | |
8-well and/or 12-well multichannel pipetman | Eppendorf | ||
96-well flat-bottomed white cell culture plate | Greiner | 655098 | |
100 mm x 20 mm cell culture dish | BD Falcon | 353003 | |
Class II biological safety cabinet with laminar flow | |||
Cell culture incubator, with 5% CO2 | |||
Centrifuge, with swinging bucket rotor for 15-ml conical tubes | |||
Infinite F200 plate reader | Tecan | ||
Phase-contrast microscope with x10 and x20 objectives | |||
Spectrophotometer | |||
Sterile reagent reservoirs for multichannel distribution | |||
Sterile paper towel |
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