Descriviamo un protocollo per isolare le piccole cripte intestinali murine e la coltura di organoidi 3D intestinali dalle cripte. Inoltre, descriviamo un metodo per generare organoidi da una singola cellula staminale intestinale in assenza di una nicchia cellulare sub-epiteliale.
Attualmente, la coltura organoide rappresenta uno strumento importante per studi in vitro di diversi aspetti biologici e malattie in diversi organi. Le piccole cripte intestinali murine possono formare organoidi che imitano l'epitelio intestinale quando coltivate in una matrice extracellulare 3D. Gli organoidi sono composti da tutti i tipi di cellule che svolgono varie funzioni omeostatiche intestinali. Questi includono cellule di Paneth, cellule enteroendocrine, enterociti, cellule caliciformi e cellule ciuffo. Molecole ben caratterizzate vengono aggiunte nel terreno di coltura per arricchire le cellule staminali intestinali (ISC) marcate con ripetizioni ricche di leucina contenenti il recettore 5 accoppiato alla proteina G e vengono utilizzate per guidare la differenziazione verso il basso linee specifiche; queste molecole includono il fattore di crescita epidermico, Noggin (una proteina morfogenetica ossea) e R-spondina 1. Inoltre, è anche dettagliato un protocollo per generare organoidi da un singolo ISC positivo al recettore epatocellulare B2 (EphB2) produttore di eritropoietina. In questo articolo sui metodi sono descritte le tecniche per isolare le piccole cripte intestinali e un singolo ISC dai tessuti e garantire l'efficiente creazione di organoidi.
Gli organoidi intestinali, che sono stati istituiti per la prima volta nel 2009, sono emersi come un potente strumento in vitro per studiare la biologia intestinale data la loro somiglianza morfologica e funzionale con i tessuti maturi. Recentemente, i progressi tecnologici negli organoidi in coltura derivati da cellule staminali dei tessuti adulti hanno permesso la coltura a lungo termine di cellule staminali intestinali (ISC) con potenziale di auto-rinnovamento e differenziazione. Questi organoidi sono stati ampiamente utilizzati per studi di ricerca di base e traslazionali sulla fisiologia gastrointestinale e fisiopatologia 1,2,3,4,5,6. Gli organoidi 3D sviluppati dal gruppo Clevers forniscono un potente strumento per studiare l'epitelio intestinale con una migliore rilevanza fisiologica7. Poiché gli organoidi intestinali derivano da cellule staminali tissutali e sono composti da più tipi di cellule, ricapitolano la funzionalità dell'epitelio intestinale. Da notare che una cellula staminale 5-positiva (Lgr5+) contenente ripetizioni contenenti proteine G può anche generare organoidi 3D senza cellule di Paneth o una nicchia ISC come la nicchia epiteliale o la nicchia stromale7. Tuttavia, la capacità di formare organoidi delle cellule Lgr5+ a singolo ordinamento è bassa rispetto a quelle delledoppiette 8 della cripta e delle cellule ISC-Paneth.
Un numero crescente di studi ha dimostrato che i metodi di incubazione dell'acido etilendiamminotetraacetico (EDTA) o di dissociazione della collagenasi causano allentamento nell'epitelio e il rilascio di cripte. Poiché la dissociazione enzimatica può avere un effetto sullo stato cellulare delle cripte, viene solitamente utilizzato un metodo di isolamento meccanico per dissociare il tessuto. Sebbene la digestione meccanica sia una tecnica rapida, questo metodo può essere associato a rese di cripta incoerenti o scarsa vitalità cellulare9. Pertanto, il trattamento EDTA e la dissociazione meccanica possono essere combinati per generare migliori rese di cripta. Una caratteristica della metodologia mostrata in questo articolo è l'uso di uno scuotimento vigoroso dei frammenti di tessuto dopo chelazione EDTA10. Uno scuotimento vigoroso consente l'isolamento efficiente delle cripte dai complessi crypt-villus nell'intestino tenue. Il grado di scuotimento manuale determina la separazione. Pertanto, ottenere cripte da complessi è importante per gli sperimentatori in questo campo. Inoltre, un'abilità adeguata può ridurre al minimo la contaminazione dei villi e aumentare il numero di cripte.
Quindi, questo protocollo sperimentale, che impiega organoidi intestinali piccoli derivati dalla murina, può isolare meglio le cripte con forza fisica dopo il trattamento con EDTA per la dissociazione. È noto che il pattern di espressione del recettore epatocellulare B2 produttore di eritropoietina (EphB2) riflette in parte l'ambiente della cripta. Ad esempio, le cellule EphB2-positive sono organizzate dal basso verso l'alto11. Il sequenziamento cellulare attivato dalla fluorescenza (FACS) è stato effettuato sulla base dell'espressione di EphB2 e le cellule ottenute sono state divise in quattro gruppi: EphB2high, EphB2med, EphB2low ed EphB2neg. Quindi, è stata dimostrata la crescita organoide da cellulealte di EphB2 a selezione singola in topi wild-type (WT).
Tutti gli esperimenti sui topi sono stati approvati dal Suntory Animal Ethics Committee (APRV000561) e tutti gli animali sono stati mantenuti in conformità con le linee guida del comitato per la cura e l'uso di animali da laboratorio. È stato utilizzato un ceppo WT standard di Mus musculus (C57BL6/J). Sono stati utilizzati topi maschi e femmine da 10 settimane a 20 settimane di età. I topi sono stati sottoposti a eutanasia con asfissia da CO2 .
1. Isolamento dell'intestino tenue
2. Isolamento della cripta
3. Selezione cellulare attivata da fluorescenza (FACS)
4. Organoidi in coltura unicellulare
Per generare organoidi intestinali di topo, è possibile utilizzare una combinazione di trattamento EDTA e un metodo di isolamento meccanico per isolare in modo efficiente le cripte10,13. I risultati di questo studio hanno mostrato che quasi tutte le cripte isolate sono state immediatamente sigillate e sono apparse a forma di cono dopo essere state spremute dalle nicchie epiteliali (Figura 1A). Per ridurre al minimo la contaminazione dei villi, la sospensione risultante è stata fatta passare attraverso un filtro cellulare da 70 μm, quindi il filtrato è stato centrifugato. Poiché alcune cripte vengono interrotte durante la filtrazione e la sospensione, questi passaggi devono essere eseguiti con attenzione. I risultati hanno mostrato che quasi tutte le cripte nella frazione finale erano integrate e adatte all'uso in coltura (Figura 1B). Per visualizzare tutte le cripte placcate singolarmente, sono state placcate 100 cripte per pozzo (Figura 1C). Dopo aver aggiunto il terreno di coltura crittografico specifico (Figura 1D), lo sviluppo degli organoidi è stato monitorato quotidianamente con un microscopio. Inoltre, la crescita organoide dalle cripte è stata osservata da immagini time-lapse per monitorare il loro sviluppo (Figura 1E e Video supplementare S1). Le cripte colte si comportavano in modo stereotipato. Il lume interno dell'organoide era pieno di una massa di cellule apoptotiche. La proliferazione attiva e la differenziazione delle ISC si sono verificate nella regione della cripta con gemmazione (Figura 1E e Video supplementare S1). Il germogliamento è stato accoppiato con la migrazione e la proliferazione ISC e la differenziazione delle cellule di Paneth. Le cellule di Paneth differenziate erano sempre situate nel sito di gemmazione (Figura supplementare S1). Poiché gli organoidi sono stati confermati stabili in coltura utilizzando un microscopio invertito con un ingrandimento 10x, la tecnica potrebbe essere utilizzata per esaminare la formazione di cripte nell'intestino tenue in via di sviluppo e per determinare la capacità di rigenerazione dei tessuti e la sopravvivenza ISC a lungo termine per la produzione di nuove cellule epiteliali intestinali14,15,16.
Lgr5 è definito come un marcatore ISC e le cellule Lgr5+ murine formano organoidi 3D7. Tuttavia, poiché l'abbondanza della superficie cellulare della proteina LGR5 è bassa e vi è una mancanza di anticorpi anti-LGR5 ad alta affinità, è difficile isolare in modo efficiente le ISC murine mediante FACS. EphB2 è stato precedentemente identificato come marker di superficie per la purificazione di ISC murine e umane dai tessuti intestinali17,18. Il pattern di espressione di EphB2 aumenta la complessità dei marcatori ISC. Le cellule EphB2-positive sono organizzate in tutto il compartimento proliferativo, raggiungendo il picco nella parte inferiore delle cripte, mentre diminuiscono in un gradiente verso la parte superiore delle cripte11. Anche le cellule di Paneth e le cellule progenitrici sono localizzate nella cripta. Le cellule di Paneth esprimono principalmente EphB3, che è necessario per il loro posizionamento, e le cellule progenitrici sopra di loro nella cripta esprimono principalmente EphB2. Pertanto, la contaminazione di entrambi i tipi di cellule può verificarsi durante il corso della purificazione ISC utilizzando l'anticorpo anti-EphB2. Di conseguenza, devono essere valutate la loro espressione genica marcatrice e la capacità organoide di cellule isolate utilizzando EphB2 mediante FACS.
Sulla base di questi fatti, utilizzando l'analisi FACS, le cellule marcate in superficie EphB2 possono essere isolate dalle cripte WT19. È stato studiato se l'espressione di EphB2 può distinguere tra quattro gruppi con l'espressione di marcatori specifici, come i geni marcatori ISC-specifici (Lgr5, Ascl2 e Olfm4) e i geni marcatori specifici delle cellule progenitrici (Ki67, Myc e FoxM1). Questo esperimento ha dimostrato che le cellulealte di EphB2 erano prevalentemente ISC, a differenza delle cellulemediche EphB220,21. Infine, sulla base del metodo di isolamento cellulare, le cellule ottenute sono state divise in quattro gruppi (EphB2high, EphB2med, EphB2low e EphB2neg cells) (Figura 2). Quindi, singole cellule che esprimono alti livelli di EphB2 ordinati da FACS sono state coltivate per la crescita degli organoidi. Una singola cellulaalta EphB2 può essere applicata indipendentemente per il trattamento localizzato e ricreare strutture cripto-villose auto-organizzanti che ricordano il normale intestino tenue (Figura 3). Tuttavia, le cellule derivate da altri gruppi (EphB2med, EphB2low ed EphB2neg) non generano organoidi20.
In uno studio precedente, ~ 6%delle cellule Lgr5-GFP hi single-sorted sono state in grado di avviare organoidi cripta-villosi7. Tuttavia, le cellule rimanenti non sono state in grado di generare organoidi e sono morte entro le prime 12 ore7. Gli autori presumevano che questo fosse il risultato di stress fisico e/o biologico inerente alla procedura di isolamento7. Meno del 6% di crescita organoide è stata ottenuta anche da cellulealte di EphB2 single-sorted nei topi WT. Entro il giorno 5 della cultura, si formarono strutture simili a sferoidi (Figura 3). Dal giorno 7 al giorno 9, si è verificata l'evaginazione delle macchie per formare cripte (Figura 3). È importante sottolineare che l'applicazione di un inibitore ROCK selezionato alle cellulealte EphB2 single-sorted ha diminuito l'apoptosi indotta dalla dissociazione e aumentato l'efficienza della crescita organoide.
Figura 1: Generazione di organoidi intestinali del topo. (A) Cripte preparate mediante una combinazione di chelazione con EDTA e dissociazione meccanica. (B) Cripte purificate risultanti. (C) Cripte incorporate nella matrice extracellulare. (A-C) Le frecce nere indicano le cripte. (D) Coltura tridimensionale di cripte e organoidi. (E) Immagini rappresentative di un organoide in crescita derivato da una cripta. Le frecce bianche indicano il germogliamento della cripta. Barre di scala = (A-C) 100 μm e (E) 50 μm. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 2: Strategia di gating della citometria a flusso per ottenere una popolazione di cellule EphB2-positive (EphB2+) in topi wild-type. (A) I grafici a dispersione in avanti e laterali sono utilizzati per separare le celle in base alle loro dimensioni e granularità, rispettivamente. (B) La dispersione di fluorescenza viene utilizzata per separare le cellule vitali in base all'intensità di fluorescenza 7-AAD (PerCP) delle cellule. È stato scelto il cancello per la popolazione cellulare 7-AAD-negativa. (C) Sono state scelte le porte per le popolazioni cellulari EphB2-high (EphB2high), EphB2-medium (EphB2med), EphB2-low (EphB2low) ed EphB2-negative (EphB2neg). Abbreviazioni: FSC-A = area di picco di dispersione in avanti; SSC-A = area laterale del picco di dispersione; 7-AAD = 7-ammino-actinomicina D. Fare clic qui per visualizzare una versione ingrandita di questa figura.
Figura 3: Andamento temporale della crescita di organoidiad alte cellule EphB2 single-sorted in topi wild-type. Fare clic qui per visualizzare una versione ingrandita di questa figura.
Tabella 1: Terreno di coltura per una piastra da 24 pozzetti. Clicca qui per scaricare questa tabella.
Video supplementare S1: Immagini time-lapse di un organoide in crescita. Barra di scala = 50 μm. Clicca qui per scaricare questo file.
Figura supplementare S1: Immagine rappresentativa della colorazione anticorpale anti-lisozima in un organoide. Le frecce bianche indicano le celle di Paneth. Abbreviazione: DIC = microscopio a contrasto di interferenza differenziale. Barra di scala = 10 μm. Clicca qui per scaricare questo file.
Questo protocollo descrive un metodo per isolare costantemente le piccole cripte intestinali e la successiva coltura di organoidi 3D. Per migliorare il tasso di rilascio della cripta, è stato stabilito un metodo di isolamento meccanico che prevede uno scuotimento vigoroso dopo il trattamento con EDTA. La composizione del mezzo è diversa dal protocollo originale di Sato et al.7. Il mezzo originale è relativamente costoso. Pertanto, un terreno di coltura e terreni personalizzati per organoidi murini dell'intestino tenue contenenti inibitori farmacologici, fattori di crescita ricombinanti e / o terreni condizionati sono mostrati nella Tabella 1. Wnt3A e N-acetilcisteina non sono inclusi nel terreno di coltura in questo protocollo. Poiché le celle di Paneth esprimono Wnt3, le celle producono Wnt3 e supportano il mantenimento di ISC. Inoltre, durante il corso dell'isolamento della cripta, il mezzo condizionato non viene utilizzato. Il modello organoide è dinamico e presenta eterogeneità cellulare e strutturale (cellule Paneth, enterociti, cellule caliciformi, cellule enteroendocrine, cellule ciuffo e ISC). Quindi, questi organoidi possono essere utilizzati su larga scala per studiare questioni fondamentali della biologia degli organoidi.
Il gradiente EphB2 mantiene la staminalità e la proliferazione ISC lungo l'asse crypt-villus nell'intestino tenue adulto18. Il vantaggio di produrre organoidi da una singola cellula EphB2 rispetto alle cripte isolate riguarda la comprensione della biologia delle ISC murine, poiché le ISC svolgono ruoli chiave in vari disturbi intestinali umani. Le singole ISC adalta espressione EphB2 possono essere coltivate per formare organoidi in modo simile allo sviluppo di organoidi da singole ISC che esprimono Lgr5. Il passo più importante è quello di dividere precisamente le cellule in quattro gruppi (EphB2alto, EphB2med, EphB2basso ed EphB2neg) secondo l'espressione EphB2 nelle cripte usando FACS. I grafici di dispersione diretta rispetto a quelli laterali (FSC vs. SSC) sono comunemente usati per identificare le celle di interesse in base alle loro dimensioni e granularità. FSC indica la dimensione della cella e SSC si riferisce alla complessità o granularità della cella nel gate P0 (Figura 2A). In questo lavoro, le cellule che rientravano all'interno del cancello definito (P0) sono state successivamente analizzate per la vitalità. Successivamente, la loro vitalità è stata determinata in base alle popolazioni negative e positive di segnali di fluorescenza 7-AAD. Il confine tra le cellule 7-AAD-negative e -positive è stato rigorosamente deciso per ottenere quelle negative con una contaminazione cellulare positiva minima. Le porte EphB2 sono state impostate approssimativamente in base all'espressione graduata EphB2.
Per confermare che i quattro gruppi erano divisi con precisione, è stata analizzata l'espressione dell'mRNA di geni selezionati. I livelli di mRNA dei marcatori ISC sono alti nelle cellulealte di EphB220. Inoltre, i livelli di mRNA dei marcatori specifici delle cellule progenitrici sono relativamente alti nelle cellulemediche EphB220. Tuttavia, l'espressione di EphB2 nelle cellule EphB2basse ed EphB2neg è bassa o negativa rispetto a quella delle cellule EphB2alte e EphB2med 20. Le misure precedenti devono essere prese per garantire l'arricchimento della popolazione adalte cellule EphB2 prima della placcatura. Tuttavia, la crescita organoide inferiore al 6% da cellulealte di EphB2 può essere dovuta alla morte delle cellule staminali durante il processo di coltura, non al vigoroso scuotimento durante l'isolamento della cripta. È stato dimostrato che l'applicazione di un inibitore selettivo della chinasi Rho-associata (ROCK) alle cellule staminali embrionali umane riduce notevolmente l'apoptosi22 indotta dalla dissociazione. Pertanto, come modifica tecnica, vale la pena provare ad aggiungere l'inibitore ROCK a una concentrazione più elevata e con un'incubazione più lunga per migliorare la vitalità.
Le cellule di Paneth che secernono Wnt3A accanto alle ISC forniscono un supporto essenziale alle ISC8. Infatti, i doppietti cellulari ISC-Paneth mostrano una capacità organoide fortemente aumentata rispetto alle singole ISC8. Inoltre, l'aggiunta di Wnt3A alla concentrazione di 100 ng/mL per i primi 3 giorni di coltura ha dimostrato di aumentare la capacità di formazione di organoidi8. Pertanto, come ulteriore cambiamento tecnico, l'aggiunta di Wnt3A esogeno potrebbe migliorare la capacità di formazione di organoidi di singole ISC ad alta espressione EphB2.
Rispetto agli approcci in vivo, gli organoidi possono essere facilmente utilizzati per la manipolazione genetica, l'analisi dei fenotipi maligni e lo screening dei farmaci20,23. Una combinazione di chelazione con EDTA e un metodo di isolamento meccanico è efficace, riproducibile ed efficiente in termini di tempo per creare piccoli organoidi intestinali dalle cripte e può essere facilmente seguita dal personale di laboratorio senza alcuna esperienza avanzata. Pertanto, l'aggiunta dell'isolamento meccanico con scuotimento vigoroso dopo il trattamento con EDTA può stabilire efficacemente organoidi murini del piccolo intestino ex vivo e fornire un potenziale strumento per la coltivazione di organoidi e la modellazione della malattia di altri tessuti epiteliali adulti.
Le cellule epiteliali intestinali sono polarizzate e orientate con il lato apicale diretto verso il lume. Tuttavia, il lato apicale rivolto verso il lume degli organoidi 3D è al loro interno. Pertanto, questa organizzazione impedisce l'accesso al lato apicale, che è un problema quando si studiano gli effetti dei componenti luminali, come nutrienti, microbi e metaboliti sulle cellule epiteliali. Per aggirare questo svantaggio, è stata sviluppata una coltura di cellule organoidi come monostrati2D 24. In termini di applicazioni future, verrà utilizzata la coltura di monostrati di cellule organoidi, in quanto rappresenta il sistema più efficiente e trattabile.
Gli autori non hanno conflitti di interesse da dichiarare.
Questo lavoro è stato sostenuto da Grants-in-Aid for Scientific Research (C) a T.T. (numeri di sovvenzione JP17K07495 e JP20K06751). Si ringrazia il Prof. Mineko Kengaku per l'utilizzo delle apparecchiature per l'imaging time-lapse a lungo termine (LCV100; Olimpo).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1.5 mL Eppendorf tube | Eppendorf | 0030 125.215 | |
5 mL syringe | TERUMO | SS-05SZ | |
15 mL Falcon tube | Iwaki | 2325-015 | |
20 μm cell strainer | Sysmex | 04-004-2325 | |
24-well plate | Iwaki | 3820-024 | |
50 mL Falcon tube | Iwaki | 2345-050 | |
60 mm tissue culture dish | FALCON | 353002 | |
70 μm cell strainer | Falcon | 352350 | |
100 mm Petri dish | Iwaki | 3020-100 | |
7-AAD | BD Biosciences | 559925 | |
Advanced DMEM/F12 | Gibco | 12634-010 | |
Alexa Fluor 568 Goat Anti-Mouse IgG (H+L) | Invitrogen | A-11004 | |
Anti-EphB2 APC-conjugated antibody | BD Biosciences | 564699 | |
C57BL6/J mice | Japan SLC, Inc. | ||
Clean bench | HITACHI | CCV-1306E | |
Confocal laser scanning microscope | Olympus | FV3000 | |
EDTA (0.5 mol/L) | Nacalai Tesque | 06894-14 | 2 mM |
FACSMelody | BD Life Sciences-Biosciences | 661762 | |
Fetal bovine serum | Sigma | 173012 | 1% (v/v) |
Fiji (software) | https://fiji.sc/ | ||
Gentamicin (10 mg/mL) | Nacalai Tesque | 16672-04 | 25 μg/mL |
Hammacher laboratory scissor | SANSYO | 91-1538 | |
Incubator | Panasonic | MCO-170-PJ | |
Laboratory tweezer | AS-ONE | 7-164-04 | |
L-Glutamine 200 mM | Gibco | 25030081 | 2 mM |
Matrigel | BD Biosciences | 354230 | ECM for 3D organoids |
Mouse Anti-Human Lysozyme | LSBio | LS-B8704-100 | |
Murine EGF (20 μg/mL stock solution) | PeproTech | 315-09 | 20 ng/mL |
PBS 1x | Gibco | 10010-023 | |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Gibco | 15140-122 | 50 U/mL |
Pipetman (10 μL, 20 μL, 200 μL, and 1,000 μL) | GILSON | 1-6855-12, -13, -15, and -16 | |
Recombinant murine Noggin (20 μg/mL stock solution | R&D Systems | 1967-NG-025 | 100 ng/mL |
Recombinant murine R-Spondin 1 (250 μg/mL stock solution) | R&D Systems | 3474-RS-050 | 500 ng/mL |
Sorbitol | Nacalai Tesque | 32021-95 | 2% (w/v) |
TE2000-S (inverted microscope) | Nikon | 24131 | |
Time-lapse image microscope | Olympus | LCV100 | |
TrypLE Express 1x | Gibco | 12605-010 | |
ULVAC | ULVAC KIKO Inc. | 100073 | |
Y-27632 | Fujifilm | 331752-47-7 | 10 μM |
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