この作品は、NIH R01 GM47607、CA163296およびCETにNSF 1334493によってサポートされています。私たちは、原稿の重要な読書のためのターナーラボのメンバーに感謝します。このレポートに表示されるすべてのデータは、駆虫剤ら。2014年11から許可を得て再現されました。

Durotaxisチェンバースの調製<ol><li> 1つの6ウェル組織培養プレートを調製するために、50 mlのコニカルチューブとのバランスを風袋引き。 50 mlチューブ中のPDMSベース溶液約10グラムを秤量（溶液は非常に粘性があります）。 </li><li> 90：1の基板（〜1キロパスカルのコンプライアンス）、必要に応じて架橋剤溶液の正確な量を決定するために90によってチューブ内のPDMS塩基溶液の測定された重量を分割。同じチューブにPDMSの架橋剤溶液の計算された量を追加します。 例：10グラム/ 90 = 0.11グラム。 PDMSベースのソリューションへのPDMS架橋剤溶液の0.11グラムを追加します。 注：ベースと架橋剤溶液は、両方のPDMSキットで提供されています。 </li><li>精力的に小さなへらを使用して室温で5分間、PDMSベース/架橋剤混合物を混ぜます。この段階で、混合物を多数の気泡を含むであろう。 </li><li> BUBを除去するために、室温で50×gで5分間、卓上遠心機でPDMS基板を遠心BLES。残っている場合は、再び5分、遠心分離後に泡。 </li><li> 90 mlのピ​​ペット1：組織培養の各ウェルに1 PDMS基板を6ウェルプレートを処理しました。 PDMS中に存在する任意の残存する気泡が21 G針を使用してそれらをポップすることにより、この段階で除去することができます。 PDMSは、ウェル中の30分間の広がりを許可します。 </li><li>ボイル12ミリメートルのガラス＃5分間蒸留水で1カバースリップ。 2回繰り返し、蒸留水にカバースリップを格納します。 </li><li>静かにPDMS上にカバーガラスをドロップし、PDMS溶液にカバースリップの片側をタッチすることで、組織培養プレートの各ウェルに1、乾燥したカバーガラスを配置します。カバーガラスが安定するように、PDMSはカバーガラスの縁の上に侵入し始めますが、それを完全にカバーしています。これは、（ 図1A、B参照）硬化後、PDMSとガラスの間のインターフェイスを生成します。 </li><li> （硬化）PDMSを硬化させる16時間オーブンで70℃でプレートをインキュベートします。 PLATを配置細胞培養フードとUVの電子は、10分間滅菌します。 注：これは、使用の数日以内にプレートを作るのがベストです。しかし、プレートは任意のバッファなしパラフィルムで包み、品質の顕著な低下させることなく2週間まで4℃で保存することができます。 </li></ol> 2.細胞播種注：siRNA媒介ノックダウンの効果を研究する場合は、製造元の指示や選択の細胞型に最適化されたプロトコルを使用してノックダウンを行います。 <ol><li>各コートは、37°C​​で1時間、カルシウムおよびマグネシウムを含まないPBS中10μg/ mlのフィブロネクチン1mlのチャンバdurotaxis。あるいは、フィブロネクチン、4℃で16時間、PBS中10μg/ mlのフィブロネクチンでPDMSをインキュベートすることによって、分析前に一日適用することができます。全面をPBS溶液中のフィブロネクチンに沈めていることを確認します。 </li><li>熱変性1％BSAを準備します。 0.5グラムのBSAを秤量し、PBS 50ml中に溶解します。フィルターは、12分間80℃で0.22μmのフィルターと熱を通して溶液を滅菌します。 注：前に4℃での細胞播種と店に一日、この溶液を調製します。 </li><li>フィブロネクチン溶液を吸引し、PBSで3回洗浄します。各ウェルにPBS中の熱変性BSAを1ml加え、室温で30分間インキュベートします。 </li><li> durotaxis室が熱変性BSAでブロックしている一方でトリプシン処理し、選択の細胞をカウントします。 </li><li>プレートの選択の特定の細胞型に必要なメディアを使用してdurotaxis室の各ウェルに2ミリリットルの容量で、1×10 5細胞 、。細胞が付着し、5％CO 2で37℃の加湿インキュベーター中で4時間、基板上に塗布することを許可します。 注：U2OS細胞を日常的に2mMのL-グルタミン、1mMピルビン酸ナトリウム、および10 IU / mlのペニシリン、を10μg/ mlのストレプトマイシンを補充した、10％FBSを含むDMEM中で維持されています。 注：この例で使用される細胞数は、のために最適化されU2OS細胞。他の細胞型のための最適化が必要とされ得ます。この密度は、細胞を他の細胞との相互作用の重要なことなく移行するための十分なスペースを提供します。 </li></ol> 3.ライブセルイメージング<ol><li> 10倍の対物レンズとの位相差を使用して、倒立顕微鏡でライブセルイメージングを実行します。顕微鏡は、長期的画像化の間に37℃の温度を制御し、5％CO 2を可能に囲まれた環境、加湿チャンバーを装着しなければなりません。 </li><li>細胞は約3.5時間に広がった後、顕微鏡室にプレートを組み立てます。サンプル（s）は30分間チャンバー内で平衡化することを許可します。 </li><li>利用可能な場合、顕微鏡に訪問し、自動化、マルチポイントを設定します。 90との間のインターフェイスに焦点を当て：1 PDMSとカバーガラスとdurotaxis室あたり40点の平均とすべてのインターフェイスの周りに画像にポイントを選択します。画像セルまでの16時間ごとに10分。 注：再興味のある祇園は、カバーガラスのエッジとPDMSとカバーガラスとの間の実際のインタフェースに対応する内側のラインに対応する外側のラインで、二行として表示されます。 図1Bを参照してください 。 </li></ol> 4.データ解析<ol><li> 表1のように 、スプレッドシートを生成します。 </li><li>生成された各ムービーからガラス表面およびその逆に、PDMSから交差イベントの数をカウントします。 Excelスプレッドシート内の適切な列に交差するイベントの数を記録します。 注：交差イベントがいずれかの方向にPDMSとガラスの間の境界を通過する細胞の核として定義されます。 </li><li>複数の交差を定量化するために、細胞を界面を越えた回数をカウントします。その数は、細胞は、映画の最後に位置された基板に対応するExcelの列に記録する必要があります。トンのインターフェイスを横断するセル毎に解析を繰り返し彼の映画。撮像中に視野の外に移動する細胞を除外します。 注：これは、細胞は、フィブロネクチンでコーティングされたPDMSとカバーガラスの表面に均等に付着することができることを、実験の開始時に細胞計数によって、検証することも重要です。 </li><li> （ すなわち、durotaxisを受けた）ガラス表面にPDMSから遊走した細胞の割合を計算します。ソフトからハードまでのイベントと交差イベントの合計数で、ハードと除算に終了した複数の交差事象を通過する数を追加します。 </li><li>交差の総数で複数の交差の数を分割して複​​数の交差の割合を計算します。 </li></ol>

<ol>
	<li>Engler, A. J., Sen, S., Sweeney, H. L., Discher, D. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Matrix+elasticity+directs+stem+cell+lineage+specification.">Matrix elasticity directs stem cell lineage specification.</a> Cell. 126 (4), 677-689 (2006).</li><li>Paszek, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tensional+homeostasis+and+the+malignant+phenotype.">Tensional homeostasis and the malignant phenotype.</a> Cancer Cell. 8 (3), 241-254 (2005).</li><li>Levental, K. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Matrix+crosslinking+forces+tumor+progression+by+enhancing+integrin+signaling.">Matrix crosslinking forces tumor progression by enhancing integrin signaling.</a> Cell. 139 (5), 891-906 (2009).</li><li>Lo, C. M., Wang, H. B., Dembo, M., Wang, Y. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell+movement+is+guided+by+the+rigidity+of+the+substrate.">Cell movement is guided by the rigidity of the substrate.</a> Biophysical Journal. 79 (1), 144-152 (2000).</li><li>Plotnikov, S. V., Waterman, C. 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Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Force+and+focal+adhesion+assembly:+a+close+relationship+studied+using+elastic+micropatterned+substrates.">Force and focal adhesion assembly: a close relationship studied using elastic micropatterned substrates.</a> Nature Cell Biology. 3 (5), 466-472 (2001).</li><li>Provenzano, P. P., Keely, P. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanical+signaling+through+the+cytoskeleton+regulates+cell+proliferation+by+coordinated+focal+adhesion+and+Rho+GTPase+signaling.">Mechanical signaling through the cytoskeleton regulates cell proliferation by coordinated focal adhesion and Rho GTPase signaling.</a> Journal of Cell Science. 124 (8), 1195-1205 (2011).</li><li>Wang, Y. L., Pelham, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preparation+of+a+flexible,+porous+polyacrylamide+substrate+for+mechanical+studies+of+cultured+cells.">Preparation of a flexible, porous polyacrylamide substrate for mechanical studies of cultured cells.</a> Methods in Enzymology. 298, 489-496 (1998).</li><li>Prager-Khoutorsky, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fibroblast+polarization+is+a+matrix-rigidity-dependent+process+controlled+by+focal+adhesion+mechanosensing.">Fibroblast polarization is a matrix-rigidity-dependent process controlled by focal adhesion mechanosensing.</a> Nature Cell Biology. 13 (12), 1457-1465 (2011).</li><li>Wormer, D. B., Davis, K. A., Henderson, J. H., Turner, C. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+focal+adhesion-localized+CdGAP+regulates+matrix+rigidity+sensing+and+durotaxis.">The focal adhesion-localized CdGAP regulates matrix rigidity sensing and durotaxis.</a> PloS ONE. 9 (3), e91815 (2014).</li><li>Trichet, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evidence+of+a+large-scale+mechanosensing+mechanism+for+cellular+adaptation+to+substrate+stiffness.">Evidence of a large-scale mechanosensing mechanism for cellular adaptation to substrate stiffness.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 109 (18), 6933-6938 (2012).</li><li>Eyckmans, J., Boudou, T., Yu, X., Chen, C. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+hitchhiker&#8217;s+guide+to+mechanobiology.">A hitchhiker&#8217;s guide to mechanobiology.</a> Developmental Cell. 21 (1), 35-47 (2011).</li><li>Martinac, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanosensitive+ion+channels:+molecules+of+mechanotransduction.">Mechanosensitive ion channels: molecules of mechanotransduction.</a> Journal of Cell Science. 117 (12), 2449-2460 (2004).</li><li>Jafar-Nejad, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sec15,+a+component+of+the+exocyst,+promotes+notch+signaling+during+the+asymmetric+division+of+Drosophila+sensory+organ+precursors.">Sec15, a component of the exocyst, promotes notch signaling during the asymmetric division of Drosophila sensory organ precursors.</a> Developmental Cell. 9 (3), 351-363 (2005).</li></ol>

The authors have no conflicts to disclose.

ここで我々は、細胞の移行にdurotaxisを研究するための単純なアッセイを説明します。このアッセイの主な強みは、PDMSを用いdurotaxisチャンバを調製する容易さです。基板の剛性を容易にアッセイにおける様々な剛性の研究を可能にするために、架橋剤にPDMSベース溶液の比率を変えることによって操作することができます。しかし、システムの潜在的な制限は、より洗練されたシステム4</sup...

細胞外マトリックス（ECM）は、コラーゲン、フィブロネクチンおよびラミニンを含む構造と架橋タンパク質の複雑な配列で構成されています。それは十分にECMは細胞組織のための重要な構造的支持を提供することが確立されているが、細胞が活発に細胞生存、分化および細胞遊走を含む多様な細胞プロセスを調節するために、それらのECM環境の物理的変化に応答することを示す証拠が増えてきています。硬い（〜25キロパスカル）の基板は骨形成分化1を促進しながら、例えば、ECMの剛性の違いは、ソフト基板（〜1キロパスカル）神経性系統を促進して、異なる系統に向けて、間葉系幹細胞を駆動することができます。同様に、間質マトリックスの剛性の増加は、周囲の組織2,3に乳腺上皮細胞の腫瘍形成および浸潤を促進することが示されています。 このmechanosignの特に興味深い点細胞がよりリジッド基板4,5の方に優先的に移行するdurotaxis、として知られているプロセスでの活動結果をaling。細胞は常に、ECMに結合するインテグリン受容体を介して、それらの細胞外環境の物理的特性を感知します。これは、順番に、接着斑または焦点コンタクト6,7として公知の接着剤構造の形成を駆動するために、それらの細胞質ドメインに、多数の構造的およびシグナル伝達タンパク質の蓄積を促進します。 インテグリンは全く固有の酵素活性を有していないので、信号がその環境変化〜8セルの応答を調整するために、これらのアクセサリータンパク質を介して、ECMから中継されます。従って、mechanosignalingとdurotaxisの調節に関与する重要なタンパク質の同定および特徴付けは、研究の重要な領域です。 様々なモデル系は 、in vitroでdurotaxisを研究するために開発されてきたが、ほとんどが持っていますコラーゲンコートポリアクリルアミド基材4を用いました。しかし、ポリアクリルアミド基質の製造は技術的に困難であることができ、これらのアッセイで使用されるコラーゲンは、 基板 9に化学的に架橋する必要があります。ポリジメチルシロキサン（PDMS）基板、ポリアクリルアミド基板10に匹敵する機械的特性を示すことが示されています。しかし、PDMS基板は、単に架橋剤を塩基の比を混合することによって調製され、これらの基板は、このようにPDMS細胞挙動に対する剛性​​の影響を研究するための容易なツールを作製する、化学的架橋を必要とせずに、ECMタンパク質でコーティングすることができます。ここで、我々はソフトPDMS基板は、硬質ガラスカバースリップで一体化された単純なdurotaxis室を準備する方法について説明します。 アッセイは、以下に概説するように、durotaxisを研究するために迅速かつ簡単な方法を提供します。この研究のために、我々は、siRNA媒介と組み合わせ、人間のU2OS骨肉腫細胞を使用しましたdurotaxis 11でこの焦点接着タンパク質の役割を研究するcdGAPのノックダウン。重要なことに、このプロトコルは、容易に個々の要件に適合させることができます。他の細胞型は、U2OS細胞に置換されてもよく、任意のタンパク質をノックダウンまたはdurotaxis中の細胞の挙動に影響を決定するために過剰発現することができます。さらに、このプロトコルは、FRAPまたはFRETの手法を使用してダイナミックス及び挙動を分析するためにタグ付けされた蛍光タンパク質を組み込むように適合されてもよいです。

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Polydimethylsiloxane (PDMS)</td>
			<td>Dow Corning</td>
			<td>3097358-1004</td>
			<td>Sylgard 184 Silicone Elastomer Kit</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>#1 Cover glass 12mm</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>12-545-82</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>6-well plate</td>
			<td>Celltreat</td>
			<td>229106</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DMEM</td>
			<td>Cellgro</td>
			<td>15-017-CM</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>L-Glutamine</td>
			<td>Cellgro</td>
			<td>25-005-CI</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Pyruvate</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP356-100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Penicillin/Streptomycin</td>
			<td>Cellgro</td>
			<td>30-002-CI</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fibronectin</td>
			<td>BD Biosciences</td>
			<td>610077</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PBS</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>21600-044</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Falcon tubes</td>
			<td>Celltreat</td>
			<td>229456</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fetal Bovine Serum</td>
			<td>Atlanta Biologicals</td>
			<td>S11150</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bovine Serum Albumin</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>A7906</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>U2OS cells</td>
			<td>ATCC</td>
			<td>HTB-96</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

a simplified system for evaluating cell mechanosensing and durotaxis in vitro

細胞外マトリックスの組成及び機械的特性は、組織型間で高度に可変です。この結合組織の間質の多様性に大きく影響を与える細胞の挙動細胞増殖、分化、接着シグナリングおよび方向性のある移動を含む正常および病理学的過程を調節するために。この点において、特定の細胞型の生来の能力がdurotaxisと呼ばれる堅い、以下に準拠マトリクス基板に向かって移動します。この現象は、胚発生、創傷修復及び癌細胞浸潤の間に重要な役割を果たしています。ここでは、ポリジメチルシロキサン（PDMS）基板を用いて、in vitroで 、durotaxisを研究するための簡単なアッセイを説明します。室durotaxis記載の製造は比較的柔らかいPDMSゲルと硬質カバーガラスとの間に剛性のインターフェースを作成します。提供された例では、CDC42 / Rac1のGTPアーゼ活性化proteの役割を実証するために、これらのdurotaxis室を使用していましたcdGAP、で、mechanosensingと人間のU2OS骨肉腫細胞におけるdurotaxis規制インチこのアッセイは、他の細胞型および/またはmechanosignalingとdurotaxisにおけるそれぞれの役割を探求するための利益の他のタンパク質のノックダウンに容易に適合可能です。

durotaxisチャンバの概略図は 、図1Aに示されています。ソフトPDMS基板を、（90：ソリューションを架橋するために、PDMSベースの1混合物）を6ウェル皿に広げ、カバーガラスがそれによってインターフェースを作成し、部分的にカバーガラスの上面を覆うPDMSの上に配置されます異なるコンプライアンスの2枚の基板の間。ソフトPDMS基板の剛性は、ガラスの剛性は約1 GPaで1~2で...

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A Simplified System for Evaluating Cell Mechanosensing and Durotaxis In Vitro

Many mammalian cells preferentially migrate towards a more rigid matrix or substrate through durotaxis. The goal of this protocol is to provide a simple in vitro system that can be used to study and manipulate cell durotaxis behaviors by incorporating polydimethylsiloxane (PDMS) substrates of defined rigidity, interfacing with glass coverslips.

セルMechanosensingとDurotaxisを評価するための簡略化したシステム<em&gt;インビトロ</em

The composition and mechanical properties of the extracellular matrix are highly variable between tissue types. This connective tissue stroma diversity ...

a-simplified-system-for-evaluating-cell-mechanosensing-durotaxis

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Biology

A Simplified System for Evaluating Cell Mechanosensing and Durotaxis In Vitro

8.1K ビュー.  SUNY Upstate Medical University. Many mammalian cells preferentially migrate towards a more rigid matrix or substrate through durotaxis. The goal of this protocol is to provide a simple in vitro system that can be used to study and manipulate cell durotaxis behaviors by incorporating polydimethylsiloxane (PDMS) substrates of defined rigidity, interfacing with glass coverslips.