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전체 머리 fNIRS 커버리지를 가진 동일한 피험자로부터 fMRI 및 fNIRS 신호를 동시에 수집하는 방법을 제시합니다. 이 프로토콜은 3명의 젊은 성인을 대상으로 테스트되었으며 발달 연구 및 임상 인구를 위한 데이터 수집에 적용할 수 있습니다.
기능적 근적외선 분광법(fNIRS)은 기능적 자기공명영상(fMRI)보다 움직임에 더 강력하고 비용 효율적인 휴대용 신경영상 방법론으로, 뇌 기능에 대한 자연주의적 연구를 수행하고 발달 및 임상 인구에 사용하는 데 매우 적합합니다. fNIRS와 fMRI 방법론 모두 기능적 뇌 활성화 중 대뇌 혈액 산소 공급의 변화를 감지하며, 이전 연구에서는 두 신호 사이에 높은 공간적 및 시간적 대응이 있음을 보여주었습니다. 그러나 전체 헤드 fNIRS 커버리지를 가진 동일한 피험자로부터 동시에 수집된 두 신호의 정량적 비교는 없습니다. 이 비교는 fMRI 골드 스탠다드에 대한 영역 수준 활성화 및 기능적 연결성을 종합적으로 검증하는 데 필요하며, 이는 수명 전반에 걸쳐 두 신호의 비교를 용이하게 할 수 있는 잠재력을 가지고 있습니다. 우리는 fMRI 및 fNIRS 신호의 동시 데이터 수집을 위한 프로토콜을 설명함으로써 이러한 격차를 해결합니다: i) 전체 헤드 fNIRS 커버리지를 제공합니다. ii) 비피질적, 전신 생리학적 신호의 회귀를 위한 단거리 측정을 포함합니다. iii) fNIRS 측정의 optode-to-scalp co-registration을 위한 두 가지 다른 방법을 구현합니다. 세 명의 피험자의 fMRI 및 fNIRS 데이터가 제시되고 발달 및 임상 인구를 테스트하기 위해 프로토콜을 조정하기 위한 권장 사항이 논의됩니다. 성인을 대상으로 한 현재 설정은 기능 및 구조 스캔을 모두 포함하여 평균 약 40분 동안 스캔 세션을 허용합니다. 이 프로토콜은 자기 공명(MR) 환경에서 사용하기 위해 fNIRS 장비를 조정하는 데 필요한 단계를 간략하게 설명하고, 데이터 기록 및 검토-두피 공동 등록에 대한 권장 사항을 제공하며, 사용 가능한 MR-안전 fNIRS 시스템의 세부 사항에 맞게 프로토콜의 잠재적 수정에 대해 논의합니다. 점멸 체커보드 작업의 대표적인 주제별 응답은 MR 환경에서 전체 헤드 fNIRS 신호를 측정하기 위한 프로토콜의 타당성을 보여줍니다. 이 프로토콜은 수명 주기 동안 fMRI에 대한 fNIRS 신호를 검증하는 데 관심이 있는 연구자에게 특히 적합합니다.
인지 기능은 거의 30년 동안 기능적 자기 공명 영상(fMRI)을 통해 성인 인간의 뇌에서 연구되어 왔습니다. fMRI는 높은 공간 해상도와 기능적 및 구조적 이미지를 모두 제공하지만, 자연주의적 맥락에서 수행되는 연구나 유아 및 임상 인구를 대상으로 하는 연구에는 실용적이지 않은 경우가 많습니다. 이러한 제약은 뇌 기능에 대한 우리의 이해를 실질적으로 제한한다. fMRI의 대안은 기능적 근적외선 분광법(fNIRS)1,2,3과 같이 보다 비용 효율적이고 움직임에 강한 휴대용 방법을 사용하는 것입니다. fNIRS는 언어 발달, 사회적으로 관련된 정보의 처리 및 객체 처리와 같은 다양한 인지 영역에서 뇌 기능을 평가하기 위해 영유아와 함께 사용되었습니다 4,5,6. fNIRS는 또한 7,8,9세에 걸쳐 반복적인 테스트 및 모니터링이 가능하기 때문에 임상 인구 테스트에 특히 적합한 신경 영상 양식입니다. 광범위한 적용 가능성에도 불구하고 동일한 피험자로부터 동시에 수집된 fMRI와 fNIRS 신호를 머리 전체를 대상으로 정량적으로 비교한 연구는 없습니다. 이 비교는 fMRI 골드 스탠다드에 대해 관심 영역(ROI) 간의 영역 수준 활성화 및 기능적 연결을 종합적으로 검증하는 데 필요합니다. 또한, 이러한 상호모달리티(inter-modality) 대응을 확립하면 fNIRS가 전형적 및 비정형 개발 모두에서 유일하게 수집된 신호인 경우 fNIRS의 해석을 향상시킬 수 있습니다.
fMRI와 fNIRS 신호는 모두 기능적 뇌 활성화 동안 대뇌 혈액 산소화(CBO)의 변화를 감지한다 10,11. fMRI는 전자기장의 변화에 의존하며 CBO 변화의 높은 공간 분해능을 제공한다12. 이와 대조적으로 fNIRS는 일련의 발광 및 광 검출 옵토드를 사용하여 근적외선의 흡수 수준을 측정합니다2. fNIRS는 서로 다른 파장에서 흡수 변화를 측정하기 때문에 산소헤모글로빈과 디옥시헤모글로빈의 농도 변화를 평가할 수 있습니다. 적은 수의 옵토드로 fMRI 및 fNIRS 신호를 동시에 기록한 선행 연구에서는 두 신호가 높은 공간적 및 시간적 대응성을 갖는다는 것을 보여주었다10. 혈중 산소 농도 의존적(BOLD) fMRI와 광학 측정사이에는 강한 상관관계가 있으며, fNIRS와 fMRI 혈역학적 반응 기능(HRF)의 시간적 역학을 비교한 선행 연구에서 보고된 바와 같이 디옥시헤모글로빈이 BOLD 반응과 가장 높은 상관관계를 보였습니다14. 이러한 초기 연구는 운동 반응 패러다임(즉, 손가락 두드리기)을 구현하고 1차 운동 및 전운동 피질 영역을 포괄하는 제한된 수의 옵토드를 사용했습니다. 지난 10년 동안 연구는 더 큰 인지 작업 및 휴식 상태 세션을 포함하도록 초점을 확장했지만 여전히 특정 ROI를 다루는 제한된 수의 옵토드를 사용하고 있습니다. 이러한 연구들은 fNIRS/fMRI 상관관계의 가변성이 두피와 뇌에서 옵토드의 거리에 따라 달라진다는 것을 보여주었다15. 또한, fNIRS는 fMRI16,17에 필적하는 휴지 상태 기능적 연결성 측정을 제공할 수 있다.
현재 프로토콜은 이전 작업을 기반으로 하며, i) 전체 헤드 fNIRS 커버리지를 제공하고, ii) 비피질 생리학적 신호의 회귀를 위한 단거리 측정을 포함하고, iii) fNIRS 측정의 검토-두피 공동 정합을 위한 두 가지 다른 방법을 구현하고, iv) 두 개의 독립적인 세션에서 신호의 테스트-재테스트 신뢰성을 평가할 수 있도록 함으로써 주요 제한 사항을 해결합니다. fMRI 및 fNIRS 신호의 동시 데이터 수집을 위한 이 프로토콜은 처음에 젊은 성인을 테스트하기 위해 개발되었습니다. 그러나 이 연구의 목표 중 하나는 발달 인구 테스트에 적용할 수 있는 동시 fMRI/fNIRS 신호를 수집하기 위한 실험 설정을 만드는 것이었습니다. 따라서 현재 프로토콜은 어린 아이들을 테스트하기 위한 프로토콜을 개발하기 위한 출발점으로도 사용할 수 있습니다. 전체 헤드 fNIRS 커버리지를 사용하는 것 외에도 프로토콜은 전신 생리학적 신호(즉, 혈압, 호흡기 및 심장 신호와 같은 비피질 소스에서 발생하는 혈관 변화)를 측정하기 위한 단거리 채널을 포함하는 것과 같은 fNIRS 하드웨어 분야의 최근 발전을 통합하는 것을 목표로 합니다.18,19 ; 및 검토-두피 공동 정합을 위한 3D 구조 센서의 사용20. 현재 프로토콜의 초점은 시각적으로 깜박이는 바둑판 작업의 결과에 있지만, 전체 실험에는 전통적인 블록 작업 설계, 휴식 상태 세션 및 자연주의적 영화 감상 패러다임이 혼합된 두 개의 세션이 포함됩니다.
이 프로토콜은 캡 설계, 트리거 동기화를 통한 시간적 정렬, 데이터 수집 시작 전에 필요한 팬텀 테스트를 포함하여 MRI 환경에서 사용할 수 있도록 fNIRS 장비를 조정하는 데 필요한 단계를 설명합니다. 앞서 언급했듯이 여기서는 깜박이는 바둑판 작업의 결과에 초점을 맞추지만 전체 절차는 작업에 국한되지 않으며 여러 실험 패러다임에 적합할 수 있습니다. 이 프로토콜은 fNIRS 캡 배치 및 신호 교정, 참가자 및 실험 장비 설정, 실험 후 정리 및 데이터 저장을 포함하여 데이터 수집 중에 필요한 단계를 추가로 설명합니다. 프로토콜은 fNIRS 및 fMRI 데이터 전처리에 특정한 분석 파이프라인에 대한 개요를 제공하는 것으로 끝납니다.
이 연구는 예일 대학의 IRB(Institutional Review Board)의 승인을 받았습니다. 모든 피험자에 대해 정보에 입각한 동의를 얻었습니다. 피험자는 안전한 참여를 보장하기 위해 MRI 검사를 통과해야 했습니다. 인지 기능에 영향을 미칠 수 있는 심각한 의학적 또는 신경학적 장애(예: 신경인지 또는 우울 장애, 외상, 정신 분열증 또는 강박 장애)의 병력이 있는 경우 제외되었습니다.
참고: 현재 프로토콜은 1.95Hz에서 샘플링된 100개의 장거리 채널과 8개의 단거리 채널(32개의 레이저 다이오드 소스, λ = 785/830nm, 평균 출력 20mW/파장, 38개의 애벌랜치 포토다이오드 검출기)이 있는 CW-NIRS 장치를 사용합니다. MRI 및 fMRI 스캔은 20채널 헤드 코일을 사용하여 Siemens 3 Tesla Prisma 스캐너에서 수집되었습니다. 모든 데이터는 예일 뇌 영상 센터(Yale Brain Imaging Center, https://brainimaging.yale.edu/)에서 수집되었습니다. 동시 fMRI 및 fNIRS 데이터를 수집하기 위한 시스템별 수정이 프로토콜 전체에 걸쳐 기록되어 있습니다.
1. 동시 데이터 수집을 위한 fNIRS 장비 개조 및 개발
참고: 3-6단계는 NIRScoutXP 시스템에만 해당되며 수집 소프트웨어 및 옵토드 평가에 사용할 수 있는 팬텀의 차이로 인해 다른 fNIRS 시스템에는 적용되지 않을 수 있습니다.
그림 1. fMRI 및 fNIRS 측정의 동시 데이터 수집을 위한 장비. (A) 각 옵토드에 인접한 fNIRS 캡에 꿰매어진 비타민 E 캡슐을 보관하기 위한 검은색 발수 소재로 만든 파우치. (B) 광섬유를 바닥 위에 고정하여 데이터 수집 중에 참가자의 머리에 도달할 수 있도록 하는 MRI 안전 브리지. (C) 스캐너에서 fNIRS 장치로 펄스를 전송하는 병렬 포트 리플리케이터. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
2. 실험과제 설계
3. 테스트 당일 fNIRS 캡 배치 및 신호 교정
참고: 아래의 모든 단계는 달리 명시되지 않는 한 MRI 제어실 또는 동의실에서 수행됩니다.
그림 2. fNIRS 캡 준비를 위한 단거리 검출기 및 도구. (A) 단거리 검출기 프로브 및 고무 버퍼는 머리카락이 최소화된 전면 영역의 fNIRS 캡에 부착됩니다. (B) 왼쪽에서 오른쪽으로: 광섬유를 번들로 배열하는 케이블 정리함, 옵토드를 배치하는 동안 모발을 밀어내는 MRI 안전 애플리케이터, 모발을 대체하기 위해 NIRS 캡을 설정하는 동안 필요한 경우 캡에서 옵토드를 제거하는 플라스틱 핀셋. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 3. 3D 구조 센서 디지타이저 및 fNIRS 캡 배치. (A) 3D 구조 센서 디지타이저를 사용하여 참가자 머리의 3D 모델을 만드는 실험자. 녹색 스티커는 기준 위치를 식별하는 데 사용됩니다. (B) 참가자 머리의 fNIRS 캡에 삽입되고 신호 보정 전에 케이블 오거나이저를 사용하여 번들로 배열된 광섬유. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
4. 참가자 설정
알림: 다음 단계는 MRI 스캐너실에서 수행됩니다. 호흡 벨트와 맥박 산소 측정기의 사용은 선택 사항이며, 연구자들이 fNIRS 데이터로부터 이러한 신호를 회귀 분석하는 데 관심이 있는 경우에만 필요하다(22). 이 프로토콜은 구속 벨트를 사용하여 호흡 진폭을 획득하기 위해 호흡 단위의 일부인 호흡 벨트를 사용합니다. 유사하게, 생리학적 맥박 단위는 심장 리듬을 획득할 수 있는 광학 혈량측정 센서로 구성됩니다.
그림 4. MRI 스캐너에 설정된 참가자. (A) 참가자의 머리를 지지하는 데 사용되는 MR 헤드 코일 내부의 베개와 참가자가 설정하기 전에 번들로 배열된 광섬유. (B) 테스트를 위해 fNIRS 캡을 씌운 채 스캐너 베드에 누워 있는 참가자. 헤드 코일의 상단은 아직 참가자의 얼굴 위에 놓이지 않았습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
5. 신호 기록 전 스캐너 및 fNIRS 장비 설정
6. 동시 신호 기록
그림 5. 실험 과제로 바둑판 패러다임을 번쩍입니다. 참가자들은 흰색 사각형이 초당 8번 깜박이는 흑백 바둑판 패턴과 흰색 원이 표시된 회색 화면이 번갈아 나타나는 것을 보았습니다. 주의 점검의 일환으로 참가자들은 화면 중앙에 흰색 원이 나타나면 오른손으로 버튼을 누르도록 지시받았습니다. 버튼을 누르면 원이 빨간색으로 바뀝니다. 이 작업은 총 22개의 블록(11개의 깜박이는 바둑판 블록과 11개의 시험 기간 간)으로 구성된 단일 실행으로 완료되었습니다. 깜박이는 바둑판 주기는 10초 동안 지속되었고 시험 간 기간은 20초 동안 지속되었습니다. 따라서 깜박이는 바둑판의 시작은 30초(0.033Hz)마다 발생했습니다. 디스플레이는 PsychoPy v2021.2.4에 의해 생성되었으며 1080p DLP 프로젝션 시스템을 통해 헤드 코일 상단의 후면 미러에 투사되었습니다. 참가자들은 이 과제를 한 번 실행했습니다(~6분). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
7. 실험 후 정리 및 데이터 저장
8. fMRI 데이터 전처리
참고: fMRI 데이터는 신경 영상 양식 전반에 걸쳐 데이터 구성, 전처리, 품질 보증 및 분석을 지원하는 오픈 소스 소프트웨어 제품군인 QuNex24를 사용하여 Human Connectome Project23의 최소 전처리 파이프라인에 따라 전처리되었습니다. 아래에 강조 표시된 각 단계의 특정 설정 및 매개변수에 대한 자세한 설명서는 QuNex 웹 사이트(https://qunex.yale.edu/)에서 확인할 수 있습니다. 데이터를 처리하는 데 사용되는 주요 단계와 매개변수는 다음과 같습니다.
9. fNIRS 데이터 전처리
참고: fNIRS 데이터는 특정 참가자 또는 지도책의 해부학에 공동 등록된 뇌 기능의 복셀 수준 맵에 대한 원시 조명 수준의 광학 데이터를 분석하기 위한 오픈 소스 환경인 NeuroDOT26을 사용하여 fNIRS 데이터 분석25의 모범 사례에 따라 분석되었습니다. 아래에 설명된 모든 단계는 NeuroDOT로 수행할 수 있습니다. 아래에 강조 표시된 각 단계의 특정 설정 및 매개 변수에 대한 추가 설명서는 https://github.com/WUSTL-ORL/NeuroDOT_Beta 의 자습서 및 스크립트에서 찾을 수 있습니다. 마지막으로, 검토-두피 정합은 기저 뇌 조직을 기준으로 fNIRS 광선 좌표를 얻어야 하며, 가능한 경우 3D 디지타이저 또는 비타민 E 캡슐을 기준점으로 사용하여 수행할 수 있습니다. 두 방법 모두 이 섹션에 설명되어 있으며 관련 소프트웨어 패키지에 대한 참조가 제공됩니다.
10. fMRI/fNIRS 작업 유발 데이터 분석
이 섹션에서는 fMRI 신호와 fNIRS 신호 모두에 대한 깜박이는 체커보드 작업에 대한 대표적인 피험자별 응답을 제공합니다. 먼저, 대표적인 원시 fNIRS 데이터 및 품질 평가가 그림 6 및 그림 7 에 표시되어 MRI 환경에서 fNIRS 신호를 측정하기 위한 실험 설정의 타당성을 보여줍니다. 전체 헤드 옵토드 어레이 및 감도 프로파일의 다이어그램은
fMRI 및 fNIRS 신호의 동시 데이터 수집을 위한 이 프로토콜은 전신 비피질 생리학적 신호를 측정하고 회귀하기 위해 전체 헤드 fNIRS 옵토드 어레이와 단거리 채널을 사용합니다. 이 프로토콜의 중요한 단계에는 MRI 환경에서 fNIRS 신호를 수집하기 위한 fNIRS 장비의 수정 및 개발이 포함됩니다. 우리가 아는 한, 전체 헤드 fNIRS 어레이를 사용하여 동시 fMRI 및 fNIRS 측정을 캡처하는 데 완전히 최적화된 턴?...
이 논문의 출판비는 NIRx에서 후원합니다. 저자는 더 이상 공개할 것이 없습니다.
이 연구는 뇌 및 행동 연구 재단(Brain and Behavior Research Foundation)의 NARSAD Young Investigator Award 보조금(보조금 #29736)(SSA), 빌 앤 멜린다 게이츠 재단(Bill and Melinda Gates Foundation)의 글로벌 그랜드 챌린지 보조금(Grant #INV-005792)(RNA) 및 예일 대학교 심리학과(RNA)의 디스커버리 기금 보조금(Discovery Fund Grant)의 지원을 받았습니다. 저자들은 또한 데이터 수집에 도움을 준 Richard Watts(Yale Brain Imaging Center)와 데이터 분석에 도움을 준 Adam Eggebrecht, Ari Segel 및 Emma Speh(Washington University in St Louis)에게 감사의 뜻을 전합니다.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
280 low-profile MRI-compatible grommets for NIRs caps | NIRx | GRM-LOP | |
4 128-position NIRS caps with 128x unpopulated slits in 10-5 layout | NIRx | CP-128-128S | Sizes: 52, 54, 56, 60 |
8 bundles of 4x detector fibers with low-profile tip; MRI-, MEG-, and TMS-compatible. | NIRx | DET-FBO- LOW | 10 m long |
8 bundles of 4x laser source fibers with MRI-compatible low-profile tip | NIRx | SRC-FBO- LAS-LOW | 10 m long |
Bundle set of 8 short-channel detectors with specialized ring grommets that fit to low-profile grommets | NIRx | DET-SHRT-SET | Splits a single detector into 8 short channels that may be placed anywhere on a single NIRS cap |
Magnetom 3T PRISMA | Siemens | N/A | 128 channel capacity, 64/32/20 channel head coils, 80 mT/m max gradient amplitude, 200 T/m/s slew rate, full neuro sequences |
NIRScout XP Core System Unit | NIRx | NSXP- CHS | Up to 64x Laser-2 (or 32x laser-4) illuminators or 64 LED-2 illuminators; up to 32x detectors; capable of tandem (multi-system) and hyperscanning (multi-subject) measurements; compatible with EEG, tDCS, eye-tracking, and other modalities; modules available for fMRI, TMS, MEG compatibility |
NIRStar software | NIRx | N/A | Version 15.3 |
NIRx parallel port replicator | NIRx | ACC-LPT-REP | The parallel prot replicator comes with three components: parallel port replicator box, USB power cable and BNC adapter |
Physiological pulse unit | Siemens | PPU098 | Optical plethysmography allowing the acquisiton of the cardiac rhythm. |
Respiratory unit | Siemens | PERU098 | Unit intended for the acquisition of the respiratory amplitude (by means of a pneumatic system and a restraint belt). |
Structure Sensor Mark II | Occipital | 101866 (SN) | 3D structure sensor for optode digitization. |
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