NIH 미국에서 부여 EB007279 및 HL081273의 지원은 기꺼이 인정받고 있습니다.

1. 산소 측정 프로토콜의 일반적인 설명 (이 섹션은 모든 작업을했지만 논문의 나머지 부분을 이해하는데 매우 중요합니다하지 않습니다. 이것이 음성과 함께, 몇 파워 포인트 슬라이드의 순서로, 예를 들어, 촬영하실 수 있습니다.) 1.1)이 프로브는 관심의 매체로 전달됩니다 예를 들어, 동물의 혈액이나 중간 유체 주입. 1.2) 개체 (조직의 표면은)는 흥분 플렛 상태로 탐사를 추진하기 위해 적절한 파장의 빛을 함께 조명됩니다. 일반적으로 여기는 한 광자 메커니즘을 통해 발생합니다. 그러나, 특별한 두 광자 향상된 프로브의 경우, 여기는 고해상도 현미경 응용 프로그램의 프로브를 사용하여 허용 두 광자 메커니즘을 통해 수행할 수 있습니다. 한 광자의 여진은 일반적으로 더 적은 공간 해상도를 제공하지만 간단한 장비가 필요하며 LED 기반 광섬유 phosphorometers 단일 포인트 측정에 사용할 수 있습니다. 프로브에 의해 방출 1.3) 인광은 긴 플렛 상태에서 유래. 프로브 분자는 특별히 플렛 상태의 높은 양자 수율을 제공하고 대신 형광 인광 방출하도록 설계되어야합니다. 플렛 상태에있는 동안 탐사선은 플렛 상태를 드 활성화할 수의 산소 분자와 collisional 조우를 경험할 수 있습니다 - &quot;. 담금질 &#39;이라는 과정 인광 부패 따라서 산소, 플렛 상태의 수명, 그리고이없는 경우, τ 0입니다. 산소의 존재에 인광 수명은 (τ) 담금질의 결과로 단축됩니다. 플렛 상태의 수명과 환경에서 산소의 양 사이 직접적인 관계가있다. 이것은 산소 농도 [O 2] (또는 산소 분압 PO 2) 인광의 수명을 (τ) 연결하는 잘 알려진 스턴 볼머 관계이다 : <img src="/files/ftp_upload/1731/1731equation.jpg" alt="방정식" /> 생물 학적 시스템에서 산소가 지금까지 산소로 인광 담금질 방법은 매우 선택적하게 인광의 가장 효과적인 끄는 것입니다. 1.4) 수명 t를 측정하기 위해서는 배출 인광을 발하는 광자는 시간에 binned 있습니다. 어떤 광자가 수집되지 때까지 예를 들어, 여기 펄스 후에 200 광자는 등등, 처음 15 마이크로초에서 다음 15 마이크로초에서 수집한 150 광자를 수집하고 수 있습니다. 방식의 숫자는 수명 τ를 반환하기 위해 분석되는 인광 부패를주는 시간이 역모를 꾸몄다. 영상에서는,이 절차는 인광 평생지도에서 결과 이​​미지의 모든 픽셀에 적용됩니다. 수명의 측정은 생물 학적 샘플에 대한 일반되는 개체에 걸쳐 프로브 배포판의 heterogeneities로 구분하지 않습니다. 따라서, 인생은 산소에 대한 리포트입니다. 수명 τ는 스턴 볼머 관계를 사용하여 산소 농도로 변환됩니다. 2. 인광을 발하는 프로브 구축 생물 학적 시스템의 산소 측정 프로브는 인광을 발하는 dendrimers의 구축 새장에 캡슐 인광을 발하는 chromophores (코어)로 구성 - 매우 일반 hyperbranched 폴리머 [3]. Dendrimers은 환경과 상호 작용에서 코어를 보호하고 가능한 프로브의 감도 및 동적 범위 (스턴 볼머 관계 상수 K Q)를 최적화하고, 코어 산소 확산의 속도를 제어합니다. dendrimers의 테르 미니 (Termini)는 프로브가 높은 수용성 및 생물 학적 macromolecules와의 상호 작용을 방지하고, 화학적으로 불활성 친수성 ​​폴리에틸렌 글리콜 (PEG) 그룹으로 변경됩니다. 프로브의 인광을 발하는 코어 porphyrins과 π - 확장 porphyrins의 PT이나 경찰들이 단지입니다. π - 확장 porphyrins은 피롤 고리가 외부 아로마 조각과 융합하는 porphyrins 있습니다. π - 연장 프로브 spectroscopic 속성의 튜닝은 특정 이미징 응용 프로그램 (예 : 현미경 대 tomography)의 요건을 충족하실 수 있습니다. 예를 들어, 우리는 경찰들이의 tetaaryltetrabenzoporphyrins의 합성 (PdAr 4 TBP) [4]. 대해 설명합니다 PdAr 4 TBP가 스펙트럼과 강한 인광의 멀리 붉은 부분에 강력한 흡수 밴드를 잘 생물 학적 산소 측정에 적합합니다. PdAr 4 TBP의 합성은 다음과 같이 구성되어 있습니다 : 린지 결로에 의해 tetraaryltetracyclohexenoporphyrins 2.1) 준비 (Ar4TCHP) [5] 대체 benzaldehydes과 tetrahydroisoindole니다. CH에서 tetrahydroisoindole (1 EQ)의 0.01 M 솔루션 &lt;서브&gt; 2 CL 2 아로마의 알데히드 (1 EQ)는 아르곤 아래에 추가되었습니다. 반응 혼합물은 RT BF 3 xEt 2 O (0.2 EQ)의 어둠 10 분 흔들되었고 추가되었고, 반응 혼합물은 추가 2 H. 위해 알티에 흔들되었습니다 DDQ (1 EQ) 추가되었고, 혼합물은 지속적인 교반에 따라 하루 남았는데. 솔루션 10% AQ 나 2 SO 졌죠 세 10 % AQ 나 2 CO 3, 5% AQ HCL 그리고 마지막으로 소금물로. 유기 단계는 다음 진공 상태에서 농축, 나 2 SO 4 이상의 건조되었다. tert - 부틸 에테르 혼합물 아르에게 녹색 분말로 4 TCHP를 제공 - 잔류물은 CH 2 Club 호텔 2 recrystallized되었습니다. 수확량은 약 50 %입니다. 경찰들이 2.2) 삽입 PdAr 4 TCHPs를 얻을 수 있습니다. 자유 기지 porphyrins (1 EQ) 잇 3 N (20 EQ)의 초과의 존재에 CH 3 CN을 refluxing에 PdCl 2 경찰들이 (OAc) 2 (1.2 EQ)와 치료를했다. 변환은 UV - 마주 분광에 의해 감시 (용매 CH 2 Club 호텔 2 AcOH) 및 468-472 nm의에서 받아쓰기의 Soret 밴드 완료 후 사라진 것으로 간주되었다. 혼합물은 CH 2 Club 호텔 2 희석과 경찰들이 (0) 제거 Celite의 얇은 레이어를 통해 필터링, 진정 허락되었습니다. 솔벤트가 증발했다, 그리고 잔류물은 용제로 Club 호텔 2 채널 2를 사용하여 실리카 겔 컬럼 크로마 토그래피에 의해 정화되었다. 다크 레드 분수가 수집되었다, 용매는 대상에게 거의 양적 수율에 PdAr 4 TCHPs를 제공 증발했다. 2.3) PdAr 4 TBP의는 refluxed THF에 DDQ의 2 배 초과 (16 EQ)와 PdAr 4 TCHPs의 산화에 의해 준비되었다. refluxing 동안 색깔은 짙은 붉은 색의 깊은 녹색으로 변경. 솔벤트가 증발했다, 찌꺼기는 10% AQ 나 2 SO 3, 물, 소금물로 씻어, CH 2 Club 호텔 2 희석되었다. 유기 단계가 나 2 SO 4 이상의 건조와 진공에 집중되었다. 잔류물은 실리카 겔에서 크로마 토그래피 (eluent CH 2 Club 호텔 2)에 의해 정화되었다. 첫 번째 어두운 녹색 분수는 PdAr4TBP의 등 푸른 녹색 분말 85-90%를 제공하기 위해 진공 상태에서 농축, 수집했습니다. 경찰들이 중 2.4) 주변 에스테르 그룹 tetrakis - (3,5 - dibutoxycarbonylphenyl) tetrabenzoporphyrin은 (PdAr4TBP) 1 % (V / V) 물 / 알티에서 THF에 코의 10 배 초과를 사용하여 분해되었다. 용매는 PdAr4TBP의 카르복실산 유도체의 형성 칼륨 염의 침전물에서 decanted했다. 고체는 물속에 녹아 있었다 CONC와 산성 추가 2 H에 대한 냈다. 산도 ~ 4-5로 HCL. 얻은 침전물을 물로 씻어하고 진공 건조, 원심 분리에 의해 고립되었다. dendrons를 보호하는 것은. dendrimer의 각 개별 분기 덴드론라고합니다. 보호 dendrons는 아릴 - 글리신 (AG) 빌딩 블록으로부터 구성되어 있습니다. AG의 dendrons 쉽게 저렴하게 시작 소재의 합성 및 크로마 토그래피없는 방법으로 고순도 및 수율에 격리 수 있습니다. 세대 2 (G2) AG - 덴드론의 합성은 다음과 같이 구성되어 있습니다 : 피셔 haloacyl 할로겐 방법을 사용하여 빌딩 블록 2.4) 합성, BOC 보호 3,5 - dicarboxyphenyl glycineamide와 3,5 - dibutoxycarbonylphenyl glycineamide. 2.5) CDMT / NMM 펩타이드 결합 화학을 사용하는 빌딩 블록의 커플링. 2.6) RT 2 H에 대한 TFA에 G2 덴드론의 솔루션을 교반하여 초점 아미노 그룹을 Deprotecting 높은 세대 dendrons의 조립 2.7)는 커플링 / deprotection 단계를 반복합니다. Dendrimer 조립은 HBTU / DIPEA 커플링 화학을 사용하여 PdAr4TBP (또는 다른 포르피린)에 deprotected dendrons의 결합에 의해 이루어진다. 2.8)는 첫째, BOC - 보호 그룹이 덴드론에서 제거됩니다. 예를 들어, BOC 보호 G3의 덴드론 (0.58 g)을 TFA (15 ML)에 해산되었고, 혼합물은 2 시간에 대한 RT 반응에서 왼쪽으로했다. 산성은 TFA - 소금으로 덴드론을 항복, 로타리 증발에 의해 제거되었습니다. 잔류물은 건조 NMP (10 ML)에 해산되었으며 DIPEA 몇 방울 TFA의 흔적을 담금질하기 위해 추가되었습니다. 2.9)은 커플링 반응을 시작하기 전에, 그것은 완전히 포르피린를 해산하는 것이 중요합니다. 예를 들어, PT tetracarboxyphenylporphyrin (0.061 g)가 140 이하 가열 건조 NMP (65 ML)에서 해산되었다 ° 질소의 흐름에 따라 10 분에 대한 C. 2.10)이 솔루션은 실내 온도로 냉각되었다, HBTU는 (0.211 g) 추가되었고, 혼합물은 5 분 흔들했다. 2.11) DIPEA (0.35 ML)은 즉시 soluti의 또한 다음, 한 부분의 혼합물에 추가되었습니다NMP에 덴드론 (2.8 참조)의 TFA - 소금과 혼합물에 대한 감동에 따라 하루 남았는데. 2.12)이 혼합물은 3% AQ에 부어되었습니다. NaCl (350 ML) 및 결과 침전물은 원심 분리 수집하여 반복 정지 / 대상 포르피린 - dendrimer를 얻을 수하기 위해 원심 분리에 의해 물, MeOH, 및 ET 2 O로 세탁했다. 주변 에스테르 그룹을 hydrolyze하기 위해 2.13) dendrimer 먼저 전체 용매 제거하여 다음 20-60 분 동안 DMSO / MeOH에 NMe 4 OH (~ 5 ㎜)와 치료를했다. 이 절차는 우리가 수성 용해도를 제공 카르복 그룹의 충분한 번호 dendrimers를 생성할 수있었습니다. 가수 분해를 완료하려면, dendrimer는 0.1N NaOH 수용액 (야간)로 취급합니다. 그 결과, 순수 포르피린 - dendrimer carboxylic 지방산은 80-95%의 수율에 격리 수 있습니다. dendrimer의 주변의 수정.이 시점에서이 같은 포르피린 - dendrimer부터, 중 하나 또는 두 개의 광자 프로브는 합성 수 있습니다. 첫 번째 경우에는, 모든 주변 카르 복실 그룹 PEG 단위 수정 - PEGylation으로 알려진 방법을. 후자의 경우에는 몇 가지 카르 복실 그룹은 처음 두 - 광자 안테나 chromophores (Coumarin - 343) 나머지 carboxyls의 PEGylation 다음, 에틸렌 (EDA) linkers와 수정 [6].과 함께 아르 Dendrimers는 HBTU / DIPEA 커플링 화학을 사용하여 monomethoxyoligoethyleneglycolamine을 (M - PEG - NH 2, AV. MW 1000)를 사용 PEGylated되었습니다. NMP에 덴드론 (또는 DMF) (10-10 ㎜) HBTU의 1.25 배 초과의 솔루션 2.14)가 추가되었고, 반응 혼합물은 10 분 RT에서 흔들했다. DIPEA의 6.25 배 초과는 M - PEG - NH2의 1.25 배 초과의 즉각 또한 다음, 추가되었습니다. 반응 혼합물은 알티 2 일 흔들했다. 디에틸 에테르이 반응 혼합물에 추가 되었음 형성된 침전물은 디에틸 에테르 이외의 THF에서 원심 분리하고 다시 시켰던으로 구분되었다. 2.15) 최종 정화는 최초의 앞 단계의 수집에 의해 크기 배제 크로마 토그래피와 함께 달성했습니다. PEGylated 포르피린 - dendrimer은 THF (~ 15 ML)의 소량의 용해와 폴리스티렌 SEC 단계 (Biorad, Biobeads S - X1)로 가득 색층 칼럼의 위에 적재되었다. 열은 순수한 THF와 eluted되었고, 전면과 함께 이동 어두운 컬러 밴드가 수집되었다. 2.16) THF는 로터리 증발기에서 제거되었고, 나머지 재료는 진공 상태에서 건조되었다. 3. 프로브 특성화 Photophysical 특성은 프로브의 흡수 및 방출 스펙트럼, 인광 수명 τ 0 스턴 볼머 산소 칭 상수 K Q 이하 생리적 조건의 측정을 포함하고 있습니다. 3.1) 흡수 및 방출 스펙트럼은 표준 장비를 (분광 광도계 및 꾸준한 fluorometer)을 사용하여 주위 조건 하에서 얻을 수 있습니다. 프로브의 ~ 1 μm의 솔루션이 사용됩니다. 3.2) 다음, 스턴 볼머 보정 음모가 얻어진다. 그것이 우리가 산소 농도에 대한 프로브의 수명을 연관 수 있기 때문에 이것은 가장 중요한 측정이다. 3.3)는 PBS 버퍼 (산도 7.2)에 탐침의 솔루션은 여기와 발광 광섬유에 대한 포트 라이트 스며들지 케이지 내부에있는 온도 제어 챔버 내부에 위치하는 특수 원통형 쿠베트,에 배치됩니다. 섬유는 오른쪽 각도 기하학의 챔버 내부의 쿠베트 들과의 긴밀한 접촉으로 이동됩니다. 3.4) 쿠베트가있는에 매우 민감한 클라크 형 산소 전극 (CK - 산소 전극)가 삽입, 스토퍼로 닫힙니다. 스토퍼는 또한 입구와 아르곤의 콘센트에 두 바늘 포트가 포함되어 있습니다. 바늘은 단순히 솔루션 표면 위에 가스 유동의 흐름을 제공 반면​​ 전극은 용액에 포장되어 있습니다. 처음에는 아르곤은 입구에 연결되지 않습니다. 3.5)은 온도가 원하는 값 (일반적으로 36-37 ° C)로 설정하고 솔루션은 평균에 대한 교반하에 남아 있습니다. 3.6) 여기 섬유는 PC에서 운영하는 디지털 phosphorometer의 여기 포트에 연결되어 있습니다. phosphorometer의 광원은 누구 출력 333 kHz에서 D / A 보드에 의해 제어되는 고출력 LED입니다. 방출 섬유는 높은 적외선에 민감한 APD (애벌 photodiode)에 결합되는 phosphorometer, 다른 광학 포트에 연결되어 있습니다. 다이오드의 출력은 증폭되고 여기 및 방출 채널 사이의 동기화를 허용하는 동일한 제어 보드의 A / D 채널로 공급됩니다. 3.7) 제어 소프트웨어를 알어떤 임의의 선택 기간 (일반적으로 2-3 MS) 동안 인광 부패를 수집하여 다음에 원하는 길이 (예 : 5 또는 10 MS)의 여기 펄스의 로우스 생성. 한 평생 측정에 필요한 시간은 일반적으로 0.5-1 S는하지만, 성능은 10-20로 초당으로 신속하게 얻을 수 있습니다. 3.8) 산소 전극의 출력은 동일한 PC에있는 다른 A / D 보드로 증폭하고 감독합니다. 이것은 선택 기간에 전류 전극을 기록하는 데 사용되는 저주파 보드 (1 kHz에서 최대)입니다. 전극 데이터를 녹음 프로그램은 phosphorometer 소프트웨어와 동시에 실행됩니다. 솔루션 온도가 equilibrated되면 3.9)는 phosphorometer 및 전극 프로그램을 모두 측정에게 매 10 S.를 수행하는 동시에 초기 그들의 출력은 두 개의 별도 파일에 동기 기록됩니다. 그 후, 아르곤은 쿠베트 스토퍼의 입구 포트에 연결되어 있습니다. 아르곤으로 3.10)가 흔들 솔루션의 표면 위로 흐르는, 그것은 점차적으로 산소를 대체합니다. 전극 전류의 감소와 phosphorometer에 의해 측정되는 인광 수명에 증가이 결과를. 보통 산소는 데이터가 완전히 자동으로 파일에 기록되는 시간 동안, 전적으로 약 2 H 후 양식에게 솔루션을 뺀 것입니다. 3.11) 적정 실행의 종료 후, 전극 데이터와 인광 수명은 표준 분석 프로그램 (예 : Miocrocal 유래)로 가져올 수 있습니다. 전극 전류는 산소 농도에 선형적으로 의존하고, 전극에 사용은 제로 산소에 거의 제로입니다. 대기압에서 PO 2 (150mm HG에 대해) 잘 알려져 있습니다. 따라서 전극 데이터는 직접 산소 규모로 변환될 수 있으며, PO 2 대 역 인광 일생 일대의 줄거리는 건설 수 있습니다. 이 음모는 그 기울기로 산소 칭 상수 kq를 제공하기 위해 최소 제곱 방법을 사용하여 직선과 함께 장착되어있다. 인광 수명 t0는 중 동일한 맞게 (도청의 반전 등) 또는 직접 제로 산소의 측정에서 얻은 것입니다. 높은 농도의 혈장에 존재 단백질 -을 - 필요한 경우, 적정이 알부민의 존재에있는 프로브의 솔루션을 사용하여 반복 3.12) 조건을 에뮬레이션하기 위해서는 (동물의 피를 실제 실험 시스템에 만난 생체내에서). dendrimer 잘 프로브를 보호하고 PEG 그룹은 알부민과 연락처에서 프로브를 분리하면 얻을 스턴 볼머 플롯은 모두 동일해야합니다. 그렇지 않으면, 프로브 및 혈액에있는 단백질이 상호 작용하는 것이며, 그것은 산소 측정의 모호성을 초래 변경 스턴 볼머 계획으로 이어질 것입니다. 따라서 얻은 보정 상수는 산소 농도가 사전 알 수없는 경우 이미징 실험에 사용됩니다.

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	<li>Vanderkooi, J. M., Maniara, G., Green, T. J., Wilson, D. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+optical+method+for+measurement+of+dioxygen+concentration+based+on+quenching+of+phosphorescence.">An optical method for measurement of dioxygen concentration based on quenching of phosphorescence.</a> J. Biol. Chem. 262, 5476-5482 (1987).</li><li>Rumsey, W. L., Vanderkooi, J. M., Wilson, D. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Imaging+of+phosphorescence:+A+novel+method+for+measuring+the+distribution+of+oxygen+in+perfused+tissue.">Imaging of phosphorescence: A novel method for measuring the distribution of oxygen in perfused tissue.</a> Science. 241, 1649-1651 (1988).</li><li>Lebedev, A. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dendritic+phosphorescent+probes+for+oxygen+Imaging+in+biological+systems.">Dendritic phosphorescent probes for oxygen Imaging in biological systems.</a> Acs Applied Materials and Interfaces. 1, 1292-1304 (2009).</li><li>Finikova, O. S., Cheprakov, A. V., Beletskaya, I. P., Carroll, P. J., Vinogradov, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Novel+versatile+synthesis+of+substituted+tetrabenzoporphyrins.">Novel versatile synthesis of substituted tetrabenzoporphyrins.</a> Journal of Organic Chemistry. 69, 522-535 (2004).</li><li>Lindsey, J. S., Schreiman, I. C., Hsu, H. C., Kearney, P. C., Marguerettaz, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rothemund+and+Adler-Longo+Reactions+revisited:+Synthesis+of+tetraphenylporphyrins+under+equilibrium+conditions.">Rothemund and Adler-Longo Reactions revisited: Synthesis of tetraphenylporphyrins under equilibrium conditions.</a> Journal of Organic Chemistry. 52, 827-836 (1987).</li><li>Lebedev, A. Y., Troxler, T., Vinogradov, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Design+of+metalloporphyrin-based+dendritic+nanoprobes+for+two-photon+microscopy+of+oxygen.">Design of metalloporphyrin-based dendritic nanoprobes for two-photon microscopy of oxygen.</a> J. Porphyrins and Phthalocyanines. 12, 1261-1269 (2008).</li></ol>

<table border="1" cellspacing="0" cellpadding="0"&gt;<tr<td<strong&gt; 약어</strong<strong</strong</td&gt;<td<strong&gt; 전체 이름</strong<strong</strong</td&gt;</tr&gt;<tr<td&gt; NMP</td&gt;<td&gt; N - methylpyrrolidinone</td&gt;</tr&gt;<tr<td&gt; TFA</td&gt;<td&gt; trifluoroacetic 산성</td&gt;</tr&gt;<tr<td&gt; DIPEA</td&gt;<td&gt; diisopropylethylamine</td&gt;</tr&gt;<tr<td&gt; HBTU</td&gt;<td&gt; 2 - (1H - benzotriazol - 1 - yl) -1,1,3,3 - tetramethyluronium의 hexafluorophosphate</td&gt;</tr&gt;<tr<td&gt; DMSO</td&gt;<td&gt; dimethylsulfoxide</td&gt;</tr&gt;<tr<td&gt; CDMT</td&gt;<td&gt; CDMT = 1 - 클로로 - 3 ,5 - dimethoxytriazine</td&gt;</tr&gt;<tr<td&gt; NMM</td&gt;<td&gt; NMM = N - methylmorfoline</td&gt;</tr&gt;</table

synthesis and calibration of phosphorescent nanoprobes for oxygen imaging in biological systems

인광 담금질 [1, 2]에 의해 산소 측정은 다음과 같이 구성되어 있습니다 : 1) 프로브가 관심의 미디어 (예 : 혈액 또는 침입형 액체)로 전달됩니다 2) 개체는 순서에 해당하는 파장의 빛으로 조명됩니다 자극 의 트리 플렛 상태로 촬영, 3) 배출 인광는 수집하며, 시간 과정은 산소 농도 (또는 부분 압력, PO로 변환되는 인광 수명을 항복으로 분석됩니다<sub&gt; 2</sub&gt;). 탐사선은 생물 학적 환경과 상호 작용해서는 안 경우에 측정이 완료되면 매체에서 배설) 4 수. 다음 단계를 각각 측정 프로토콜의 유일한 침략 구성 요소를 구성 인광을 발하는 프로브의 분자 설계에 대한 요구 사항을 부과. 여기 우리는 생물 학적 시스템에서 산소 측정 돌기 인광을 발하는 nanosensors의 디자인을 검토합니다. 프로브는 PT 또는 폴리에틸렌 글리콜 (PEG의) 잔류와 peripherally 수정 경찰들이 포르피린 기반 polyarylglycine (AG) dendrimers, 구성되어 있습니다. 효과적인 두 광자 여기 들어, dendrimers의 테르는 (포스터 공명 에너지 전송) 걱정 여기 에너지를 캡처 및 분자내 통해 프로브의 트리 플렛 코어에 채널 두 광자 안테나 chromophores와 수정할 수 있습니다. 우리는 프로브와 현재 세부 교정 프로토콜의 핵심 photophysical 속성을 설명합니다.

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Synthesis and Calibration of Phosphorescent Nanoprobes for Oxygen Imaging in Biological Systems

우리는 인광 담금질 및 생물 학적 시스템에서 산소 이미징을위한 포르피린 기반 돌기 nanosensors의 검토 설계에 의해 산소 측정의 원칙을 제시.

생물 학적 시스템에서 산소 이미징에 대한 인광을 발하는 나노 프로브의 합성 및 교정

Oxygen measurement by phosphorescence quenching [1, 2] consists of the following steps: 1) the probe is delivered into the medium of interest (e.g. blood ...

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Research

JoVE Journal

Biology

13.8K 조회수.  University of Pennsylvania. 우리는 인광 담금질 및 생물 학적 시스템에서 산소 이미징을위한 포르피린 기반 돌기 nanosensors의 검토 설계에 의해 산소 측정의 원칙을 제시.

비디오: Synthesis and Calibration of Phosphorescent Nanoprobes for Oxygen Imaging in Biological Systems

Using Micro-Electro-Mechanical Systems (MEMS) to Develop Diagnostic Tools

Using Micro-Electro-Mechanical Systems MEMS to Develop Diagnostic Tools

진단 도구를 개발하기 위해 마이크로 전자 기계 시스템 (MEMS)를 사용

연구

생물학

Born Normalization for Fluorescence Optical Projection Tomography for Whole Heart Imaging

Optical projection tomography is a three-dimensional imaging technique that has been recently introduced as an imaging tool primarily in developmental biology and gene expression studies. The technique renders biological sample optically transparent by first dehydrating them and then placing in a mixture of benzyl alcohol and benzyl benzoate in a 2:1 ratio (BABB or Murray s Clear solution). The technique renders biological samples optically transparent by first dehydrating them in graded ethanol solutions then placing them in a mixture of benzyl alcohol and benzyl benzoate in a 2:1 ratio (BABB or Murray s Clear solution) to clear. After the clearing process the scattering contribution in the sample can be greatly reduced and made almost negligible while the absorption contribution cannot be eliminated completely. When trying to reconstruct the fluorescence distribution within the sample under investigation, this contribution affects the reconstructions and leads, inevitably, to image artifacts and quantification errors.. While absorption could be reduced further with a permanence of weeks or months in the clearing media, this will lead to progressive loss of fluorescence and to an unrealistically long sample processing time. This is true when reconstructing both exogenous contrast agents (molecular contrast agents) as well as endogenous contrast (e.g. reconstructions of genetically expressed fluorescent proteins).

We suggest a Born normalized approach for Optical Projection Tomography (BnOPT) that accounts for the absorption properties of imaged samples to obtain accurate and quantitative fluorescence tomographic reconstructions. We use the proposed algorithm to reconstruct the fluorescence molecular probe distribution within small animal organs.

전체 심장 이미징에 대한 형광 광 프로젝션 Tomography에 대한 출생 정규화

Optical projection tomography is a three-dimensional imaging technique that has been recently introduced as an imaging tool primarily in developmental ...

Mesoscopic Fluorescence Tomography for In-vivo Imaging of Developing Drosophila

Visualizing developing organ formation as well as progession and treatment of disease often heavily relies on the ability to optically interrogate molecular and functional changes in intact living organisms. Most existing optical imaging methods are inadequate for imaging at dimensions that lie between the penetration limits of modern optical microscopy (0.5-1mm) and the diffusion-imposed limits of optical macroscopy (&gt;1cm) [1]. Thus, many important model organisms, e.g. insects, animal embryos or small animal extremities, remain inaccessible for in-vivo optical imaging. 
Although there is increasing interest towards the development of nanometer-resolution optical imaging methods, there have not been many successful efforts in improving the imaging penetration depth. The ability to perform in-vivo imaging beyond microscopy limits is in fact met with the difficulties associated with photon scattering present in tissues. Recent efforts to image entire embryos for example [2,3] require special chemical treatment of the specimen, to clear them from scattering, a procedure that makes them suitable only for post-mortem imaging. These methods however evidence the need for imaging larger specimens than the ones usually allowed by two-photon or confocal microscopy, especially in developmental biology and in drug discovery.
We have developed a new optical imaging technique named Mesoscopic Fluorescence Tomography [4], which appropriate for non-invasive in-vivo imaging at dimensions of 1mm-5mm. The method exchanges resolution for penetration depth, but offers unprecedented tomographic imaging performance and it has been developed to add time as a new dimension in developmental biology observations (and possibly other areas of biological research) by imparting the ability to image the evolution of fluorescence-tagged responses over time. As such it can accelerate studies of morphological or functional dependencies on gene mutations or external stimuli, and can importantly, capture the complete picture of development or tissue function by allowing longitudinal time-lapse visualization of the same, developing organism.
The technique utilizes a modified laboratory microscope and multi-projection illumination to collect data at 360-degree projections. It applies the Fermi simplification to Fokker-Plank solution of the photon transport equation, combined with geometrical optics principles in order to build a realistic inversion scheme suitable for mesoscopic range. This allows in-vivo whole-body visualization of non-transparent three-dimensional structures in samples up to several millimeters in size.
We have demonstrated the in-vivo performance of the technique by imaging three-dimensional structures of developing Drosophila tissues in-vivo and by following the morphogenesis of the wings in the opaque Drosophila pupae in real time over six consecutive hours.

Mesoscopic Fluorescence Tomography for In-vivo Imaging of Developing Drosophila

Mesoscopic fluorescence tomography operates beyond the penetration limits of tissue-sectioning fluorescence microscopy. The technique is based on multi-projection illumination and a photon transport description. We demonstrate in-vivo whole-body 3D visualization of the morphogenesis of GFP-expressing wing imaginal discs in Drosophila melanogaster.

에 대한 Mesoscopic 형광 Tomography 인 - 생체내</em개발> 이미징 Drosophila</em

Visualizing  developing organ formation as well as progession and treatment of disease often  heavily relies on the ability to optically interrogate ...

Imaging Cell Membrane Injury and Subcellular Processes Involved in Repair

The ability of injured cells to heal is a fundamental cellular process, but cellular and molecular mechanisms involved in healing injured cells are poorly understood. Here assays are described to monitor the ability and kinetics of healing of cultured cells following localized injury. The first protocol describes an end point based approach to simultaneously assess cell membrane repair ability of hundreds of cells. The second protocol describes a real time imaging approach to monitor the kinetics of cell membrane repair in individual cells following localized injury with a pulsed laser. As healing injured cells involves trafficking of specific proteins and subcellular compartments to the site of injury, the third protocol describes the use of above end point based approach to assess one such trafficking event (lysosomal exocytosis) in hundreds of cells injured simultaneously and the last protocol describes the use of pulsed laser injury together with TIRF microscopy to monitor the dynamics of individual subcellular compartments in injured cells at high spatial and temporal resolution. While the protocols here describe the use of these approaches to study the link between cell membrane repair and lysosomal exocytosis in cultured muscle cells, they can be applied as such for any other adherent cultured cell and subcellular compartment of choice.

The process of healing injured cells involves trafficking of specific proteins and subcellular compartments to the site of cell membrane injury. This protocol describes assays to monitor these processes.

이미징 세포 막 상해 및 수리에 관여하는 세포 내 프로세스

The ability of injured cells to heal is a fundamental cellular process, but cellular and molecular mechanisms involved in healing injured cells are poorly ...

Measurement of Heme Synthesis Levels in Mammalian Cells

Heme serves as the prosthetic group for a wide variety of proteins known as hemoproteins, such as hemoglobin, myoglobin and cytochromes. It is involved in various molecular and cellular processes such as gene transcription, translation, cell differentiation and cell proliferation. The biosynthesis levels of heme vary across different tissues and cell types and is altered in diseased conditions such as anemia, neuropathy and cancer. This technique uses [4-14C] 5-aminolevulinic acid ([14C] 5-ALA), one of the early precursors in the heme biosynthesis pathway to measure the levels of heme synthesis in mammalian cells. This assay involves incubation of cells with [14C] 5-ALA followed by extraction of heme and measurement of the radioactivity incorporated into heme. This procedure is accurate and quick. This method measures the relative levels of heme biosynthesis rather than the total heme content. To demonstrate the use of this technique the levels of heme biosynthesis were measured in several mammalian cell lines.

Altered intracellular heme levels are associated with common diseases such as cancer. Thus, there is a need to measure heme biosynthesis levels in diverse cells. The goal of this protocol is to provide a fast and sensitive method to measure and compare the levels of heme synthesis in different cells.

포유 동물 세포에서 헴 합성 레벨 측정

Heme serves as the prosthetic group for a wide variety of proteins known as hemoproteins, such as hemoglobin, myoglobin and cytochromes. It is involved in ...

HeLa Based Cell Free Expression Systems for Expression of Plasmodium Rhoptry Proteins

Malaria causes significant global morbidity and mortality. No routine vaccine is currently available. One of the major reasons for lack of a vaccine is the challenge of identifying suitable vaccine candidates. Malarial proteins expressed using prokaryotic and eukaryotic cell based expression systems are poorly glycosylated, generally insoluble and undergo improper folding leading to reduced immunogenicity. The wheat germ, rabbit reticulocyte lysate and Escherichia coli lysate cell free expression systems are currently used for expression of malarial proteins. However, the length of expression time and improper glycosylation of proteins still remains a challenge. We demonstrate expression of Plasmodium proteins in vitro using HeLa based cell free expression systems, termed &#8220;in vitro human cell free expression systems&#8221;. The 2 HeLa based cell free expression systems transcribe mRNA in 75 min and 3 &#181;l of transcribed mRNA is sufficient to translate proteins in 90 min. The 1-step expression system is a transcription and translation coupled expression system; the transcription and co-translation occurs in 3 hr. The process can also be extended for 6 hr by providing additional energy. In the 2-step expression system, mRNA is first transcribed and then added to the translation mix for protein expression. We describe how to express malaria proteins; a hydrophobic PF3D7_0114100 Maurer&#8217;s Cleft &#8211; 2 transmembrane (PfMC-2TM) protein, a hydrophilic PF3D7_0925900 protein and an armadillo repeats containing protein PF3D7_1361800, using the HeLa based cell free expression system. The proteins are expressed in micro volumes employing 2-step and 1-step expression strategies. An affinity purification method to purify 25 &#181;l of proteins expressed using the in vitro human cell free expression system is also described. Protein yield is determined by Bradford&#8217;s assay and the expressed and purified proteins can be confirmed by western blotting analysis. Expressed recombinant proteins can be used for immunizations, immunoassays and protein sequencing.

HeLa Based Cell Free Expression Systems for Expression of Plasmodium Rhoptry Proteins

Expression of malarial proteins in cell based systems remains challenging. We demonstrate two step and one step IVT (in vitro translation) cell free expression systems for expressing malarial recombinant rhoptry proteins from HeLa cells. We use a Ni-resin affinity based purification system to purify the rhoptry proteins.

의 발현에 대한 헬라 세포를 기반으로 무료 발현 시스템<em&gt; 변형체</em&gt; Rhoptry 단백질

Malaria causes significant global morbidity and mortality. No routine vaccine is currently available. One of the major reasons for lack of a vaccine is ...

High-resolution Time-lapse Imaging and Automated Analysis of Microtubule Dynamics in Living Human Umbilical Vein Endothelial Cells

The physiological process by which new vasculature forms from existing vasculature requires specific signaling events that trigger morphological changes within individual endothelial cells (ECs). These processes are critical for homeostatic maintenance such as wound healing, and are also crucial in promoting tumor growth and metastasis. EC morphology is defined by the organization of the cytoskeleton, a tightly regulated system of actin and microtubule (MT) dynamics that is known to control EC branching, polarity and directional migration, essential components of angiogenesis. To study MT dynamics, we used high-resolution fluorescence microscopy coupled with computational image analysis of fluorescently-labeled MT plus-ends to investigate MT growth dynamics and the regulation of EC branching morphology and directional migration. Time-lapse imaging of living Human Umbilical Vein Endothelial Cells (HUVECs) was performed following transfection with fluorescently-labeled MT End Binding protein 3 (EB3) and Mitotic Centromere Associated Kinesin (MCAK)-specific cDNA constructs to evaluate effects on MT dynamics. PlusTipTracker software was used to track EB3-labeled MT plus ends in order to measure MT growth speeds and MT growth lifetimes in time-lapse images. This methodology allows for the study of MT dynamics and the identification of how localized regulation of MT dynamics within sub-cellular regions contributes to the angiogenic processes of EC branching and migration.

Protocols for Human Umbilical Vein Endothelial Cell (HUVEC) culture, transient transfection of fluorescently-labeled markers of microtubule growth, live-cell imaging and automated analysis of interphase microtubule growth dynamics are detailed.

고해상도 시간 경과 이미징 및 생활 인간 제대 정맥 내피 세포의 미세 소관 역학의 자동 분석

The physiological process by which new vasculature forms from existing vasculature requires specific signaling events that trigger morphological changes ...

ACT-PRESTO: Biological Tissue Clearing and Immunolabeling Methods for Volume Imaging

The identification and exploration of the detailed organization of organs or of the whole body at the cellular level are fundamental challenges in biology. Transitional methods require a substantial amount of time and effort to obtain a 3D image and including sectioning the intact tissue, immunolabeling, and imaging serially-sectioned tissue, which produces a loss of information at each step of the process. In recently developed approaches for high-resolution imaging within intact tissue, molecular characterization has been restricted to the labeling of proteins. However, currently available protocols for organ clearing require a considerably long process time, making it difficult to implement tissue clearing techniques in the lab. We recently established a rapid and highly-reproducible protocol termed ACT-PRESTO (active clarity technique&#8211;pressure related efficient and stable transfer of macromolecules into organs), which allows for tissue clearance within several hours. Moreover, ACT-PRESTO enables rapid immunolabeling with conventional methods and accelerates antibody penetration into the deep layer of densely-formed, thick specimens by applying pressure or convection flow. We describe how to prepare tissues, how to clear by lipid removal using electrophoresis, and how to immuno-stain by a pressure-assisted delivery. The rapidity and consistency of the protocol will expedite the performance of 3D histological research and volume-based diagnoses.

ACT-PRESTO (active clarity technique&#8211;pressure related efficient and stable transfer of macromolecules into organs) enables rapid, efficient, but inexpensive tissue clearing and rapid antibody penetration into cleared tissues by passive diffusion or pressure-assisted delivery. Using this method, a wide range of tissues can be cleared, immunolabeled by multiple antibodies, and volume-imaged.

ACT-PRESTO : 생물 조직 지우기 및 볼륨 이미징을위한 Immunolabeling 방법

The identification and exploration of the detailed organization of organs or of the whole body at the cellular level are fundamental challenges in ...

Environmental Screening of Aeromonas hydrophila, Mycobacterium spp., and Pseudocapillaria tomentosa in Zebrafish Systems

Health monitoring systems are developed and used in zebrafish research facilities because pathogens of Danio rerio such as Aeromonas hydrophila, Mycobacterium spp., and Pseudocapillaria tomentosa have the potential to impair animal welfare and research. The fish are typically analyzed post mortem to detect microbes. The use of sentinels is a suggested way to improve the sensitivity of the surveillance and to reduce the number of animals to sample. The setting of a pre-filtration sentinel tank out of a recirculating system is described. The technique is developed to prevent water pollution and to represent the fish population by a careful selection of age, gender, and strains. In order to use the minimum number of animals, techniques to screen the environment are also detailed. Polymerase Chain Reaction (PCR) on surface sump swabs is used to significantly improve the detection of some prevalent and pathogenic mycobacterial species such as Mycobacterium fortuitum, Mycobacterium haemophilum, and Mycobacterium chelonae. Another environmental method consists of processing the sludge at the bottom of a holding tank or sump to look for P. tomentosa eggs. This is a cheap and fast technique that can be applied in quarantine where a breeding device is submerged into the holding tank of imported animals. Finally, PCR is applied to the sludge sample and A. hydrophila is detected at the sump&#39;s bottom and surface. Generally, these environmental screening techniques applied to these specific pathogens have led to an increased sensitivity compared to the testing of pre-filtration sentinels.

Environmental Screening of Aeromonas hydrophila, Mycobacterium spp., and Pseudocapillaria tomentosa in Zebrafish Systems

This protocol describes the use of sump swabs and sludge analysis of zebrafish systems, which leads to increased detection compared to the sole use of sentinels to detect pathogens such as Aeromonas hydrophila, Mycobacterium spp., and Pseudocapillaria tomentosa. A system to monitor P. tomentosa eggs in quarantine is also proposed.

Aeromonas hydrophila, 진 균 종, 및 Pseudocapillaria tomentosa Zebrafish 시스템에서의 환경 심사

Health monitoring systems are developed and used in zebrafish research facilities because pathogens of Danio rerio such as Aeromonas hydrophila, ...

Xenopus laevis Egg Extract Preparation and Live Imaging Methods for Visualizing Dynamic Cytoplasmic Organization

Traditionally used for bulk biochemical assays, Xenopus laevis egg extracts have emerged as a powerful imaging-based tool for studying cytoplasmic phenomena, such as cytokinesis, mitotic spindle formation and assembly of the nucleus. Building upon early methods that imaged fixed extracts sampled at sparse time points, recent approaches image live extracts using time-lapse microscopy, revealing more dynamical features with enhanced temporal resolution. These methods usually require sophisticated surface treatments of the imaging vessel. Here we introduce an alternative method for live imaging of egg extracts that require no chemical surface treatment. It is simple to implement and utilizes mass-produced laboratory consumables for imaging. We describe a system that can be used for both wide-field and confocal microscopy. It is designed for imaging extracts in a 2-dimensional (2D) field, but can be easily extended to imaging in 3D. It is well-suited for studying spatial pattern formation within the cytoplasm. With representative data, we demonstrate the typical dynamic organization of microtubules, nuclei and mitochondria in interphase extracts prepared using this method. These image data can provide quantitative information on cytoplasmic dynamics and spatial organization.

Xenopus laevis Egg Extract Preparation and Live Imaging Methods for Visualizing Dynamic Cytoplasmic Organization

We describe a method for the preparation and live imaging of undiluted cytoplasmic extracts from Xenopus laevis eggs.