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Method Article
Combinando monodispersos geração gota com ordenação de inércia de células e partículas, nós descrevemos um método para encapsular um número desejado de células ou partículas em uma única gota a taxas kHz. Nós demonstramos a eficiência duas vezes superiores às de encapsulamento desordenada para gotas simples e dupla-partícula.
Microfluidic encapsulation methods have been previously utilized to capture cells in picoliter-scale aqueous, monodisperse drops, providing confinement from a bulk fluid environment with applications in high throughput screening, cytometry, and mass spectrometry. We describe a method to not only encapsulate single cells, but to repeatedly capture a set number of cells (here we demonstrate one- and two-cell encapsulation) to study both isolation and the interactions between cells in groups of controlled sizes. By combining drop generation techniques with cell and particle ordering, we demonstrate controlled encapsulation of cell-sized particles for efficient, continuous encapsulation. Using an aqueous particle suspension and immiscible fluorocarbon oil, we generate aqueous drops in oil with a flow focusing nozzle. The aqueous flow rate is sufficiently high to create ordering of particles which reach the nozzle at integer multiple frequencies of the drop generation frequency, encapsulating a controlled number of cells in each drop. For representative results, 9.9 μm polystyrene particles are used as cell surrogates. This study shows a single-particle encapsulation efficiency Pk=1 of 83.7% and a double-particle encapsulation efficiency Pk=2 of 79.5% as compared to their respective Poisson efficiencies of 39.3% and 33.3%, respectively. The effect of consistent cell and particle concentration is demonstrated to be of major importance for efficient encapsulation, and dripping to jetting transitions are also addressed.
Introduction
Continuous media aqueous cell suspensions share a common fluid environment which allows cells to interact in parallel and also homogenizes the effects of specific cells in measurements from the media. High-throughput encapsulation of cells into picoliter-scale drops confines the samples to protect drops from cross-contamination, enable a measure of cellular diversity within samples, prevent dilution of reagents and expressed biomarkers, and amplify signals from bioreactor products. Drops also provide the ability to re-merge drops into larger aqueous samples or with other drops for intercellular signaling studies.1,2 The reduction in dilution implies stronger detection signals for higher accuracy measurements as well as the ability to reduce potentially costly sample and reagent volumes.3 Encapsulation of cells in drops has been utilized to improve detection of protein expression,4 antibodies,5,6 enzymes,7 and metabolic activity8 for high throughput screening, and could be used to improve high throughput cytometry.9 Additional studies present applications in bio-electrospraying of cell containing drops for mass spectrometry10 and targeted surface cell coatings.11 Some applications, however, have been limited by the lack of ability to control the number of cells encapsulated in drops. Here we present a method of ordered encapsulation12 which increases the demonstrated encapsulation efficiencies for one and two cells and may be extrapolated for encapsulation of a larger number of cells.
To achieve monodisperse drop generation, microfluidic "flow focusing" enables the creation of controllable-size drops of one fluid (an aqueous cell mixture) within another (a continuous oil phase) by using a nozzle at which the streams converge.13 For a given nozzle geometry, the drop generation frequency f and drop size can be altered by adjusting oil and aqueous flow rates Qoil and Qaq. As the flow rates increase, the flows may transition from drop generation to unstable jetting of aqueous fluid from the nozzle.14
When the aqueous solution contains suspended particles, particles become encapsulated and isolated from one another at the nozzle. For drop generation using a randomly distributed aqueous cell suspension, the average fraction of drops Dk containing k cells is dictated by Poisson statistics, where Dk = λk exp(-λ)/(k!) and λ is the average number of cells per drop. The fraction of cells which end up in the "correctly" encapsulated drops is calculated using Pk = (k x Dk)/Σ(k' x Dk'). The subtle difference between the two metrics is that Dk relates to the utilization of aqueous fluid and the amount of drop sorting that must be completed following encapsulation, and Pk relates to the utilization of the cell sample. As an example, one could use a dilute cell suspension (low λ) to encapsulate drops where most drops containing cells would contain just one cell. While the efficiency metric Pk would be high, the majority of drops would be empty (low Dk), thus requiring a sorting mechanism to remove empty drops, also reducing throughput.15
Combining drop generation with inertial ordering provides the ability to encapsulate drops with more predictable numbers of cells per drop and higher throughputs than random encapsulation. Inertial focusing was first discovered by Segre and Silberberg16 and refers to the tendency of finite-sized particles to migrate to lateral equilibrium positions in channel flow. Inertial ordering refers to the tendency of the particles and cells to passively organize into equally spaced, staggered, constant velocity trains. Both focusing and ordering require sufficiently high flow rates (high Reynolds number) and particle sizes (high Particle Reynolds number).17,18 Here, the Reynolds number Re =uDh/ν and particle Reynolds number Rep =Re(a/Dh)2, where u is a characteristic flow velocity, Dh [=2wh/(w+h)] is the hydraulic diameter, ν is the kinematic viscosity, a is the particle diameter, w is the channel width, and h is the channel height. Empirically, the length required to achieve fully ordered trains decreases as Re and Rep increase. Note that the high Re and Rep requirements (for this study on the order of 5 and 0.5, respectively) may conflict with the need to keep aqueous flow rates low to avoid jetting at the drop generation nozzle. Additionally, high flow rates lead to higher shear stresses on cells, which are not addressed in this protocol. The previous ordered encapsulation study demonstrated that over 90% of singly encapsulated HL60 cells under similar flow conditions to those in this study maintained cell membrane integrity.12 However, the effect of the magnitude and time scales of shear stresses will need to be carefully considered when extrapolating to different cell types and flow parameters. The overlapping of the cell ordering, drop generation, and cell viability aqueous flow rate constraints provides an ideal operational regime for controlled encapsulation of single and multiple cells.
Because very few studies address inter-particle train spacing,19,20 determining the spacing is most easily done empirically and will depend on channel geometry, flow rate, particle size, and particle concentration. Nonetheless, the equal lateral spacing between trains implies that cells arrive at predictable, consistent time intervals. When drop generation occurs at the same rate at which ordered cells arrive at the nozzle, the cells become encapsulated within the drop in a controlled manner. This technique has been utilized to encapsulate single cells with throughputs on the order of 15 kHz,12 a significant improvement over previous studies reporting encapsulation rates on the order of 60-160 Hz.4,15 In the controlled encapsulation work, over 80% of drops contained one and only one cell, a significant efficiency improvement over Poisson (random) statistics, which predicts less than 40% efficiency on average.12
In previous controlled encapsulation work,12 the average number of particles per drop λ was tuned to provide single-cell encapsulation. We hypothesize that through tuning of flow rates, we can efficiently encapsulate any number of cells per drop when λ is equal or close to the number of desired cells per drop. While single-cell encapsulation is valuable in determining individual cell responses from stimuli, multiple-cell encapsulation provides information relating to the interaction of controlled numbers and types of cells. Here we present a protocol, representative results using polystyrene microspheres, and discussion for controlled encapsulation of multiple cells using a passive inertial ordering channel and drop generation nozzle.
Os protocolos nesta secção descrever os materiais e equipamentos utilizados especificamente para obter os resultados experimentais apresentados. Note-se que os fornecedores alternativos para produtos químicos e os equipamentos podem ser utilizados.
1. Fabricação de dispositivos e litografia suave
Técnicas padrão de litografia suave, 21 um número de que foram caracterizados em artigos Jové anteriores, 22 foram utilizados para a criação de polidimetilsiloxano (PDMS) redes de microcanais ligados a substratos de vidro. Além de mestre fabricação de moldes de réplica por SU-8 fotolitografia, os processos podem ser realizados fora de uma sala limpa ou capuz limpo, no entanto, poeiras e partículas deve ainda ser minimizada para alcançar resultados consistentes.
2. Preparação da Amostra
3. Instalação Experimental
4. Os resultados representativos
Os resultados são apresentados que alcançar tanto controlada de partícula única e controlada de encapsulação de duplo de partícula (Figura 3). Ao cortara taxa de fluxo de FC-40 óleo em meia, uma única partícula de encapsulação torna-se dois-partícula de encapsulação. Por outro lado, poderíamos ter aumentado a taxa de fluxo aquoso para fornecer partículas para o bico mais rapidamente, mas também teria aumentado o risco de ejecção do fluxo aquoso. Histogramas da Figura 3 apresenta o número fraccionário de partículas por gota para os dois casos, juntamente com as comparações com estatística de Poisson. As gotas ocasionais com partículas de zero são principalmente devido à "faltando" partículas nos comboios ordenadas, enquanto que os casos em que existem partículas mais do que encapsulados resultado desejado a partir de locais altas concentrações de partículas e as partículas que, por vezes, migram para uma das duas posições verticais de focagem. Note-se que a flutuabilidade correspondente conforme descrito na Seção 2, não foi utilizado. Em vez disso, a bomba de seringa foi fisicamente inclinada para permitir sedimentação de partículas para a saída da seringa, levando a uma elevada concentração de partículas durante a corrida.
Uma execução experimental ilustra a necessidade de partícula adequada e as concentrações de células é mostrado na Figura 4. Sem ordenação completa, os grupos localizados de forma de partículas e são encapsulados, mas muitas gotas são sem partículas. Um histograma mostra a diminuição da eficiência de encapsulação para o encapsulamento de partícula desejado dois.
Figura 1. Dispositivo de encapsulamento. a) dispositivo geral com entradas, saída, e canal de ordenação muito tempo. A altura do dispositivo é de 52 mM ea largura do canal ordenação é de 27 mM. b) Tanto aquosa e as entradas de óleo têm filtros detritos grandes com aberturas do fim da largura do canal ordenar para o ponto de vista ampliada da entrada de óleo. c) A vista alargada do bico mostra larguras de canal iguais de 27 mm para os canais aquosos e óleo, seguido pela contracção do bocal de 22 uM e expansão súbita de um canal mais largo iM 61.Note-se que as dimensões do dispositivo mostrado aqui foram verificados utilizando um perfilómetro após microfabricação e diferem um pouco das dimensões nominais da máscara. A verdadeira imagem do canal de ordenação e bico estão disponíveis on-line como Suplementar Figura 1 . A máscara de arquivo AutoCAD também foi incluída on-line como um complemento a este manuscrito.
Figura 2. Histerese de um gotejamento para a transição de jacto usando um mais amplo do dispositivo (80 mM de largura x 22 uM alta). a) Para a taxa de FC-40 de fluxo constante (Q óleo = 45 uL / min), a formação de gota constante ocorre a 10 kHz utilizando uma solução aquosa caudal Q aq = 8 uL / min. Como a taxa de fluxo aquosa é lentamente aumentada para 10 e mu; L / min, ejecção do fluxo de fluido aquoso é disparado. b) Quando a taxa de fluxo é retornado a 8 mL / min de jacto continua. Note-se que a formação de gota constante pode ser re-estabelecido, por breves instantes parando a bomba de fluxo aquoso (uma pausa de 1 segundo é típico).
Figura 3. Encapsulação simples e dupla-partícula. Uma formação da gota) com uma célula por gota (Q óleo = 60 uL / min, Q aq = 9 mL / min) com uma taxa de geração de gota de 6,1 kHz, o tamanho médio de gota 24,4 pL, e uma eficiência de captura de uma única célula D k = 79,5% e P k = 83,7% (λ = 0,95) para um tamanho de amostra de n d = 517 gotas e n p = 491 partículas formação da gota. b) com duas células por gota é conseguido simplesmente por redução da FC-40 caudal de óleo Q para 30 μL / min. As maiores (39,8 pL) gotas são formados a uma taxa de 3,8 kHz com uma eficiência de captura de duas células D k = 71,5% e P k = 79,5% (λ = 1,80) para um tamanho de amostra de n D = 383 gotas e n p = 689 partículas. CD) Dois histogramas comparar as eficiências de encapsulação de queda de partículas de D k ordenou encapsulamento simples e duplo de partículas, com estatística de Poisson (encapsulamento aleatório). Note-se que para ambos os casos, o espaçamento de partícula na direcção do fluxo é de cerca de 17-18 mm para totalmente ordenadas, as partículas alternados. Vídeos Suplementares mostrando tanto o encapsulamento de um único e duplo-partícula estão disponíveis online. Clique aqui para ver 3 filmes complementares . Clique aqui para ver 3b filme Suplementares .
Concentração Figura 4. Afecta grandemente a eficiência de encapsulamento. A) Como as reduções de concentração, ordenação completa não ocorre, e assim "buracos" nos trens emergir, deixando algumas gotas com menos do que as partículas previstas. B) O histograma mostra a eficiência diminuiu ( D k = 55,9%, P k = 70,9%) para dois-partícula de encapsulação devido a um valor mais baixo de λ = 1,57, onde há quase a mesma quantidade de partículas de um único cai como existem duas vezes de partículas gotas. Isto resulta a partir de óleo figura Q = 30 uL / min e Q aq = 9 mL / min, as condições de escoamento mesmas para Figura 3b. Um vídeo representante suplementar está disponível online. Clique aqui para ver 4 Movie Suplementar .
Apesar graus relativamente elevados de ordenação, nem todos os gotas conterá o número apropriado de partículas ou células. Eficiência de encapsulação pode ser calculada como o número de células ou partículas que ficam encapsulados em gotas com a ocupação desejado dividido pelo seu número total. Estes dados em bruto pode ser obtido quer a partir de um algoritmo de vídeo de alta velocidade automático ou de imagiologia de uma amostra de emulsão recolhida. Isto pode ser comparado com a fracção de par...
JE é um inventor em uma patente pendente baseado na tecnologia utilizada neste manuscrito.
Agradecemos Technologies Raindance para a amostra de PFPE-PEG surfactante utilizada neste estudo, e agradecemos a BioMEMS Resource Center (Mehmet Toner, diretor) para o molde de wafer de silício usado para criar réplicas dos canais de PDMS.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Nome do reagente | Companhia | Número de catálogo | Comentários |
AutoCAD | AutoDesk | ||
Máscara de transparência | Fineline Imaging Inc. | ||
SU-8 Photoresist | Microchem | 2050 | |
Profilometer Dektak | Veeco | ||
Placa de Petri | BD Falcon | 351058 | |
PDMS Kit Elastômero de Silicone | A Dow Corning Corp | Sylgard 184, número de material (240) 4019862 | |
Exsicador de vácuo | Jencons | 250-030 | |
Bomba de vácuo | Alcatel Vacuum Technology | 2010 C2 | |
Regulador de vácuo | Cole-Parmer | EW-00910-10 | |
Forno | Thermo Scientific | Lindberg Blue M, OV800F | |
Biópsia com punch, 0,75 mm | Harris | Uni-Core 15072 | |
Laboratório de Corona Treater | Electro-Technic Products Inc. | BD-20AC, SKU 12051A | |
Lâminas de vidro | Gold Seal | 3010 | |
Aquapel | PPG Industries | Estratégia Alternativa | |
Microesferas de poliestireno, 9,9 mM | Thermo | G1000 | |
OptiPrep | Sigma-Aldrich | D1556 | Não demonstraram |
Luer-Lok Seringas | BD | 1 mL: 309,628 3 mL: 309,585 | |
FC-40 Óleo Fluorocarbon | 3M Inc. | Sigma Aldrich, F9755 | |
PFPE-PEG fluorotensioactivo | Raindance Technologies | ||
Óleo Mineral Luz | Processos Químicos PTI | 08042-47-5 | Estratégia Alternativa |
Surfactante Óleo Mineral | Evonik Goldschmidt Corporação | ABIL EM 90 | Estratégia Alternativa |
Tygon Tubing PVC | SmallParts | TGY-010 | |
Calibre 30 Luer-Lok Seringa Agulha, 1/2 " | SmallParts | NE-301PL-C | |
Microscópio invertido | Carl Zeiss imagem | Axio Observer.Z1 | |
Câmera de alta velocidade | Vision Research | Fantasma V310 | |
Bombas de seringa (2) | Chemyx Inc. | Nexus 3000 | |
Óleo de silicone | A Dow Corning | 200 de fluido, a 10 cSt | Opcional para armazenamento de emulsão |
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