Method Article
Aqui, apresentamos um protocolo para o desenvolvimento e a caracterização de um modelo de zebrafish de epilepsia resultante da inibição transitória do gene DEPDC5.
A epilepsia representa uma das doenças neurológicas mais comuns, afetando cerca de 50 milhões de pessoas em todo o mundo. Avanços recentes na pesquisa genética descobriram um grande espectro de genes implicados em várias formas de epilepsia, destacando a natureza heterogênea deste transtorno. Modelos animais adequados são essenciais para investigar os mecanismos patológicos desencadeados por mutações genéticas implicadas na epilepsia e para o desenvolvimento de terapias especializadas e direcionadas. Nos últimos anos, o zebrafish emergiu como um valioso organismo vertebrado para modelar epilepsias, com o uso de manipulação genética e exposição a drogas epiléptogênicas conhecidas, como pentilenotetrazol (PTZ), para identificar novas terapêuticas antiepilépticas. Mutações deletérios no regulador mTOR DEPDC5 têm sido associadas a várias formas de epilepsias focais e a derrubada da ortopedia de zebrafish causa hiperatividade associada a episódios semelhantes a convulsões espontâneas, bem como atividade eletrográfica aprimorada e natação característica da roda. Aqui, descrevemos o método envolvido na geração do modelo de perda de função DEPDC5 e ilustramos o protocolo de avaliação da atividade motora em 28 e 48 horas de fertilização pós-fertilização (hpf), bem como um método para registro da atividade de campo no tectum óptico zebrafish. Uma ilustração do efeito da droga epieptogênica PTZ sobre a atividade neuronal ao longo do tempo também é fornecida.
Devido ao seu pequeno tamanho, desenvolvimento oviparas e transparência nos estágios iniciais do desenvolvimento, o zebrafish emergiu como um valioso organismo vertebrado para modelar doenças humanas tão diversas quanto doenças cardiovasculares, cancerígenas ou neurológicas1,2. O zebrafish combina as vantagens de um vertebrado, incluindo a alta conservação da arquitetura de órgãos e código genético, com o pequeno tamanho e facilidade de manipulação genética de organismos modelos mais simples, facilitando, assim, tanto estudos fundamentais quanto aplicações translacionais. Em particular, sua comodidade à triagem automatizada de comportamento e marcadores fluorescentes de processos celulares tornou o zebrafish um modelo particularmente atraente para a pesquisa de epilepsia. Isso foi demonstrado por um alto aumento na última década do número de publicações com modelos quimicamente induzidos e/ou genéticos de epilepsia3,4,5 e, mais recentemente, relatos de terapêuticas promissoras obtidas a partir de telas químicas nesses modelos6,7,8.
O DEPDC5 é membro do complexo GATOR1, um regulador negativo da sinalização mTOR9. Mutações no gene DEPDC5 foram descobertas pela primeira vez em 2013 em probandes que sofrem de epilepsias focais autossômicas dominantes10,11, e desde então foram relatadas em uma série de condições clínicas associadas a manifestações epilépticas focais e displasia cortical12. Prevê-se que a grande maioria das mutações relatadas causem a perda de função do gene12, e isso foi formalmente demonstrado para uma série de transcrições mutadas DEPDC5 que são alvo de decadência mRNA mediada sem sentido12,13. De acordo com, a derrubada da ortopedia genética em zebrafish usando oligonucleotídeos de morfolino antiscenos (AMOs) resulta em uma série de características comuns a modelos epilépticos neste organismo, incluindo hiperatividade, natação em forma de roda, convulsões espontâneas e atividade neuronal aprimorada14,15,16,17,18. Curiosamente, o tratamento com rapamicina, um inibidor da sinalização mTOR, inverteu as características comportamentais deste modelo18,apoiando a hipótese de que a perda de função de DEPDC5 pode desencadear a epilepsia devido a uma má regulação da via mTOR9,19.
A derrubada transitória da expressão genética in vivo usando oligonucleotídeos antissentidos que carregam a modificação da morfolino tem sido uma ferramenta inestimável para estudar o papel de genes específicos, em comparação com as técnicas baseadas em si/shRNA. Recentemente, estratégias baseadas em AMO também encontraram aplicações clínicas, com uma primeira terapia AMO recebendo a aprovação da FDA para o tratamento da atrofia muscular de Duchenne em 201620. Embora tenha sido relatado que, em zebrafish, o fenótipo de knock-down genético agudo baseado em AMO nem sempre se correlaciona com os modelos de knock-out constitutivos21, isso pode ser devido, pelo menos em alguns casos, a mecanismos compensatórios gerados por modificações genéticas constitutivas22. No entanto, a questão da especificidade do fenótipo induzido pela AMO é uma preocupação indiscutível que deve ser diligentemente abordada em estudos utilizando essa tecnologia23. Para garantir a especificidade do fenótipo de knock-down baseado em AMO, vários controles-chave são necessários. Estes incluem uma curva dose-resposta que permite a seleção da menor dose de AMO eficaz para knock-down genético, evitando a toxicidade geral devido à introdução de um excesso de material genético. O uso de um AMO incompatível que não visa nenhuma região específica no genoma também é necessário para estabelecer uma dose apropriada e na identificação de um fenótipo específico. Um segundo AMO que tem como alvo uma região diferente do mesmo gene, como uma AMO de bloqueio de emendas, é necessário para confirmar que o fenótipo é devido à derrubada do gene alvo. O resgate do fenótipo derrubado com o cDNA do gene, seja o ortopedia humano ou uma versão modificada por codon do gene zebrafish que não pode ser alvo da AMO, fornece um forte argumento a favor da especificidade do fenótipo. A falta de resgate com o mesmo cDNA contendo mutações de perda de função (como a introdução de um códons de parada precoce) é mais uma prova nesta direção.
Aqui, apresentamos um método para gerar um modelo de perda de função de zebrafish DEPDC5 e o protocolo para fenotipagem comportamental em 28 e 48 h pós fertilização (hpf). Com 28 cvf, a perda de função DEPDC5 causa hiperatividade geral, como evidenciado pelo aumento dos movimentos de enrolamento e contração dos embriões dentro do acorde. Um sistema automatizado de detecção de movimento pode ser usado nesta fase para quantificar a atividade global por embrião. Com 48 hpf, zebrafish exibem fuga estereotipada natação em resposta ao toque. Em zebrafish com expressão de baixa regulagem do DEPDC5, a trajetória de natação é significativamente mais tortuosa do que nos controles, o peixe exibindo um "parafuso de cortiça" ou "roda-de-giro" como padrão, semelhante a outros modelos de epilepsia relatados neste organismo3,4. Os registros eletrofisiológicos foram obtidos no tecto óptico em larvas de zebrafish entre 4-6 dias após a fertilização (dpf) e mostram um aumento da atividade neuronal nos animais de knock-down DEPDC5. A vantagem deste modelo é que ele apresenta várias características fenotípicas em diferentes momentos, o que pode ser útil no monitoramento e avaliação da eficácia das terapias medicamentosas durante o desenvolvimento.
Os procedimentos experimentais foram aprovados pelos Comitês de Ética Nacional e Institucional.
1. Derrubada transitória do gene DEPDC5 em embrião de zebrafish
2. Análise de Comportamento
3. Análise Eletrofisiológica
A Figura 1 mostra traços representativos de tensão de 4-6 dpf zebrafish larva extracelular no caso de duas condições genéticas: controle de incompatibilidade e knock-down DEPDC5. No período de base da gravação, o knock-down DEPDC5 mostra maior ocorrência de eventos espontâneos, enquanto o controle de incompatibilidade apresenta muito poucas flutuações. Esses padrões de atividade são representativos do aumento significativo da atividade neuronal devido à perda de função do DEPDC5,como já noticiamos anteriormente18. Após a aplicação ptz, tanto o controle de incompatibilidade quanto o knock-down DEPDC5 mostram um número crescente de eventos de despolarização. Durante o primeiro período após a aplicação de PTZ (10 – 60 min), observa-se uma taxa de 0,8 eventos por min tanto no controle de incompatibilidade quanto no knock-down de DEPDC5, onde a maioria dos eventos são de alta amplitude (>1 mV). Durante este último período de resposta (60 – 120 min após a aplicação do PTZ), a taxa de eventos de despolarização aumenta para cerca de 1 evento por minuto, e a maioria dos eventos são de baixa amplitude (≤1 mV).
Figura 1: Exemplos de gravações de campo no cérebro de larvas de zebrafish. (A) Visão geral da gravação de 180 min para uma larva de controle de incompatibilidade e um Knock-down DEPDC5. Primeiro, foi registrada atividade de base espontânea, depois o PTZ foi aplicado no banho (barra vermelha). (B) Histogramas de tempo de peri-estímulo dos eventos de despolarização para controle de incompatibilidade e knock-down DEPDC5. Os eventos foram classificados como alta amplitude (>1 mV - azul) e baixa amplitude (≤1 mV - preto). (C-E) Exemplos de traços dos diferentes períodos da gravação: (C) atividade espontânea, (D) Eventos de alta amplitude durante o primeiro período após a aplicação ptz, (E) Eventos de baixa amplitude durante este último período após a aplicação ptz. Observe que os arquivos de script para obter esses números são fornecidos como Arquivo Suplementar. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Arquivo suplementar: Arquivos de script para a etapa 3.4. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
A epilepsia é uma doença neurológica complexa, com uma ampla gama de etiologias que começam a ser elucidadas com o advento das tecnologias de sequenciamento genético25,26,27. Modelos animais versáteis são essenciais para uma estratégia translacional eficiente que produzirá tanto insights sobre os mecanismos patológicos de epilepsias geneticamente ligadas, bem como terapias direcionadas para as formas distintas dessa condição. Os modelos de zebrafish têm sido muito eficazes na reprodução das principais características da epilepsia e no fornecimento de leituras confiáveis para o rastreamento de medicamentos antiepilépticos5,28. Convulsões espontâneas podem ser detectadas em zebrafish geneticamentemodificados 15,29,30,31 e análise neurofisiológica nesses modelos28 confirmou a base neuronal do comportamento epiléptico32,33. Larvas de zebrafish de pequeno porte são favoráveis a telas químicas em formato de 96 poços usando detecção automatizada de comportamentos simples, como a natação espontânea, que permite a detecção rápida de potenciais terapêuticos.
O modelo de knock-down DEPDC5 apresentado aqui é obtido pela injeção de AMO no embrião de zebrafish para bloquear a expressão genética durante o desenvolvimento. Este modelo apresenta várias características fenotípicas de pedra-chave durante diferentes pontos de tempo do desenvolvimento larval, que podem ser usados como indicadores de eficiência terapêutica durante um protocolo de triagem química ou genética. O knock-down genético mediado pela AMO é uma técnica poderosa, exibindo vantagens sobre modelos de convulsão induzidos quimicamente, pois visa especificamente a expressão de um gene de interesse, permitindo assim a identificação dos mecanismos patogênicos subjacentes desencadeados por uma mutação genética. Os indutores químicos, que são, no entanto, ferramentas potentes para rastreamento de drogas, podem atuar através de múltiplas vias celulares que podem nem sempre ser relevantes para a mutação genética em estudo. Embora a injeção AMO seja em si uma técnica simples quando dominada pelo experimentador, ela também apresenta uma série de limitações. As injeções devem ser realizadas no embrião de um estágio celular; em nossas mãos, as injeções em estágios posteriores aumentaram muito a variabilidade do fenótipo. Isso limita o tempo disponível para injeção; portanto, uma estratégia de geração de ovos para injeção em uma sequência de tempo é útil. Usamos rotineiramente 4-5 cruzes que abrimos em intervalos de 15-20 minutos, permitindo a injeção de uma embreagem antes de obter a próxima. Além disso, deve-se tomar cuidado para avaliar o fenótipo ao mesmo tempo entre diferentes experimentos, à medida que comportamentos estereotipados evoluem rapidamente durante os primeiros dias de desenvolvimento. O volume e a concentração de AMOs também devem ser cuidadosamente controlados, pois a toxicidade geral devido à injeção de quantidades excessivas mascarará o fenótipo específico. Os diferentes controles apresentados na introdução são essenciais para determinar a dose de injeção certa e o fenótipo correspondente.
As gravações de campo do cérebro de zebrafish larval são uma ferramenta útil para investigar os efeitos deletérios das mutações genéticas envolvidas em diferentes distúrbios cerebrais na atividade neuronal global34. Eventos de despolarização vistos nessas condições experimentais são um método estabelecido para avaliar efeitos eletrofisiológicos de drogas em diferentes condições epilépticas15,35. No entanto, a avaliação desses efeitos tem sido feita em sua maioria qualitativamente e não quantitativamente, e tendo um observador subjetivo como ator na análise. Aqui, desenvolvemos uma estratégia de detecção automática que pode quantificar objetivamente a taxa de despolarizações, sua amplitude e duração, e pode avaliar o progresso desses parâmetros ao longo do tempo, ou com diferentes intervenções genéticas ou farmacológicas.
Os resultados representativos aqui apresentados mostram a atividade de campo esperada do modelo genético de knock-down DEPDC5 em comparação com um controle de incompatibilidade em 4-6 dpf zebrafish, antes e depois da aplicação do PTZ para introduzir atividade eletrográfica semelhante à epipeso. Anteriormente, mostramos um aumento significativo na atividade basal da condição de knockdown DEPDC5 18. Aqui, mostramos que a resposta dessas duas condições ao PTZ, um indutor de atividade epileptiforme química, tem trajetória semelhante no tempo, começando com um período de frequência relativamente baixa, eventos de despolarização de alta amplitude e continuando com um período de maior frequência, eventos de despolarização de menor amplitude. Os eventos de gravação de campo têm dinâmica lenta (as frequências de interesse estão na faixa de 0,005-0,2 s-1), portanto, tanto filtros de baixo e alto passe são usados neste protocolo para isolar os eventos de interesse. Após a eliminação do ruído de baixa frequência, a detecção de eventos de despolarização é realizada usando um limiar simples. Uma vez que as estatísticas do sinal são muito afetadas pela presença de eventos de despolarização, não poderíamos usar o desvio padrão do sinal total para determinar esse limiar. A variabilidade do valor do desvio padrão entre os conjuntos de dados foi maior do que os níveis de ruído de gravação observados. Portanto, após a inspeção visual dos traços, utilizou-se um valor fixo do limiar de 0,3 mV, a fim de evitar o viés induzido por diferentes níveis de atividade de despolarização.
O protocolo descrito fornece um método padronizado e simples para avaliar o comportamento motor e a atividade do campo neuronal, por meio do registro de tensão de corrente extracelular, juntamente com a detecção automática de eventos de despolarização no tectum óptico, para caracterizar fenótipos epitipos epilépticos em modelos de zebrafish.
Os autores não têm nada a revelar.
Gostaríamos de agradecer ao pessoal da plataforma de eletrofisiologia do ICM onde foram realizados os experimentos de neurofisiologia. Agradecemos também a Anca Marian pela ajuda técnica. SC foi apoiado pelo Trampolim Grant #21488. O EK foi apoiado pelo AFM Grant #18469 e pela ERC Consolidator Grant (ALS-Networks). O HC foi apoiado por prêmios de doutorado da Fondation pour la Recherche Médicale (PLP20141031462) e arsla. Para AD e RM, este trabalho foi apoiado por três bolsas da Autoridade Nacional Romena de Pesquisa Científica e Inovação, CNCS-UEFISCDI (números do projeto PN-III-P4-ID-PCE-2016-0010, PN-III-P2-2.1-PED-2016-0007, e COFUND-NEURON-NMDAR-PSY), uma subvenção do programa de pesquisa e inovação Horizon 2020 da União Europeia – acordo de subvenção nº 668863-SyBil-AA, e uma bolsa da Fundação Nacional de Ciência nSF-IOS-1656830 financiada pelo Governo dos EUA.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Agarose | Sigma-Aldrich, France | A9539 | |
Aquarium salt | Instant Ocean, Blacksburg, VA | SS15-10 | |
Borosilicate glass with filament | Sutter Instruments | BF100-50-10 | OD: 1.5mm, ID: 0.5 mm |
CaCl2 | Sigma-Aldrich, France | C1016 | |
Depdc5-atg antisense morpholino | GeneTools, OR, USA | N/A | sequence 5’- TGCCTTCATGGTGACCGTCATTTTA -3’ |
Depdc5-mis antisense morpholino | GeneTools, OR, USA | N/A | sequence 5’- TGCgTTgATcGTGACCcTgATTTTA -3’ |
Depdc5-splice antisense morpholino | GeneTools, OR, USA | N/A | sequence 5’- ACATTCCTGTTTCACCATAGATGAT -3’ |
Digitizer | Molecular Devices, CA, USA | Digidata 1550 | |
Fast Green Dye | Sigma-Aldrich, France | F7258 | Stock solution of 0.2% |
Glass-bottom petri dishes | Ibidi, Germany | 81218 | |
Glucose | Sigma-Aldrich, France | 68270 | |
Grasshopper 2 camera | FLIR, BC, Canada | GRAS-03K2M-C | formerly Point Grey Research |
HEPES | Sigma-Aldrich, France | H3375 | |
Human wild-type DEPDC5 cDNA | Dharmacon, France | NM_001242897.1 | Accession: BC144291 Clone ID 905 |
ImageJ software | NIH, USA | N/A | |
KCl | Sigma-Aldrich, France | P9333 | |
Matlab software | MathWorks, MA, USA | N/A | |
MgCl2 | Sigma-Aldrich, France | M2670 | |
NaCl | Sigma-Aldrich, France | S7653 | |
NaOH | Sigma-Aldrich, France | 71687 | |
Pancuronium bromide | Alomone Labs | P-130 | Stock solution of 60 mM in water |
Parafilm | Sigma-Aldrich, France | P7793 | |
Patch clamp amplifier | Molecular Devices, CA, USA | MultiClamp 700B | Computer-controled patch clamp amplifier |
pClamp10 acquisition software | Molecular Devices | N/A | |
Pentylenetetrazol (PTZ) | Sigma-Aldrich, France | P6500 | Stock solution of 300 mM (dissolved in recording solution) |
Pipette puller | Narishige, Japan | PC-10 | |
Pneumatic PicoPump | WPI, France | PV 820 | |
Sylgard 184 kit | Sigma-Aldrich Intl. | 761036 | |
Transfer plastic pipettes | Sigma-Aldrich, France | Z350605 | |
Zebralab | Viewpoint, France | N/A |
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