Параллельный допрос по набору в лигунд-2 для скрининга в Лиганде по шкале GPCR с использованием PRESTO-Tango Assay

Резюме

С учетом того, что GPCRs являются привлекательными целевыми показателями, пригодными для наркотиков, скрининг лиганда GPCR, таким образом, необходим для идентификации свинцовых соединений и для проведения исследований по дефанфанизации. К этим усилиям мы описываем PRESTO-Tango, ресурсную платформу с открытым исходным кодом, используемую для одновременного профилирования переходного набора на работу в формате приблизительно 300 GPCRs с использованием речевого агентства TEV.

Аннотация

Как крупнейшая и наиболее универсальная генная суперсемейство и посредники гаммы клеточных сигнальных путей, G-белковые рецепторы (GPCRs) представляют собой одну из наиболее перспективных целей для фармацевтической промышленности. Ergo, дизайн, реализация и оптимизация GPCR лиганд скрининга анализы имеет решающее значение, так как они представляют собой дистанционного управления инструментами для обнаружения наркотиков и для манипулирования GPCR фармакологии и результатов. В прошлом, G-белковых ипотеческих анализов типифицировали эту область исследований, обнаружения лиганд-индуцированных событий и количественного поколения вторичных посланников. Однако, с появлением функциональной избирательности, а также повышение осведомленности о нескольких других G белка независимых путей и ограничения, связанные с G-белок зависимых анализов, есть больший толчок к созданию альтернативных GpCR лиганд скрининга анализы. Для этого мы описываем применение одного такого ресурса, платформы PRESTO-Tango, системы на основе репортеров, которая позволяет параллельно и одновременно проводить допрос человека GPCR-ome, подвиг, который ранее считался технически и экономически неосуществимым. Основываясь на независимом исследовании вербовки G-protein, при посредничестве группы по борьбе с торговлей людьми и сигнализации в GPCRs делает PRESTO-TANGO подходящим инструментом для изучения примерно 300 необоняемых ГПКР, в том числе около 100 сиротских рецепторов. Чувствительность и надежность PRESTO-Tango делают его пригодным для первичных высокопроизводительных экранов с использованием сложных библиотек, используемых для выявления новых целей GPCR для известных препаратов или для открытия новых лиганд для рецепторов сирот.

Введение

G-белковые рецепторы (GPCRs) представляют собой самое большое и разнообразное семейство трансмембранных белков, работающих в качестве связующих интерфейсов между клеткой и ее окружающей средой^1. Универсальность GPCRs подчеркивается их способность обнаруживать разнообразный спектр лигандов от нейротрансмиттеров до нуклеотидов, пептидов до фотонов, и многое другое, а также их способность регулировать многочисленные вниз по течению сигнальных каскадов, участвующих в клеточном росте, миграции, дифференциации, апоптоза, стрельбы клеток и т.д.²,^3. Учитывая их повсеместность и участие во множестве физиологических процессов, это семейство рецепторов имеет первостепенное терапевтическое значение, продемонстрированное тем фактом, что более трети имеющихся в настоящее время предписанных лекарств нацелены на GPCRs^4. Тем не менее, эти существующие терапевтические только целевой небольшой подмножество суперсемьи (по оценкам, 10%), и фармакология многих GPCRs остается необезвеченной. Кроме того, более 100 GPCRs существуют как сиротские рецепторы, так как они не были сопоставлены с эндогенным^{лигандом 5}. Таким образом, скрининг GPCR ligand имеет решающее значение в дефанфанизации и разработке лекарств, поскольку он прокладывает путь к открытию и оптимизации свинца, и, возможно, к стадии клинических испытаний.

Методы скрининга GPCR ligand традиционно упали в одной из двух категорий, G-белковая зависимость или G-белок независимых функциональных анализов⁶. Сигнализация GPCR регулируется гетеротримыми G-белками (ГЗЗ), которые активируются в виде обмена GTP на ВВП, связанных на субъединице⁷. Сигналы от активированного рецептора передаются G-белками через вторичные посланники, такие как cAMP, Кальций, DAG и IP3, чтобы посредничать вниз по течению сигнализации на вниз по течению эффекторов⁸. Характер функциональных последствий G-белковой сигнализации был использован для создания клеточных анализов, которые отражают активацию рецепторов. Эти методы, которые измеряют проксимальные (прямые) или дистальные (косвенные) события в G-белковой сигнализации, наиболее часто используются для скрининга лиганд GPCR и в основном используются в исследованиях десиротенизации⁶. Примеры анализов, которые непосредственно измеряют активацию G-белка при посредничестве GPCR, включают в себя связывающую асссид «35S»GTP-S, которая измеряет связывание радиомаркированных и негидроизируемых аналогов GTP с субъединицей ГЗ, и Фюрстер/биолюминесценционный резонансный рецензионный перенос энергии (FRET/BRET, соответственно) зонды для мониторинга GPCR-G и ГЗ /ГЗ взаимодействий, которые набирают больше тяги на протяжении⁹лет^,10. Анализы, которые отслеживают дистальные события, являются наиболее часто используемыми инструментами для профилирования GPCR; например, анализы cAMP и IP1/3 измеряют внутриклеточное накопление G-белковых зависимых вторичных посланников, в то время как «Ca^2»- поток и репортирующие анализы, связанные с конкретными элементами реакции, вовлеченными в активацию G-белка (CRE, NFAT-RE, SRE, SRF-RE), изучают события, далее вниз по течению сигнального каскада^11. В то время как большинство вышеупомянутых анализов могут быть выполнены на высоком уровне пропускной записи, являются довольно чувствительными, и похвастаться определенными ассаем-специфических преимуществ (например, дискриминация между полными / частичными агонистов, нейтральных антагонистов и обратных агонистов в случае связывания GTP, или анализ функциональности на живых клетках, таких как "Ca^2"и IP1/3)⁶, Есть, к сожалению, нет существующих G белково-зависимых методов быть подходящим допроса всего druggable GPCR.ru. Это в значительной степени связано с родной связи нескольких G-белковых подсемейств с GPCRs, в результате чего сигнализации на нескольких каскадах и неизвестных G-белков ойс на сиротах GPCRs. Чтобы смягчить эту проблему, анализы были разработаны, чтобы заставить беспорядочную G-белок связи через один общий сигнализации считывания, такие как cAMP, и Ca^{2 ",}хотя большинство из них имеют низкую пропускную силу¹².

Важным аспектом жизненного цикла GPCR является прекращение G-белково-зависимой сигнализации, которая происходит в значительной степени за счет набора q-arrestins, который вызывает диссоциацию G-белка, и в конечном итоге десенсибилизации рецептора, который предназначен для клатрин покрытием интернализации¹³. Наиболее повсеместно выраженными изоформами з-арестина являются невизуальные q-arrestin1 и q-arrestin2, также обозначенные как arrestin-2 и arrestin-3, соответственно¹⁴. Введите G-протеиновые независимые анализы на основе клеток, которые добавляют новое измерение скринингу лиганда GPCR; торговля рецепторами, без этикетки целые ячейки, и к-арестин вербовки анализы все примечательные примеры. GPCR торговли анализы использовать флюорофор помечены лиганды или совместно интернализированных антител, направленных на рецептор¹⁵, в то время как этикетка свободных целых клеток анализы использовать биосенсоры, которые переводят клеточные изменения, вызванные лиганд связывания в количественных выходов, таких как электрические или оптические сигналы¹⁶. Примечательно, что квинтэссенцией GPCR-- - арестин взаимодействий моды на набор анализ q-arrestin как привлекательный инструмент в репертуаре функциональных анализов¹⁷. Система танго, впервые разработанная Барнеа и др. всего десять лет назад, включает в себя введение трех экзогенных генетических элементов: синтез белка, состоящий из q-arrestin2 с протеазой вируса табачного etch (TEVp), тетрациклинового трансактиватора (tTA), который привязан к GPCR через табак etch вирус протеаза расщепления сайта (TEVcs) и предшествует последовательность из C-терминус V2 вазопрессин рецептор (V2 хвост) для содействия арестин вербовки, и репортер luciferase гена, транскрипция которого вызвана tTA транскрипции фактор транскрипции транскрипции транслокации в ядро, которое освобождается от мембраны якорь после q-arrestin2 вербовки (Рисунок 1)¹⁸. Количественные показания активации GPCR и набора q-arrestin2 могут быть впоследствии определены путем чтения для люминесценции. Заметным отличием является то, что в то время как торговля рецепторами и этикетки свободных целых клеточных методов являются относительно низкой пропускной способом, танго имеет ряд преимуществ, в том числе селективного чтения, что характерно для целевого рецептора и чувствительность из-за интеграции сигнала, которые делают его подходящим кандидатом для лиганда скрининга в большей шкале¹⁸.

В связи с этими стратегическими особенностями, Kroeze et al. разработаны PRESTO-Tango (Параллельное выражение и скрининг рецепторов и скрининг атлетизм через транскрипционный выход-Танго), высокопроизводительная платформа с открытым исходным кодом, которая использует подход Tango для профиля наркотического GPCR-ome в параллельной и одновременной манере¹⁹. Используя «неразборчивый» набор q-arrestin2 почти для всех GPCRs, PRESTO-Tango является первым в своем роде с точки зрения функциональных анализов на основе клеток, что позволяет быстро "первый раунд" скрининга малых молекулных соединений почти на всех необонятельных GPCRs, в том числе сирот, независимо от G-белка подсемейства.

протокол

1. Первичный скрининг: культура клеток и посев пластин

1. Для приготовления поли-L-лизин (PLL) покрытием пластин, обойтись 20 л /хорошо 25 мкг/мл бульона раствор PLL в белом или черном 384-пуговый оптический нижний пластины с помощью электронного многоканального пипетка или реагента дозатор. Инкубировать пластины при комнатной температуре 0,5-2 ч.
   ПРИМЕЧАНИЕ: При использовании черных 384-колодцев, ожидайте, что фоновый сигнал будет ниже по сравнению с белыми пластинами. Черные пластины рекомендуется уменьшить кровотечение через люминесценции между соседними скважинами.
2. Чтобы сохранить покрытием пластин и смыть избыток PLL, удалить PLL, стряхивая его над раковиной, кран сухой над бумажным полотенцем, и добавить 40 Л / хорошо разбавленного 1x раствор антибиотик-антимикотик с помощью электронного многоканального пипетки или реагента дозатор. Храните пластины с покрытием PLL при 4 градусах По Цельсию до готовности к посевной пластины.
3. Поддерживать htLA клеток (любезно предоставляемые д-р Ричард Аксель) - человеческой эмбриональной линии клеток почек (HEK293T) застойно выражая q-arrestin2-TEV и tTA-управляемых luciferase-в полном Dulbecco в модифицированной среде Eagle (DMEM) дополнены 5% плода сыворотки, 5% сыворотки из телячьей коровки, 2,5 мкг/мл пуромицина, 50 мкг/мл гигромицина, 100 U/mL пенициллин, и 100 мкг/мл стрептомицина при 37 градусах По Цельсия в увлажненном инкубаторе, содержащем 5% CO₂.
4. Культура HTLA клеток в 150 мм посуды и проходят клетки два раза в неделю с коэффициентом разбавления 1:10, с оптимальным номером прохода клеток 5-25. Убедитесь, что достаточное количество 150 мм посуды сливится в день 384-хорошо посева пластины, в зависимости от масштаба первичного экрана.
   ПРИМЕЧАНИЕ: Использование клеток HTLA больше, чем проход 25 может привести к снижению жизнеспособности, что дает неоптимальные результаты.
5. Чтобы семена htLA клеток для первичного экрана, аккуратно промыть конфлятор 150 мм блюдо (es) с 1x фосфат-буфера солей (PBS), рН 7.4. Отсоединить клетки с примерно 6 мл 0,05% Трипсин /0,53 мМ EDTA, и передать в центрифуге трубки, содержащие по крайней мере равное количество полного Dulbecco в модифицированной среде Eagle (DMEM) для нейтрализации трипсина.
6. Спин вниз HTLA клеток на 500 х г в течение 3 мин и resuspend клеточной гранулы при плотности 0,22 х 10⁶ клеток / мл в полном DMEM, опуская добавление 2,5 мкг/мл пуромицина и 50 мкг/мл гигромицина, поскольку они могут уменьшить эффективность трансфекции.
7. Инкубировать необходимые 384-хорошо PLL покрытием пластин при 37 градусов по Цельсию, чтобы согреть их перед посевными клетками. Удалите раствор для хранения 1x антибиотик-антимикотизм из 384-хорошо PLL покрытием пластины (ы), щелкнув пластины над раковиной и лентой его на бумажное полотенце, чтобы высохнуть.
8. Семенные клетки в 384-хорошо PLL покрытием пластин при окончательной плотности 10000 клеток / хорошо путем дозирования 45 зл и 0,22 х 10⁶ ячеек / мл HTLA подвески с помощью электронного многоканального пайпе. Инкубировать пластины при 37 градусах Цельсия на ночь. Если в тот же день трансфекции является предпочтительным, семенные клетки при плотности 16000 клеток / хорошо и выполнять трансфекции 4 ч позже.
   ПРИМЕЧАНИЕ: Для высокой эффективности трансфекции, 50-70% клеточной выпуклости является оптимальным.

2. Первичный скрининг: подготовка пластин ДНК и трансфекции

1. Чтобы подготовить 384-хорошо ДНК источник пластины для трансфекции, как показано на рисунке 2, распространять плазмид cDNAs кодирования GPCR-Танго конструкций интерес в 96-колодец пластины, с другой GPCR / хорошо. Плазмидная ДНК должна быть приостановлена в 0.1x Tris-EDTA (TE) буфера в концентрации 50 нг / Л.
   ПРИМЕЧАНИЕ: 96-колодские пластины ДНК могут быть запечатаны и сохранены при -20 градусов по Цельсию, и повторно использованы для нескольких экспериментов скрининга. Все конструкции cDNA, кодируя GPCR-Tango, доступны на коммерческой основе (см. Таблицу Материалов)и клонируются в плазмидpc pcDNA3.1. Комплект PRESTO-Tango GPCR состоит из четырех 96-колодных пластин, которые включают в себя 80 GPCRs каждый, пару скважин с пустым вектором в качестве отрицательного контроля, и положительные контрольные скважины, которые держат рецептор допамина D2 (DRD2), и колодцы, которые несут плазмид, кодирующую флуоресцентизирующую белковую (YFP) для отслеживания эффективности трансфекции.
2. Используя многоканальный пипетки, вручную переносите раствор ДНК из 96-ну хорошо в 384-пуговую исходную пластину ДНК, добавляя 10 л на 384 скважины. Для того, чтобы каждое условие эксперимента анализировалось в четырехсторонней, половина 96-ну а ДНК пластины (ряды A-D или E-H) будет охватывать полный 384-ну хорошо пластины путем распределения каждого GPCR в двух квадрантов (первый квадрант - соединение, второй квадрант - соединение), таким образом, что тот же GPCR будет трансфицироваться в 8 скважин из 384 пластины.
3. Соберите следующие трансфекционные реагенты, необходимые для метода выпадения фосфатов кальция, как описано Иорданией и др.²⁰: 0,1x TE буфер (1 мм Tris-HCl и 0,1 мм EDTA); 2.5 M CaCl₂ решение; 2x Hepes буфер, рН 7.05 (50 mM HEPES, 280 mM NaCl, 1.5 mM Na₂HPO_4). Стерилизовать все растворы путем фильтрации и хранить при 4 градусах Цельсия. День трансфекции, позволяют реагентам достичь комнатной температуры перед использованием.
4. Разбавить 2,5 M CaCl₂ стокового раствора в 0.1x TE (1:8 разбавления) до конечной концентрации 0.313 M CaCl₂ и вихря. Передача 40 зл 0,313 M CaCl₂ на 384-ну хорошо ДНК источник пластины и смешивать путем pipetting вверх и вниз с ручным многоканальным пипеткой или автоматизированной скамейке 384-канальный пипетки.
5. Добавьте 50 qL буфера 2x Hepes к плите источника дна 384-наилучшим образом, смешайте снова путем pipetting вверх и вниз и препятствуйте стоять на 1 min; каждый 384-хорошо будет иметь достаточное количество ДНК / трансфекционной смеси для трансфекции девяти 384-коловидной пластины, в зависимости от количества соединений, которые должны быть проверены. Перенесите 10 qL смеси ДНК/трансфекции из 384-хорошо исходной пластины ДНК в семенае клетки HTLA и инкубировать пластины на ночь при 37 градусах Цельсия.

3. Первичный скрининг: Стимуляция клеток

1. Двадцать четыре часа спустя, decant транс-инфицированных клеток, мягко щелкая 384-ну пластины над раковиной и лентой его на бумажное полотенце, или с головкой аспиратора. Медленно добавьте 40 qL голодающих носителей (DMEM дополнен1% диализированной сыворотки крупного рогатого скота плода (dFBS) и 1x антибиотик / антимикотический), стараясь, чтобы избежать прикосновения к клеткам непосредственно.
2. Пипет капота 20 л соединения интереса в 3x концентрации (окончательная концентрация препарата в клеточной пластине будет 1x) в чередующихся строках с стимуляцией с (я) стимуляцией, и 20 qL буфера транспортного средства для чередующихся рядов без (-) соединения. Вернуть клеточную пластину при 37 градусах Цельсия в 5% CO₂ и инкубировать, по крайней мере 16 ч.

4. Первичный скрининг: Чтение люминесценции

1. Подготовка glo реагент, модифицированный из Бейкер и Бойс²¹: 108 мМ Tris-HCl; 42 мМ Трис-База, 75 мм NaCl, 3 мМ MgCl2, 5 мМ Дитиотрей-тол (DTT), 0,2 мМ Кофермент А, 0,14 мг/мл D-Люциферин, 1,1 мм ММ АТФ, 0,25% v/v Triton X-100, 2 мМ гидросульфит.
   ПРИМЕЧАНИЕ: Фондовые растворы реагентов могут быть сделаны заранее, за исключением D-Люциферина, который всегда только что добавляется в реагент Glo в его порошкообразной форме. Если черные пластины были использованы, количество D-люциферин может быть увеличена до 0,25 мг /мл.
2. На 16-24 ч после стимуляции, decant транс-инфицированных клеток, мягко щелкая 384-ну пластины над раковиной и лентой его на бумажное полотенце. Добавьте 20 л/также реагента Glo и инкубировать пластину при комнатной температуре в течение 5-20 мин. Прочитайте пластины с помощью счетчика люминесценции микроплиты, с интеграцией время 1 с/хорошо.

5. Первичный скрининг: анализ данных

1. Экспорт сохраненных файлов из счетчика люминесценции в виде электронной таблицы; результаты будут зарегистрированы в относительных единицах люминесценции (RLU). На основе макета 384-хорошо пластины, рассчитать активации (изменение склада) каждого рецептора с помощью следующей формулы:
   
   ПРИМЕЧАНИЕ: Здесь образец RLU относится к значению каждой из четырех репликации скважин стимулируемого (я м. соединения) квадранта, Средний фон RLU является средним отрицательным контролем на пластине, и средний базальный RLU относится к среднему необработанного квадранта того же рецептора (- соединения). Кроме того, вычислить стандартное отклонение 4 точек данных для проверки качества результатов. Рекомендуется выполнить преобразование log2 на среднем износе изменений для исправления любой гетероскедности; log2 база является практическим выбором, чтобы помочь определить положительные хиты. Эмпирически установить положительные пороги попадания; следует отметить, что некоторые рецепторы могут иметь как низко как 2-кратное увеличение и до 40-кратного увеличения для других с полным агонистом.
2. На основе полученных результатов выберите GPCRs, которые являются потенциальными положительными хитами для вторичного скрининга.

6. Вторичный скрининг: посев клеток и трансфекции

1. Субкультура HTLA клеток в 100 мм посуды при общей плотности клеток 5 х 10⁶ ячеек в 11 мл полного носителя (4,55 х 10⁵/мл) и инкубировать при 37 градусов по Цельсию на 24 ч. Если в тот же день трансфекции является предпочтительным, семенные клетки при плотности 7,5 х 10⁶ клеток и выполнить трансфекции 4 ч позже.
2. Предварительно разогреть реагенты, необходимые для выпадения фосфатов кальция при комнатной температуре. Объедините 450 л 0,1x TE буфера с 50 зл и 2,5 М CaCl₂ и быстро вихрь; эти количества специфичны для одной 100-мм тарелки, исходя из объема медиума роста, который она удерживает.
3. В трубке добавьте 500 кЛ раствора TE/CaCl₂ до 10 мкг GPCR cDNA и вихря. Добавьте 500 л буферного раствора 2x Hepes в трубку, энергично встряхните (не вихрь) и инкубируют в течение 1 мин.
   ПРИМЕЧАНИЕ: 1 мкг любой плазмиды, кодирующей флуоресцентный белок (например, YFP, mCherry и т.д.), может быть со-трансэфектом с 9 мкг GPCR cDNA в общей сложности 10 мкг. Флуоресцентный белок используется для отслеживания эффективности трансфекции, и это минимальное количество не будет мешать анализу.
4. Сразу же после короткой инкубации, распределять раствор 1 мл dropwise на клетки. Аккуратно раскачивать тарелку взад и вперед, чтобы равномерно распределить осадок, позаботившись о том, чтобы не закружить тарелку, и инкубировать при 37 градусах По Цельсию в течение 24 ч.
5. На следующий день, наблюдать эффективность трансфекции, глядя на выражение флуоресцентного белка под флуоресцентным изображением клетки; трансфекции более 50% охвата являются идеальными.
6. Инкубировать необходимую 384-пуговую пластину с покрытием PLL (ы) в инкубаторе при 37 градусах Цельсия, чтобы согреть ее перед посевными клетками. Удалите раствор для хранения 1x антибиотик-антимикотизм из 384-хорошо PLL покрытием пластины (ы), щелкнув пластины над раковиной и лентой его на бумажное полотенце, чтобы высохнуть.
7. Аккуратно промыть трансинфицированные клетки раствором Versene (1X PBS, pH 7.4; 0.53 mM EDTA), и отсоедините, добавив 3 мл 0,05% трипсин/0,53 мМ EDTA к блюду. Перенесите содержимое в центрифужную трубку, содержащую по крайней мере равное количество полного DMEM, чтобы нейтрализовать трипсин.
8. Спин вниз клетки на 500 х г в течение 3 мин и повторного действия клеток при плотности 0,4 х 10⁶ клеток / мл в голодающих средств массовой информации. Семенные клетки в 384-хорошо PLL покрытием пластины (ы) при окончательной плотности 25000 клеток / хорошо путем дозирования 45 л клеточной подвески с помощью электронного многоканального пипетки. Верните пластины к 37 градусов по Цельсию в течение как минимум 4 ч, что позволяет клеткам должным образом прикрепляться к колодцам, прежде чем приступить к стимуляции.

7. Вторичный скрининг: Препарат пластины подготовки к 16-точечной (половина журнала) доза кривой

1. В 96-хорошо пластины, добавить 270 л 1X HBSS наркотиков буфера (1x Хэнка сбалансированное решение соли "HBSS", 20 мМ HEPES рН 7,4, 1x антибиотик-антимикот), за исключением последнего ряда (ряд H) пластины, как показано на рисунке 4.
   ПРИМЕЧАНИЕ: Для пептидов, коллоидных молекул, и плохо водорастворимых соединений, добавление 0,1-1% BSA предлагается. Для предотвращения окисления препарата, до 0,01% аскорбиновой кислоты также могут быть добавлены.
2. Из лекарственного запаса подготовьте лекарственный раствор (называемый "высокой" концентрацией) путем расчета окончательной концентрации в 3 раза (окончательная концентрация препарата в клеточной пластине составит 1x). В качестве примера, для кривой дозы-реакции с 10 мкм в качестве самой высокой концентрации, приготовьте "высокую" концентрацию на уровне 30 мкм. Пипетка 300 л "высокой" концентрации в скважинах в ряду H.
3. В другой трубке подготовьте "низкую" концентрацию, которая представляет собой "высокую" концентрацию, разделенную на 3,16 (половина журнала). Исходя из предыдущего примера, концентрация "низкая" составит 9,49 мкм. Труба 300 л "низкой" концентрации в скважинах в ряду H, прилегающих к скважинам "Высокий".
   ПРИМЕЧАНИЕ: Общее количество 96 скважин, необходимых в строке H, будет зависеть от количества клеток и условий стимуляции. Четыре скважины (два "высоких" и два "Низкий") будет иметь достаточное решение наркотиков, чтобы стимулировать весь 384 хорошо пластины.
4. Выполните серийное разбавление путем трубоукладки 30 зл и снадобья раствора от "Высокого" и "Низкого" скважин строки H до предыдущей строки (ряд G) и смешайте вручную пайпеттинг вверх и вниз, или, как рекомендуется, используя электронный многоканальный пипеткс с функцией "Pipette and Mix". Повторите этот шаг до первого и наиболее разбавленного ряда (строка А), отбрасывая советы между разбавлениями.
   ПРИМЕЧАНИЕ: При желании, серийные разбавления могут быть остановлены до строки А, представляющие внутренний контроль без наркотиков, другими словами, "истинный ноль".
5. Используя Рисунок 4 в качестве эталона, стимулируйте трансинфицированные клетки путем прокладки 20 qL "Низкий" колонки разбавления от 96-ну хорошо пластины на ряды A-O ранее семенами 384-хорошо пластины, а также 20 зл "Высокий" столбец разбавления скважин B-P. Инкубировать пластину при 37 градусов по Цельсию для минимума 16 h.

8. Вторичный скрининг: luminescence чтения и анализа данных

1. На 16-24 ч после стимуляции, decant транс-инфицированных клеток, мягко щелкая 384-ну пластины над раковиной и лентой его на бумажное полотенце. Добавьте 20 л/также реагента Glo и инкубировать пластину при комнатной температуре в течение 5-20 мин. Прочитайте пластины с помощью счетчика люминесценции микроплиты, с интеграцией время 1 с/хорошо.
2. Экспорт сохраненных файлов из счетчика люминесценции в виде электронной таблицы; результаты будут зарегистрированы в относительных единицах люминесценции (RLU). Передача данных 384-хорошо пластины в статистическое программное обеспечение для анализа результатов с помощью встроенного xY анализа для нелинейной кривой регрессии подходят. Выберите встроенную функцию стимуляции 3-параметра для дозы-реакции "Log (агонист) против ответа (три параметра)",
   
   ПРИМЕЧАНИЕ: Здесь верхний и нижний являются плато в единицах оси Y, соответственно максимальная реакция и базальный уровень, EC50 является концентрация агониста, который генерирует 50% ответ между верхней и нижней, и X относится к концентрации журнала агониста. Эта модель предполагает, что кривая доза-реакция имеет стандартный наклон холма 1.

Результаты

Используя протокол PRESTO-Tango, представленный в настоящем, экстракт гранулы хромаффина (CG) был проверен против 168 необонворных целей GPCR, при этом большинство из них являются сиротскими рецепторами. Профилирование указанного экстракта было выполнено путем изучения мобилизации на выбранны?...

Обсуждение

Конформно динамические GPCRs являются электростанциями трансдукции сигналов. Физиохимические свойства связывающих карманов этих гептахелевых рецепторов, а также их физиологическая актуальность подчеркивают необходимость инструментов скрининга лиганда GPCR. Как указано выше, престо-Та...

Материалы

Name	Company	Catalog Number	Comments
384 Well Optical Bottom Plates, Polystyrene Polymer Base, Cell Culture Treated, BLACK, with lid, Sterile	NUNC	12-566
384 Well Optical Bottom Plates, Polystyrene Polymer Base, Cell Culture Treated, White, with lid, Sterile	NUNC	12-566-1
384 Well Round Bottom, Polypropylene, Non-Treated, Blue, non-sterile, without lid	ThermoFisher	12-565-390
Antibiotic-Antimycotic	Wisent	450-115-EL
D-Luciferin, sodium salt	GoldBio	LUCNA
DMEM with L-Glutamine, 4.5g/L Glucose and Sodium Pyruvate	Corning	10-013-CV
Eppendorf Xplorer, 12-channel, variable, 15–300 µL	Eppendorf	4861000155
Eppendorf Xplorer, 12-channel, variable, 5–100 µL	Eppendorf	4861000139
Matrix Platemate 2x3	ThermoFisher	801-10001
MicroBeta 1450 Wallac	Perkin Elmer
Penicilin-Streptomycin	Wisent	450-201-EL
Poly-L-Lysine hydrobromide	Millipore-Sigma	P2636-500MG
Roth Lab PRESTO-Tango GPCR Kit	Addgene	Kit #1000000068