Выделение кишечника из личинок данио-рерио для секвенирования одноклеточной РНК

Наше исследование направлено на изучение транскриптомных изменений, происходящих в процессе развития и дисфункции желудочно-кишечного тракта у личинок данио-рерио. Здесь мы предлагаем новый протокол, который позволяет выделять различные типы клеток в кишечнике рыбок данио, что имеет потенциальное применение в понимании здоровья и заболеваний желудочно-кишечного тракта. В последние годы растет интерес к изучению взаимодействия между энтеральной нервной системой и другими типами кишечных клеток во время развития и заболевания.

Понимание этой сложной динамики с использованием передовых методов, таких как секвенирование одноклеточной РНК, может дать важную информацию о кишечных нейромиопатиях, что приведет к более точной диагностике и лечению. Используя этот протокол, мы успешно идентифицировали различные типы кишечных клеток, включая эпителиальные, стромальные, кровяные, мышечные, иммунные клетки и даже энтеральные нейроны и глию, которые ранее не были захвачены в таком количестве с использованием аналогичных подходов. Таким образом, мы предоставляем надежную методику исследования состава желудочно-кишечного тракта в период развития и дисфункции.