Nossa pesquisa visa investigar as alterações transcriptômicas que ocorrem durante o desenvolvimento e disfunção gastrointestinal em larvas de zebrafish. Aqui, fornecemos um novo protocolo que permite o isolamento de diferentes tipos de células dentro do intestino do peixe-zebra, que tem aplicações potenciais na compreensão da saúde e da doença gastrointestinal. Nos últimos anos, tem havido crescente interesse em explorar a interação entre o sistema nervoso entérico e outros tipos de células intestinais durante o desenvolvimento e a doença.
Compreender essas dinâmicas complexas usando técnicas avançadas, como o sequenciamento de RNA de célula única, tem o potencial de revelar insights críticos sobre neuromiopatias entéricas, levando a diagnósticos e tratamentos mais precisos. Usando este protocolo, identificamos com sucesso vários tipos de células intestinais, incluindo epiteliais, estromais, sangue, músculos, células imunes e até neurônios entéricos e glia, que não foram capturados antes nesta quantidade usando abordagens semelhantes. Assim, fornecemos uma técnica confiável para estudar a composição gastrointestinal durante o desenvolvimento e disfunção.