Универсальный конвейер для анализа динамических изменений в ядерных телах в различных типах клеток

Наш основной исследовательский интерес заключается в эпигенетическом механизме, регулирующем эластичность клеток человека и адаптацию к окружающей среде. В настоящее время я сосредоточен на изучении того, как изменяется хроматизация в ядерном конденсате при трех патологических клеточных состояниях. Я считаю, что изучение биофизических свойств хроматизации открывает новую область и открывает уникальные возможности для разработки новых терапевтических подходов.

Иммунофлуоресцентные анализы полезны для скрининга организации белков в ядерных конденсатах. Тем не менее, генетика человека может быть сложной задачей из-за проблем с выбором параметров и большого объема данных при изучении нескольких условий. Мы предлагаем комплексные рекомендации по использованию правильных параметров и автоматизированный конвейер анализа для оптимизации процесса.

Наш протокол направляет пользователя от подготовки образца до анализа. Мы предоставили смоделированный проект трубопровода с помощью Doza с ограниченным опытом в области вычислений и анализа изображений. Рабочий процесс доступен для всех бесплатно и использует широко внедряемое программное обеспечение, такое как Imogene и Python, а также бесплатный облачный сервис Google Colab.