Çeşitli hücre tiplerinde nükleer cisimlerdeki dinamik değişiklikleri analiz etmek için çok yönlü bir boru hattı

Ana araştırma ilgi alanımız, insan hücresel elastikiyetini ve çevresel adaptasyonunu düzenleyen epigenetik bir mekanizmadır. Şu anda bir nükleer kondensat içindeki kromatizasyondaki değişikliklerin üç patolojik hücresel koşul üzerinde nasıl olduğunu incelemeye odaklanıyorum. Kromatizasyonun biyofiziksel özelliklerini incelemenin yeni bir alan açtığına ve yeni terapötik yaklaşımlar geliştirmek için eşsiz fırsatlar sunduğuna inanıyorum.

İmmünofloresan deneyleri, nükleer kondensatlarda protein organizasyonunu taramak için değerlidir. Bununla birlikte, insan genetiği, birden fazla koşulu incelerken parametre seçimi sorunları ve büyük veri hacmi nedeniyle zor olabilir. Süreci kolaylaştırmak için doğru parametrelerin ve otomatik analiz hattının nasıl kullanılacağına dair kapsamlı bir rehberlik sunuyoruz.

Protokolümüz, numune hazırlamadan analize kadar kullanıcıya rehberlik eder. Doza aracılığıyla sınırlı hesaplama ve görüntü analizi uzmanlığı ile simüle edilmiş bir boru hattı tasarımı sağladık. İş akışına herkes ücretsiz olarak erişebilir ve Imogene ve Python gibi yaygın olarak benimsenen yazılımlardan ve ücretsiz bulut tabanlı hizmet Google Colab'dan yararlanır.