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In This Article

  • Summary
  • Abstract
  • Introduction
  • Protocol
  • Representative Results
  • Discussion
  • Acknowledgements
  • Materials
  • References
  • Reprints and Permissions

Summary

在这里,我们提出了一个描述网络药理学和分子对接技术的方案,以探索嘉味盛江散 (JWSJS) 治疗糖尿病肾病的作用机制。

Abstract

我们旨在深入研究 Jiawei Shengjiang San (JWSJS) 治疗糖尿病肾病和部署网络药理学作用的机制。利用网络药理学和分子对接技术,我们预测了 JWSJS 的活性成分和靶点,并构建了一个细致的“药物-成分-靶点”网络。利用基因本体论 (GO) 和京都基因与基因组百科全书 (KEGG) 富集分析来识别 JWSJS 的治疗途径和靶点。部署 Autodock Vina 1.2.0 进行分子对接验证,并进行 100 ns 分子动力学模拟以确认对接结果,然后进行 体内 动物验证。研究结果显示,JWSJS 与糖尿病肾病共享 227 个交叉靶点,构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络拓扑。KEGG 富集分析表明,JWSJS 通过调节脂质和动脉粥样硬化、PI3K-Akt 信号通路、细胞凋亡和 HIF-1 信号通路减轻糖尿病肾病,丝裂原活化蛋白激酶 1 (MAPK1)、MAPK3、表皮生长因子受体 (EGFR) 和丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 1 (AKT1) 被确定为多个通路的集体靶点。分子对接断言 JWSJS 的核心成分 (槲皮素、棕榈油酸和木犀草素) 可以通过氢键稳定与三个关键靶点 (MAPK1、MAPK3 和 EGFR) 的构象。 体内 检查表明,由于 JWSJS,体重显着增加,糖化血清蛋白 (GSP) 、低密度脂蛋白胆固醇 (LDL-C) 、三磷酸尿苷 (UTP) 和空腹血糖 (FBG) 水平降低。电子显微镜结合苏木精和伊红 (HE) 以及高碘酸-希夫 (PAS) 染色突出了每个治疗组在不同程度上减轻肾脏损伤的潜力,表现出 p-EGFR 、 p-MAPK3/1 和 BAX 的不同下降,以及 BCL-2 表达的增加治疗大鼠的肾脏组织。总之,这些见解表明,JWSJS 对糖尿病肾病的保护作用可能与抑制 EGFR/MAPK3/1 信号通路的激活和减轻肾细胞凋亡有关。

Introduction

糖尿病 (DM) 是一种影响多个系统的慢性疾病,可因持续高血糖而引起各种并发症,例如糖尿病肾病 (DN)、视网膜病变和神经病变1。DN 是 DM 的一种严重并发症,约占终末期肾病 (ESRD) 的 30%-50%2。其临床表现为微量白蛋白尿,可进展为 ESRD,其特征是肾小球体积增加、系膜基质增生和肾小球基底膜增厚3。DN 的发病机制很复杂,尚未完全阐明。临床方法如降低血糖、调节血压、减少蛋白尿等多用于延缓其进展,但效果一般。

目前,尚未发现治疗 DN4 的特异性药物。然而,几个世纪以来,中草药已广泛用于治疗 DM 及其并发症5 ,并改善了患者的临床症状并延缓了疾病进展。由于中草药具有多组分、多靶点、多通路效应的优势,有望成为治疗 DN6 的创新药物来源。

“生江散”起源于明代医医龚庭贤的《万兵汇春》。《内浮仙坊》一书描述了 Bombyx BatryticatusCicadae periiostracumCurcumael....

Protocol

所有动物均按照美国国家研究委员会实验动物护理和使用指南第 8进行维护和使用,并按照 ARRIVE 指南中的建议进行报告16,17。该研究是根据中国国家研究委员会《实验动物护理和使用指南》进行的,并获得了河北中医药大学动物伦理委员会 (DWLL2019030) 的批准。

1. JWSJS 活性成分和靶标集合

Representative Results

按照方案,根据 OB 和 DL 的既定标准,经过筛选和重复数据删除,最终从分析中获得 JWSJS 的 90 种活性成分。其中包括 20 种 Hedysarum multijugum Maxim、23 种 Epimrdii Herba、15 种光滑 根瘤病、16 种 大黄根茎、4 种 姜黄根瘤、15 种 蝉 Periostracum 和 6 种 Bombyx Batryticatus 成分。由于 JWSJS 中有许多活性成分,因此仅列出了 20 种(见 表.......

Discussion

我们的研究结合了网络药理学、分子对接和 体内 动物模型。一个关键步骤是建立“药物-成分-靶点”网络,这对于确定 JWSJS 治疗 DN 的潜在机制至关重要,特别关注其与 EGFR/MAPK3/1 信号通路的相互作用。

在这项研究中,我们进行了几次修改,特别是在分子对接过程中,以提高我们预测的准确性。故障排除主要集中在优化 体内 动物模型的.......

Acknowledgements

本研究得到了中国河北省自然科学基金面上项目(第 H2019423037 号)的支持。

....

Materials

NameCompanyCatalog NumberComments
2×SYBR Green qPCR Master Mix Servicebio, Wuhan, ChinaG3320-05
24-h urine protein quantification (UTP)Nanjing Jiancheng Institute of Biological EngineeringN/A
3,3'-DiaminobenzidineShanghai Huzheng Biotech, China91-95-2
Automatic biochemical analysis instrumentHitachi, Japan7170A
Anhydrous EthanolBiosharp, Tianjin, ChinaN/A
BAX Primary antibodies Affinity, USAAF0120Rat
BCL-2 Primary antibodies Affinity, USAAF6139Rat
BX53 microscopeOlympus, JapanBX53
Chloroform SubstituteECOTOP, Guangzhou, ChinaES-8522
Desmond software New York, NY, USARelease 2019-1
Digital Constant Temperature Water BathChangzhou Jintan Liangyou Instrument, ChinaDK-8D
EGFR Primary antibodies Affinity, USAAF6043Rat
Embed-812 RESINShell Chemical, USA14900
Fasting blood glucose (FBG)Nanjing Jiancheng Institute of Biological EngineeringN/A
FC-type full-wavelength enzyme label analyserMultiskan; Thermo, USAN/A
GAPDH  Primary antibodies Affinity, USAAF7021Rat
Glycated serum protein (GSP)Nanjing Jiancheng Institute of Biological EngineeringN/A
Transmission electron microscopeHitachi, JapanH-7650
Haematoxylin/eosin (HE) staining solutionServicebio, USAG1003
Image-Pro PlusMEDIA CYBERNETICS, USAN/A
Real-Time PCR Amplification InstrumentApplied Biosystems, USAiQ5 
Irbesartan tabletsHangzhou Sanofi PharmaceuticalsN/A
IsopropanolBiosharp, Tianjin, ChinaN/A
 JWSJS granulesGuangdong Yifang PharmaceuticalN/A
Kodak Image Station 2000 MM imaging systemKodak, USAIS2000
Low-density cholesterol (LDL-C)Nanjing Jiancheng Institute of Biological EngineeringN/A
MAPK3/1Primary antibodies Affinity, USAAF0155Rat
Medical CentrifugeHunan Xiangyi Laboratory Instrument Development, China TGL-16K
Mini trans-blot transfer systemBio-Rad, USAN/A
Mini-PROTEAN electrophoresis systemBio-Rad, USAN/A
NanoVue Plus SpectrophotometerHealthcare Bio-Sciences AB, Sweden111765
p-EGFR Primary antibodies Affinity, USAAF3044Rat
Periodic acid-Schiff (PAS) staining solutionServicebio, USAG1008
p-MAPK3/1 Primary antibodies Affinity, USAAF1015Rat
Secondary antibodies Santa Cruz, USAsc-2357Rabbit
StreptozotocinSigma, USAS0130
SureScript First-Strand cDNA Synthesis KitGeneCopeia, USAQP056T
TriQuick ReagentSolarbio, Beijing, ChinaR1100
Ultra-Clean WorkbenchSuzhou Purification Equipment, ChinaSW-CJ-1F 

References

  1. Viigimaa, M., Sachinidis, A., Toumpourleka, M., Koutsampasopoulos, K., Alliksoo, S., Titma, T. Macrovascular complications of Type 2 diabetes mellitus. Curr Vasc Pharmacol. 18 (2), 110-116 (2020).
  2. Umanath, K., Lewis, J. B. Update on diabetic ne....

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