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* These authors contributed equally
在这里,我们提出了一个描述网络药理学和分子对接技术的方案,以探索嘉味盛江散 (JWSJS) 治疗糖尿病肾病的作用机制。
我们旨在深入研究 Jiawei Shengjiang San (JWSJS) 治疗糖尿病肾病和部署网络药理学作用的机制。利用网络药理学和分子对接技术,我们预测了 JWSJS 的活性成分和靶点,并构建了一个细致的“药物-成分-靶点”网络。利用基因本体论 (GO) 和京都基因与基因组百科全书 (KEGG) 富集分析来识别 JWSJS 的治疗途径和靶点。部署 Autodock Vina 1.2.0 进行分子对接验证,并进行 100 ns 分子动力学模拟以确认对接结果,然后进行 体内 动物验证。研究结果显示,JWSJS 与糖尿病肾病共享 227 个交叉靶点,构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络拓扑。KEGG 富集分析表明,JWSJS 通过调节脂质和动脉粥样硬化、PI3K-Akt 信号通路、细胞凋亡和 HIF-1 信号通路减轻糖尿病肾病,丝裂原活化蛋白激酶 1 (MAPK1)、MAPK3、表皮生长因子受体 (EGFR) 和丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 1 (AKT1) 被确定为多个通路的集体靶点。分子对接断言 JWSJS 的核心成分 (槲皮素、棕榈油酸和木犀草素) 可以通过氢键稳定与三个关键靶点 (MAPK1、MAPK3 和 EGFR) 的构象。 体内 检查表明,由于 JWSJS,体重显着增加,糖化血清蛋白 (GSP) 、低密度脂蛋白胆固醇 (LDL-C) 、三磷酸尿苷 (UTP) 和空腹血糖 (FBG) 水平降低。电子显微镜结合苏木精和伊红 (HE) 以及高碘酸-希夫 (PAS) 染色突出了每个治疗组在不同程度上减轻肾脏损伤的潜力,表现出 p-EGFR 、 p-MAPK3/1 和 BAX 的不同下降,以及 BCL-2 表达的增加治疗大鼠的肾脏组织。总之,这些见解表明,JWSJS 对糖尿病肾病的保护作用可能与抑制 EGFR/MAPK3/1 信号通路的激活和减轻肾细胞凋亡有关。
糖尿病 (DM) 是一种影响多个系统的慢性疾病,可因持续高血糖而引起各种并发症,例如糖尿病肾病 (DN)、视网膜病变和神经病变1。DN 是 DM 的一种严重并发症,约占终末期肾病 (ESRD) 的 30%-50%2。其临床表现为微量白蛋白尿,可进展为 ESRD,其特征是肾小球体积增加、系膜基质增生和肾小球基底膜增厚3。DN 的发病机制很复杂,尚未完全阐明。临床方法如降低血糖、调节血压、减少蛋白尿等多用于延缓其进展,但效果一般。
目前,尚未发现治疗 DN4 的特异性药物。然而,几个世纪以来,中草药已广泛用于治疗 DM 及其并发症5 ,并改善了患者的临床症状并延缓了疾病进展。由于中草药具有多组分、多靶点、多通路效应的优势,有望成为治疗 DN6 的创新药物来源。
“生江散”起源于明代医医龚庭贤的《万兵汇春》。《内浮仙坊》一书描述了 Bombyx Batryticatus、Cicadae periiostracum、Curcumael....
所有动物均按照美国国家研究委员会实验动物护理和使用指南第 8版进行维护和使用,并按照 ARRIVE 指南中的建议进行报告16,17。该研究是根据中国国家研究委员会《实验动物护理和使用指南》进行的,并获得了河北中医药大学动物伦理委员会 (DWLL2019030) 的批准。
1. JWSJS 活性成分和靶标集合
按照方案,根据 OB 和 DL 的既定标准,经过筛选和重复数据删除,最终从分析中获得 JWSJS 的 90 种活性成分。其中包括 20 种 Hedysarum multijugum Maxim、23 种 Epimrdii Herba、15 种光滑 根瘤病、16 种 大黄根茎、4 种 姜黄根瘤、15 种 蝉 Periostracum 和 6 种 Bombyx Batryticatus 成分。由于 JWSJS 中有许多活性成分,因此仅列出了 20 种(见 表.......
我们的研究结合了网络药理学、分子对接和 体内 动物模型。一个关键步骤是建立“药物-成分-靶点”网络,这对于确定 JWSJS 治疗 DN 的潜在机制至关重要,特别关注其与 EGFR/MAPK3/1 信号通路的相互作用。
在这项研究中,我们进行了几次修改,特别是在分子对接过程中,以提高我们预测的准确性。故障排除主要集中在优化 体内 动物模型的.......
本研究得到了中国河北省自然科学基金面上项目(第 H2019423037 号)的支持。
....Name | Company | Catalog Number | Comments |
2×SYBR Green qPCR Master Mix | Servicebio, Wuhan, China | G3320-05 | |
24-h urine protein quantification (UTP) | Nanjing Jiancheng Institute of Biological Engineering | N/A | |
3,3'-Diaminobenzidine | Shanghai Huzheng Biotech, China | 91-95-2 | |
Automatic biochemical analysis instrument | Hitachi, Japan | 7170A | |
Anhydrous Ethanol | Biosharp, Tianjin, China | N/A | |
BAX Primary antibodies | Affinity, USA | AF0120 | Rat |
BCL-2 Primary antibodies | Affinity, USA | AF6139 | Rat |
BX53 microscope | Olympus, Japan | BX53 | |
Chloroform Substitute | ECOTOP, Guangzhou, China | ES-8522 | |
Desmond software | New York, NY, USA | Release 2019-1 | |
Digital Constant Temperature Water Bath | Changzhou Jintan Liangyou Instrument, China | DK-8D | |
EGFR Primary antibodies | Affinity, USA | AF6043 | Rat |
Embed-812 RESIN | Shell Chemical, USA | 14900 | |
Fasting blood glucose (FBG) | Nanjing Jiancheng Institute of Biological Engineering | N/A | |
FC-type full-wavelength enzyme label analyser | Multiskan; Thermo, USA | N/A | |
GAPDH Primary antibodies | Affinity, USA | AF7021 | Rat |
Glycated serum protein (GSP) | Nanjing Jiancheng Institute of Biological Engineering | N/A | |
Transmission electron microscope | Hitachi, Japan | H-7650 | |
Haematoxylin/eosin (HE) staining solution | Servicebio, USA | G1003 | |
Image-Pro Plus | MEDIA CYBERNETICS, USA | N/A | |
Real-Time PCR Amplification Instrument | Applied Biosystems, USA | iQ5 | |
Irbesartan tablets | Hangzhou Sanofi Pharmaceuticals | N/A | |
Isopropanol | Biosharp, Tianjin, China | N/A | |
JWSJS granules | Guangdong Yifang Pharmaceutical | N/A | |
Kodak Image Station 2000 MM imaging system | Kodak, USA | IS2000 | |
Low-density cholesterol (LDL-C) | Nanjing Jiancheng Institute of Biological Engineering | N/A | |
MAPK3/1Primary antibodies | Affinity, USA | AF0155 | Rat |
Medical Centrifuge | Hunan Xiangyi Laboratory Instrument Development, China | TGL-16K | |
Mini trans-blot transfer system | Bio-Rad, USA | N/A | |
Mini-PROTEAN electrophoresis system | Bio-Rad, USA | N/A | |
NanoVue Plus Spectrophotometer | Healthcare Bio-Sciences AB, Sweden | 111765 | |
p-EGFR Primary antibodies | Affinity, USA | AF3044 | Rat |
Periodic acid-Schiff (PAS) staining solution | Servicebio, USA | G1008 | |
p-MAPK3/1 Primary antibodies | Affinity, USA | AF1015 | Rat |
Secondary antibodies | Santa Cruz, USA | sc-2357 | Rabbit |
Streptozotocin | Sigma, USA | S0130 | |
SureScript First-Strand cDNA Synthesis Kit | GeneCopeia, USA | QP056T | |
TriQuick Reagent | Solarbio, Beijing, China | R1100 | |
Ultra-Clean Workbench | Suzhou Purification Equipment, China | SW-CJ-1F |
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