Doğrusal Invadozom Oluşumu ve Aktivitesi Çalışmak İçin 2D ve 3D Matrisler

Özet

Bu protokol, jelatin ve kollajen I'den oluşan bir 2D karışık matristin nasıl hazırlanacağını ve lineer invadozomaları incelemek için bir 3D kolajen I fünyesinin nasıl hazırlandığını açıklamaktadır. Bu protokoller lineer invadozom oluşumunun, matris bozulma aktivitesinin ve birincil hücrelerin ve kanser hücre çizgilerinin invazyon yeteneklerinin incelenmesine izin verir.

Özet

Hücre yapışması, migrasyonu ve istilası birçok fizyolojik ve patolojik süreçte yer alır. Örneğin, metastaz oluşumu sırasında, tümör hücreleri, kan veya lenfatik damarlara ulaşmak için çevresindeki dokuya istila etmek ve göç etmek için anatomik engelleri aşmak zorundadır. Bu, hücreler ile ekstrasellüler matriks (ECM) arasındaki etkileşimi gerektirir. Hücresel seviyede, kanser hücrelerinin çoğunluğu da dahil olmak üzere pek çok hücre, ECM'yi düşürebilen F-aktin esaslı yapılar olan invadozomlar oluşturabilir. Invadozomlar, matriks metaloproteinazları (MMP'ler) işe alıp aktive eden protrusif aktin yapılardır. ECM'nin moleküler kompozisyonu, yoğunluğu, düzenlenmesi ve sertliği, invadozom oluşumunun ve aktivasyonunun düzenlenmesinde çok önemlidir. İn vitro olarak , bir jelatin testi, invadozom yıkım aktivitesini gözlemek ve ölçmek için kullanılan standart tahlildir. Bununla birlikte, denatüre kolajen I olan jelatin, fizyolojik bir matris değildir eelemanının net. Tip I kollajen fibriller kullanan yeni bir deney geliştirildi ve bu fizyolojik matrisin invadozomların güçlü bir uyarıcısı olduğunu göstermek için kullanıldı. Kollajen fibriller boyunca oluşan invadozomlar, fiberler üzerindeki lineer organizasyonu nedeniyle doğrusal invadozomlar olarak bilinirler. Dahası, lineer invadozomların moleküler analizi, diskoidin alan reseptör 1'in (DDR1) oluşumunda yer alan reseptör olduğunu gösterdi. Bu veriler, hücreler ile ECM arasındaki karmaşık etkileşimleri anlamak için fizyolojik olarak önemli bir matrisin kullanılmasının önemini açıkça göstermektedir.

Giriş

Ekstraselüler matriks (ECM) yeniden şekillenmesi, anjiyogenez ve tümör hücresi invazyonu gibi fizyolojik ve patolojik süreçler sırasında ortaya çıkar. Fizyolojik koşullarda, çoğunlukla hematopoietik soytan gelen birçok hücre türü ECM elementlerini parçalayabilir. Örneğin, makrofajlar dokulara ulaşmak için anatomik engelleri aşabilir ve osteoklastlar kalsiyum homeostazını sağlamak için kemik matriksini parçalayabilir. Daha genel olarak, vücudun tüm matrisleri fiziksel ve kimyasal özelliklerini korumak için yenilenir. Kanser dokularında tümör mikro çevre bileşimi değişir. Örneğin göğüs ve akciğer kanserinde tip I kollajen aşırı eksprese edilir ve tümörün çevresinde birikir. Üstelik bu birikim, metastaz gelişme riski ^{1 , 2} ile ilişkilidir. Kanser metastazı, kanser hücrelerinin ECM'yi bozma ve bitişik dokuları istila etme kabiliyetine bağlıdır.

Hücrelerin invaziv aktivitesi invadosomes olarak bilinen özel aktin bakımından zengin yapılara atfedilir. Bu terim, normal ve kanser hücrelerinde ( örn., Makrofajlar, endotel hücreleri ve MDA-MB-231 meme kanseri hücre hattı gibi kanser hücreleri) bulunan podozomları ve invadopodiyi içerir. In vitro olarak , invadozomlar farklı şekillerde organize edilebilir: noktalar, agregalar veya rozetler ³ . Klasik olarak, invadozomlar, integrinler ve vinculin ⁴ gibi adezyon plak molekülleri ile çevrili İskele proteini Tks5 ve kortaktin gibi birkaç protein ihtiva eden bir F-aktin çekirdeğinden oluşur. Son zamanlarda, Tks5 ve RhoGTPase Cdc42'nin fonksiyonel invadozomlar için minimum bir moleküler imza olarak kullanılabileceği gösterildi ⁵ . Bu yapılar, MT1-MMP ve MMP-2 gibi spesifik metalloproteaz proteinlerinin işe alınması ve aktivasyonu yoluyla ECM'yi bozabilmektedir. Önceki bir çalışmada, tip I kollajen fibrillerin spesifik bir reseptörü olan diskoidin alan reseptörü 1 (DDR1) arasındaki tip I kollajen fibrilleri arasındaki etkileşimin, lineer invadozomlar olarak adlandırılan invadozomların yeni bir sınıfının oluşumuna yol açtığını bildirdik. Doğrusal invadozomlar tip I kollajen fibriller boyunca oluşur ⁷ . Bu yapılar MT1-MMP / MMP2 alımında ve aktivasyonuyla tip I kollajen fibrillerini bozabilmektedir. Dahası, bunların oluşumu Tks5 ve Cdc42 5'e bağlıdır. İn vitro olarak doğrusal invadozomların varlığını ve DDR1'in oluşum ve aktivitelerine ⁸ dahil çeşitli matris elementlerinin kombinasyonundan oluşan farklı stratejileri kullanarak gösterdiklerini göstermiştir: i) flüoresan jelatin kaplı lamelleri, ii) flüoresan tip I kollajen fibril Kaplamalı lamelleri ve iii) 3D tip I kollajen fişleri. Farklı matrislerin kullanımı nedeniyle, çalışmak ve karakterLineer invadozom oluşumu ve parçalanma aktiviteleri 7,8.

Son olarak, invaziv hücrelerin biyolojisini daha iyi anlamak için, 2D ve 3D kültür sistemlerindeki tüm ECM bileşenleri kombinasyonu kullanıldı ve tümör mikro çevre bileşiminin karmaşıklığını taklit etti. Aşağıda, 2D ve 3D kültür sistemlerinde jelatin / tip I kollajene sahip lamelleri kaplama protokolleri bulunmaktadır.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Protokol

NOT: Sabitlemeden önce, tüm basamaklar steril bir laminer akış davlumbazında tamamlanır.

1. 2D matris

NOT: 2B matrisler, invadozom oluşturan hücrelerin yüzdesini ve hücre başına matris bozunum alanını belirlemek için kullanılır.

Şekil 1: Protokol. Jelatin ve kollajen I matrislerini hazırlamak için kullanılan protokolün özeti. Sadece jelatin matrisi veya bir jelatin ve kollajen I karışık matris yapmak mümkündür. Bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen tıklayınız.

1. Jelatin matrisi
   NOT: Floresan jelatin matrisleri, matris bozunumunu nicelemek için kullanılır ve floresan olmayan jelatin, kollajen I liflerinin yapışmasını arttırmak için kullanılır. Floresan jelatinli matPirinç podozom ve invadopodia çalışmaları için de kullanılır (bkz. Şekil 1 ).
   1. Steril bir laminer akış kaputunun altında, çalışma alanına bir parça parafilm (20 cm x 15 cm) yerleştirin ve% 70 etanol ile dezenfekte edin.
   2. Yaklaşık 1 cm aralıklarla bir çizgi halinde, 1 mg / mL jelatin parçacıkları 20 uL'lik damlacıklar; Damlacık organizasyonu için Şekil 1'e bakın.
   3. Otoklavlanmış bir cam lamel (çap 12 mm) ile her 20 mcL jelatin damlacık örtün.
   4. Oda sıcaklığında 20 dakika inkübe edin. Jelatin floresan ise ışığa karşı koruyun.
   5. Her biri, adım 1.1.3'teki lamellerin hattının yaklaşık 1 cm altında bir aralıkla 1x fosfat tamponlu salin (PBS) içerisinde% 0.5 glutaraldehit damlalıkları 40 uL'lik damlacıklar.
      DİKKAT: Glutaraldehit toksik bir sabitleyici maddedir. Eldiven kullanın ve nefes almayın.
   6. Mücevherli forseps kullanarak, her jelatin kaplı lamel bir glutaraldehit damla aktarın.
      NOT: BuParafilm üzerinde küçük bir jelatin damlasının kalması normaldir. Bunu başka bir deney için tekrar kullanmayın.
   7. Oda sıcaklığında 40 dakika inkübe edin. Floresan lamelleri için onları ışıktan koruyun.
   8. 24 yuvalı bir hücre kültürü plakası alın ve steril 1x PBS 500 mcL ile her kuyu doldurun. Lamelleri, jelatin tarafı yukarıya her kuyuya yerleştirin.
   9. Her biri için 5 dakika boyunca iki kez 1x PBS'de yıkayın.
      NOT: Bu adımda, lamelleri deneme için kullanılabilir veya 1 ° C PBS'de 4 ° C'de saklanabilir. Floresansız lamelleri bir hafta boyunca saklanabilir ve floresan lamelleri 48 saat boyunca saklanabilir.
2. Fibriler kollajen tip I matris
   NOT: Fibriler kollajen tip I matrisi, lineer invadozom oluşumunu ve buna bağlı matris bozunumunu incelemek için kullanılır. Florasan kollajen I ve floresan olmayan jelatin lamelleri bir kombinasyonu, invadozom belirteçlerini kollajen liflerle ( örn., F-aktin i) birlikte yerelleştirmek için kullanılırKırmızı kanala, kırmızı kanalı I kolajenine, yeşil kanalda Tks5'e ve nükleer bir leke için Hoechst boyasına). Öte yandan, floresan olmayan jelatin lamelleri ile floresan olmayan bir kolajenin I kombinasyonu lekelenmiş invadozom belirteçlerinin sayısını en üst düzeye çıkarmak için kullanılır ( örn., Kırmızı-kırmızı kanada F-aktin, kırmızı kanada kortaktin, Tks5'de Yeşil kanal ve bir nükleer leke için Hoechst boyası). Son olarak, floresan jelatin lamelleri ile floresan olmayan bir kollajenin bir kombinasyonu, jelatin ile ilişkili bozulmayı ölçmek için kullanılır ( örneğin, kırmızı kanada F-aktin, kırmızı kanada, yeşil kanalda Tks5 ve Hoechst boyası Nükleer bir leke için) (bakınız Şekil 1). Çekirge boyası, çekirdeği leke yapmak için kullanılır ve kullanılan hücre hatlarında düzenli olarak yapılan bir PCR testine ek olarak, mycoplasma kontaminasyonunu kontrol eder.
   1. Floresan kollajen I
      1. 0.02 N asetik asitte sıçan-kuyruk tendonundan çıkarılan ticari kollajen kullanınd. 0.4 mg / mL kollajen I nihai konsantrasyonunda lamel başına 500 μL solüsyon hazırlamak için gerekli kolajen miktarını geri çekin.
      2. Kollajen I solüsyonunun nihai hacmi (nx 500 uL) için hesaplanan 10 ug / mL nihai konsantrasyonda 5-karboksi x rhodamin sukkinimidil esteri ilave edin.
      3. Pipetleme ile yukarı ve aşağı çözümü karıştırın ve ışıktan korunarak oda sıcaklığında 5 dakika inkübe edin.
      4. 1X Dulbecco'nun kalsiyum ve magnezyum içeren Fosfat Tamponlu Tuz (DPBS) ile son hacme kadar seyreltin ve doğrudan kullanın.
   2. Fibrillar collagen I lamelleri
      1. Daha önce 1.1 adımında hazırlanan floresan veya floresan jelatin lamelleri kullanın.
      2. Kalsiyum ve magnezyum içeren 1X DPBS'de 0.4 mg / mL son konsantrasyonda floresan veya floresan olmayan bir kollajen I çözeltisi hazırlayın.
      3. Floresan veya floresan olmayan kollajen I çözeltisi başına 500 μL ekleyin.24 yuvalı bir hücre kültürü plakasındaki lamelleri.
      4. Kollajen I polimerizasyonu için 37 ° C'de 4 saat inkübe edin.
      5. İnkübasyondan sonra, plakayı eğip matrisin zarar görmesini önlemek için kuyunun (doğrudan lamel üzeri) pipetleme yaparak aşırı kolajen I'i alın.
         NOT: Bu matris saklanamaz. Fazla kolajen I çıkardıktan hemen sonra hücreleri tohumladım.

2. Hücre ekimi, kültür zamanı ve fiksasyon

1. Hücre türüne bağlı olarak, hücreleri uygun kültür ortamında hazırlayın ve göz başına 500 uL'lik nihai hacim için hücreler ekleyin.
2. Bir hücre çizgisinin lineer invadozom oluşturabilme ve matrisi bozma kabiliyetini karakterize etmek için lineer invadozom oluşumunun kinetiğini ve bununla ilişkili parçalanma aktivitesini belirlemek için hücreleri plakaları 4 saat, 12 saat ve 24 saat boyunca kollajen I matrisi üzerine yerleştirin.
   NOT: Tablo 1 , hücre hatlarının örneklerini içerirLaboratuarda test edilmiştir.

   Hücre çizgisi	Lamel başına hücre sayısı	Lineer invadozom nicelemesi için matriste temas süresi	Lineer invadozom bozulma aktivitesinin nicelleştirilmesi için matriste temas süresi
   MDA MB 231	40.000	4 saat	12 saat
   Huh7	40.000	12 saat	24 saat
   HEP 3B	40.000	12 saat	24 saat
   SNU 398	40.000	12 saat	24 saat
   NIH 3T3 src	30.000	4 saat	12 saat
   A431	50,000	6 saat	24 saat
   A549	40.000	12 saat	24 saat &# 160;
   ÇİĞ	40.000	12 saat	12 saat
   PAE	40.000	12 saat	12 saat

   Tablo 1: Hücre tohumlama ve kuluçka süresi referans. Bu tablo, lineer invadozomaları incelemek için kullanılan hücre çizgilerinin kapsamlı olmayan bir listesini sunmaktadır. Matriste tohumlanacak hücre sayısını, doğrusal invadozomları gözlemlemek için gerekli süreyi ve ilişkili matris bozulmasını gözlemlemek için gerekli süreyi belirtir. Doğrusal invadozomların ömrü kısadır. Maksimum sayıda hücrede doğrusal invadozomları gözlemleyebilmek için, hücrelerin kısa bir süre için kollajen I matrisi ile temas halinde olması gerekir. Öte yandan, bildirilen jelatin parçalanmasını görselleştirebilmek için, hücrelerin, yukarıda listelenenlerden daha uzun süre, kollajen I matrisi ile temas halinde olması gerekir.
3. Hücre kültür ortamının çıkarılmasından sonra,1X PBS 500 mcL% 4 paraformaldehid 10 dakika lamelleri sabitleyin.
4. 1x PBS ile iki kez yıkayın.
5. Işıktan korunarak 4 ° C'de saklayın.

3. İmmünofloresans

1. Hücreleri, taze hazırlanmış bir solüsyon ile 10 dakika boyunca geçirgen hale getirin 1x PBS içerisinde% 0.2 Triton X-100 ile yıkandı. Bu çözümü tekrar kullanmayın.
2. Lamelleri iki kez 1x PBS ile yıkayın.
3. Tezgah üzerine bir parafilm parçası (20 cm x 15 cm) yerleştirin.
4. Birinci antikoru, Malzeme Tablosunda açıklandığı gibi 1x PBS içinde% 4 sığır serum albümininde (BSA) seyreltin .
5. Herbiri yaklaşık 1 cm aralıklarla birer birer birincil antikor çözeltisinin 50 uL damlacıkları.
6. Her lamel bir damla yerleştirin.
7. Oda sıcaklığında 40 dakika inkübe edin, ışığa karşı koruyun.
8. Kuluçka döneminden sonra, iki kez 1x PBS ile yıkayın.
9. İkincil antikor, phalloidin ve Hoechst boyasını% 1 BSA içinde 1x'de seyreltinPBS.
10. Karışımın 50 uL'lik damlaları, her biri daha önce yapıldığı gibi lamellerin birinci satırının yaklaşık 1 cm altında aralıklarla yerleştirildi.
11. Her lamel bir damla yerleştirin.
12. Oda sıcaklığında 30 dakika inkübe edin, ışığa karşı koruyun.
13. Kuluçkadan sonra, iki kez 1x PBS ile yıkayın.
14. Tuzları çıkarmak için bir kez distile su ile yıkayın.
15. Lamelleri, polimerize edici montaj ortamı olan bir cam slayt üzerine monte edin.
16. Lamelleri gece boyunca oda sıcaklığında kurumaya bırakın, mikroskopi öncesi ışıktan koruyun.

4. Nicelikler

Şekil 2: Doğrusal invadozom nicelemesi. Makro, F-aktin ve Tks5 boyanmasının konform görüntülerini gerektirir (format: 1,024 x 1,024). ( A ) Önce, F-aktin resmini açın ve bir maske yapın. ( B ) Daha sonra açıkTks5 resmi ve eşik. Makroyu uygulayın. ( C ) Analiz edilen sonuçlar iki tabloda görünecektir. Hücre başına doğrusal invadozom sayısı ve hücredeki doğrusal invadozomlar tarafından kullanılan yüzdelik alan gibi diğer bilgiler, Özet tablosunda yer alır. Her doğrusal invadozomun boyutu Sonuçlar tablosunda olacaktır. Bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen tıklayınız.

1. Lineer invadozom oluşturan hücrelerin yüzdesi
   1. Lineer invadozom oluşturan hücreleri sayın, lamel başına yaklaşık 100 hücre (teknik triplit kullan). N = 3 ile n başına en az 300 hücrenin nicelendirilmesi.
   2. Üç bağımsız deneyin ortalaması alınarak doğrusal invadozom oluşturan hücrelerin yüzdesini hesaplayarak, 900 sayılı hücre elde edin.
2. Doğrusal invadozom boyutu ve hücre başına sayısı
   NOT: F-aktin ve Tks5 lekelerinin ardışık görüntülerini almak için konfokal bir mikroskop kullanın. Makro, 1,024 x 1,024 görüntü biçimine uyarlanmıştır.
   1. Ek makro ile ImageJ'yi kullanın.
3. Hücre başına düşüş
   1. Her durum için üç lamel kullanın.
   2. Floresan jelatin ve Hoechst lekeli çekirdek lamelleri başına 30 görüntüleri alın.
   3. ImageJ yazılımını Martin KH ve ark. ⁹ .

5. 3D Kollajen İşgali Testi

Şekil 3: Invasion assay şeması. İstilâsyon tahlil protokolünün özeti. Kollajen I sukkinimidil ester boya ile çapraz bağlanır ve 1 saat boyunca 37 ° C'de polimerleştirilir. Hücreler serum içermeyen besiyerinde kolajen I eklenir. Ek parça orta ağırlıkta% 10 FBS. Kollajen I fişleri, hücre tohumlamasından 1 saat sonra ve hücre ekiminden 3 gün sonra hücrelerin işgal kapasitesini belirlemek için deneye tabi tutulur. Bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen tıklayınız.

1. Collagen I fiş hazırlığı
   1. Hücre türüne göre jel içine işgali kinetiğini belirlemek için ilk deney için 4 saat, 12 saat, 24 saat, 48 saat ve 72 saatlik bir zaman rotası yapın. Her deney için, bir istila olmadığında bir referans zaman noktası olarak 1 saat zaman noktası ekleyin.
   2. Kollajen I solüsyonunu steril bir laminar akış kaputunun altına hazırlayın. 3 Boyden oda ekleri için 500 μL solüsyon hazırlayın.
   3. 2 mg / mL kollajen I'in son konsantrasyonu ile bir çözelti hazırlamak için 1 mg ticari rat-kuyruk kollajeni I aspire edin.
   4. 5-karboksi x Rhodamine suksinimidil esteri,Kollajen I çözeltisinin nihai hacmi için hesaplanan nihai konsantrasyon 1 μg / mL (bu durumda, 500 uL).
   5. Iyi bir şekilde karıştırın ve ışığa karşı korunmuş steril laminer akış kaputunun altında buz üzerinde 5 dakika inkübe edin.
   6. Buzla soğutulmuş 50 μL, süzülmüş 10X PBS ve buz soğukluğunda 1 M sodyum hidroksit (NaOH) 6.25 μL ekleyin.
   7. 443.75 - x mcL kollajen I formülüne göre steril su ekleyin.
   8. Boyden oda girişi başına 100 μL çözelti ekleyin.
   9. Polimerizasyona izin vermek için 1 saat süreyle 37 ° C'de inkübe edin.
   10. Yeni kuyucuklara fetüs sığır serumu (FBS) ile zenginleştirilmiş hücre kültürü ortamı ekleyin; Ek yerleri bu kuyulara yerleştirin.
   11. FBS içermeyen ortamda kolajen I'in üzerine 30.000 hücre tohum ekti.
   12. Hücreleri 37 ° C'de kültürledikten sonra, kollajen I fişi, 1x PBS içerisinde% 4 paraformaldehit içinde 30 dakika sabitleyin.
   13. Aşama 3'de olduğu gibi komple immünofloresans, aşağıdaki adımlar haricinde: permeabiliZe 10 dakika değil 30 dakika için 1x PBS içerisinde% 0.2 Triton X-100 ile; Primer ve sekonder antikor çözeltileriyle sırasıyla 40 dakika ve 30 dakika yerine 1.5 saat inkübe edin. F-aktin veya hücreleri lokalize etmek için çekirdekler lekeli.
   14. İmmün floresans sonrasında, eklentinin membranını kesmek için bir neşter kullanın ve kollajen I fişini bir cam altı tabağa aktarın. Kolajen I fişinin üst kısmının camla temas ettiğinden emin olun. Tapanın bütünlüğünü korumak için insert membranı kolajen I tıpasının altına tutun.
       NOT: Cam tabağında kolajen I fişi kalır. Cam tabanı ve cam tabanı çevreleyen plastik arasındaki derinlik, tapanın kalınlığına eşdeğerdir.
   15. Takılan kollajene lamel yerleştirin ve tıpanın kurumasını önlemek için polimerize edici montaj ortamı ile monte edin.
   16. Taktığım kolajeni imgelemek için ters konfokal mikroskop kullanın; Üst kısmıTıpa tabağın cam altıyla temas halindedir.
       1. Hücrenin istilasını görselleştirmek için üstten alttan kollajen I fişine bir z-yığıtı bulun. Hücrelerin görüntüleme alanını ne kadar derine işgal ettiğini inceleyerek z-yığınının kalınlığını belirleyin. Z-adım boyutu 0.25 μm olan 512 x 512 formatında 40X yağ hedefi ile satın almalar yapın.
          NOT: Referans için, tohumlamadan 3 gün sonra MDA-MB-231 hücreleri için ortalama z-yığını 30 μm'dir.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Sonuçlar

İki tip matris, jelatin ve tip I kollajen kombinasyonunu kullanarak ( Şekil 1 ve 4 ) doğrusal invadozomlar olarak bilinen yeni bir invadozom türüne dikkat çektik. Bu matrislerin etiketlenmesi, kollajen I lifleri boyunca doğrusal invadozom oluşumunun gözlemlenmesine ve bozunma kabiliyetlerine izin verir ( Şekil 5 ). Daha sonra invazif yapıların sayısı, daha önce açıklanan makro (adım 4.2) ile nicelleştirilebilir ve degr...

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Tartışmalar

Klasik olarak, invadozomlar, mikro ortam ve hücrelerin kaplandığı matrise bakılmaksızın in vitro olarak incelenir. Şu anda, jelatin, fibronektin, vitronektin veya yüksek yoğunluklu fibriler kollajen (HDFC) ^{7 , 11 dahil} çeşitli matris türleri kullanılmaktadır; Bununla birlikte, bunlar genellikle hücrelerin bulunduğu mikro çevreyi temsil etmez ve fizyolojik olarak uygun değildir. Burada, jelatin ile fibriler tip I kollajen arasındaki i...

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Malzemeler

Name	Company	Catalog Number	Comments
Gelatin solution	Sigma	G1393	Stock 20 mg/ml used at 1 mg/ml
Gelatin from pig skin Oregon green 488 conjugate	Molecular probe life technologies	G13186	5mg dilute at 1 mg/ml in sterile water
Microscope cover glasses	Marlenfeld GmbH & Co	111520	Ø12mm No.1
2.5% Glutaraldehyd in 0.1M sodium cacodylate buffer pH 7.4	Electron microscopy science	15960	Dilute at 0.5 % in sterile water
1x PBS pH 7.4	Gibco by life technologies	10010-015	Use this PBS in all steps before fixation
Collagen I Rat tail	Corning	354236
5 carboxy X rhodamin siccinimidyl ester	Life technologies	C-6125
DPBS 1x + calcium + magnesium	Gibco by life technologies	14040-091
Paraformaldehyde 16% solution	Electron microscopy science	15710	Dilute at 4% in 1X PBS
Triton X 100	Sigma	T9284
10x PBS buffer pH 7.4	Ambion	AM9625	Dilute at 1X in water Use in steps after fixation
Tks5 antibody	Santa Cruz	sc-30122	Invadosome markers Dilution : 1/100
Cortactin 4F11 antibody	Millipore	5180	Invadosome markers Dilution :1/100
DDR1 antibody	Cell signaling	5583	Linear invadosome receptor
Dilution :1/100
Phalloidin FluoProbes	Interchim	FT-AZ0330	Fibrillary actin marker Dilution :1/200
Hoechst	Sigma	33258	Nucleus marker Dilution :1/200
Secondary antibodies FluoProbes	Interchim	FP-488 FP-547H or FP-647H
Albumin from bovine serum	Sigma	A2153	Dilute at 4% in 1X PBS
Fluoromount G mounting medium	Interchim	FP 483331
ImageJ software	Public domain		http://www.macbiophotonics.ca/imagej/
Cell culture insert	Corning	353097	8.0µm pore size / 24 wells
Sodium hydroxide (NaOH)	Sigma	221465