Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliği gereklidir. Oturum açın veya ücretsiz deneme sürümünü başlatın.
Method Article
Burada, gerçek in situ ortam sıcaklığı ve ışık koşulları altında mikrobiyal paspasların birincil verimliliğini ölçmek için uygun maliyetli ve taşınabilir bir yöntem / tesis sunulmaktadır. Deney düzeneği, yaygın olarak bulunan malzemelere dayanmaktadır ve laboratuvar tabanlı modellerin avantajlarını sunarken çeşitli koşullar altında kullanılabilir.
Büyüme mevsimi gradyanı sırasında perifitonun in situ birincil verimliliğinin ölçülmesi, çevresel faktörlerin (esas olarak fosfor konsantrasyonu ve ışık yoğunluğu) ve tür kompozisyonunun birincil verimlilik üzerindeki nicel etkisini açıklığa kavuşturabilir. Birincil üretkenlik esas olarak ışık yoğunluğu, sıcaklık, besin maddelerinin mevcudiyeti ve karbonat sisteminin iyonik türlerinin öfotik bölgenin ilgili derinliklerindeki dağılımından kaynaklanmaktadır. Laboratuvarda simüle edilmesi çok zor olan karmaşık bir sistemdir. Bu ucuz, taşınabilir ve yapımı kolay yüzer mavna, birincil üretkenliğin gerçek doğal koşullar altında doğrudan doğru bir şekilde ölçülmesini sağlar. Metodoloji, sıkıca kapatılmış cam kavanozlara entegre edilmiş invaziv olmayan oksijen sensörlerini kullanarak birincil üretkenliği gerçek zamanlı olarak ölçmeye dayanır, böylece çevrimiçi oksijen akısı izlemeyi mümkün kılar ve metabolik faaliyetler hakkında yeni bilgiler sağlar. Mikrobiyal paspasların (veya diğer bentik organizmaların) brüt birincil verimliliğinin ayrıntılı mevsimsel in situ ölçümleri, merceksi sularda birincil verimlilik dinamiklerini kontrol eden süreçler hakkındaki mevcut bilgileri artırabilir.
Birincil verimlilik, otokton karbonun tüm sistem gıda ağını oluşturan su sistemlerine tek girişidir1. Bu nedenle, birincil verimliliğin doğru bir şekilde tahmin edilmesi, sucul ekosistemlerin işleyişini anlamaya yönelik önemli bir adımdır. Littoral bölgeler, yüksek birincil verimlilik ve biyolojik çeşitlilik alanlarıdır. Fitoplanktona ek olarak, perifitonun (bundan böyle mikrobiyal paspaslar olarak anılacaktır) ve makroalglerin, kıyı bölgelerinde birincil üretkenliğe önemli ölçüde katkıda bulunduğu varsayılmaktadır2. Sapsız yaşam tarzları ve önemli mekansal heterojenlikleri nedeniyle, birincil üretkenliğin nicelleştirilmesi önemsiz değildir.
Birincil üretkenlik esas olarak ışık yoğunluğu, sıcaklık, besin maddelerinin mevcudiyeti ve karbonat sisteminin iyonik türlerinin öfotik bölgelerin ilgili derinliklerinde dağılımı tarafından yönlendirilir 3,4. Derinlik, mikrobiyal paspasların mekansal dağılımını belirgin şekilde etkiler. Mikrobiyal topluluklar, yüksek ışınlamanın olumsuz etkileri ve sığ derinliklerde belirgin mevsimsel sıcaklık değişimleri ve daha büyük derinliklerde daha düşük ışık yoğunluğu ile başa çıkmalıdır. Derinlik gradyanına ek olarak, dinamik trofik etkileşimler farklı ölçeklerde çoklu ve karmaşık uzamsal desenler üretir5. Bu karmaşık sistemin laboratuvarda simüle edilmesi karmaşıktır. Bireysel birincil üreticilerin metabolik aktivitesini littoral bölgelerden çıkarmanın en doğru yolu, yerinde deneyler yapmaktır.
Bu yazıda tanıtılan metodoloji, geleneksel oda yöntemi 2,6,7'ye, taşınabilir ve yapımı kolay düşük maliyetli yüzer bir mavna ile birlikte dayanmaktadır. Bu, doğal ışık spektrumu, sıcaklık ve karbonat sisteminin iyonik türlerinin derinlik ile farklı dağılımı altında farklı derinliklerde birincil verimliliğin ölçülmesini sağlar. Yöntem, ilk olarak fitoplankton fotosentezini ölçmek için kullanılan ve hala yaygın olarak kullanılan 6,7 olan açık ve koyu şişe oksijeniilkesine dayanmaktadır. Işıkta tutulan şişelerdeki oksijen değişim oranını (birincil üretkenlik ve solunumun etkilerini içerir) karanlıkta tutulanlarla (yalnızca solunum)8 karşılaştırır. Yöntem, birincil üretkenlik için bir vekil olarak oksijen evrimini (fotosentez) kullanır. Ölçülen değişkenler net ekosistem üretkenliği (NEP, ışık koşullarında zaman içinde O2 konsantrasyonunda bir değişiklik olarak) ve ekosistem solunumudur (RE, karanlıkta zaman içindeO2 konsantrasyonunda bir değişiklik olarak). Brüt ekosistem verimliliği (GEP), ikisi arasındaki farkın hesaplanmasıdır (Tablo 1). Burada "ekosistem" terimi, perifitonun ototrofik ve heterotrofik organizmalardan oluştuğunu belirtmek için kullanılır. Bu geleneksel oda yönteminin en önemli gelişimi, invaziv olmayan oksijen optik sensörlerinin kullanılması ve perifitik birincil üretkenliğin ölçülmesi için bu öncelikle planktonik yöntemin optimizasyonudur.
Bu teknik, Çek Cumhuriyeti-Milada, Most ve Medar'da yeni ortaya çıkan madencilik sonrası göllerin kıyı bölgesindeki mikrobiyal paspasların ölçülmesi örneğinde açıklanmaktadır. Mikrobiyal paspasların metabolik aktivitesi, incelenen toplulukların doğal olarak meydana geldiği belirli derinliklerde doğrudan gerçekleştirilenO2 akılarının doğrudan yerinde ölçümü kullanılarak belirlenir. Heterotrofik ve fototrofik aktivite, invaziv olmayan optik oksijen sensörleri ile donatılmış kapalı cam şişelerde ölçülür. Bu sensörler, ışığa duyarlı boyaların floresansını kullanarak kısmi oksijen basıncını algılar. Mikrobiyal paspaslı şişeler askıya alınır ve uygun derinliklerde yüzen bir cihazda inkübe edilir. Şişelerin içindeki oksijen konsantrasyonu, küçük tekneden gün ışığı periyodu boyunca sürekli olarak ölçüldü.
Bozulmamış mikrobiyal paspas örnekleri toplanır ve tüplü dalgıçlar tarafından belirlenen derinliklerde gaz geçirmez inkübasyon şişelerine yerleştirilir. Her şişe, zaman içindeO2 üretkenliğini / tüketimini izleyen invaziv olmayan bir optik oksijen mikrosensörü ile donatılmıştır. Tüm ölçümler, her derinlikte beş kopya karanlık / ışık çifti halinde yapılır. Sıcaklık ve fotosentetik olarak aktif radyasyon (PHAR) yoğunlukları, inkübasyon boyunca ilgili derinliklerde ölçülür. 6 saatlik in situ inkübasyondan sonra (gündüz saatleri), mikrobiyal paspaslar şişelerden toplanır ve kurutulur. O2 akıları mikrobiyal biyokütleye normalleştirilir. Bir kontrol olarak, mikrobiyal mat biyokütlesi olmadan göl suyu içeren ayrı açık ve koyu gaz geçirmez şişelerde (boş kontroller) O2 konsantrasyonundaki değişiklikler için akışlar düzeltilir. Aşağıda, yüzen mavnayı inşa etmek ve tüm deneyi adım adım gerçekleştirmek için ayrıntılı talimatlar verilmiştir. Bu makale aynı zamanda iki derinlikte (1 m ve 2 m) mikrobiyal paspasların ölçümlerinden elde edilen temsili sonuçları ve her derinlikte beş kopya sunmaktadır. Gerçek sıcaklık ve ışık yoğunluğu, dataloggerlar kullanılarak tüm deney boyunca ölçüldü.
NOT: Örneklemeden önce, genel proje gereksinimlerine, istatistiksel tasarıma veya beklenen örnek değişkenlik miktarına göre çoğaltmaların derecesini belirleyin. Hassas istatistiksel analiz için ve potansiyel numune kaybını veya kırılmasını hesaba katmak için beş adet açık ve koyu renkli inkübasyon şişesi çifti önerilmektedir. Tarif edilen yüzen deneysel mavna, beş kopya artı bir çift boş kontrol taşımak üzere tasarlanmıştır; deneysel mavnanın teknik çizimi için Şekil 1'e bakınız.
Resim 1: Deneysel mavna ve yan şamandıranın teknik çizimleri. (A) Üstten görünüm: Mavnanın çerçevesi, dört Alüminyum düz çubukla (gri) birleştirilen dört Alüminyum açılı L profil parçasından (mavi) oluşur. XPS şamandıraları (pembe), her biri paralel alüminyum parçalar üzerinde olmak üzere çerçeveye iki noktada monte edilir. Kuluçka şişeleri için zincirler, aralarında 550 mm mesafe bulunan önceden delinmiş deliklerde (kırmızı oklar) çıtçıtlı kancalar kullanılarak her iki taraftaki çerçeveye tutturulur. Zincirlere, kuluçka şişesi bağlantısı için 1 m ve 2 m mesafelerde çıtçıtlı kancalar sağlandı (deneysel derinliğe göre çıtçıtlı kancaların konumunu seçin). Beton ankraj, mavnanın pruvasına sabitlenir, burada 25 mm'lik bir çıkıntı, çapanın zinciri ve araştırma kabı için bir bağlantı noktası olarak hizmet etmek üzere önceden delinmiş iki deliğin (sarı ok uçları) kullanılmasına izin verir. Çerçeve, dört alüminyum açılı parça (yeşil ok uçları) arasındaki paralel bağlantılar aracılığıyla kolayca monte edilir veya sökülür. (B) Yan görünüm, asılı kuluçka şişeleri ve beton ankrajlı (kahverengi kare) asılı zincirleri gösterir. (C) Yan XPS şamandırası: Paralel alüminyum açılı L parçaları (mavi) dikey alüminyum düz çubuklarla (gri) birleştirilir. Enine çubuk bölümünün altında, XPS şamandıra (pembe), gerekli delik boyutları belirtilmiş (4 mm) olacak şekilde monte edilir. Asılı zincirler, 8 mm'lik deliklerde (kırmızı ok ucu) çıtçıtlı kancalarla tutturulmuştur. Mavnanın yayında, biri çapayı mavnaya (sarı ok ucu) sabitlemek için ve diğeri araştırma gemisini mavnaya (mavi) demirlemek için çıkıntılı alüminyuma iki adet 8 mm'lik delik açılır. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
1. Deneysel mavnanın yapımı
NOT: Yüzer mavna, birbirine monte edilmiş iki eşit bölümden oluşur ve kolay montaj/sökme sağlar. Kullanılan tüm parçalar herhangi bir hobi pazarından veya yapı malzemeleri satan mağazadan satın alınabilir.
Resim 2: Birleştirilmiş deneysel mavna. Toplanan deneysel mavnanın fotoğrafı. Kırmızı ok uçları, zincirlerin kuluçka şişeleriyle tutturulması için delikleri gösterir. Yeşil ok uçları, şamandıranın iki yarısının bir araya getirildiği yeri işaret eder. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Resim 3: Kuluçka şişeleri. 1 m derinlikte asılı iki çift karanlık ve hafif kuluçka şişesinin fotoğrafı. Bir çift şişe, taş üzerinde hala büyüyen bozulmamış mikrobiyal paspasların örneğini içerir (kırmızı ok ucu). İkincisi, ilgili derinlikten göl suyu içeren boş şişedir. Sarı bir ok ucu, kuluçka şişesinin iç duvarına tutturulmuş oksijen sensörü noktasına işaret eder. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
2. Sahada kurulum
3. Kuluçka şişesi hazırlama
4. Numune toplama ve işleme
NOT: Dalgıçlar, numunelerin manuel olarak toplanmasını daha derin sularda gerçekleştirir. Sığ sularda, şnorkelle yüzerek veya bisiklete binerek yapılabilir.
5. Birincil üretkenliğin ölçülmesi
NOT: Teknede oturan kişi kutuyu dalgıçtan alır ve aşağıdaki adımları uygular.
Şekil 4: Alandaki deney düzeneğinin şeması. Göl yüzeyindeki demirli deneysel mavnanın illüstrasyonu. Mikrobiyal mat biyokütleli kuluçka şişeleri (0,5 L) iki farklı derinliğe (1 m ve 2 m) asılır. Dalgıçlar, mikrobiyal paspas örneklerini doğrudan inkübasyon şişelerine uygun derinliklerde topladılar. Tek tek şişelerdeki oksijen konsantrasyonu gemiden ölçülür. Şişeler sudan çıkarılır. Oksijen konsantrasyon değeri, oksijen sensörüne optik bir kablo takılarak birkaç saniye içinde ölçülür. Şişeler daha sonra dikkatlice suya indirilir. İki çift inkübasyon şişesini iki derinlikten ölçme prosedürünün tamamı ~ 2 dakika sürer. Bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
6. Numune analizleri
7. Veri analizleri
Şekil 5: Gün ışığında mikrobiyal paspasların net ve brüt ekosistem verimliliği. (A) Işık şişesi-net ekosistem verimliliği: Işık şişelerinden mikrobiyal paspasların net oksijen verimliliğinin zaman çizelgesi verileri. Kuluçka şişelerindeki oksijen konsantrasyonu değişimi, gün ışığında 1 saat sonra ölçüldü. Gri dai...
Bu makalede açıklanan metodoloji, optik oksijen sensörleri kullanılarakO2 konsantrasyonunu ölçmenin noninvaziv tekniği ile birlikte açık ve koyu şişe oksijen tekniğinin prensibine dayanmaktadır. Bu sistem,O2'yi ölçmek için optik fiber şişeden şişeye hızlı bir şekilde taşınabildiğinden, farklı inkübasyon ayarlarının paralel olarak ölçülmesini sağlar. Çeşitli derinliklerden gelen bentik topluluklar taksonomik kompozisyon ve üretkenlikte farklılık gösterebilir; a...
Yazarlar, açıklayacak çıkar çatışmaları olmadığını doğrulamaktadır.
Bu çalışma, Çek Bilim Vakfı (GACR 19-05791S), RVO 67985939 ve CAS tarafından Strateji AV 21, Arazi tasarrufu ve kurtarma programı kapsamında desteklenmiştir. Ondřej Sihelský'ye sahada çekim yaptığı için çok teşekkürler - o olmasaydı, çekimler tam bir cehennem olurdu. Proje, incelenen bölgelere erişim sağlayan Palivový Kombinát Ústí s.p. ve Sokolovská Uhelná şirketleriyle sıkı işbirliği olmadan mümkün olmazdı.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Aluminum angle L profile 40 x 40 mm x 3 mm, length 2,000 mm | |||
Aluminum flat bar 40 x 3 x 350 mm | |||
Bucket 15 L with concrete infill | |||
Carabine hook with screw lock 50 x 5 mm | |||
electric tape black | |||
Extruded polystyrene (XPS) material 500 x 200 x 150 mm | |||
Fibox 3 LCD trace | PreSens Precision Sensing GmbH | stand-alone fiber optic oxygen meter | |
Hondex PS-7 Portable Depth Sounder | Hondex - Honda Electronics | to measures distances through water - to bottom depth measurement; https://www.honda-el.net/industry/ps-7e | |
KORKEN - glass tight-seal jar 0.5 L | IKEA | incubation bottles; https://www.ikea.com/cz/en/p/korken-jar-with-lid-clear-glass-70213545/ | |
metal hook | |||
Oxygen Sensor Spot SP-PSt3-NAU-D5 | PreSens Precision Sensing GmbH | non-invasive optical oxygen sensor for measurements under Real Conditions | |
SCOUT infantable canoe | GUMOTEX | https://www.gumotexboats.com/en/scout-standard#0000-044667-021-13/11C | |
Screw 10 x 170 mm with hexagonal nuts | |||
Screw 4 x 15 mm with hexagonal nuts | |||
Screw 4 x 15 mm with wing nuts | |||
Snap hooks 50 x 5 mm | |||
Steel Carabine hook 50 x 5 mm | |||
Steel chain with wire diameter 3 mm, inside link 5.5 x 26 mm | |||
Steel chain, 5 m | |||
toothbrush | |||
tweezer | |||
Washer 10 x 50 mm | |||
Washer 4 x 10 mm | |||
Washer 4 x 10 mm |
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiThis article has been published
Video Coming Soon
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır