Bu çalışma, R01 DC013339, R03 DC011373 ve Ruth L. Kirschstein Ulusal Araştırma Hizmet Ödülü T32 DC000014 tarafından desteklenmiştir. Işin bir kısmı NIH-NIDCD Çekirdek Grant P30 DC011735 fon tarafından, kısmen desteklenen Monell kimyasal duyusal Reseptör Sinyalizasyon Çekirdek kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Yazarlar veri toplama ile yardım için C. Sezille teşekkür ederim.

Hana3A Hücreler 1. Culture <ol><li> % 10 (v / v) FBS ile en az temel ortam (MEM) ile takviye M10 ortamı hazırlayın. </li><li> Kültür Muhafazası <ol><li> M10 ortam içinde hücreler koruyun. Not: RTP1L, RTP2, REEP1 ve G için ifade vektörleri Hana3A hücrelere puromisin direnç kazandıran αolf, ancak bu antibiyotik ile hücrelerin bakımı anlamlı deney sonuçlarını etkilemez. </li><li> 01:08 10 cm tabaklar, 2-3 gün arasında bir oranda alt kültürü. </li><li> % 5 CO2 ile 37 ° C&#39;de inkübe edilir. </li></ol></li></ol> Transfeksiyonu 2. Kaplama Hücreler <ol><li> Hana3A hücrelerin% 100 konfluent 10 cm çanak medya aspire. </li><li> , 10 ml PBS ekleyerek çanak dönen ve PBS aspire hücreleri yıkayın. </li><li> % 0.05 tripsin / EDTA, 3 ml ilave edilir ve hücreler (yaklaşık 1 dakika) ayırmak için bekleyin. </li><li> 5 ml M10 ekleyerek tripsin inaktive ve kabaca 10x &amp; tritüe hücre kümeleri break up# 160, bir 10 ml pipet ile. Pipet dikkatle medya içine hava kabarcıkları tanıtan önlemek için. </li><li> Her 96 oyuklu plaka, 15 ml konik tüp, 5 dakika boyunca 200 x g&#39;de santrifüje aktarım hücrelerin 1 ml ve hücre pelletini bozmadan süpernatan aspire için. </li><li> Aşama 2.5 transfer hücre 1 ml başına 6 ml M10 hücreleri yeniden süspanse edin. </li><li> Pipet, 96 oyuklu plakanın her oyuğuna hücre 50 ul ve% 5 CO2 ile 37 ° C&#39;de gece boyunca inkübe edilir. </li></ol> Koku reseptörleri 3. Transfeksiyonu <ol><li> Plasmid DNA&#39;nın hazırlanması <ol><li> Bir endotoksin içermeyen protokolü ile plazmid DNA hazırlanması. NOT: plasmid DNA hazırlama kiti belirlenen &quot;endotoksin içermez,&quot; ya da plasmid DNA hazırlanması için bir protokol, bir fenol-kloroform ekstraksiyon aşamasını ekleyin. </li><li> TE tamponu içinde 100 ng / ul &#39;lik bir konsantrasyona DNA seyreltin. </li></ol></li><li> Approxima uygun bir akışkanlığa sağlamak için kaplama hücreleri (Basamak 2.7) dikkattely 30-50 kuyu başına% ve inkübatör dönmek. NOT: Bu confluency lipit transfeksiyon tepkin maddesi için uygun değildir, bu aşamada% 30-50 bir confluency transfeksiyonundan sonra lusiferaz aktivitesi, 24 saat ölçmek için en uygunudur. </li><li> Transfection Mix hazırlanması <ol><li> Plasmid karışım yapmak için Tablo 1 &#39;de ayrıntılı olarak açıklanan miktarlar başına MEM ortam içine Pipet RTP1S-pCI, M3-R-pCI, pcre-luc ve pSV40-RL plasmidleri (belirtilen miktarlar 96-çukurlu plaka başına) bulunuyor. <table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:356px;"><tbody><tr height="22"><td colspan="3" height="22" style="height:22px;width:356px;"> Plazmid mix </td></tr><tr height="21"><td height="21" style="height:21px;"></td><td> oyuk başına </td><td> 96 oyuklu bir plaka başına </td></tr><tr height="21"><td height="21" style="height:21px;"> MEM </td><td> - </td><td> 500 ul </td></tr><trheight = &quot;21&quot;&gt; <td height="21" style="height:21px;"> RTP1S-pCI </td><td> 5 ng </td><td> 480 ng </td></tr><tr height="21"><td height="21" style="height:21px;"> M3-R-pCI </td><td> 2.5 ng </td><td> 240 ng </td></tr><tr height="21"><td height="21" style="height:21px;"> PCRE-luc </td><td> 10 ng </td><td> 960 ng </td></tr><tr height="22"><td height="22" style="height:22px;"> pSV40-RL </td><td> 5 ng </td><td> 480 ng </td></tr></tbody></table> Tablo 1. Plazmid karışım bileşenleri. Başına iyi ve RTP1S-pCI, M3-R-pCI, pcre-Luc ve pSV40-RL, ve MEM 96-plaka hacimleri başına. </li><li> Her 96 oyuklu plaka için, 450 ul MEM ortamı içinde 18 ul lipid transfeksiyon ayıracı seyreltin. </li><li> Pipet Plazmid karışımı (Adım 3.3.1 &#39;dan itibaren), pCI plazmid (Rho-OR-pCI) in rodopsin-etiketli koku reseptörü, ve Kompleks detaylı yapmak için (Adım 3.3.2&#39; dan itibaren) lipit transfeksiyon mix <strong&gt; Tablo 2. toz haline getirilerek çözüm karıştırın ve 15 dakika boyunca oda sıcaklığında inkübe edin. Tablo 2&#39;ye göre M10 ilave ederek reaksiyonu durdurun Not:., Bu reaksiyon süresi, duyarlıdır ve en fazla 30 dakika devam etmesine izin verilmemelidir. Iyi +% 10 hesaplama daha sonraki aşamalar için yeterli hacmi sağlamak için önemlidir. <table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0"><tbody><tr height="21"><td colspan="3" height="21" style="height:21px;width:472px;"> Karmaşık </td></tr><tr height="21"><td height="21" style="height:21px;"></td><td> oyuk başına </td><td> de +% 10 başına </td></tr><tr height="21"><td height="21" style="height:21px;"> Plazmid mix </td><td> 4.2 ul </td><td> 4.58 ul </td></tr><tr height="21"><td height="21" style="height:21px;"> Rho-OR-pCI </td><td> 0.05 ng </td><td> 0.06 ng </td></tr><trheight = &quot;21&quot;&gt; <td height="21" style="height:21px;"> Lipid transfeksiyon karışımı </td><td> 4.2 ul </td><td> 4.58 ul </td></tr><tr height="22"><td height="22" style="height:22px;"> M10 </td><td> 41.7 ul </td><td> 45.83 ul </td></tr></tbody></table> Tablo 2. Complex bileşenler. Başına iyi ve plasmid karışımı (Tablo 1) de +% 10 hacim başına koku reseptör plazmid (Rho-OR-pCI) ve lipit transfeksiyon karışımı. M10, oda sıcaklığında 15 dakika inkübe edildikten sonra, reaksiyonu söndürmek için ilave edildi. </li></ol></li></ol><ol start="4"><li> Hücre plakaları üzerinde medyayı dışarı dokunun. </li><li> Pipet 50 de her bir kompleksin ul ve% 5 CO2 ile 37 ° C&#39;de gece boyunca inkübe edilir. </li></ol> 4. Koku Uyarım <ol><li> Oyuk başına% 50-80 uygun bir akışkanlığa sağlamak ve kuluçka makinesine geri dönmek için transfekte edilmiş hücrelerin dikkate alınmalıdır. Not: hücreler 50&#39;den az ise% Konfluent, ateşböceği lusiferaz ve Renilla lusiferaz okuma reseptör aktivasyonunun ölçülmesi için çok düşük olabilir. Plakayı çıkardığını düşünün. </li><li> DMSO her koku 1 M stok çözümleri hazırlayın. </li><li> CD293 ortam içinde koku uyarım çözelti hazırlayın. <ol><li> Tarama deneyleri, 100 uM koku stok solüsyonu seyreltik. Ayrıca, (sadece CD293) VEYA plan aktivasyonu için kontrol etmek için bir no-koku kontrolü hazırlamak. NOT: eleme deneylerinde, her OR / koku çift sadece deney bir kez test edilir. Kuyular arasında bir koku yayılma mümkün olduğu için, her bir plaka için, bir koku verici madde ile uyarmak için tavsiye edilir. </li><li> Doz tepki deneyleri için, üç kopya halindeki her bir reseptör için 1 mM&#39;den başlayarak koku stok çözeltisi yedi 10-kat seri dilüsyonları hazırlar. Ayrıca, koku arka aktivasyonu için kontrol edilmesi amacıyla boş vektör-transfekte edilmiş hücreler için üç kopya halinde aynı koku dilüsyonları hazırlar. Not: Doz tepkisi deneyleri için, her biri odor konsantrasyonu muamele üç kez yapılmalıdır. </li></ol></li><li> Hücre plakaları üzerinde medyayı dışarı dokunun. </li><li> Pipet 25 her bir oyuğa koku uyarım çözeltisi ul ve 4 saat için inkübe edilir. </li></ol> Lüsiferaz Tahlil aracılığıyla 5. Ölçüm YA Etkinliği <ol><li> -80 ° C de, üreticinin talimatlarına ve mağaza başına süspanse ateş böceği lusiferaz alt-tabaka </li><li> 96 çukurlu levha başına ateş böceği lusiferaz alt-tabaka 1 ml çözülme. </li><li> Söndürücü taze ateş böceği lusiferaz reaksiyonu hazırlanması ve Renilla lusiferaz alt-tabaka reaktif (1 ml tampon başına 5 ul lusiferaz söndürücü / Renilla lusiferaz substratı). NOT: maddesi yaklaşık 1 ml, 96 oyuklu plaka başına gereklidir. </li><li> Lüminesan mikroplaka okuyucu hazırlayın. Mikroplaka okuyucu yazılımı açın. Sistem simgesi dahilinde: <ol><li> &quot;Ön ısıtma&quot; sekmesi altında, &quot;ON&quot; için kutuyu işaretleyin ve 25 ° makinenin sıcaklığını ayarlamak; C. </li><li> &quot;Dispenser&quot; sekmesi altında,% 70 etanol 1000 ul her bir ana dağıtıcı damıtık su 1000 ul eklenmiştir. NOT: Her dağıtıcı için, alkol ve su ayrı alikotları kullanın. Etanol dağıtıcıları dezenfekte etmek için kullanılır ve su artık etanol kaldırır. </li><li> Başbakan havanın 1.500 ul her dağıtıcı (sıvıdan dağıtıcıları kaldırın). Not: hava ile prime lusiferaz alt-tabakalar kalıntı su ile seyreltilir değildir sağlar. </li><li> (Aşama 5.2 &#39;den) ateş böceği lusiferaz substrat 1080 ul Prime dağıtıcı 1. (Adım 5.3 dan itibaren) Renilla lusiferaz alt tabaka ile Başbakan dağıtıcı 2. NOT: değil kontaminasyona lusiferaz yüzeylerde dikkatli olun. Lusiferaz substratlarla emişli reaktif dağıtıcıları ölü boşluğu doldurur. </li></ol></li><li> Hem ateşböceği ve Renilla lusiferaz lüminesans okumak için aşağıdaki protokol kurmak. Mikrotabak okuyucu, un ile ilişkili yazılım içinde&quot;Dosya&quot; menüsünden der, &quot;Yeni Görev&quot; üzerine tıklayın. &quot;Protokoller&quot; vurgulayın ve &quot;Yeni Oluştur&quot; üzerine tıklayın. Bir sonraki pencerede, bir sonraki &quot;Standart Protokolü&quot; için daire seçilmelidir. &quot;Tamam&quot; ı tıklayın. Ekranın sol tarafındaki &quot;Usul&quot; üzerine çift tıklayın. <ol><li> Dağıtıcı 1 kullanarak tüm kuyulara ateşböceği lusiferaz substrat 10 ul dağıtın. &quot;Eylemler&quot; menüsü altında, &quot;dağıtın&quot; tıklayın. &quot;Dağıtın Adım&quot; penceresinde, set: hiçbiri, 10 ul &quot;Dağıtım Volume&quot; ve 225 ul / sn &quot;Oranı&quot; için &quot;Astar&quot; &quot;Dağıtıcı&quot; 1,. &quot;Tamam&quot; ı tıklayın. </li><li> 30 saniye için plakayı sallayın. &quot;Eylemler&quot; menüsü altında, &quot;Salla&quot; tıklayın. SS: &quot;Sarsıntı Adım&quot; penceresinde, Orta ve 00:30 MM &quot;Süre&quot; için &quot;Intensity&quot; olarak ayarlayın. &quot;Tamam&quot; ı tıklayın. </li><li> Oyuk başına 0.5 saniye seyahati kuyuların lüminesans okuyun. &quot;Eylemler&quot; menüsü altında, &quot;Oku&quot; tıklayın;. &quot;Oku Adım&quot; penceresinde, ayarlayın: Lüminesans için &quot;Algılama Yöntemi&quot;, 00:00:50 MM, bitiş noktasına &quot;Entegrasyon Time&quot; &quot;Type Oku&quot;: SS: ss, &quot;Filtre Setleri&quot; 1, &quot;Emisyon&quot; Hole, Başa &quot;Optik Konumu&quot;, 135 için &quot;Kazanç&quot;, ve 1.00 mm &quot;Yükseklik oku&quot;. &quot;Tamam&quot; ı tıklayın. </li><li> 2 dağıtıcı kullanan tüm oyuklara Renilla lusiferaz alt-tabaka 10 ul koyun. Grubu &quot;Dispenser&quot; 2 dışında, Aşama 5.6.1 gibi koşullarını ayarlayın. </li><li> 30 saniye için plakayı sallayın. Aşama 5.6.2 gibi koşulları ayarlayın. </li><li> 0.5 saniye seyahati kuyu lüminesans okuyun oyuk başına. Aşama 5.6.3 gibi koşulları ayarlayın. </li></ol></li><li> 96 oyuklu plaka kapağı çıkarın ve mikro-plaka okuyucuda plaka yerleştirilir. Plaka lüminesans okumak için Adım 5.5 kurmak programını başlatın. </li><li> Reaktif dağıtıcı pompaları temizleyin. &quot;Dağıtıcı&quot; sekmesi altında sistem simgesinden: <ol><li> F 1000 ul temizleyinbir geri kazanım borusu içine, ateş böceği luciferase dağıtıcıdan irefly lusiferaz alt-tabaka. Not: ateş böceği lusiferaz -80 ° C&#39;de saklanır ve yeniden kullanılabilir. </li><li> Prime% 70 etanol, ardından 1.000 ul damıtık su 1.000 ul, ve son olarak hava 1.500 ul her bir dağıtıcı (sıvıdan dağıtma kaldırmak). NOT: Su reaktif pompaları, etanol dezenfekte ve hava herhangi bir kalıntı etanol kurur lusiferaz tabakaları kaldırır. </li></ol></li></ol> 6.. Veri Analizi <ol><li> Veri Aktarma <ol><li> Mikroplaka okuyucu yazılım, ekranın sol tarafındaki &quot;Raporu / İhracat Üreticileri&quot; üzerine çift tıklayın. </li><li> Düğmesi &quot;Excel&#39;e Yeni İhracat&quot; üzerine tıklayın ve &quot;Tamam&quot; a tıklayın. </li><li> Export_1 vurgulayın ve &quot;Düzenle&quot; ye tıklayın. <ol><li> &quot;İçerik&quot; &quot;Sistem Açıklama&quot; kontrol &quot;Usul&quot;, &quot;Plate Açıklama&quot; ve &quot;Plaka Düzen Matrix&quot; altında. &quot;Ham Veri&quot; a dahilnd &quot;Veri Hesaplanan&quot;. </li><li> &quot;İş Akışı&quot; başlığı altında, &quot;prosedürün tamamlanması AutoExecute&quot; check. İhracat Modu altında, &quot;Hepsi aynı çalışma kitabında plakaları&quot; ve &quot;yeni bir çalışma olarak&quot; check. </li><li> &quot;File&quot; dosya adı formatı ve dosya konumu seçin ve &quot;OK&quot; butonuna tıklayınız altında. </li><li> &quot;Rapor / Export İnşaatçılar&quot; penceresini kapatın. </li></ol></li></ol></li><li> Normalize edilmiş lusiferaz değerlerini elde etmek için, her bir oyuk için Renilla lüminesans okuma (Adım 5.6.6) ile her bir oyuk için ateşböceği lüsiferaz ışıldama okuma (Aşama 5.6.3) bölün. </li></ol>

<ol>
	<li>Wetzel, C. H., Oles, M., Wellerdieck, C., Kuczkowiak, M., Gisselmann, G., Hatt, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Specificity+and+sensitivity+of+a+human+olfactory+receptor+functionally+expressed+in+human+embryonic+kidney+293+cells+and+Xenopus+Laevis+oocytes.">Specificity and sensitivity of a human olfactory receptor functionally expressed in human embryonic kidney 293 cells and Xenopus Laevis oocytes.</a> The Journal of neuroscience the official journal of the Society for Neuroscience. 19 (17), 7426-7433 (1999).</li><li>Spehr, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+a+testicular+odorant+receptor+mediating+human+sperm+chemotaxis.">Identification of a testicular odorant receptor mediating human sperm chemotaxis.</a> Science. 299 (5615), 2054-2058 (2003).</li><li>Sanz, G., Schlegel, C., Pernollet, J. -. C., Briand, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+odorant+specificity+of+two+human+olfactory+receptors+from+different+phylogenetic+classes+and+evidence+for+antagonism.">Comparison of odorant specificity of two human olfactory receptors from different phylogenetic classes and evidence for antagonism.</a> Chemical senses. 30 (1), 69-80 (2005).</li><li>Matarazzo, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+characterization+of+two+human+olfactory+receptors+expressed+in+the+baculovirus+Sf9+insect+cell+system.">Functional characterization of two human olfactory receptors expressed in the baculovirus Sf9 insect cell system.</a> Chemical senses. 30 (3), 195-207 (2005).</li><li>Jacquier, V., Pick, H., Vogel, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+an+extended+receptive+ligand+repertoire+of+the+human+olfactory+receptor+OR17-40+comprising+structurally+related+compounds.">Characterization of an extended receptive ligand repertoire of the human olfactory receptor OR17-40 comprising structurally related compounds.</a> Journal of neurochemistry. 97 (2), 537-544 (2006).</li><li>Neuhaus, E. M., Mashukova, A., Zhang, W., Barbour, J., Hatt, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+specific+heat+shock+protein+enhances+the+expression+of+mammalian+olfactory+receptor+proteins.">A specific heat shock protein enhances the expression of mammalian olfactory receptor proteins.</a> Chemical senses. 31 (5), 445-452 (2006).</li><li>Shirokova, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+specific+ligands+for+orphan+olfactory+receptors.+G+protein-dependent+agonism+and+antagonism+of+odorants.">Identification of specific ligands for orphan olfactory receptors. G protein-dependent agonism and antagonism of odorants.</a> The Journal of biological chemistry. 280 (12), 11807-11815 (2005).</li><li>Keller, A., Zhuang, H., Chi, Q., Vosshall, L. B., Matsunami, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetic+variation+in+a+human+odorant+receptor+alters+odour+perception.">Genetic variation in a human odorant receptor alters odour perception.</a> Nature. 449 (7161), 468-472 (2007).</li><li>Menashe, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetic+elucidation+of+human+hyperosmia+to+isovaleric+acid.">Genetic elucidation of human hyperosmia to isovaleric acid.</a> PLoS biology. 5 (11), (2007).</li><li>Saito, H., Chi, Q., Zhuang, H., Matsunami, H., Mainland, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Odor+coding+by+a+Mammalian+receptor+repertoire.">Odor coding by a Mammalian receptor repertoire.</a> Science signaling. 2 (60), (2009).</li><li>Jaeger, S. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Mendelian+Trait+for+Olfactory+Sensitivity+Affects+Odor+Experience+and+Food+Selection.">A Mendelian Trait for Olfactory Sensitivity Affects Odor Experience and Food Selection.</a> Current Biology. 23, 1-5 (2013).</li><li>DeMaria, S., Ngai, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+cell+biology+of+smell.">The cell biology of smell.</a> The Journal of cell biology. 191 (3), 443-452 (2010).</li><li>Zhang, X., Firestein, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+olfactory+receptor+gene+superfamily+of+the+mouse.">The olfactory receptor gene superfamily of the mouse.</a> Nature nauroscience. 5 (2), 124-1233 (2002).</li><li>Glusman, G., Yanai, I., Rubin, I., Lancet, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+complete+human+olfactory+subgenome.">The complete human olfactory subgenome.</a> Genome research. 11 (5), 685-702 (2001).</li><li>Olender, T., Lancet, D., Nebert, D. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Update+on+the+olfactory+receptor+(OR)+gene+superfamily.">Update on the olfactory receptor (OR) gene superfamily.</a> Human Genomics. 3 (1), 87 (2008).</li><li>Mombaerts, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genes+and+ligands+for+odorant,+vomeronasal+and+taste+receptors.">Genes and ligands for odorant, vomeronasal and taste receptors.</a> Nature reviews. Neuroscience. 5 (4), 263-278 (2004).</li><li>Malnic, B., Hirono, J., Sato, T., Buck, L. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Combinatorial+receptor+codes+for+odors.">Combinatorial receptor codes for odors.</a> Cell. 96 (5), 713-723 (1999).</li><li>Araneda, R. C., Kini, a. D., Firestein, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+molecular+receptive+range+of+an+odorant+receptor.">The molecular receptive range of an odorant receptor.</a> Nature. 3 (12), 1248-1255 (2000).</li><li>Saito, H., Kubota, M., Roberts, R. W., Chi, Q., Matsunami, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=RTP+family+members+induce+functional+expression+of+mammalian+odorant+receptors.">RTP family members induce functional expression of mammalian odorant receptors.</a> Cell. 119 (5), 679-691 (2004).</li><li>Katada, S., Hirokawa, T., Oka, Y., Suwa, M., Touhara, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Structural+basis+for+a+broad+but+selective+ligand+spectrum+of+a+mouse+olfactory+receptor:+mapping+the+odorant-binding+site.">Structural basis for a broad but selective ligand spectrum of a mouse olfactory receptor: mapping the odorant-binding site.</a> The Journal of neuroscience the official journal of the Society for Neuroscience. 25 (7), 1806-1815 (2005).</li><li>Lu, M., Echeverri, F., Moyer, B. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Endoplasmic+Reticulum+Retention,+Degradation,+and+Aggregation+of+Olfactory+G-Protein+Coupled+Receptors.">Endoplasmic Reticulum Retention, Degradation, and Aggregation of Olfactory G-Protein Coupled Receptors.</a> Traffic. 4 (6), 416-433 (2003).</li><li>McClintock, T. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+expression+of+olfactory-adrenergic+receptor+chimeras+and+intracellular+retention+of+heterologously+expressed+olfactory+receptors.">Functional expression of olfactory-adrenergic receptor chimeras and intracellular retention of heterologously expressed olfactory receptors.</a> Brain research. Molecular brain research. 48 (2), 270-278 (1997).</li><li>Zhao, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+Expression+of+a+Mammalian+Odorant+Receptor.">Functional Expression of a Mammalian Odorant Receptor.</a> Science. 279 (5348), 237-242 (1998).</li><li>Kajiya, K., Inaki, K., Tanaka, M., Haga, T., Kataoka, H., Touhara, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular+bases+of+odor+discrimination:+Reconstitution+of+olfactory+receptors+that+recognize+overlapping+sets+of+odorants.">Molecular bases of odor discrimination: Reconstitution of olfactory receptors that recognize overlapping sets of odorants.</a> The Journal of neuroscience the official journal of the Society for Neuroscience. 21 (16), 6018-6025 (2001).</li><li>Krautwurst, D., Yau, K., Reed, R. R., Hughes, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+Ligands+for+Olfactory+Receptors.">Identification of Ligands for Olfactory Receptors.</a> Cell. 95, 917-926 (1998).</li><li>Li, Y. R., Matsunami, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Activation+state+of+the+M3+muscarinic+acetylcholine+receptor+modulates+mammalian+odorant+receptor+signaling.">Activation state of the M3 muscarinic acetylcholine receptor modulates mammalian odorant receptor signaling.</a> Science signaling. 4 (155), (2011).</li><li>Zhuang, H., Matsunami, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluating+cell-surface+expression+and+measuring+activation+of+mammalian+odorant+receptors+in+heterologous+cells.">Evaluating cell-surface expression and measuring activation of mammalian odorant receptors in heterologous cells.</a> Nature. 3 (9), 1402-1413 (2008).</li><li>Haddad, R., Khan, R., Takahashi, Y. K., Mori, K., Harel, D., Sobel, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+metric+for+odorant+comparison.">A metric for odorant comparison.</a> Nature methods. 5 (5), 425-429 (2008).</li><li>Veithen, A., Wilkin, F., Philippeau, M., Van Osselaer, C., Chatelain, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Olfactory+Receptors:+From+basic+science+to+applications+in+flavors+and+fragrances.">Olfactory Receptors: From basic science to applications in flavors and fragrances.</a> Perfumer and Flavorist. 35 (1), 38-40 (2010).</li><li>Bozza, T., Feinstein, P., Zheng, C., Mombaerts, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Odorant+receptor+expression+defines+functional+units+in+the+mouse+olfactory+system.">Odorant receptor expression defines functional units in the mouse olfactory system.</a> The Journal of neuroscience the official journal of the Society for Neuroscience. 22 (8), 3033-3043 (2002).</li><li>Oka, Y., Katada, S., Omura, M., Suwa, M., Yoshihara, Y., Touhara, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Odorant+receptor+map+in+the+mouse+olfactory+bulb:+in+vivo+sensitivity+and+specificity+of+receptor-defined+glomeruli.">Odorant receptor map in the mouse olfactory bulb: in vivo sensitivity and specificity of receptor-defined glomeruli.</a> Neuron. 52 (5), 857-869 (2006).</li><li>Zhao, H., Ivic, L., Otaki, J. M., Hashimoto, M., Mikoshiba, K., Firestein, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+expression+of+a+mammalian+odorant+receptor.">Functional expression of a mammalian odorant receptor.</a> Science. 279 (5348), 237-242 (1998).</li><li>Touhara, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+identification+and+reconstitution+of+an+odorant+receptor+in+single+olfactory+neurons.">Functional identification and reconstitution of an odorant receptor in single olfactory neurons.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 96 (7), 4040-4045 (1999).</li><li>Zhuang, H., Matsunami, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synergism+of+accessory+factors+in+functional+expression+of+mammalian+odorant+receptors.">Synergism of accessory factors in functional expression of mammalian odorant receptors.</a> The Journal of biological chemistry. 282 (20), 15284-15293 (2007).</li><li>McRae, J. F., Mainland, J. D., Jaeger, S. R., Adipietro, K. A., Matsunami, H., Newcomb, R. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetic+variation+in+the+odorant+receptor+OR2J3+is+associated+with+the+ability+to+detect+the+&amp;#34;grassy&amp;#34;+smelling+odor,+cis-3-hexen-1-ol.">Genetic variation in the odorant receptor OR2J3 is associated with the ability to detect the &amp;#34;grassy&amp;#34; smelling odor, cis-3-hexen-1-ol.</a> Chemical senses. 37 (7), 585-593 (2012).</li><li>Adipietro, K. A., Mainland, J. D., Matsunami, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+evolution+of+mammalian+odorant+receptors.">Functional evolution of mammalian odorant receptors.</a> PLoS genetics. 8 (7), (2012).</li><li>Zhuang, H., Chien, M. -. S., Matsunami, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dynamic+functional+evolution+of+an+odorant+receptor+for+sex-steroid-derived+odors+in+primates.">Dynamic functional evolution of an odorant receptor for sex-steroid-derived odors in primates.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106 (50), 21247-21251 (2009).</li><li>Oka, Y., Nakamura, A., Watanabe, H., Touhara, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+odorant+derivative+as+an+antagonist+for+an+olfactory+receptor.">An odorant derivative as an antagonist for an olfactory receptor.</a> Chemical senses. 29 (9), 815-822 (2004).</li><li>Oka, Y., Omura, M., Kataoka, H., Touhara, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Olfactory+receptor+antagonism+between+odorants.">Olfactory receptor antagonism between odorants.</a> The EMBO journal. 23 (1), 120-126 (2004).</li><li>Fawcett, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+introduction+to+ROC+analysis.">An introduction to ROC analysis.</a> Pattern Recognition Letters. 27 (8), 861-874 (2006).</li><li>Baghaei, K. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Olfactory+Receptors.">Olfactory Receptors.</a> Olfactory Recept. Methods Protoc. 1003, 229-238 (2013).</li><li>Dey, S., Zhan, S., Matsunami, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assaying+surface+expression+of+chemosensory+receptors+in+heterologous+cells.">Assaying surface expression of chemosensory receptors in heterologous cells.</a> Journal of visualized experiments JoVE. (48), (2011).</li></ol>

Yazarlar ifşa hiçbir şey yok.

Koku maddesi kimlik olfaktori reseptör aktivasyon paternlerinin ile kodlanan, ancak reseptörleri aktive edilmiş ve hangi dereceye kadar olan da dahil olmak üzere alıcı aktivasyonu desenler insan olfaktori reseptör 1-11 arasında daha az% 6 ile tanınırlar. Koku reseptörleri karakterize etmek için çabalar koku reseptör ailesi 17,23,24,33,34 sadece bir alt kendi emek-yoğun yöntemlerle veya uygulanabilirliği ile sınırlı kalmıştır. Hana3A heterolog sentezleme sistemi, test edilen k...

Memeli koku algılama sistemi, ve koku binlerce ayrım sağlayan, kokulu uyaranlara bir çok sayıda yanıt yeteneğine sahiptir. Koku reseptörleri (OR) koku epiteli 12 koku duyusal nöronlar tarafından ifade moleküler sensörler bulunmaktadır. Memeli koku tanıma koku tarafından ameliyathanelerinde diferansiyel aktivasyonu yoluyla gerçekleşir ve OR gen ailesi kabaca 1.000 kemirgen ve 400 insan reseptörleri 12-16 ile kapsamlıdır. Koku nöronlarda ve heterolog hücrelerde ameliyathanelerinde önceki fonksiyonel analizleri farklı katkılar benzersiz tarafından tanınan olduğunu göstermiştir, ancak OR 10,17-20 arasında toplulukları örtüşen var. Ameliyathanelerinde ligandları Eşleştirme koku kodunu ve koku duyusunun uygulanabilir modeller oluşturmak için gerekli anlamak için önemlidir. Nedeniyle koku ve ORs hem de çok sayıda hem de heterolog sistemlerde eksprese OR&#39;lar zorluklar, bu veriler f büyük ölçüde yok olduield; Gerçekten, insan ameliyathanelerinde azının% 6, yayımlanmış bir ligandı 1-11 var. Bu protokol odorant / veya karakterize etmek için bir etkileşimi lusiferaz tahlilin kullanımını tarif eder. Bu tahlil ameliyathanelerinde yüksek verimlilik karakterizasyonu, Deodorantını / VEYA etkileşimleri anlamak yanı sıra koku kodlama bir model geliştirmek için gerekli bir görevi sağlar. Ameliyathanelerinde yüksek verimlilik çalışmaları üç büyük sorunlarla karşı karşıyadır. İlk olarak, heterolog hücrelerde ifade edilen ORs ER &#39;in içinde muhafaza edildi ve daha sonra, deney sisteminde 23-25 ​​koku maddeleri ile etkileşim ORS önlenmesi, proteazom 21,22 parçalanır. Bu sorun OR&#39;lar 19,26,27 geniş bir yelpazede stabil hücre yüzey ifadesini kolaylaştıran aksesuar proteinlerin keşif tarafından ele alındı. Reseptör-taşıyıcı proteinler-1 ve 2 (RTP1 ve 2) desteklemek OR odorant uyarılması 19 tepki olarak hücre yüzey ifadesi ve aktivasyonu. Bu çalışmalara dayanarak, HEK293T hücreleriydikararlı bir şekilde hücre çizgisi 19,27 Hana3A sonuçlanan RTP1 uzun (RTP1L) ve RTP2, reseptör ekspresyon arttırıcı protein 1 ve G αolf ifade için değiştirilebilir. Buna ek olarak, tip 3 muskarinik asetilkolin reseptörü (M3-R), hücre yüzeyinde ORs ile etkileşime girer ve koku 26 yanıt olarak aktivasyonunu artırır. Hücre yüzeyi 27 de ORs geniş bir aralığının, sağlam, tutarlı ve fonksiyonel ifade Hana3A hücreler sonuçlara RTP1S ve M3-R ile bir OR ko-transfeksiyonu. İkinci olarak, memeli ya da repertuarları oldukça büyüktür. İnsanlarda, örneğin, VEYA repertuar tat reseptör repertuvarının daha çok büyüklükte bir sipariş olduğunu ve görsel reseptör repertuvarının daha çok büyüklük 2 emirleri. Tek bir klonlama ya da nispeten basit bir protokoldür, ancak önemli ön nitelikli kapsamlı bir kitaplık oluşturmak için gereklidir. Biz vizyonu olduğunu bilmenize rağmen Üçüncü olarak, dalga boyu renk çevirir veSeçmeler frekans sahası içine çevirir içinde, kokuların organizasyonu kötü zor araştırmacılar koku temsili bir örnek katmak için yapıyor, anlaşılmaktadır. Bazı ilerlemeler bu ön 10,28 üzerinde yapılmış olmasına rağmen, koku manzara haritası eksik kalır. Ameliyathanelerinde yüzlerce karşı onlarca moleküllerinin binlerce Tarama yıldırıcı bir iştir; Bu alanda yüksek verim ekranlar dikkatlice tanımlanmış kampanyalar gerektirebilir. Geri kalan en büyük zorluklar yerine tekniğe özgü problemlere göre lojistik ve maliyet olanlardır. Heterolog tarama yaygın akademik grupları ligandları tanımlamak için kullanılır olmasına rağmen, bir özel şirket 100 insan ameliyathanelerinde 29 ligandlar tanımlamak için aynı tekniği kullandı. Ne yazık ki, bu veriler, özel kalır. Burada özetlenen yüksek verimli bir lusiferaz deney değerlendirmek veya aktivasyon için kullanılan diğer yöntemlere göre bazı avantajları vardır. Her ne kadar sorumluluğuyerli koku duyu nöronlarının ses elektrofizyoloji ve kalsiyum görüntüleme kullanılarak ölçülmüş, bu teknikler zorluğu nedeniyle koku nöronlar için tepki özellikleri örtüşme bir nöronun tepki yol açar VEYA ayrı alay var. , GFP etiketli reseptör tipi 30,31 in-vurma 32,33 koku nöronlar sıçangile adenovirüs üzerinden belirli reseptörleri teslim, ya da 17,24,33 tek reseptör türlerine kayıtları bağlayabilirsiniz kayıtlarından sonra RT-PCR performans, bu yöntemler olmasına rağmen düşük verimlilik ve büyük ölçekli ekranlar için uygun değildir. Heterolog tarama sistemleri daha ölçeklenebilir, ve iki büyük formları literatürde bulunur: cAMP yolunun muhabirleri ve inositol trifosfat (IP3) yolunun muhabirler. Koku uyarılması üzerine, ORs, siklik AMP (cAMP) 12 üretimi ile sonuçlanan bir sinyal transdüksiyon G αolf kaskadını aktive. Ac kontrolü altında ateş böceği lusiferaz raportör geni ile ko-transfekteAMP yanıt elemanı (CRE), lusiferaz üretimi miktarının ya da aktivasyon sağlayan, koku yanıtı bir fonksiyonu olarak ölçülebilir. Ya da aktivasyon, aynı zamanda, G ya da G α15/16 α15-olf kimera 24,25,34 olarak G-proteinleri ko-ifade ile IP3 yolu ile bağlantılı olabilir. Üç faktörlere dayalı Burada yer alan tahlili seçtik: Rho-etiketli koku reseptörleri ile RTP1 (1) eş-ekspresyon hücre yüzeyi 19,27 az koku reseptör ekspresyonunu iyileştirir; (2) bir cAMP tepki veren bildirici genin kullanımı ölçülmesi OR kanonik ikinci haberci yolu ile aktivasyonu için izin verir; ve (3) deney yüksek verimli taramalar için çok uygundur. Bu, yüksek verimli lusiferaz deney olfaction alanında değerli çalışmalar çeşitli uygulanabilir. İlk olarak, ORs, çok sayıda, bir sp için reseptör aktivasyon modelini belirlemek amacıyla tek bir koku verici madde karşı taranabilirecific Odorant. Çalışmanın bu tür steroid odorant Androstenone 8 yanıt için OR sorumlu OR7D4 olarak tespit edilmiştir. Bunun tersine, bir ya da reseptör karşılığı profilini 10 belirlemek amacıyla koku bir paneline karşı taranabilir. Aday koku odorant / veya çiftleri bu ekranların ile tespit edilirse, koku verici madde etkileşim artan konsantrasyonları için ya da tepkisini inceleyen bir doz tepki deney ile teyit edilebilir. Doz yanıt eğrileri de ameliyathanede genetik varyasyon vitro Odorant yanıt 8,9,11,35 olarak nasıl etkilediğini değerlendirmek ve bu çalışmaların evrim türlerin ve nedensel mutasyonlar arasında reseptör evrim incelenmesi için izin interspesifik VEYA varyasyona uzatılabilir 36,37, Son olarak, bu deney, antagonize etmek mümkün ya da bilinen bir odorant / reseptör çifti 38,39 için belirli bir koku verici madde için olan koku yanıtı antagonistlerinin taranması için de kullanılabilir. Özet olarak, bu yüksekVerimlilik lusiferaz tahlil karakterize yardımcı VEYA aktivasyon desen ve koku sisteminde koku kodlama daha iyi anlaşılmasını sağlayacak çalışmalar bir dizi uygulanabilir.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:685px;" width="685">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:265px;">Name of Material/ Equipment</td>
			<td style="width:135px;">Company</td>
			<td style="width:119px;">Catalog Number</td>
			<td style="width:167px;">Comments/Description</td>
		</tr>
		<tr height="84">
			<td height="84" style="height:84px;width:265px;">Hana3A cells</td>
			<td style="width:135px;">Avaiable from the Matsunami Laboratory upon request</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="84">
			<td height="84" style="height:84px;width:265px;">RTP1S-pCI</td>
			<td style="width:135px;">Avaiable from the Matsunami Laboratory upon request</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="84">
			<td height="84" style="height:84px;width:265px;">M3-R-pCI</td>
			<td style="width:135px;">Avaiable from the Matsunami Laboratory upon request</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:265px;">pCRE-luc</td>
			<td style="width:135px;">Agilent</td>
			<td style="width:119px;">219076</td>
			<td><a href="http://www.chem.agilent.com/store/ProductDetail.aspx?productID=219076%28Agilent%29">LUC</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:265px;">pSV40-RL</td>
			<td style="width:135px;">Promega</td>
			<td style="width:119px;">E2231</td>
			<td><a href="http://www.promega.com/products/reporter-assays-and-transfection/reporter-vectors-and-cell-lines/prl-renilla-luciferase-control-reporter-vectors/">RL</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Minimum Essential Media, Eagle</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>M4655</td>
			<td><a href="http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sigma/m4655?lang=en&amp;region=US">MEM</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:265px;">FBS</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>16000-044</td>
			<td><a href="https://products.invitrogen.com/ivgn/product/16000044?ICID=search-16000044">FBS</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">PBS (without Ca2+ and Mg2+)</td>
			<td>Cellgro</td>
			<td>21-040-CV</td>
			<td><a href="http://cellgro.com/products/balanced-salt-solutions/phosphate-buffered-saline/phosphate-buffered-saline-1x-2.html">PBS</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Trypsin (0.05% Trypsin EDTA)</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>25300</td>
			<td><a href="https://products.invitrogen.com/ivgn/product/25300054?ICID=search-product">Trypsin</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:265px;">CD293</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>11913-019</td>
			<td><a href="http://products.invitrogen.com/ivgn/product/11913019?ICID=search-11913019">CD293</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:265px;">96 well PDL white/clear plate</td>
			<td style="width:135px;">BD BioCoat</td>
			<td style="width:119px;">356693</td>
			<td><a href="http://www.thomassci.com/Supplies/Tissue-Culture-Cellware/_/BD-Biocoat-Poly-D-Lysine-Culture-Dishes?q=356693">plates</a></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:265px;">Lipid transfection reagent: Lipofectamine 2000</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>11668-019</td>
			<td><a href="https://products.invitrogen.com/ivgn/product/11668019?ICID=search-11668019">Lipofectamine</a></td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:265px;">Firefly luciferase substrate, firefly luciferase quencher/Renilla luciferase substrate: Dual-Glo Assay</td>
			<td style="width:135px;">Promega</td>
			<td style="width:119px;">E2980</td>
			<td><a href="http://www.promega.com/products/reporter-assays-and-transfection/reporter-assays/dual_glo-luciferase-assay-system/?__utma=1.1932750276.1376486173.1376486173.1376486173.1&amp;__utmb=1.1.10.1376486173&amp;__utmc=1&amp;__utmx=-&amp;__utmz=1.1376486173.1.1.utmcsr=google|utmc">dual glo</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Synergy S2&#160;</td>
			<td style="width:135px;">BioTek</td>
			<td style="width:119px;">SLAD</td>
			<td><a href="http://www.biotek.com/products/microplate_detection/synergy2_multimode_microplate_reader.html">BioTek S2</a></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:265px;">Microplate reader software: Gen5 Data Analysis Software</td>
			<td style="width:135px;">BioTek</td>
			<td style="width:119px;">Gen5</td>
			<td><a href="http://www.biotek.com/products/microplate_software/gen5_data_analysis_software.html">Gen5</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:265px;">BIOSTACK</td>
			<td style="width:135px;">BioTek</td>
			<td style="width:119px;">BIOSTACK2WR</td>
			<td><a href="http://www.biotek.com/products/microplate_software/biostack_microplate_stacker.html">BioStack</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:265px;">Multiflo</td>
			<td style="width:135px;">BioTek</td>
			<td style="width:119px;">MFP</td>
			<td><a href="http://www.biotek.com/products/liquid_handling/multiflo_microplate_dispenser.html">MultiFlo</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:265px;">300ul GripTips</td>
			<td style="width:135px;">Integra</td>
			<td style="width:119px;">4433</td>
			<td><a href="http://www.integra-biosciences.com/sites/us/pipette_tips_griptips_4_e.html">GripTips</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:265px;">12.5ul GripTips</td>
			<td style="width:135px;">Integra</td>
			<td style="width:119px;">4414</td>
			<td><a href="http://www.integra-biosciences.com/sites/us/pipette_tips_griptips_4_e.html">GripTips</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:265px;">300ul GripTips ViaFlo96</td>
			<td style="width:135px;">Integra</td>
			<td style="width:119px;">6433</td>
			<td><a href="http://www.integra-biosciences.com/sites/us/pipette_tips_griptips_XYZ_4_e.html">XYZ tips</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:265px;">12.5ul GripTips 384 XYZ</td>
			<td style="width:135px;">Integra</td>
			<td style="width:119px;">6403</td>
			<td><a href="http://www.integra-biosciences.com/sites/us/pipette_tips_griptips_XYZ_4_e.html">XYZ tips</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:265px;">384ViaFlo</td>
			<td style="width:135px;">Integra</td>
			<td>6030</td>
			<td><a href="http://www.integra-biosciences.com/sites/us/96_384_channel_pipette.html">384ViaFlo</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">TE buffer</td>
			<td>Macherey Nagel</td>
			<td>740797.1</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">DMSO</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>D2650-100ML</td>
			<td><a href="http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sigma/d2650?lang=en&amp;region=US">DMSO</a></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">forskolin</td>
			<td>Enzo Life Sciences</td>
			<td>BML-CN100-0010</td>
			<td><a href="http://www.thomassci.com/007635F0-AA41-4B24-B46A-05723D685997/_/FORSKOLIN-10MG?q=c002e24">FOR</a></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

high-throughput analysis of mammalian olfactory receptors: measurement of receptor activation via luciferase activity

Parfüm yaklaşık 1000 murin ve 400 insan reseptörleri ailesidir koku binlerce tanımak için izin koku reseptör aktivasyonunun benzersiz ve üst üste gelen desenleri oluşturmak. Odorant ligandlar insan reseptörleri 1-11 az% 6 yayınlanmıştır. Bu veri eksikliği, kısmen fonksiyonel heterolog sistemlerde bu reseptörleri eksprese zorluklar kaynaklanmaktadır. Burada, bir lusiferaz haberci deneyi kullanılarak koku reseptör aktivasyonunun, yüksek verimli değerlendirme ardından Hana3A hücrelerde koku reseptör ailesinin, çoğunluğu ifade etmek için bir yöntem tarif eder. Bu deney, koku reseptörlerinin panel karşı koku maddesi (1) ekran panelleri için de kullanılabilir; (2) doz tepki eğrileri ile odorant / reseptör etkileşimi teyit; ve (3) reseptör varyantlar arasında reseptörü aktivasyon düzeyleri karşılaştırın. Bizim örnek veri, 328 koku reseptörleri 26 koku karşı tarandı. Değişen tepki puanları ile odorant / reseptör çifti selec edildited ve doz yanıt olarak test edilmiştir. Bu veriler, bir ekran, bir koku verici madde için iyi niyetli bir tepki, yani reseptörleri, bir doz cevap deneyi geçecek odorant / alıcı çiftleri için zenginleştirmek için etkili bir yöntem olduğunu göstermektedir. Bu nedenle, bu yüksek verimli bir lusiferaz deney memeli koku koku kodlama sisteminde bir modeline doğru koku reseptörleri temel bir adım karakterize etmek için etkili bir yöntemdir.

Birincil ekran 100 uM bir konsantrasyonda 26 kokulara karşı 328 OR&#39;lar test edilmiştir. Bu koku yoğunluğu etkin bilinen ligandlar 10 ORs önemli bir bölümünü etkinleştirmek için gösterilmiştir. İlk olarak, normalize edilmiş lusiferaz aktivitesi, Renilla lusiferaz okunması ile, ateş böceği luciferase okuma bölünmesi ile hesaplanmıştır. Daha sonra, başlangıç ​​çizgisi değerleri, her bir (Şekil 1) için normalize edilmiş lusiferaz okumalardan herha...

Watch this Scientific Journal Video about High-throughput Analysis of Mammalian Olfactory Receptors: Measurement of Receptor Activation via Luciferase Activity at JoVE.com

High-throughput Analysis of Mammalian Olfactory Receptors: Measurement of Receptor Activation via Luciferase Activity

Koku reseptör aktivasyonu desenler koku kimliğini kodlamak, ancak memeli koku reseptörleri için Odorant ligandlar belirlenmesi yayınlanan verilerin eksikliği koku kodlama kapsamlı bir modelinin gelişmesini engellemektedir. Bu protokol, koku reseptör ligandları ve reseptör aktivasyonunun miktar yüksek throughput belirlenmesini kolaylaştırmak için bir yöntem tarif etmektedir.

Lusiferaz aktivitesi ile reseptör aktivasyonunun bir ölçümü: Memeli Koku reseptörünün yüksek throughput Analizi

Odorants create unique and overlapping patterns of olfactory receptor activation, allowing a family of approximately 1,000 murine and 400 human receptors ...

high-throughput-analysis-mammalian-olfactory-receptors-measurement

Research

JoVE Journal

Neuroscience

12.4K Görüntüleme.  Monell Chemical Senses Center.  Koku reseptör aktivasyonu desenler koku kimliğini kodlamak, ancak memeli koku reseptörleri için Odorant ligandlar belirlenmesi yayınlanan verilerin eksikliği koku kodlama kapsamlı bir modelinin gelişmesini engellemektedir. Bu protokol, koku reseptör ligandları ve reseptör aktivasyonunun miktar yüksek throughput belirlenmesini kolaylaştırmak için bir yöntem tarif etmektedir. 

Video: High-throughput Analysis of Mammalian Olfactory Receptors: Measurement of Receptor Activation via Luciferase Activity

In vivo Electroporation of Developing Mouse Retina

The functional characterization of genes expressed during mammalian retinal development remains a significant challenge. Gene targeting to generate constitutive or conditional loss of function knockouts remains cost and labor intensive, as well as time consuming. Adding to these challenges, retina expressed genes may have essential roles outside the retina leading to unintended confounds when using a knockout approach. Furthermore, the ability to ectopically express a gene in a gain of function experiment can be extremely valuable when attempting to identify a role in cell fate specification and/or terminal differentiation.
We present a method for the rapid and efficient incorporation of DNA plasmids into the neonatal mouse retina by electroporation. The application of short electrical impulses above a certain field strength results in a transient increase in plasma membrane permeability, facilitating the transfer of material across the membrane 1,2,3,4. Groundbreaking work demonstrated that electroporation could be utilized as a method of gene transfer into mammalian cells by inducing the formation of hydrophilic plasma membrane pores allowing the passage of highly charged DNA through the lipid bilayer 5. Continuous technical development has resulted in the viability of electroporation as a method for in vivo gene transfer in multiple mouse tissues including the retina, the method for which is described herein 6, 7, 8, 9, 10. 
DNA solution is injected into the subretinal space so that DNA is placed between the retinal pigmented epithelium and retina of the neonatal (P0) mouse and electrical pulses are applied using a tweezer electrode. The lateral placement of the eyes in the mouse allows for the easy orientation of the tweezer electrode to the necessary negative pole-DNA-retina-positive pole alignment. Extensive incorporation and expression of transferred genes can be identified by postnatal day 2 (P2). Due to the lack of significant lateral migration of cells in the retina, electroporated and non-electroporated regions are generated. Non-electroporated regions may serve as internal histological controls where appropriate. 
Retinal electroporation can be used to express a gene under a ubiquitous promoter, such as CAG, or to disrupt gene function using shRNA constructs or Cre-recombinase. More targeted expression can be achieved by designing constructs with cell specific gene promoters. Visualization of electroporated cells is achieved using bicistronic constructs expressing GFP or by co-electroporating a GFP expression construct. Furthermore, multiple constructs may be electroporated for the study of combinatorial gene effects or simultaneous gain and loss of function of different genes. Retinal electroporation may also be utilized for the analysis of genomic cis-regulatory elements by generating appropriate expression constructs and deletion mutants. Such experiments can be used to identify cis-regulatory regions sufficient or required for cell specific gene expression 11. Potential experiments are limited only by construct availability.

In vivo Electroporation of Developing Mouse Retina

A method for the incorporation of plasmid DNA into murine retinal cells for the purpose of performing either gain- or loss of function studies in vivo is presented. This method capitalizes on the transient increase in permeability of cell plasma membranes induced by the application of an external electrical field.

Gelişmekte olan Fare Retina in vivo Elektroporasyon olarak

The functional characterization of genes expressed during mammalian retinal development remains a significant challenge.  Gene targeting to generate ...

Nörobilim

Odorant-induced Responses Recorded from Olfactory Receptor Neurons using the Suction Pipette Technique

Animals sample the odorous environment around them through the chemosensory systems located in the nasal cavity. Chemosensory signals affect complex behaviors such as food choice, predator, conspecific and mate recognition and other socially relevant cues. Olfactory receptor neurons (ORNs) are located in the dorsal part of the nasal cavity embedded in the olfactory epithelium. These bipolar neurons send an axon to the olfactory bulb (see Fig. 1, Reisert &amp; Zhao1, originally published in the Journal of General Physiology) and extend a single dendrite to the epithelial border from where cilia radiate into the mucus that covers the olfactory epithelium. The cilia contain the signal transduction machinery that ultimately leads to excitatory current influx through the ciliary transduction channels, a cyclic nucleotide-gated (CNG) channel and a Ca2+-activated Cl- channel (Fig. 1). The ensuing depolarization triggers action potential generation at the cell body2-4.
In this video we describe the use of the "suction pipette technique" to record odorant-induced responses from ORNs. This method was originally developed to record from rod photoreceptors5 and a variant of this method can be found at jove.com modified to record from mouse cone photoreceptors6. The suction pipette technique was later adapted to also record from ORNs7,8. Briefly, following dissociation of the olfactory epithelium and cell isolation, the entire cell body of an ORN is sucked into the tip of a recording pipette. The dendrite and the cilia remain exposed to the bath solution and thus accessible to solution changes to enable e.g. odorant or pharmacological blocker application. In this configuration, no access to the intracellular environment is gained (no whole-cell voltage clamp) and the intracellular voltage remains free to vary. This allows the simultaneous recording of the slow receptor current that originates at the cilia and fast action potentials fired by the cell body9. The difference in kinetics between these two signals allows them to be separated using different filter settings. This technique can be used on any wild type or knockout mouse or to record selectively from ORNs that also express GFP to label specific subsets of ORNs, e.g. expressing a given odorant receptor or ion channel.

Olfactory receptor neurons (ORNs) convert odor signals first into a receptor current that in turn triggers action potentials that are conveyed to second order neurons in the olfactory bulb. Here we describe the suction pipette technique to record simultaneously the odorant-induced receptor current and action potentials from mouse ORNs.

Emme Pipet Tekniği kullanılarak Olfaktör Reseptör Nöronlar Kaydedilmiş odorant bağlı Cevapları

Animals sample the odorous environment around them through the chemosensory systems located in the nasal cavity. Chemosensory signals affect complex ...

Functional Interrogation of Adult Hypothalamic Neurogenesis with Focal Radiological Inhibition

The functional characterization of adult-born neurons remains a significant challenge. Approaches to inhibit adult neurogenesis via invasive viral delivery or transgenic animals have potential confounds that make interpretation of results from these studies difficult. New radiological tools are emerging, however, that allow one to noninvasively investigate the function of select groups of adult-born neurons through accurate and precise anatomical targeting in small animals. Focal ionizing radiation inhibits the birth and differentiation of new neurons, and allows targeting of specific neural progenitor regions. In order to illuminate the potential functional role that adult hypothalamic neurogenesis plays in the regulation of physiological processes, we developed a noninvasive focal irradiation technique to selectively inhibit the birth of adult-born neurons in the hypothalamic median eminence. We describe a method for Computer tomography-guided focal irradiation (CFIR) delivery to enable precise and accurate anatomical targeting in small animals. CFIR uses three-dimensional volumetric image guidance for localization and targeting of the radiation dose, minimizes radiation exposure to nontargeted brain regions, and allows for conformal dose distribution with sharp beam boundaries. This protocol allows one to ask questions regarding the function of adult-born neurons, but also opens areas to questions in areas of radiobiology, tumor biology, and immunology. These radiological tools will facilitate the translation of discoveries at the bench to the bedside.

The function of adult-born mammalian neurons remains an active area of investigation. Ionizing radiation inhibits the birth of new neurons. Using computer tomography-guided focal irradiation (CFIR), three-dimensional anatomical targeting of specific neural progenitor populations can now be used to assess the functional role of adult neurogenesis.

Odak Radyolojik Geciktiricisinin Erişkin Hipotalamus nöron Fonksiyonel Sorgulama

The functional characterization of adult-born neurons remains a significant challenge. Approaches to inhibit adult neurogenesis via invasive viral ...

Whole Mount Immunolabeling of Olfactory Receptor Neurons in the Drosophila Antenna

Odorant molecules bind to their target receptors in a precise and coordinated manner. Each receptor recognizes a specific signal and relays this information to the brain. As such, determining how olfactory information is transferred to the brain, modifying both perception and behavior, merits investigation. Interestingly, there is emerging evidence that cellular transduction and transcriptional factors are involved in the diversification of olfactory receptor neuron. Here we provide a robust whole mount immunological labeling method to assay in vivo olfactory receptor neuron organization. Using this method, we identified all olfactory receptor neurons with anti-ELAV antibody, a known pan-neural marker and Or49a-mCD8::GFP, an olfactory receptor neuron specifically expressed in Nba neuron using anti-GFP antibody.

Whole Mount Immunolabeling of Olfactory Receptor Neurons in the Drosophila Antenna

Herein we describe the process of whole mount immunostaining of Drosophila antennae, which enables us to better understand the molecular mechanisms involved in the diversification of olfactory receptor neurons (ORN)s.

In Koku Reseptör Nöronlar Tüm Dağı ile immün<em&gt; Drosophila</em&gt; Anten

Odorant molecules bind to their target receptors in a precise and coordinated manner. Each receptor recognizes a specific signal and relays this ...

FIM Imaging and FIMtrack: Two New Tools Allowing High-throughput and Cost Effective Locomotion Analysis

The analysis of neuronal network function requires a reliable measurement of behavioral traits. Since the behavior of freely moving animals is variable to a certain degree, many animals have to be analyzed, to obtain statistically significant data. This in turn requires a computer assisted automated quantification of locomotion patterns. To obtain high contrast images of almost translucent and small moving objects, a novel imaging technique based on frustrated total internal reflection called FIM was developed. In this setup, animals are only illuminated with infrared light at the very specific position of contact with the underlying crawling surface. This methodology results in very high contrast images. Subsequently, these high contrast images are processed using established contour tracking algorithms. Based on this, we developed the FIMTrack software, which serves to extract a number of features needed to quantitatively describe a large variety of locomotion characteristics. During the development of this software package, we focused our efforts on an open source architecture allowing the easy addition of further modules. The program operates platform independent and is accompanied by an intuitive GUI guiding the user through data analysis. All locomotion parameter values are given in form of csv files allowing further data analyses. In addition, a Results Viewer integrated into the tracking software provides the opportunity to interactively review and adjust the output, as might be needed during stimulus integration. The power of FIM and FIMTrack is demonstrated by studying the locomotion of Drosophila larvae.

FIM is a novel, cost effective imaging system designed to track small moving objects such as C. elegans, planaria or Drosophila larvae. The accompanying FIMTrack program is designed to deliver fast and efficient data analysis. Together, these tools allow high-throughput analysis of behavioral traits.

FIM Görüntüleme ve FIMtrack: Yüksek verim ve Maliyet Etkili Hareket Analizi izin İki Yeni Araçlar

The analysis of neuronal network function requires a reliable measurement of behavioral traits. Since the behavior of freely moving animals is variable to ...

Perforated Patch-clamp Recording of Mouse Olfactory Sensory Neurons in Intact Neuroepithelium: Functional Analysis of Neurons Expressing an Identified Odorant Receptor

Analyzing the physiological responses of olfactory sensory neurons (OSN) when stimulated with specific ligands is critical to understand the basis of olfactory-driven behaviors and their modulation. These coding properties depend heavily on the initial interaction between odor molecules and the olfactory receptor (OR) expressed in the OSNs. The identity, specificity and ligand spectrum of the expressed OR are critical. The probability to find the ligand of the OR expressed in an OSN chosen randomly within the epithelium is very low. To address this challenge, this protocol uses genetically tagged mice expressing the fluorescent protein GFP under the control of the promoter of defined ORs. OSNs are located in a tight and organized epithelium lining the nasal cavity, with neighboring cells influencing their maturation and function. Here we describe a method to isolate an intact olfactory epithelium and record through patch-clamp recordings the properties of OSNs expressing defined odorant receptors. The protocol allows one to characterize OSN membrane properties while keeping the influence of the neighboring tissue. Analysis of patch-clamp results yields&#160;a precise quantification of ligand/OR interactions, transduction pathways and pharmacology, OSNs&#39; coding properties and their modulation at the membrane level.&#160;

Analyzing the physiological properties of olfactory sensory neurons still faces technical limitations. Here we record them through perforated patch-clamp in an intact preparation of the olfactory epithelium in gene-targeted mice. This technique allows the characterization of membrane properties and responses to specific ligands of neurons expressing defined olfactory receptors.

Bozulmamış neuroepithelium Fare Koku Duyu Nöronlar Delikli Patch-kelepçe Kayıt: Bir Belirlenen Odorant Reseptör ifade Nöronlar Fonksiyonel Analiz

Analyzing the physiological responses of olfactory sensory neurons (OSN) when stimulated with specific ligands is critical to understand the basis of ...

Receptor Autoradiography Protocol for the Localized Visualization of Angiotensin II Receptors

This protocol describes receptor binding patterns for Angiotensin II (Ang II) in the rat brain using a radioligand specific for Ang II receptors to perform receptor autoradiographic mapping.
Tissue specimens are harvested and stored at -80 &#176;C. A cryostat is used to coronally section the tissue (brain) and thaw-mount the sections onto charged slides. The slide-mounted tissue sections are incubated in 125I-SI-Ang II to radiolabel Ang II receptors. Adjacent slides are separated into two sets: &#39;non-specific binding&#39; (NSP) in the presence of a receptor saturating concentration of non-radiolabeled Ang II, or an AT1 Ang II receptor subtype (AT1R) selective Ang II receptor antagonist, and &#39;total binding&#39; with no AT1R antagonist. A saturating concentration of AT2 Ang II receptor subtype (AT2R) antagonist (PD123319, 10 &#181;M) is also present in the incubation buffer to limit 125I-SI-Ang II binding to the AT1R subtype. During a 30 min pre-incubation at ~22 &#176;C, NSP slides are exposed to 10 &#181;M PD123319 and losartan, while &#39;total binding&#39; slides are exposed to 10 &#181;M PD123319. Slides are then incubated with 125I-SI-Ang II in the presence of PD123319 for &#39;total binding&#39;, and PD123319 and losartan for NSP in assay buffer, followed by several &#39;washes&#39; in buffer, and water to remove salt and non-specifically bound radioligand. The slides are dried using blow-dryers, then exposed to autoradiography film using a specialized film and cassette. The film is developed and the images are scanned into a computer for visual and quantitative densitometry using a proprietary imaging system and a spreadsheet. An additional set of slides are thionin-stained for histological comparisons.
The advantage of using receptor autoradiography is the ability to visualize Ang II receptors in situ, within a section of a tissue specimen, and anatomically identify the region of the tissue by comparing it to an adjacent histological reference section.

Here we present a protocol to describe the localization of angiotensin II Type 1 receptors in the rat brain by quantitative, densitometric, in vitro receptor autoradiography using an iodine-125 labeled analog of angiotensin II.

Anjiyotensin II Reseptör lokalize Görselleştirme için Reseptör Otoradyografi Protokolü

This protocol describes receptor binding patterns for Angiotensin II (Ang II) in the rat brain using a radioligand specific for Ang II receptors to ...

Recording Temperature-induced Neuronal Activity through Monitoring Calcium Changes in the Olfactory Bulb of Xenopus laevis

The olfactory system, specialized in the detection, integration and processing of chemical molecules is likely the most thoroughly studied sensory system. However, there is piling evidence that olfaction is not solely limited to chemical sensitivity, but also includes temperature sensitivity. Premetamorphic Xenopus laevis are translucent animals, with protruding nasal cavities deprived of the cribriform plate separating the nose and the olfactory bulb. These characteristics make them well suited for studying olfaction, and particularly thermosensitivity. The present article describes the complete procedure for measuring temperature responses in the olfactory bulb of X. laevis larvae. Firstly, the electroporation of olfactory receptor neurons (ORNs) is performed with spectrally distinct dyes loaded into the nasal cavities in order to stain their axon terminals in the bulbar neuropil. The differential staining between left and right receptor neurons serves to identify the &#947;-glomerulus as the only structure innervated by contralateral presynaptic afferents. Secondly, the electroporation is combined with focal bolus loading in the olfactory bulb in order to stain mitral cells and their dendrites. The 3D brain volume is then scanned under line-illumination microscopy for the acquisition of fast calcium imaging data while small temperature drops are induced at the olfactory epithelium. Lastly, the post-acquisition analysis allows the morphological reconstruction of the thermosensitive network comprising the &#947;-glomerulus and its innervating mitral cells, based on specific temperature-induced Ca2+ traces. Using chemical odorants as stimuli in addition to temperature jumps enables the comparison between thermosensitive and chemosensitive networks in the olfactory bulb.

Recording Temperature-induced Neuronal Activity through Monitoring Calcium Changes in the Olfactory Bulb of Xenopus laevis

Here we describe a protocol for measuring and analyzing temperature responses in the olfactory bulb of Xenopus laevis. Olfactory receptor neurons and mitral cells are differentially stained, after which calcium changes are recorded, reflecting a sensitivity of some neural networks in the bulb to temperature drops induced at the nose.

koku ampul kalsiyum Değişiklikleri İzleme yoluyla Sıcaklık kaynaklı Nöronal Aktivite Kayıt<em&gt; Xenopus laevis</em

The olfactory system, specialized in the detection, integration and processing of chemical molecules is likely the most thoroughly studied sensory system. ...

Live-cell Measurement of Odorant Receptor Activation Using a Real-time cAMP Assay

The enormous sizes of the mammalian odorant receptor (OR) families present difficulties to find their cognate ligands among numerous volatile chemicals. To efficiently and accurately deorphanize ORs, we combine the use of a heterologous cell line to express mammalian ORs and a genetically modified biosensor plasmid to measure cAMP production downstream of OR activation in real time. This assay can be used to screen odorants against ORs and vice versa. Positive odorant-receptor interactions from the screens can be subsequently confirmed by testing against various odor concentrations, generating concentration-response curves. Here we used this method to perform a high-throughput screening of an odorous compound against a human OR library expressed in Hana3A cells and confirmed that the positively-responding receptor is the cognate receptor for the compound of interest. We found this high-throughput detection method to be efficient and reliable in assessing OR activation and our data provide an example of its potential use in OR functional studies.

Characterizing the function of odorant receptors serves an indispensable part in the deorphanization process. We describe a method to measure the activation of odorant receptors in real time using a cAMP assay.

Canlı hücre ölçüm propil reseptörü harekete geçirmek kullanımı gerçek zamanlı bir kamp tahlil

The enormous sizes of the mammalian odorant receptor (OR) families present difficulties to find their cognate ligands among numerous volatile chemicals. ...

High-throughput Analysis of Locomotor Behavior in the Drosophila Island Assay

Advances in next-generation sequencing technologies contribute to the identification of (candidate) disease genes for movement disorders and other neurological diseases at an increasing speed. However, little is known about the molecular mechanisms that underlie these disorders. The genetic, molecular, and behavioral toolbox of Drosophila melanogaster makes this model organism particularly useful to characterize new disease genes and mechanisms in a high-throughput manner. Nevertheless, high-throughput screens require efficient and reliable assays that, ideally, are cost-effective and allow for the automatized quantification of traits relevant to these disorders. The island assay is a cost-effective and easily set-up method to evaluate Drosophila locomotor behavior. In this assay, flies are thrown onto a platform from a fixed height. This induces an innate motor response that enables the flies to escape from the platform within seconds. At present, quantitative analyses of filmed island assays are done manually, which is a laborious undertaking, particularly when performing large screens.
This manuscript describes the &#34;Drosophila Island Assay&#34; and &#34;Island Assay Analysis&#34; algorithms for&#160;high-throughput, automated data processing and quantification of island assay data. In the setup, a simple webcam connected to a laptop collects an image series of the platform while the assay is performed. The &#34;Drosophila Island Assay&#34; algorithm developed for the open-source software Fiji processes these image series and quantifies, for each experimental condition, the number of flies on the platform over time. The &#34;Island Assay Analysis&#34; script, compatible with the free software R, was developed to automatically process the obtained data and to calculate whether treatments/genotypes are statistically different. This greatly improves the efficiency of the island assay and makes it a powerful readout for basic locomotion and flight behavior. It can thus be applied to large screens investigating fly locomotor ability, Drosophila models of movement disorders, and drug efficacy.

High-throughput Analysis of Locomotor Behavior in the Drosophila Island Assay

The island assay is a relatively new, cost-effective assay that can be used to evaluate the basic locomotor behavior of Drosophila melanogaster. This manuscript describes algorithms for automatic data processing and objective quantification of island assay data, making this assay a sensitive, high-throughput readout for large genetic or pharmacological screens.